MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 35659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022352	A	6	6	46137	46142	100 %	0 %	0 %	0 %	543947261
1002	NC_022352	AGCA	2	8	46180	46187	50 %	0 %	25 %	25 %	543947261
1003	NC_022352	ATA	2	6	46265	46270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947261
1004	NC_022352	A	6	6	46378	46383	100 %	0 %	0 %	0 %	543947261
1005	NC_022352	AGA	2	6	46390	46395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947261
1006	NC_022352	ACA	2	6	46410	46415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947261
1007	NC_022352	TAA	2	6	46438	46443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947261
1008	NC_022352	AAATT	2	10	46451	46460	60 %	40 %	0 %	0 %	543947261
1009	NC_022352	A	6	6	46719	46724	100 %	0 %	0 %	0 %	543947261
1010	NC_022352	A	6	6	46732	46737	100 %	0 %	0 %	0 %	543947261
1011	NC_022352	ATC	2	6	46782	46787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947262
1012	NC_022352	AGT	2	6	46797	46802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947262
1013	NC_022352	TAG	2	6	46809	46814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947262
1014	NC_022352	T	6	6	46889	46894	0 %	100 %	0 %	0 %	543947262
1015	NC_022352	CTT	2	6	46962	46967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947262
1016	NC_022352	ATC	2	6	47023	47028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947262
1017	NC_022352	TCT	2	6	47216	47221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947262
1018	NC_022352	TGA	2	6	47247	47252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947262
1019	NC_022352	TTC	2	6	47275	47280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947262
1020	NC_022352	TTG	2	6	47297	47302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947262
1021	NC_022352	CTT	2	6	47349	47354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947262
1022	NC_022352	TACACT	2	12	47371	47382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947262
1023	NC_022352	ATT	2	6	47473	47478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947262
1024	NC_022352	T	6	6	47487	47492	0 %	100 %	0 %	0 %	543947262
1025	NC_022352	AT	3	6	47514	47519	50 %	50 %	0 %	0 %	543947263
1026	NC_022352	CA	3	6	47543	47548	50 %	0 %	0 %	50 %	543947263
1027	NC_022352	A	6	6	47769	47774	100 %	0 %	0 %	0 %	543947263
1028	NC_022352	ATC	2	6	47812	47817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947263
1029	NC_022352	T	6	6	47834	47839	0 %	100 %	0 %	0 %	543947263
1030	NC_022352	GAC	2	6	47883	47888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947263
1031	NC_022352	AGCAA	2	10	47914	47923	60 %	0 %	20 %	20 %	543947263
1032	NC_022352	A	6	6	47943	47948	100 %	0 %	0 %	0 %	543947263
1033	NC_022352	CGC	2	6	47991	47996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543947263
1034	NC_022352	AAG	2	6	48005	48010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947263
1035	NC_022352	TA	3	6	48018	48023	50 %	50 %	0 %	0 %	543947263
1036	NC_022352	ATG	2	6	48075	48080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947263
1037	NC_022352	T	6	6	48087	48092	0 %	100 %	0 %	0 %	543947263
1038	NC_022352	ATC	2	6	48133	48138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947263
1039	NC_022352	A	7	7	48139	48145	100 %	0 %	0 %	0 %	543947263
1040	NC_022352	CAAA	2	8	48161	48168	75 %	0 %	0 %	25 %	543947263
1041	NC_022352	CAT	2	6	48255	48260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947263
1042	NC_022352	CTT	2	6	48281	48286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947263
1043	NC_022352	A	6	6	48354	48359	100 %	0 %	0 %	0 %	543947263
1044	NC_022352	ATC	2	6	48384	48389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947263
1045	NC_022352	CA	3	6	48396	48401	50 %	0 %	0 %	50 %	543947263
1046	NC_022352	AAAC	2	8	48402	48409	75 %	0 %	0 %	25 %	543947263
1047	NC_022352	GAA	2	6	48420	48425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947263
1048	NC_022352	AT	3	6	48480	48485	50 %	50 %	0 %	0 %	543947263
1049	NC_022352	A	7	7	48510	48516	100 %	0 %	0 %	0 %	543947263
1050	NC_022352	A	6	6	48538	48543	100 %	0 %	0 %	0 %	543947263
1051	NC_022352	GT	3	6	48673	48678	0 %	50 %	50 %	0 %	543947263
1052	NC_022352	CAAAT	2	10	48813	48822	60 %	20 %	0 %	20 %	543947264
1053	NC_022352	CAAG	2	8	48887	48894	50 %	0 %	25 %	25 %	543947264
1054	NC_022352	A	8	8	48907	48914	100 %	0 %	0 %	0 %	543947264
1055	NC_022352	TGA	3	9	48920	48928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947264
1056	NC_022352	CTT	2	6	49029	49034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947264
1057	NC_022352	CA	3	6	49067	49072	50 %	0 %	0 %	50 %	543947264
1058	NC_022352	ATGAAA	2	12	49120	49131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947264
1059	NC_022352	AAG	2	6	49144	49149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
1060	NC_022352	A	7	7	49158	49164	100 %	0 %	0 %	0 %	543947264
1061	NC_022352	AG	3	6	49218	49223	50 %	0 %	50 %	0 %	543947264
1062	NC_022352	GAA	2	6	49236	49241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
1063	NC_022352	AGA	2	6	49262	49267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
1064	NC_022352	A	6	6	49321	49326	100 %	0 %	0 %	0 %	543947264
1065	NC_022352	A	6	6	49342	49347	100 %	0 %	0 %	0 %	543947264
1066	NC_022352	AGA	2	6	49415	49420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
1067	NC_022352	AGC	2	6	49466	49471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947264
