MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 35659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_022352	GAA	2	6	225891	225896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947467
5003	NC_022352	AGA	2	6	225932	225937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947467
5004	NC_022352	A	7	7	225956	225962	100 %	0 %	0 %	0 %	543947467
5005	NC_022352	AG	3	6	226068	226073	50 %	0 %	50 %	0 %	543947467
5006	NC_022352	A	6	6	226183	226188	100 %	0 %	0 %	0 %	543947467
5007	NC_022352	A	6	6	226221	226226	100 %	0 %	0 %	0 %	543947467
5008	NC_022352	A	7	7	226262	226268	100 %	0 %	0 %	0 %	543947467
5009	NC_022352	A	6	6	226275	226280	100 %	0 %	0 %	0 %	543947467
5010	NC_022352	ATC	2	6	226350	226355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947468
5011	NC_022352	TGAAA	2	10	226395	226404	60 %	20 %	20 %	0 %	543947468
5012	NC_022352	A	6	6	226402	226407	100 %	0 %	0 %	0 %	543947468
5013	NC_022352	AATC	2	8	226409	226416	50 %	25 %	0 %	25 %	543947468
5014	NC_022352	TTTC	2	8	226429	226436	0 %	75 %	0 %	25 %	543947468
5015	NC_022352	CCA	2	6	226458	226463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947468
5016	NC_022352	ATC	2	6	226530	226535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947468
5017	NC_022352	A	6	6	226558	226563	100 %	0 %	0 %	0 %	543947468
5018	NC_022352	ATCC	2	8	226649	226656	25 %	25 %	0 %	50 %	543947468
5019	NC_022352	A	6	6	226681	226686	100 %	0 %	0 %	0 %	543947468
5020	NC_022352	CTT	2	6	226796	226801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947468
5021	NC_022352	CAT	2	6	226802	226807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947468
5022	NC_022352	A	6	6	226809	226814	100 %	0 %	0 %	0 %	543947468
5023	NC_022352	T	7	7	226821	226827	0 %	100 %	0 %	0 %	543947468
5024	NC_022352	T	7	7	226922	226928	0 %	100 %	0 %	0 %	543947468
5025	NC_022352	AGT	2	6	227050	227055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947468
5026	NC_022352	ATT	2	6	227059	227064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947468
5027	NC_022352	T	7	7	227207	227213	0 %	100 %	0 %	0 %	543947469
5028	NC_022352	TGA	2	6	227221	227226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947469
5029	NC_022352	TTG	2	6	227232	227237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947469
5030	NC_022352	ATTT	2	8	227245	227252	25 %	75 %	0 %	0 %	543947469
5031	NC_022352	A	7	7	227266	227272	100 %	0 %	0 %	0 %	543947469
5032	NC_022352	T	6	6	227358	227363	0 %	100 %	0 %	0 %	543947469
5033	NC_022352	T	7	7	227370	227376	0 %	100 %	0 %	0 %	543947469
5034	NC_022352	TAT	2	6	227380	227385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947469
5035	NC_022352	ATC	2	6	227393	227398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947469
5036	NC_022352	T	6	6	227399	227404	0 %	100 %	0 %	0 %	543947469
5037	NC_022352	TTA	2	6	227416	227421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947469
5038	NC_022352	ATG	2	6	227451	227456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947469
5039	NC_022352	TGT	2	6	227462	227467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947469
5040	NC_022352	AAG	2	6	227482	227487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947469
5041	NC_022352	TGT	2	6	227522	227527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947469
5042	NC_022352	TAT	2	6	227536	227541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947469
5043	NC_022352	T	6	6	227545	227550	0 %	100 %	0 %	0 %	543947469
5044	NC_022352	TGT	2	6	227552	227557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947469
5045	NC_022352	ATT	2	6	227572	227577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947469
5046	NC_022352	AATAT	2	10	227616	227625	60 %	40 %	0 %	0 %	543947469
5047	NC_022352	TTG	2	6	227635	227640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947469
5048	NC_022352	T	7	7	227681	227687	0 %	100 %	0 %	0 %	543947469
5049	NC_022352	TAT	2	6	227751	227756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947469
5050	NC_022352	ATG	2	6	227800	227805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947469
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5052	NC_022352	TTTTGG	2	12	227836	227847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947469
