MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 35659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022352	AC	3	6	251881	251886	50 %	0 %	0 %	50 %	543947493
5502	NC_022352	T	6	6	251917	251922	0 %	100 %	0 %	0 %	543947493
5503	NC_022352	CAT	2	6	251958	251963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947493
5504	NC_022352	CCA	2	6	251968	251973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947493
5505	NC_022352	ATG	2	6	252000	252005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947493
5506	NC_022352	ACC	2	6	252072	252077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947493
5507	NC_022352	T	6	6	252174	252179	0 %	100 %	0 %	0 %	543947493
5508	NC_022352	A	6	6	252226	252231	100 %	0 %	0 %	0 %	543947493
5509	NC_022352	CCAT	2	8	252319	252326	25 %	25 %	0 %	50 %	543947493
5510	NC_022352	GGT	2	6	252471	252476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947494
5511	NC_022352	TTCTGT	2	12	252484	252495	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543947494
5512	NC_022352	ATCT	2	8	252517	252524	25 %	50 %	0 %	25 %	543947494
5513	NC_022352	TCC	2	6	252542	252547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543947494
5514	NC_022352	AT	3	6	252582	252587	50 %	50 %	0 %	0 %	543947494
5515	NC_022352	TGA	2	6	252727	252732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947494
5516	NC_022352	CAA	2	6	252787	252792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947494
5517	NC_022352	GAT	2	6	252797	252802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947494
5518	NC_022352	ATC	2	6	252803	252808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947494
5519	NC_022352	T	6	6	252907	252912	0 %	100 %	0 %	0 %	543947495
5520	NC_022352	AT	3	6	252955	252960	50 %	50 %	0 %	0 %	543947495
5521	NC_022352	ATCC	2	8	253079	253086	25 %	25 %	0 %	50 %	543947495
5522	NC_022352	TTG	2	6	253169	253174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947495
5523	NC_022352	AACT	2	8	253184	253191	50 %	25 %	0 %	25 %	543947495
5524	NC_022352	ATC	2	6	253239	253244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947495
5525	NC_022352	GTT	2	6	253271	253276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947495
5526	NC_022352	T	6	6	253284	253289	0 %	100 %	0 %	0 %	543947495
5527	NC_022352	CAT	2	6	253344	253349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947495
5528	NC_022352	CAC	2	6	253385	253390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947495
5529	NC_022352	AAT	2	6	253427	253432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947495
5530	NC_022352	TAA	2	6	253445	253450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947495
5531	NC_022352	TCT	2	6	253456	253461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947495
5532	NC_022352	CTA	2	6	253478	253483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947495
5533	NC_022352	GCTT	2	8	253493	253500	0 %	50 %	25 %	25 %	543947495
5534	NC_022352	AAC	2	6	253515	253520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947495
5535	NC_022352	ATC	2	6	253641	253646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947495
5536	NC_022352	TCAATT	2	12	253789	253800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543947495
5537	NC_022352	AAC	2	6	253830	253835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947495
5538	NC_022352	CTT	2	6	253916	253921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947495
5539	NC_022352	TGTC	2	8	253922	253929	0 %	50 %	25 %	25 %	543947495
5540	NC_022352	GCTTTT	2	12	253972	253983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543947495
5541	NC_022352	TTC	2	6	254196	254201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947495
5542	NC_022352	AAC	2	6	254253	254258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947495
5543	NC_022352	TAA	2	6	254333	254338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947495
5544	NC_022352	TTC	2	6	254367	254372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947495
5545	NC_022352	CAT	2	6	254405	254410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947495
5546	NC_022352	TAC	2	6	254522	254527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947495
5547	NC_022352	T	6	6	254541	254546	0 %	100 %	0 %	0 %	543947495
5548	NC_022352	TGT	2	6	254604	254609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947495
5549	NC_022352	CGA	2	6	254626	254631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947495
5550	NC_022352	AGC	2	6	254727	254732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947495
5551	NC_022352	TGA	2	6	255042	255047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947495
5552	NC_022352	TAA	2	6	255084	255089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947495
5553	NC_022352	TCT	2	6	255097	255102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947495
