MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 35659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022352	T	7	7	179372	179378	0 %	100 %	0 %	0 %	543947411
4002	NC_022352	CTA	2	6	179459	179464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947411
4003	NC_022352	T	6	6	179547	179552	0 %	100 %	0 %	0 %	543947411
4004	NC_022352	T	6	6	179561	179566	0 %	100 %	0 %	0 %	543947412
4005	NC_022352	TCT	2	6	179575	179580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947412
4006	NC_022352	T	6	6	179626	179631	0 %	100 %	0 %	0 %	543947412
4007	NC_022352	TAAA	2	8	179635	179642	75 %	25 %	0 %	0 %	543947412
4008	NC_022352	A	6	6	179685	179690	100 %	0 %	0 %	0 %	543947412
4009	NC_022352	CTT	2	6	179764	179769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947412
4010	NC_022352	A	7	7	179771	179777	100 %	0 %	0 %	0 %	543947412
4011	NC_022352	TTC	2	6	179816	179821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947412
4012	NC_022352	AAT	2	6	179831	179836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947412
4013	NC_022352	TCT	2	6	179862	179867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947412
4014	NC_022352	T	8	8	179867	179874	0 %	100 %	0 %	0 %	543947412
4015	NC_022352	TCA	2	6	179886	179891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947412
4016	NC_022352	GCT	2	6	179937	179942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947412
4017	NC_022352	CATA	2	8	179974	179981	50 %	25 %	0 %	25 %	543947412
4018	NC_022352	TCA	2	6	179982	179987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947412
4019	NC_022352	ATTT	2	8	180013	180020	25 %	75 %	0 %	0 %	543947412
4020	NC_022352	A	7	7	180036	180042	100 %	0 %	0 %	0 %	543947412
4021	NC_022352	T	6	6	180126	180131	0 %	100 %	0 %	0 %	543947413
4022	NC_022352	ATCA	2	8	180142	180149	50 %	25 %	0 %	25 %	543947413
4023	NC_022352	CTT	2	6	180165	180170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947413
4024	NC_022352	A	6	6	180182	180187	100 %	0 %	0 %	0 %	543947413
4025	NC_022352	T	6	6	180233	180238	0 %	100 %	0 %	0 %	543947413
4026	NC_022352	TGA	2	6	180332	180337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947413
4027	NC_022352	ATA	2	6	180341	180346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947413
4028	NC_022352	GCAAA	2	10	180357	180366	60 %	0 %	20 %	20 %	543947413
4029	NC_022352	AGC	2	6	180412	180417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947413
4030	NC_022352	ACC	2	6	180496	180501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947413
4031	NC_022352	A	7	7	180551	180557	100 %	0 %	0 %	0 %	543947413
4032	NC_022352	TCA	2	6	180587	180592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947413
4033	NC_022352	CAC	2	6	180600	180605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947413
4034	NC_022352	ATA	2	6	180611	180616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947413
4035	NC_022352	CTT	2	6	180653	180658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947413
4036	NC_022352	CAC	2	6	180660	180665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947413
4037	NC_022352	ATT	2	6	180698	180703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947413
4038	NC_022352	TCT	2	6	180706	180711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947414
4039	NC_022352	T	6	6	180717	180722	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4040	NC_022352	TTC	2	6	180777	180782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947414
4041	NC_022352	CAG	2	6	180800	180805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947414
4042	NC_022352	T	6	6	180819	180824	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4043	NC_022352	AAAT	2	8	180874	180881	75 %	25 %	0 %	0 %	543947414
4044	NC_022352	TCA	2	6	180934	180939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
4045	NC_022352	AAGT	2	8	180947	180954	50 %	25 %	25 %	0 %	543947414
4046	NC_022352	T	6	6	180962	180967	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4047	NC_022352	CTT	3	9	180971	180979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947414
4048	NC_022352	CGCA	2	8	181062	181069	25 %	0 %	25 %	50 %	543947414
4049	NC_022352	CTA	2	6	181091	181096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
4050	NC_022352	TCAA	2	8	181126	181133	50 %	25 %	0 %	25 %	543947414
4051	NC_022352	TCA	2	6	181159	181164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
4052	NC_022352	TCT	2	6	181240	181245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947414
4053	NC_022352	T	6	6	181257	181262	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4054	NC_022352	TCA	3	9	181270	181278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
4055	NC_022352	TGCGC	2	10	181348	181357	0 %	20 %	40 %	40 %	543947414
4056	NC_022352	TTC	2	6	181392	181397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947414
4057	NC_022352	ACCAT	2	10	181414	181423	40 %	20 %	0 %	40 %	543947414
4058	NC_022352	ACC	2	6	181482	181487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947414