5053	NC_022352	TGG	3	9	227845	227853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947469
5054	NC_022352	A	6	6	227922	227927	100 %	0 %	0 %	0 %	543947469
5055	NC_022352	T	6	6	227940	227945	0 %	100 %	0 %	0 %	543947469
5056	NC_022352	TCA	2	6	227955	227960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947469
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5058	NC_022352	TTTCTA	2	12	227998	228009	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947469
5059	NC_022352	ATT	2	6	228019	228024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947469
5060	NC_022352	GATG	2	8	228050	228057	25 %	25 %	50 %	0 %	543947469
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5062	NC_022352	TGG	2	6	228104	228109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947469
5063	NC_022352	ATA	2	6	228222	228227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947469
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5067	NC_022352	ATA	2	6	228361	228366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947469
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5072	NC_022352	TTTA	2	8	228772	228779	25 %	75 %	0 %	0 %	543947470
5073	NC_022352	AAATG	2	10	228781	228790	60 %	20 %	20 %	0 %	543947470
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5077	NC_022352	TTGAT	2	10	228939	228948	20 %	60 %	20 %	0 %	543947470
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5079	NC_022352	TTTG	2	8	229031	229038	0 %	75 %	25 %	0 %	543947470
5080	NC_022352	TTTAT	2	10	229043	229052	20 %	80 %	0 %	0 %	543947470
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5083	NC_022352	TAT	2	6	229158	229163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947471
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5088	NC_022352	TGCATT	2	12	229326	229337	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947472
5089	NC_022352	AGA	2	6	229438	229443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
5090	NC_022352	T	8	8	229512	229519	0 %	100 %	0 %	0 %	543947472
5091	NC_022352	ATG	2	6	229527	229532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947472
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5094	NC_022352	TGG	2	6	229609	229614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947472
5095	NC_022352	CAT	2	6	229862	229867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947472
5096	NC_022352	ATC	2	6	229871	229876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947472
5097	NC_022352	GAT	2	6	229883	229888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947472
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5099	NC_022352	AAG	2	6	229953	229958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
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5102	NC_022352	ATA	2	6	230151	230156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947472
5103	NC_022352	AGA	2	6	230185	230190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
5104	NC_022352	AGA	2	6	230206	230211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947472
5105	NC_022352	TTTA	2	8	230339	230346	25 %	75 %	0 %	0 %	543947473
5106	NC_022352	AGAT	2	8	230373	230380	50 %	25 %	25 %	0 %	543947473
5107	NC_022352	A	8	8	230384	230391	100 %	0 %	0 %	0 %	543947473
5108	NC_022352	CAT	2	6	230457	230462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947473
5109	NC_022352	AAAGC	2	10	230474	230483	60 %	0 %	20 %	20 %	543947473
5110	NC_022352	ACA	2	6	230485	230490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947473
5111	NC_022352	TGA	2	6	230534	230539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947473
5112	NC_022352	TTAT	2	8	230618	230625	25 %	75 %	0 %	0 %	543947474
5113	NC_022352	TTTTA	2	10	230635	230644	20 %	80 %	0 %	0 %	543947474
5114	NC_022352	ATT	2	6	230665	230670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947474
5115	NC_022352	CTT	2	6	230751	230756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947474
5116	NC_022352	TCA	2	6	230780	230785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947474
5117	NC_022352	A	6	6	230800	230805	100 %	0 %	0 %	0 %	543947474
5118	NC_022352	T	7	7	230810	230816	0 %	100 %	0 %	0 %	543947474
5119	NC_022352	AAT	2	6	230823	230828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947474
5120	NC_022352	T	6	6	230839	230844	0 %	100 %	0 %	0 %	543947474
