MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 35659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022352	ACC	2	6	821222	821227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543948088
18002	NC_022352	ATC	2	6	821243	821248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948088
18003	NC_022352	CAC	2	6	821296	821301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543948088
18004	NC_022352	A	6	6	821303	821308	100 %	0 %	0 %	0 %	543948088
18005	NC_022352	T	7	7	821457	821463	0 %	100 %	0 %	0 %	543948088
18006	NC_022352	A	6	6	821517	821522	100 %	0 %	0 %	0 %	543948088
18007	NC_022352	TAA	2	6	821526	821531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948088
18008	NC_022352	ATA	2	6	821559	821564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948088
18009	NC_022352	TTA	2	6	821586	821591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948088
18010	NC_022352	ATA	2	6	821628	821633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948088
18011	NC_022352	AAG	2	6	821750	821755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948089
18012	NC_022352	CTT	2	6	821824	821829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948089
18013	NC_022352	T	7	7	821929	821935	0 %	100 %	0 %	0 %	543948089
18014	NC_022352	GTT	2	6	821971	821976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948089
18015	NC_022352	A	8	8	821980	821987	100 %	0 %	0 %	0 %	543948089
18016	NC_022352	TTCA	2	8	822009	822016	25 %	50 %	0 %	25 %	543948089
18017	NC_022352	TTC	2	6	822021	822026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948089
18018	NC_022352	ATA	2	6	822040	822045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948089
18019	NC_022352	TAC	2	6	822164	822169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948089
18020	NC_022352	A	7	7	822281	822287	100 %	0 %	0 %	0 %	543948090
18021	NC_022352	TTTCCA	2	12	822381	822392	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543948090
18022	NC_022352	C	6	6	822403	822408	0 %	0 %	0 %	100 %	543948090
18023	NC_022352	GCA	2	6	822474	822479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543948090
18024	NC_022352	TGC	2	6	822644	822649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948090
18025	NC_022352	ATA	2	6	822667	822672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948090
18026	NC_022352	T	7	7	822686	822692	0 %	100 %	0 %	0 %	543948090
18027	NC_022352	A	7	7	822731	822737	100 %	0 %	0 %	0 %	543948090
18028	NC_022352	TCCA	2	8	822740	822747	25 %	25 %	0 %	50 %	543948090
18029	NC_022352	ATGC	2	8	822854	822861	25 %	25 %	25 %	25 %	543948090
18030	NC_022352	CTTG	2	8	822892	822899	0 %	50 %	25 %	25 %	543948090
18031	NC_022352	T	6	6	822903	822908	0 %	100 %	0 %	0 %	543948090
18032	NC_022352	ATAA	2	8	822932	822939	75 %	25 %	0 %	0 %	543948090
18033	NC_022352	AT	3	6	822982	822987	50 %	50 %	0 %	0 %	543948090
18034	NC_022352	A	6	6	822992	822997	100 %	0 %	0 %	0 %	543948090
18035	NC_022352	TTC	2	6	822998	823003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948090
18036	NC_022352	CTT	3	9	823015	823023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948090
18037	NC_022352	CAA	2	6	823036	823041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948090
18038	NC_022352	T	7	7	823141	823147	0 %	100 %	0 %	0 %	543948090
18039	NC_022352	TTA	2	6	823192	823197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948090
18040	NC_022352	CTAT	2	8	823239	823246	25 %	50 %	0 %	25 %	543948091
18041	NC_022352	TAA	2	6	823293	823298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948091
18042	NC_022352	TCT	2	6	823386	823391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948091
18043	NC_022352	A	6	6	823399	823404	100 %	0 %	0 %	0 %	543948091
18044	NC_022352	T	6	6	823409	823414	0 %	100 %	0 %	0 %	543948091
18045	NC_022352	TCA	2	6	823467	823472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948091
18046	NC_022352	T	6	6	823573	823578	0 %	100 %	0 %	0 %	543948091
18047	NC_022352	TCT	2	6	823584	823589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948091
18048	NC_022352	T	6	6	823604	823609	0 %	100 %	0 %	0 %	543948091
18049	NC_022352	ATT	3	9	823640	823648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948091
18050	NC_022352	TCA	2	6	823680	823685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948091
18051	NC_022352	ACC	3	9	823724	823732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543948091
18052	NC_022352	ATA	2	6	823793	823798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948091
18053	NC_022352	T	7	7	823867	823873	0 %	100 %	0 %	0 %	543948091
18054	NC_022352	TTA	2	6	823891	823896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948091
18055	NC_022352	ATC	2	6	823994	823999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948091
18056	NC_022352	T	7	7	824349	824355	0 %	100 %	0 %	0 %	543948092
18057	NC_022352	T	6	6	824367	824372	0 %	100 %	0 %	0 %	543948092
18058	NC_022352	AGAA	2	8	824414	824421	75 %	0 %	25 %	0 %	543948092
18059	NC_022352	T	6	6	824483	824488	0 %	100 %	0 %	0 %	543948092
18060	NC_022352	TAA	2	6	824493	824498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948092
18061	NC_022352	A	8	8	824497	824504	100 %	0 %	0 %	0 %	543948092
18062	NC_022352	ACT	2	6	824551	824556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948092
18063	NC_022352	ATT	2	6	824579	824584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948092
18064	NC_022352	TA	3	6	824620	824625	50 %	50 %	0 %	0 %	543948092
18065	NC_022352	GAT	2	6	824698	824703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948092