4059	NC_022352	ATC	2	6	181500	181505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
4060	NC_022352	CTT	2	6	181541	181546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947414
4061	NC_022352	T	6	6	181605	181610	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4062	NC_022352	TCA	2	6	181612	181617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947414
4063	NC_022352	T	6	6	181623	181628	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4064	NC_022352	ACTT	2	8	181629	181636	25 %	50 %	0 %	25 %	543947414
4065	NC_022352	AAAG	2	8	181696	181703	75 %	0 %	25 %	0 %	543947414
4066	NC_022352	AAT	2	6	181716	181721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947414
4067	NC_022352	T	6	6	181782	181787	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4068	NC_022352	TGAG	2	8	181843	181850	25 %	25 %	50 %	0 %	543947414
4069	NC_022352	CT	3	6	181851	181856	0 %	50 %	0 %	50 %	543947414
4070	NC_022352	CCAT	2	8	181906	181913	25 %	25 %	0 %	50 %	543947414
4071	NC_022352	T	7	7	181932	181938	0 %	100 %	0 %	0 %	543947414
4072	NC_022352	A	8	8	182180	182187	100 %	0 %	0 %	0 %	543947415
4073	NC_022352	TTA	2	6	182249	182254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947415
4074	NC_022352	TAA	2	6	182352	182357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947415
4075	NC_022352	CAT	2	6	182404	182409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947415
4076	NC_022352	T	7	7	182418	182424	0 %	100 %	0 %	0 %	543947415
4077	NC_022352	TAA	2	6	182451	182456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947415
4078	NC_022352	A	6	6	182455	182460	100 %	0 %	0 %	0 %	543947415
4079	NC_022352	GTA	2	6	182461	182466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947415
4080	NC_022352	AAG	2	6	182505	182510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947415
4081	NC_022352	AAC	2	6	182525	182530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947415
4082	NC_022352	TG	3	6	182609	182614	0 %	50 %	50 %	0 %	543947415
4083	NC_022352	CCA	2	6	182645	182650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947415
4084	NC_022352	A	6	6	182682	182687	100 %	0 %	0 %	0 %	543947415
4085	NC_022352	A	6	6	182690	182695	100 %	0 %	0 %	0 %	543947415
4086	NC_022352	AG	3	6	182698	182703	50 %	0 %	50 %	0 %	543947415
4087	NC_022352	T	7	7	182707	182713	0 %	100 %	0 %	0 %	543947415
4088	NC_022352	GA	3	6	182806	182811	50 %	0 %	50 %	0 %	543947416
4089	NC_022352	AGTT	2	8	182878	182885	25 %	50 %	25 %	0 %	543947416
4090	NC_022352	AATGAA	2	12	182889	182900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947416
4091	NC_022352	GTA	2	6	183054	183059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947416
4092	NC_022352	AT	3	6	183110	183115	50 %	50 %	0 %	0 %	543947416
4093	NC_022352	AGA	2	6	183161	183166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947416
4094	NC_022352	AGT	2	6	183308	183313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947416
4095	NC_022352	A	7	7	183358	183364	100 %	0 %	0 %	0 %	543947416
4096	NC_022352	GAT	2	6	183381	183386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947416
4097	NC_022352	ATT	2	6	183393	183398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947416
4098	NC_022352	TGA	2	6	183410	183415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947416
4099	NC_022352	CCT	2	6	183564	183569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543947416
4100	NC_022352	CCA	2	6	183585	183590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947416
4101	NC_022352	AGA	2	6	183635	183640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947416
4102	NC_022352	T	6	6	183663	183668	0 %	100 %	0 %	0 %	543947416
4103	NC_022352	TGA	2	6	183686	183691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947416
4104	NC_022352	TCC	2	6	183779	183784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543947416
4105	NC_022352	TGA	2	6	183814	183819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947416
4106	NC_022352	TGA	2	6	183944	183949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947416
4107	NC_022352	A	6	6	183960	183965	100 %	0 %	0 %	0 %	543947416
4108	NC_022352	GAA	2	6	183999	184004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947416
4109	NC_022352	CCA	2	6	184068	184073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947416
4110	NC_022352	AAGTGC	2	12	184094	184105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543947416
4111	NC_022352	CCTAAT	2	12	184113	184124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947416
4112	NC_022352	TAAAA	2	10	184126	184135	80 %	20 %	0 %	0 %	543947416
4113	NC_022352	TAA	2	6	184141	184146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947417
4114	NC_022352	AAT	2	6	184147	184152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947417
4115	NC_022352	A	6	6	184221	184226	100 %	0 %	0 %	0 %	543947417
4116	NC_022352	CTT	2	6	184258	184263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947417
4117	NC_022352	TTC	2	6	184289	184294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947417
