MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022351	T	6	6	180230	180235	0 %	100 %	0 %	0 %	543945591
4002	NC_022351	TGA	2	6	180329	180334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945591
4003	NC_022351	ATA	2	6	180338	180343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945591
4004	NC_022351	GCAAA	2	10	180354	180363	60 %	0 %	20 %	20 %	543945591
4005	NC_022351	AGC	2	6	180409	180414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945591
4006	NC_022351	ACC	2	6	180493	180498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945591
4007	NC_022351	A	7	7	180548	180554	100 %	0 %	0 %	0 %	543945591
4008	NC_022351	TCA	2	6	180584	180589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945591
4009	NC_022351	CAC	2	6	180597	180602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945591
4010	NC_022351	ATA	2	6	180608	180613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945591
4011	NC_022351	CTT	2	6	180650	180655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945591
4012	NC_022351	CAC	2	6	180657	180662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945591
4013	NC_022351	ATT	2	6	180695	180700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945591
4014	NC_022351	TCT	2	6	180703	180708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945592
4015	NC_022351	T	6	6	180714	180719	0 %	100 %	0 %	0 %	543945592
4016	NC_022351	TTC	2	6	180774	180779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945592
4017	NC_022351	CAG	2	6	180797	180802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945592
4018	NC_022351	T	6	6	180816	180821	0 %	100 %	0 %	0 %	543945592
4019	NC_022351	AAAT	2	8	180871	180878	75 %	25 %	0 %	0 %	543945592
4020	NC_022351	TCA	2	6	180931	180936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945592
4021	NC_022351	AAGT	2	8	180944	180951	50 %	25 %	25 %	0 %	543945592
4022	NC_022351	T	6	6	180959	180964	0 %	100 %	0 %	0 %	543945592
4023	NC_022351	CTT	3	9	180968	180976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945592
4024	NC_022351	CGCA	2	8	181059	181066	25 %	0 %	25 %	50 %	543945592
4025	NC_022351	CTA	2	6	181088	181093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945592
4026	NC_022351	TCAA	2	8	181123	181130	50 %	25 %	0 %	25 %	543945592
4027	NC_022351	TCA	2	6	181156	181161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945592
4028	NC_022351	TCT	2	6	181237	181242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945592
4029	NC_022351	T	6	6	181254	181259	0 %	100 %	0 %	0 %	543945592
4030	NC_022351	TCA	3	9	181267	181275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945592
4031	NC_022351	TGCGC	2	10	181345	181354	0 %	20 %	40 %	40 %	543945592
4032	NC_022351	TTC	2	6	181389	181394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945592
4033	NC_022351	ACCAT	2	10	181411	181420	40 %	20 %	0 %	40 %	543945592
4034	NC_022351	ACC	2	6	181479	181484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945592
4035	NC_022351	ATC	2	6	181497	181502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945592
4036	NC_022351	CTT	2	6	181538	181543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945592
4037	NC_022351	T	6	6	181602	181607	0 %	100 %	0 %	0 %	543945592
4038	NC_022351	TCA	2	6	181609	181614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945592
4039	NC_022351	T	6	6	181620	181625	0 %	100 %	0 %	0 %	543945592
4040	NC_022351	ACTT	2	8	181626	181633	25 %	50 %	0 %	25 %	543945592
4041	NC_022351	AAAG	2	8	181693	181700	75 %	0 %	25 %	0 %	543945592
4042	NC_022351	AAT	2	6	181713	181718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945592
4043	NC_022351	T	6	6	181779	181784	0 %	100 %	0 %	0 %	543945592
4044	NC_022351	TGAG	2	8	181840	181847	25 %	25 %	50 %	0 %	543945592
4045	NC_022351	CT	3	6	181848	181853	0 %	50 %	0 %	50 %	543945592
4046	NC_022351	CCAT	2	8	181903	181910	25 %	25 %	0 %	50 %	543945592
4047	NC_022351	T	7	7	181929	181935	0 %	100 %	0 %	0 %	543945592
4048	NC_022351	A	8	8	182177	182184	100 %	0 %	0 %	0 %	543945593
4049	NC_022351	TTA	2	6	182246	182251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945593
4050	NC_022351	TAA	2	6	182349	182354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945593
4051	NC_022351	CAT	2	6	182401	182406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945593
4052	NC_022351	T	7	7	182415	182421	0 %	100 %	0 %	0 %	543945593
4053	NC_022351	TAA	2	6	182448	182453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945593
4054	NC_022351	A	6	6	182452	182457	100 %	0 %	0 %	0 %	543945593
4055	NC_022351	GTA	2	6	182458	182463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945593
4056	NC_022351	AAG	2	6	182502	182507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945593
4057	NC_022351	AAC	2	6	182522	182527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945593
4058	NC_022351	TG	3	6	182606	182611	0 %	50 %	50 %	0 %	543945593
4059	NC_022351	CCA	2	6	182642	182647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945593
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4061	NC_022351	A	6	6	182687	182692	100 %	0 %	0 %	0 %	543945593
4062	NC_022351	AG	3	6	182695	182700	50 %	0 %	50 %	0 %	543945593
4063	NC_022351	T	7	7	182704	182710	0 %	100 %	0 %	0 %	543945593
4064	NC_022351	GA	3	6	182803	182808	50 %	0 %	50 %	0 %	543945594
4065	NC_022351	AGTT	2	8	182875	182882	25 %	50 %	25 %	0 %	543945594
4066	NC_022351	AATGAA	2	12	182886	182897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945594
4067	NC_022351	GTA	2	6	183051	183056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945594
4068	NC_022351	AT	3	6	183107	183112	50 %	50 %	0 %	0 %	543945594