5121	NC_022352	A	6	6	230891	230896	100 %	0 %	0 %	0 %	543947474
5122	NC_022352	CCAA	2	8	230917	230924	50 %	0 %	0 %	50 %	543947474
5123	NC_022352	T	6	6	231088	231093	0 %	100 %	0 %	0 %	543947474
5124	NC_022352	TCT	2	6	231098	231103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947474
5125	NC_022352	AGCAT	2	10	231116	231125	40 %	20 %	20 %	20 %	543947474
5126	NC_022352	CTT	2	6	231156	231161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947474
5127	NC_022352	GTTT	2	8	231257	231264	0 %	75 %	25 %	0 %	543947474
5128	NC_022352	TAC	2	6	233043	233048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947475
5129	NC_022352	T	7	7	233096	233102	0 %	100 %	0 %	0 %	543947475
5130	NC_022352	GAT	2	6	233111	233116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947475
5131	NC_022352	CTTT	2	8	233126	233133	0 %	75 %	0 %	25 %	543947475
5132	NC_022352	AT	4	8	233162	233169	50 %	50 %	0 %	0 %	543947475
5133	NC_022352	T	7	7	233257	233263	0 %	100 %	0 %	0 %	543947475
5134	NC_022352	ATTG	2	8	233284	233291	25 %	50 %	25 %	0 %	543947475
5135	NC_022352	AGA	2	6	233332	233337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947475
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5137	NC_022352	GCTATA	2	12	233540	233551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947475
5138	NC_022352	A	6	6	233624	233629	100 %	0 %	0 %	0 %	543947475
5139	NC_022352	TATT	2	8	233635	233642	25 %	75 %	0 %	0 %	543947475
5140	NC_022352	TTG	2	6	233679	233684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947475
5141	NC_022352	TGA	2	6	233773	233778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947475
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5147	NC_022352	T	7	7	234208	234214	0 %	100 %	0 %	0 %	543947476
5148	NC_022352	CT	3	6	234241	234246	0 %	50 %	0 %	50 %	543947476
5149	NC_022352	TG	3	6	234277	234282	0 %	50 %	50 %	0 %	543947476
5150	NC_022352	GTAA	2	8	234320	234327	50 %	25 %	25 %	0 %	543947476
5151	NC_022352	CTT	2	6	234339	234344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947476
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5154	NC_022352	TCT	2	6	234482	234487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947476
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5156	NC_022352	GTTT	2	8	234614	234621	0 %	75 %	25 %	0 %	543947476
5157	NC_022352	TGT	2	6	234630	234635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947476
5158	NC_022352	TGA	2	6	234645	234650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947476
5159	NC_022352	T	6	6	234661	234666	0 %	100 %	0 %	0 %	543947476
5160	NC_022352	ATC	2	6	234736	234741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947476
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5162	NC_022352	ATC	2	6	234820	234825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947476
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5164	NC_022352	TGA	2	6	234950	234955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947476
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5237	NC_022352	CTT	2	6	239012	239017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947480
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5249	NC_022352	AAATT	2	10	239524	239533	60 %	40 %	0 %	0 %	543947480
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5257	NC_022352	TAT	2	6	239748	239753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947481
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5360	NC_022352	GA	3	6	244863	244868	50 %	0 %	50 %	0 %	543947487
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5492	NC_022352	A	6	6	251493	251498	100 %	0 %	0 %	0 %	543947492
5493	NC_022352	GAG	2	6	251499	251504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543947492
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5496	NC_022352	T	9	9	251565	251573	0 %	100 %	0 %	0 %	543947492
5497	NC_022352	TTTAA	2	10	251576	251585	40 %	60 %	0 %	0 %	543947492
5498	NC_022352	ATA	2	6	251670	251675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947492
5499	NC_022352	A	6	6	251696	251701	100 %	0 %	0 %	0 %	543947492
5500	NC_022352	TAT	2	6	251754	251759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947493

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