4118	NC_022352	GCTC	2	8	184367	184374	0 %	25 %	25 %	50 %	543947417
4119	NC_022352	GCA	2	6	184377	184382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947417
4120	NC_022352	ATT	2	6	184395	184400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947417
4121	NC_022352	T	7	7	184399	184405	0 %	100 %	0 %	0 %	543947417
4122	NC_022352	AGT	2	6	184409	184414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947417
4123	NC_022352	ATC	2	6	184430	184435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947417
4124	NC_022352	TTC	2	6	184534	184539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947417
4125	NC_022352	T	6	6	184661	184666	0 %	100 %	0 %	0 %	543947417
4126	NC_022352	T	7	7	184684	184690	0 %	100 %	0 %	0 %	543947417
4127	NC_022352	CTA	2	6	184717	184722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947417
4128	NC_022352	AAAT	2	8	184740	184747	75 %	25 %	0 %	0 %	543947417
4129	NC_022352	A	6	6	184780	184785	100 %	0 %	0 %	0 %	543947417
4130	NC_022352	TA	3	6	184901	184906	50 %	50 %	0 %	0 %	543947417
4131	NC_022352	ACA	2	6	184962	184967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947417
4132	NC_022352	TGCT	2	8	184981	184988	0 %	50 %	25 %	25 %	543947417
4133	NC_022352	AAAAC	2	10	184989	184998	80 %	0 %	0 %	20 %	543947417
4134	NC_022352	ATCT	2	8	185035	185042	25 %	50 %	0 %	25 %	543947417
4135	NC_022352	CTT	2	6	185061	185066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947417
4136	NC_022352	ACA	2	6	185079	185084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947417
4137	NC_022352	CTT	2	6	185146	185151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947417
4138	NC_022352	GCT	2	6	185205	185210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947417
4139	NC_022352	CTG	2	6	185242	185247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947417
4140	NC_022352	CTT	2	6	185383	185388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947417
4141	NC_022352	ATA	2	6	185417	185422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947417
4142	NC_022352	T	6	6	185439	185444	0 %	100 %	0 %	0 %	543947417
4143	NC_022352	CA	3	6	185467	185472	50 %	0 %	0 %	50 %	543947417
4144	NC_022352	A	6	6	185485	185490	100 %	0 %	0 %	0 %	543947418
4145	NC_022352	ATTG	2	8	185493	185500	25 %	50 %	25 %	0 %	543947418
4146	NC_022352	CTT	2	6	185513	185518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947418
4147	NC_022352	CTA	2	6	185636	185641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947418
4148	NC_022352	TCA	2	6	185660	185665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947418
4149	NC_022352	CTT	2	6	185683	185688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947418
4150	NC_022352	CTTACT	2	12	185713	185724	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543947418
4151	NC_022352	T	6	6	185796	185801	0 %	100 %	0 %	0 %	543947418
4152	NC_022352	GAT	2	6	185807	185812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947418
4153	NC_022352	A	6	6	185912	185917	100 %	0 %	0 %	0 %	543947418
4154	NC_022352	TCACT	2	10	185924	185933	20 %	40 %	0 %	40 %	543947418
4155	NC_022352	TCA	2	6	185962	185967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947418
4156	NC_022352	TGT	2	6	185973	185978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947418
4157	NC_022352	GAA	2	6	186043	186048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947418
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4159	NC_022352	T	6	6	186068	186073	0 %	100 %	0 %	0 %	543947418
4160	NC_022352	TTC	2	6	186147	186152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947418
4161	NC_022352	ATC	2	6	186199	186204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947418
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4163	NC_022352	TA	3	6	186289	186294	50 %	50 %	0 %	0 %	543947419
4164	NC_022352	CTT	2	6	186313	186318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947419
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4167	NC_022352	TGA	2	6	186420	186425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947419
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4169	NC_022352	ATT	2	6	186461	186466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947419
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4171	NC_022352	TGCT	2	8	186523	186530	0 %	50 %	25 %	25 %	543947419
4172	NC_022352	A	6	6	186655	186660	100 %	0 %	0 %	0 %	543947419
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4177	NC_022352	CTT	2	6	187041	187046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947419
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4182	NC_022352	TCC	2	6	187244	187249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543947419
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4184	NC_022352	CTG	2	6	187318	187323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947419
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4190	NC_022352	A	6	6	187550	187555	100 %	0 %	0 %	0 %	543947420