5554	NC_022352	CTA	2	6	255119	255124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947495
5555	NC_022352	CAA	2	6	255143	255148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947495
5556	NC_022352	T	6	6	255228	255233	0 %	100 %	0 %	0 %	543947496
5557	NC_022352	GAA	2	6	255255	255260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947496
5558	NC_022352	CCA	2	6	255295	255300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947496
5559	NC_022352	CTT	2	6	255302	255307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947496
5560	NC_022352	TCAT	2	8	255319	255326	25 %	50 %	0 %	25 %	543947496
5561	NC_022352	TCT	2	6	255382	255387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947496
5562	NC_022352	GCA	2	6	255397	255402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947496
5563	NC_022352	CCAT	2	8	255412	255419	25 %	25 %	0 %	50 %	543947496
5564	NC_022352	TTC	2	6	255492	255497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947496
5565	NC_022352	CAA	2	6	255533	255538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947496
5566	NC_022352	CAT	2	6	255558	255563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947496
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5568	NC_022352	CAA	2	6	255680	255685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947496
5569	NC_022352	TCA	2	6	255715	255720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947496
5570	NC_022352	TAA	3	9	255872	255880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947496
5571	NC_022352	CCTTA	2	10	256035	256044	20 %	40 %	0 %	40 %	543947496
5572	NC_022352	CATTT	2	10	256119	256128	20 %	60 %	0 %	20 %	543947496
5573	NC_022352	TCA	2	6	256150	256155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947496
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5577	NC_022352	TTGAT	2	10	256274	256283	20 %	60 %	20 %	0 %	543947497
5578	NC_022352	TGA	2	6	256289	256294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947497
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5580	NC_022352	A	6	6	256380	256385	100 %	0 %	0 %	0 %	543947497
5581	NC_022352	T	8	8	256388	256395	0 %	100 %	0 %	0 %	543947497
5582	NC_022352	TTTTGA	2	12	256397	256408	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947497
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5587	NC_022352	A	7	7	256517	256523	100 %	0 %	0 %	0 %	543947497
5588	NC_022352	ATT	2	6	256552	256557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947497
5589	NC_022352	ATT	2	6	256567	256572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947497
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5591	NC_022352	A	7	7	256639	256645	100 %	0 %	0 %	0 %	543947497
5592	NC_022352	AAGA	2	8	256647	256654	75 %	0 %	25 %	0 %	543947497
5593	NC_022352	TTC	2	6	256705	256710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947497
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5596	NC_022352	T	7	7	257008	257014	0 %	100 %	0 %	0 %	543947498
5597	NC_022352	CTA	2	6	257085	257090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947498
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5599	NC_022352	GATC	2	8	257178	257185	25 %	25 %	25 %	25 %	543947498
5600	NC_022352	GCTT	2	8	257240	257247	0 %	50 %	25 %	25 %	543947498
5601	NC_022352	GCA	2	6	257255	257260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947498
5602	NC_022352	TTTC	2	8	257274	257281	0 %	75 %	0 %	25 %	543947498
5603	NC_022352	CTT	2	6	257294	257299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947498
5604	NC_022352	A	6	6	257479	257484	100 %	0 %	0 %	0 %	543947499
5605	NC_022352	A	6	6	257496	257501	100 %	0 %	0 %	0 %	543947499
5606	NC_022352	CTT	2	6	257582	257587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947499
5607	NC_022352	A	6	6	257603	257608	100 %	0 %	0 %	0 %	543947499
5608	NC_022352	GCT	2	6	257710	257715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947499
5609	NC_022352	T	6	6	257757	257762	0 %	100 %	0 %	0 %	543947499
5610	NC_022352	T	7	7	257855	257861	0 %	100 %	0 %	0 %	543947499
5611	NC_022352	T	6	6	257948	257953	0 %	100 %	0 %	0 %	543947499
5612	NC_022352	CAT	2	6	257954	257959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947499
5613	NC_022352	T	7	7	257961	257967	0 %	100 %	0 %	0 %	543947499
5614	NC_022352	TCT	2	6	257986	257991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947499
5615	NC_022352	TA	3	6	258033	258038	50 %	50 %	0 %	0 %	543947499
5616	NC_022352	A	6	6	258051	258056	100 %	0 %	0 %	0 %	543947499
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5620	NC_022352	T	7	7	258183	258189	0 %	100 %	0 %	0 %	543947499
5621	NC_022352	ATTT	2	8	258243	258250	25 %	75 %	0 %	0 %	543947499
5622	NC_022352	T	6	6	258248	258253	0 %	100 %	0 %	0 %	543947499
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