1068	NC_022352	ACT	2	6	49475	49480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947264
1069	NC_022352	AGA	2	6	49484	49489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
1070	NC_022352	ATAC	2	8	49490	49497	50 %	25 %	0 %	25 %	543947264
1071	NC_022352	AAG	2	6	49525	49530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
1072	NC_022352	TAA	2	6	49634	49639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947264
1073	NC_022352	TAAACT	2	12	49652	49663	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543947264
1074	NC_022352	A	6	6	49729	49734	100 %	0 %	0 %	0 %	543947264
1075	NC_022352	AAG	2	6	49744	49749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
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1077	NC_022352	AGA	2	6	49943	49948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
1078	NC_022352	A	6	6	49960	49965	100 %	0 %	0 %	0 %	543947264
1079	NC_022352	AT	3	6	49978	49983	50 %	50 %	0 %	0 %	543947264
1080	NC_022352	A	7	7	49986	49992	100 %	0 %	0 %	0 %	543947264
1081	NC_022352	GAA	2	6	50091	50096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947264
1082	NC_022352	TGT	2	6	50238	50243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947265
1083	NC_022352	ATG	2	6	50269	50274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947265
1084	NC_022352	GCT	2	6	50358	50363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947265
1085	NC_022352	CCA	2	6	50469	50474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947265
1086	NC_022352	GATA	2	8	50479	50486	50 %	25 %	25 %	0 %	543947265
1087	NC_022352	TTGT	2	8	50516	50523	0 %	75 %	25 %	0 %	543947265
1088	NC_022352	T	6	6	50532	50537	0 %	100 %	0 %	0 %	543947265
1089	NC_022352	GCAA	2	8	50561	50568	50 %	0 %	25 %	25 %	543947265
1090	NC_022352	TTC	2	6	50576	50581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947265
1091	NC_022352	T	7	7	50588	50594	0 %	100 %	0 %	0 %	543947265
1092	NC_022352	A	7	7	50639	50645	100 %	0 %	0 %	0 %	543947265
1093	NC_022352	CTT	2	6	50683	50688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947265
1094	NC_022352	GAT	2	6	50792	50797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947265
1095	NC_022352	T	7	7	50861	50867	0 %	100 %	0 %	0 %	543947265
1096	NC_022352	T	6	6	50934	50939	0 %	100 %	0 %	0 %	543947265
1097	NC_022352	ATT	2	6	51029	51034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947265
1098	NC_022352	TACTC	2	10	51093	51102	20 %	40 %	0 %	40 %	543947265
1099	NC_022352	TTC	2	6	51119	51124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947265
1100	NC_022352	TCAC	2	8	51138	51145	25 %	25 %	0 %	50 %	543947265
1101	NC_022352	T	6	6	51197	51202	0 %	100 %	0 %	0 %	543947265
1102	NC_022352	ATT	2	6	51382	51387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947266
1103	NC_022352	GTTT	2	8	51394	51401	0 %	75 %	25 %	0 %	543947266
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1105	NC_022352	TCT	2	6	51420	51425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947266
1106	NC_022352	T	7	7	51452	51458	0 %	100 %	0 %	0 %	543947266
1107	NC_022352	AAAG	2	8	51467	51474	75 %	0 %	25 %	0 %	543947266
1108	NC_022352	GATAA	2	10	51491	51500	60 %	20 %	20 %	0 %	543947266
1109	NC_022352	TTTG	2	8	51590	51597	0 %	75 %	25 %	0 %	543947266
1110	NC_022352	A	7	7	51625	51631	100 %	0 %	0 %	0 %	543947266
1111	NC_022352	GTTT	2	8	51634	51641	0 %	75 %	25 %	0 %	543947266
1112	NC_022352	ACG	2	6	51785	51790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947266
1113	NC_022352	AGTTTT	2	12	51834	51845	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947266
1114	NC_022352	T	6	6	51842	51847	0 %	100 %	0 %	0 %	543947266
1115	NC_022352	GAAA	2	8	51859	51866	75 %	0 %	25 %	0 %	543947266
1116	NC_022352	A	7	7	51864	51870	100 %	0 %	0 %	0 %	543947266
1117	NC_022352	A	6	6	51930	51935	100 %	0 %	0 %	0 %	543947266
1118	NC_022352	TA	3	6	51992	51997	50 %	50 %	0 %	0 %	543947266
1119	NC_022352	TAT	2	6	52003	52008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947266
1120	NC_022352	TTCTTT	2	12	52050	52061	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543947267
1121	NC_022352	TCT	3	9	52124	52132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947267
1122	NC_022352	CAT	2	6	52188	52193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947267
1123	NC_022352	ATT	2	6	52393	52398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947267
1124	NC_022352	ACCGC	2	10	52409	52418	20 %	0 %	20 %	60 %	543947267
1125	NC_022352	TCA	2	6	52449	52454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947267
1126	NC_022352	CGCCTT	2	12	52455	52466	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543947267
1127	NC_022352	TTGT	2	8	52533	52540	0 %	75 %	25 %	0 %	543947267
1128	NC_022352	CTTTT	2	10	52575	52584	0 %	80 %	0 %	20 %	543947267
1129	NC_022352	ACCGC	2	10	52601	52610	20 %	0 %	20 %	60 %	543947267
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1495	NC_022352	CTTT	2	8	69711	69718	0 %	75 %	0 %	25 %	543947285
1496	NC_022352	ACC	2	6	69809	69814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947285
1497	NC_022352	GATT	2	8	69850	69857	25 %	50 %	25 %	0 %	543947285
1498	NC_022352	A	6	6	69892	69897	100 %	0 %	0 %	0 %	543947285
1499	NC_022352	TTG	2	6	69907	69912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947285
1500	NC_022352	TGAA	2	8	69959	69966	50 %	25 %	25 %	0 %	543947285

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