MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 36529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022353	GAT	2	6	228026	228031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949214
5002	NC_022353	CAAT	2	8	228073	228080	50 %	25 %	0 %	25 %	543949214
5003	NC_022353	A	6	6	228096	228101	100 %	0 %	0 %	0 %	543949214
5004	NC_022353	TTTA	2	8	228110	228117	25 %	75 %	0 %	0 %	543949214
5005	NC_022353	T	6	6	228141	228146	0 %	100 %	0 %	0 %	543949214
5006	NC_022353	TGC	2	6	228161	228166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949214
5007	NC_022353	ATT	2	6	228171	228176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949214
5008	NC_022353	T	7	7	228702	228708	0 %	100 %	0 %	0 %	543949215
5009	NC_022353	T	6	6	228721	228726	0 %	100 %	0 %	0 %	543949215
5010	NC_022353	TAC	2	6	228766	228771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949215
5011	NC_022353	AGG	2	6	228871	228876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543949215
5012	NC_022353	GTT	2	6	228899	228904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949215
5013	NC_022353	TTA	2	6	228906	228911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5014	NC_022353	TTTG	2	8	228946	228953	0 %	75 %	25 %	0 %	543949215
5015	NC_022353	T	6	6	228954	228959	0 %	100 %	0 %	0 %	543949215
5016	NC_022353	T	6	6	228968	228973	0 %	100 %	0 %	0 %	543949215
5017	NC_022353	T	7	7	228994	229000	0 %	100 %	0 %	0 %	543949215
5018	NC_022353	TGC	3	9	229075	229083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949215
5019	NC_022353	ATT	2	6	229135	229140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5020	NC_022353	AAGA	2	8	229165	229172	75 %	0 %	25 %	0 %	543949215
5021	NC_022353	ATT	2	6	229187	229192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5022	NC_022353	GGT	2	6	229229	229234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543949215
5023	NC_022353	CTA	2	6	229251	229256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949215
5024	NC_022353	TAT	2	6	229320	229325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5025	NC_022353	CTT	2	6	229328	229333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949215
5026	NC_022353	A	6	6	229413	229418	100 %	0 %	0 %	0 %	543949215
5027	NC_022353	TAT	2	6	229495	229500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5028	NC_022353	AAT	2	6	229534	229539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949215
5029	NC_022353	A	6	6	229574	229579	100 %	0 %	0 %	0 %	543949215
5030	NC_022353	TAT	2	6	229669	229674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5031	NC_022353	ATT	2	6	229713	229718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5032	NC_022353	ATT	2	6	229769	229774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5033	NC_022353	T	6	6	229773	229778	0 %	100 %	0 %	0 %	543949215
5034	NC_022353	TAT	2	6	229861	229866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5035	NC_022353	ATTT	2	8	229894	229901	25 %	75 %	0 %	0 %	543949215
5036	NC_022353	TGT	2	6	229906	229911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949215
5037	NC_022353	T	7	7	229976	229982	0 %	100 %	0 %	0 %	543949215
5038	NC_022353	AT	3	6	229983	229988	50 %	50 %	0 %	0 %	543949215
5039	NC_022353	TAT	2	6	229999	230004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949215
5040	NC_022353	ATA	2	6	230033	230038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949215
5041	NC_022353	ATG	2	6	230224	230229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949216
5042	NC_022353	A	6	6	230233	230238	100 %	0 %	0 %	0 %	543949216
5043	NC_022353	TAT	2	6	230292	230297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949216
5044	NC_022353	ACTT	2	8	230337	230344	25 %	50 %	0 %	25 %	543949216
5045	NC_022353	TCA	3	9	230347	230355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949216
5046	NC_022353	ATA	2	6	230420	230425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949216
5047	NC_022353	CAG	3	9	230444	230452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949216
5048	NC_022353	ATC	2	6	230460	230465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949216
5049	NC_022353	TG	3	6	230495	230500	0 %	50 %	50 %	0 %	543949216
5050	NC_022353	TGG	2	6	230550	230555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543949216
5051	NC_022353	AAG	2	6	230586	230591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949216
5052	NC_022353	TGG	2	6	230597	230602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543949216
5053	NC_022353	GCTT	2	8	230613	230620	0 %	50 %	25 %	25 %	543949216
5054	NC_022353	AGT	2	6	230674	230679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949216
5055	NC_022353	A	6	6	230680	230685	100 %	0 %	0 %	0 %	543949216
5056	NC_022353	GCT	2	6	230728	230733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949216
5057	NC_022353	A	6	6	230958	230963	100 %	0 %	0 %	0 %	543949216
5058	NC_022353	AGC	2	6	231033	231038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949216
5059	NC_022353	A	7	7	231122	231128	100 %	0 %	0 %	0 %	543949216
5060	NC_022353	CTTT	2	8	231148	231155	0 %	75 %	0 %	25 %	543949216
5061	NC_022353	TTTA	2	8	231195	231202	25 %	75 %	0 %	0 %	543949216
5062	NC_022353	TTG	2	6	231218	231223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949216
5063	NC_022353	TATT	2	8	231240	231247	25 %	75 %	0 %	0 %	543949216
5064	NC_022353	TTG	2	6	231266	231271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949216
5065	NC_022353	T	7	7	231297	231303	0 %	100 %	0 %	0 %	543949216
5066	NC_022353	GCA	2	6	231307	231312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949216
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5068	NC_022353	TCT	3	9	231343	231351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949216
5069	NC_022353	TTA	2	6	231383	231388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949216
5070	NC_022353	TCT	2	6	231391	231396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949216
5071	NC_022353	T	7	7	231401	231407	0 %	100 %	0 %	0 %	543949216