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4070	NC_022351	AGT	2	6	183305	183310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945594
4071	NC_022351	A	7	7	183355	183361	100 %	0 %	0 %	0 %	543945594
4072	NC_022351	GAT	2	6	183378	183383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945594
4073	NC_022351	ATT	2	6	183390	183395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945594
4074	NC_022351	TGA	2	6	183407	183412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945594
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4078	NC_022351	T	6	6	183660	183665	0 %	100 %	0 %	0 %	543945594
4079	NC_022351	TGA	2	6	183683	183688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945594
4080	NC_022351	TCC	2	6	183776	183781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945594
4081	NC_022351	TGA	2	6	183811	183816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945594
4082	NC_022351	TGA	2	6	183941	183946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945594
4083	NC_022351	A	6	6	183957	183962	100 %	0 %	0 %	0 %	543945594
4084	NC_022351	GAA	2	6	183996	184001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945594
4085	NC_022351	CCA	2	6	184065	184070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945594
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4087	NC_022351	CCTAAT	2	12	184110	184121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945594
4088	NC_022351	TAAAA	2	10	184123	184132	80 %	20 %	0 %	0 %	543945594
4089	NC_022351	TAA	2	6	184138	184143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945595
4090	NC_022351	AAT	2	6	184144	184149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945595
4091	NC_022351	A	6	6	184218	184223	100 %	0 %	0 %	0 %	543945595
4092	NC_022351	CTT	2	6	184255	184260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945595
4093	NC_022351	TTC	2	6	184286	184291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945595
4094	NC_022351	GCTC	2	8	184364	184371	0 %	25 %	25 %	50 %	543945595
4095	NC_022351	GCA	2	6	184374	184379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945595
4096	NC_022351	ATT	2	6	184392	184397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945595
4097	NC_022351	T	7	7	184396	184402	0 %	100 %	0 %	0 %	543945595
4098	NC_022351	AGT	2	6	184406	184411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945595
4099	NC_022351	ATC	2	6	184427	184432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945595
4100	NC_022351	TTC	2	6	184531	184536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945595
4101	NC_022351	T	6	6	184658	184663	0 %	100 %	0 %	0 %	543945595
4102	NC_022351	T	7	7	184681	184687	0 %	100 %	0 %	0 %	543945595
4103	NC_022351	CTA	2	6	184714	184719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945595
4104	NC_022351	AAAT	2	8	184737	184744	75 %	25 %	0 %	0 %	543945595
4105	NC_022351	A	6	6	184777	184782	100 %	0 %	0 %	0 %	543945595
4106	NC_022351	TA	3	6	184898	184903	50 %	50 %	0 %	0 %	543945595
4107	NC_022351	ACA	2	6	184959	184964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945595
4108	NC_022351	TGCT	2	8	184978	184985	0 %	50 %	25 %	25 %	543945595
4109	NC_022351	AAAAC	2	10	184986	184995	80 %	0 %	0 %	20 %	543945595
4110	NC_022351	ATCT	2	8	185032	185039	25 %	50 %	0 %	25 %	543945595
4111	NC_022351	CTT	2	6	185058	185063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945595
4112	NC_022351	ACA	2	6	185076	185081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945595
4113	NC_022351	CTT	2	6	185143	185148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945595
4114	NC_022351	GCT	2	6	185202	185207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945595
4115	NC_022351	CTG	2	6	185239	185244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945595
4116	NC_022351	CTT	2	6	185380	185385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945595
4117	NC_022351	ATA	2	6	185414	185419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945595
4118	NC_022351	T	6	6	185436	185441	0 %	100 %	0 %	0 %	543945595
4119	NC_022351	CA	3	6	185464	185469	50 %	0 %	0 %	50 %	543945595
4120	NC_022351	A	6	6	185482	185487	100 %	0 %	0 %	0 %	543945596
4121	NC_022351	ATTG	2	8	185490	185497	25 %	50 %	25 %	0 %	543945596
4122	NC_022351	CTT	2	6	185510	185515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945596
4123	NC_022351	CTA	2	6	185633	185638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945596
4124	NC_022351	TCA	2	6	185657	185662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945596
4125	NC_022351	CTT	2	6	185680	185685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945596
4126	NC_022351	CTTACT	2	12	185710	185721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543945596
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4130	NC_022351	TCACT	2	10	185921	185930	20 %	40 %	0 %	40 %	543945596
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4241	NC_022351	GGT	2	6	190818	190823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945602
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4245	NC_022351	A	6	6	191002	191007	100 %	0 %	0 %	0 %	543945602
4246	NC_022351	TAT	2	6	191084	191089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945602
4247	NC_022351	AAT	2	6	191123	191128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945602
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4249	NC_022351	TAT	2	6	191258	191263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945602
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4499	NC_022351	TGG	2	6	204179	204184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945619
4500	NC_022351	CCTA	2	8	204229	204236	25 %	25 %	0 %	50 %	543945620

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