4191	NC_022352	TCA	2	6	187598	187603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947420
4192	NC_022352	GTT	2	6	187645	187650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947420
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4194	NC_022352	T	7	7	187727	187733	0 %	100 %	0 %	0 %	543947420
4195	NC_022352	GA	3	6	187743	187748	50 %	0 %	50 %	0 %	543947420
4196	NC_022352	A	6	6	187765	187770	100 %	0 %	0 %	0 %	543947420
4197	NC_022352	TTTTG	2	10	187792	187801	0 %	80 %	20 %	0 %	543947420
4198	NC_022352	AAATTC	2	12	187805	187816	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543947420
4199	NC_022352	CTG	2	6	187875	187880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947420
4200	NC_022352	TTC	2	6	187885	187890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947420
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4203	NC_022352	A	6	6	188020	188025	100 %	0 %	0 %	0 %	543947420
4204	NC_022352	AT	3	6	188141	188146	50 %	50 %	0 %	0 %	543947420
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4210	NC_022352	A	6	6	188327	188332	100 %	0 %	0 %	0 %	543947420
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4221	NC_022352	ATT	2	6	188567	188572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947420
4222	NC_022352	TAA	2	6	188704	188709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947421
4223	NC_022352	T	6	6	188712	188717	0 %	100 %	0 %	0 %	543947421
4224	NC_022352	A	6	6	188803	188808	100 %	0 %	0 %	0 %	543947421
4225	NC_022352	ATC	2	6	188865	188870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947421
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4227	NC_022352	AGCT	2	8	189008	189015	25 %	25 %	25 %	25 %	543947421
4228	NC_022352	T	7	7	189041	189047	0 %	100 %	0 %	0 %	543947421
4229	NC_022352	ATT	2	6	189150	189155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947422
4230	NC_022352	A	7	7	189159	189165	100 %	0 %	0 %	0 %	543947422
4231	NC_022352	A	6	6	189259	189264	100 %	0 %	0 %	0 %	543947422
4232	NC_022352	T	6	6	189341	189346	0 %	100 %	0 %	0 %	543947422
4233	NC_022352	T	6	6	189353	189358	0 %	100 %	0 %	0 %	543947422
4234	NC_022352	A	6	6	189403	189408	100 %	0 %	0 %	0 %	543947422
4235	NC_022352	TCA	2	6	189451	189456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947422
4236	NC_022352	TGT	2	6	189459	189464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947422
4237	NC_022352	A	6	6	189544	189549	100 %	0 %	0 %	0 %	543947422
4238	NC_022352	T	6	6	189612	189617	0 %	100 %	0 %	0 %	543947422
4239	NC_022352	GAT	2	6	189618	189623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947422
4240	NC_022352	CAAT	2	8	189665	189672	50 %	25 %	0 %	25 %	543947422
4241	NC_022352	A	6	6	189688	189693	100 %	0 %	0 %	0 %	543947422
4242	NC_022352	TTTA	2	8	189702	189709	25 %	75 %	0 %	0 %	543947422
4243	NC_022352	T	6	6	189733	189738	0 %	100 %	0 %	0 %	543947422
4244	NC_022352	TGC	2	6	189753	189758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947422
4245	NC_022352	ATT	2	6	189763	189768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947422
4246	NC_022352	T	7	7	190294	190300	0 %	100 %	0 %	0 %	543947423
4247	NC_022352	T	6	6	190313	190318	0 %	100 %	0 %	0 %	543947423
4248	NC_022352	TAC	2	6	190358	190363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947423
4249	NC_022352	AGG	2	6	190463	190468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543947423
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4253	NC_022352	T	6	6	190546	190551	0 %	100 %	0 %	0 %	543947423
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4360	NC_022352	ACTC	2	8	195306	195313	25 %	25 %	0 %	50 %	543947426
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4371	NC_022352	A	6	6	195812	195817	100 %	0 %	0 %	0 %	543947426
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4386	NC_022352	TTTTAG	2	12	196493	196504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947426
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4402	NC_022352	TGAT	2	8	196876	196883	25 %	50 %	25 %	0 %	543947427
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4486	NC_022352	AAG	2	6	202974	202979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947438
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4489	NC_022352	TGAT	2	8	203048	203055	25 %	50 %	25 %	0 %	543947438
4490	NC_022352	GAA	2	6	203056	203061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947438
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4494	NC_022352	A	6	6	203139	203144	100 %	0 %	0 %	0 %	543947438
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4496	NC_022352	AG	3	6	203278	203283	50 %	0 %	50 %	0 %	543947438
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4498	NC_022352	TCTT	2	8	203301	203308	0 %	75 %	0 %	25 %	543947438
4499	NC_022352	TA	3	6	203401	203406	50 %	50 %	0 %	0 %	543947439
4500	NC_022352	CGG	2	6	203442	203447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543947439

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