5072	NC_022353	TAC	2	6	231474	231479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949216
5073	NC_022353	GCT	2	6	231499	231504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949216
5074	NC_022353	ACA	2	6	231567	231572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543949216
5075	NC_022353	TCA	2	6	231688	231693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949216
5076	NC_022353	AGC	2	6	231699	231704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949216
5077	NC_022353	GCAA	2	8	231708	231715	50 %	0 %	25 %	25 %	543949216
5078	NC_022353	TCA	2	6	231747	231752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949216
5079	NC_022353	ATT	2	6	231805	231810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949216
5080	NC_022353	GCC	2	6	231849	231854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543949216
5081	NC_022353	CTG	2	6	231887	231892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543949216
5082	NC_022353	AT	3	6	231927	231932	50 %	50 %	0 %	0 %	543949216
5083	NC_022353	A	6	6	231952	231957	100 %	0 %	0 %	0 %	543949216
5084	NC_022353	A	6	6	231963	231968	100 %	0 %	0 %	0 %	543949216
5085	NC_022353	AGA	2	6	231978	231983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949216
5086	NC_022353	AGTA	2	8	232086	232093	50 %	25 %	25 %	0 %	543949216
5087	NC_022353	GTA	2	6	232100	232105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949216
5088	NC_022353	T	6	6	232165	232170	0 %	100 %	0 %	0 %	543949216
5089	NC_022353	TAT	2	6	232181	232186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949216
5090	NC_022353	A	6	6	232207	232212	100 %	0 %	0 %	0 %	543949216
5091	NC_022353	CTGA	2	8	232337	232344	25 %	25 %	25 %	25 %	543949217
5092	NC_022353	TTC	2	6	232357	232362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949217
5093	NC_022353	ATC	2	6	232436	232441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949217
5094	NC_022353	T	6	6	232529	232534	0 %	100 %	0 %	0 %	543949217
5095	NC_022353	TTTA	2	8	232579	232586	25 %	75 %	0 %	0 %	543949217
5096	NC_022353	GGTTG	2	10	232589	232598	0 %	40 %	60 %	0 %	543949217
5097	NC_022353	GTGTT	2	10	232623	232632	0 %	60 %	40 %	0 %	543949217
5098	NC_022353	AGA	2	6	232684	232689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949217
5099	NC_022353	AAG	2	6	232756	232761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949217
5100	NC_022353	TAT	2	6	232771	232776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949217
5101	NC_022353	TGG	2	6	232777	232782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543949217
5102	NC_022353	AGTTT	2	10	232818	232827	20 %	60 %	20 %	0 %	543949217
5103	NC_022353	T	6	6	232825	232830	0 %	100 %	0 %	0 %	543949217
5104	NC_022353	GAT	2	6	232846	232851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949217
5105	NC_022353	CTT	2	6	232889	232894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949217
5106	NC_022353	TTG	2	6	232947	232952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949217
5107	NC_022353	ATTT	2	8	232981	232988	25 %	75 %	0 %	0 %	543949217
5108	NC_022353	TAT	2	6	233023	233028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949217
5109	NC_022353	TAT	2	6	233054	233059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949217
5110	NC_022353	TAAA	2	8	233096	233103	75 %	25 %	0 %	0 %	543949217
5111	NC_022353	AAG	2	6	233236	233241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949218
5112	NC_022353	AAT	2	6	233267	233272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543949218
5113	NC_022353	ATTT	2	8	233310	233317	25 %	75 %	0 %	0 %	543949218
5114	NC_022353	AAAG	2	8	233328	233335	75 %	0 %	25 %	0 %	543949218
5115	NC_022353	AGA	2	6	233429	233434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949218
5116	NC_022353	TAT	2	6	233442	233447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949218
5117	NC_022353	GAA	2	6	233475	233480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949218
5118	NC_022353	A	7	7	233497	233503	100 %	0 %	0 %	0 %	543949218
5119	NC_022353	ATG	2	6	233584	233589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543949218
5120	NC_022353	AAG	2	6	233599	233604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543949218
5121	NC_022353	T	6	6	233706	233711	0 %	100 %	0 %	0 %	543949218
5122	NC_022353	ACTC	2	8	233714	233721	25 %	25 %	0 %	50 %	543949218
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5124	NC_022353	ATT	2	6	233826	233831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949218
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5237	NC_022353	TAAA	2	8	240184	240191	75 %	25 %	0 %	0 %	543949230
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5243	NC_022353	GTT	2	6	240703	240708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543949231
5244	NC_022353	AAAGA	2	10	240747	240756	80 %	0 %	20 %	0 %	543949231
5245	NC_022353	TTA	2	6	240775	240780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949231
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5247	NC_022353	T	6	6	240835	240840	0 %	100 %	0 %	0 %	543949231
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5249	NC_022353	GCA	2	6	241212	241217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543949231
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5364	NC_022353	AT	3	6	246580	246585	50 %	50 %	0 %	0 %	543949238
5365	NC_022353	TCT	2	6	246586	246591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543949238
5366	NC_022353	ATC	2	6	246597	246602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543949238
5367	NC_022353	TGATT	2	10	246614	246623	20 %	60 %	20 %	0 %	543949238
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5498	NC_022353	TAT	2	6	252145	252150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949245
5499	NC_022353	AT	3	6	252149	252154	50 %	50 %	0 %	0 %	543949245
5500	NC_022353	TAT	2	6	252185	252190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543949245

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