18066	NC_022352	AAT	2	6	824731	824736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948092
18067	NC_022352	T	6	6	824748	824753	0 %	100 %	0 %	0 %	543948092
18068	NC_022352	TTTGAT	2	12	824755	824766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543948092
18069	NC_022352	A	7	7	824777	824783	100 %	0 %	0 %	0 %	543948092
18070	NC_022352	AC	3	6	824798	824803	50 %	0 %	0 %	50 %	543948092
18071	NC_022352	A	7	7	824897	824903	100 %	0 %	0 %	0 %	543948093
18072	NC_022352	TTC	2	6	824904	824909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948093
18073	NC_022352	A	6	6	824962	824967	100 %	0 %	0 %	0 %	543948093
18074	NC_022352	AAAC	2	8	824978	824985	75 %	0 %	0 %	25 %	543948093
18075	NC_022352	TAA	2	6	825028	825033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948093
18076	NC_022352	TAA	2	6	825037	825042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948093
18077	NC_022352	TAA	2	6	825054	825059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948093
18078	NC_022352	ATG	3	9	825122	825130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948093
18079	NC_022352	A	6	6	825132	825137	100 %	0 %	0 %	0 %	543948093
18080	NC_022352	ATT	2	6	825146	825151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948093
18081	NC_022352	A	7	7	825214	825220	100 %	0 %	0 %	0 %	543948093
18082	NC_022352	TAT	2	6	825223	825228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948093
18083	NC_022352	TAA	2	6	825262	825267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948093
18084	NC_022352	A	6	6	825286	825291	100 %	0 %	0 %	0 %	543948093
18085	NC_022352	TAAT	2	8	825311	825318	50 %	50 %	0 %	0 %	543948093
18086	NC_022352	ATT	2	6	825326	825331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948094
18087	NC_022352	GCTTTT	2	12	825341	825352	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543948094
18088	NC_022352	TA	3	6	825366	825371	50 %	50 %	0 %	0 %	543948094
18089	NC_022352	TAA	2	6	825390	825395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948094
18090	NC_022352	A	6	6	825405	825410	100 %	0 %	0 %	0 %	543948094
18091	NC_022352	A	6	6	825485	825490	100 %	0 %	0 %	0 %	543948094
18092	NC_022352	AAC	2	6	825569	825574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948094
18093	NC_022352	TGC	2	6	825673	825678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948094
18094	NC_022352	ATA	3	9	825720	825728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948094
18095	NC_022352	ATTTTG	2	12	825744	825755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543948094
18096	NC_022352	A	7	7	825760	825766	100 %	0 %	0 %	0 %	543948094
18097	NC_022352	A	8	8	825769	825776	100 %	0 %	0 %	0 %	543948094
18098	NC_022352	TAT	2	6	825777	825782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948095
18099	NC_022352	TATAGT	2	12	825789	825800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543948095
18100	NC_022352	ATT	2	6	825805	825810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948095
18101	NC_022352	T	6	6	825823	825828	0 %	100 %	0 %	0 %	543948095
18102	NC_022352	ATC	2	6	825836	825841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948095
18103	NC_022352	ACC	2	6	825886	825891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543948095
18104	NC_022352	TTA	2	6	825917	825922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948095
18105	NC_022352	TTAGT	2	10	825968	825977	20 %	60 %	20 %	0 %	543948095
18106	NC_022352	AAT	2	6	826000	826005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948095
18107	NC_022352	CTT	2	6	826018	826023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948095
18108	NC_022352	ATA	2	6	826049	826054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948095
18109	NC_022352	A	6	6	826124	826129	100 %	0 %	0 %	0 %	543948095
18110	NC_022352	A	6	6	826136	826141	100 %	0 %	0 %	0 %	543948095
18111	NC_022352	AACAA	2	10	826143	826152	80 %	0 %	0 %	20 %	543948095
18112	NC_022352	A	6	6	826169	826174	100 %	0 %	0 %	0 %	543948095
18113	NC_022352	TGA	2	6	826236	826241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948095
18114	NC_022352	AAT	2	6	826322	826327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948095
18115	NC_022352	TACC	2	8	826455	826462	25 %	25 %	0 %	50 %	543948096
18116	NC_022352	TTAC	2	8	826511	826518	25 %	50 %	0 %	25 %	543948096
18117	NC_022352	CTT	2	6	826539	826544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948096
18118	NC_022352	CAA	2	6	826644	826649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948096
18119	NC_022352	TAA	2	6	826843	826848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948096
18120	NC_022352	TCT	2	6	826936	826941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948096
18121	NC_022352	GTA	2	6	827048	827053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948096
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18123	NC_022352	GCT	2	6	827102	827107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948096
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18250	NC_022352	GA	3	6	832569	832574	50 %	0 %	50 %	0 %	543948102
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18490	NC_022352	CTT	2	6	843107	843112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948115
18491	NC_022352	TCT	2	6	843115	843120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948115
18492	NC_022352	TAT	2	6	843131	843136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948115
18493	NC_022352	T	8	8	843232	843239	0 %	100 %	0 %	0 %	543948115
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