MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022351	CAA	2	6	69973	69978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945469
1502	NC_022351	TCA	2	6	69985	69990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945469
1503	NC_022351	GTT	2	6	70054	70059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945469
1504	NC_022351	TTTC	2	8	70104	70111	0 %	75 %	0 %	25 %	543945469
1505	NC_022351	GT	3	6	70144	70149	0 %	50 %	50 %	0 %	543945469
1506	NC_022351	ATC	2	6	70157	70162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945469
1507	NC_022351	TCT	2	6	70188	70193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945469
1508	NC_022351	T	6	6	70234	70239	0 %	100 %	0 %	0 %	543945470
1509	NC_022351	AAG	2	6	70240	70245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945470
1510	NC_022351	T	6	6	70246	70251	0 %	100 %	0 %	0 %	543945470
1511	NC_022351	TTC	2	6	70315	70320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945470
1512	NC_022351	ATA	3	9	70321	70329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945470
1513	NC_022351	AAT	2	6	70336	70341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945470
1514	NC_022351	ATC	2	6	70363	70368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945470
1515	NC_022351	T	6	6	70383	70388	0 %	100 %	0 %	0 %	543945470
1516	NC_022351	TTC	2	6	70396	70401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945470
1517	NC_022351	T	6	6	70410	70415	0 %	100 %	0 %	0 %	543945470
1518	NC_022351	TCA	2	6	70451	70456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945470
1519	NC_022351	CTT	2	6	70494	70499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945470
1520	NC_022351	T	6	6	70503	70508	0 %	100 %	0 %	0 %	543945470
1521	NC_022351	T	6	6	70525	70530	0 %	100 %	0 %	0 %	543945470
1522	NC_022351	TCA	3	9	70541	70549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945470
1523	NC_022351	A	6	6	70568	70573	100 %	0 %	0 %	0 %	543945470
1524	NC_022351	TAA	2	6	70602	70607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945470
1525	NC_022351	ATT	2	6	70615	70620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945470
1526	NC_022351	TTC	2	6	70741	70746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945470
1527	NC_022351	TAA	2	6	70758	70763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945470
1528	NC_022351	CTTT	2	8	70860	70867	0 %	75 %	0 %	25 %	543945470
1529	NC_022351	GGC	2	6	70889	70894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543945470
1530	NC_022351	TCTT	2	8	70913	70920	0 %	75 %	0 %	25 %	543945470
1531	NC_022351	CTCTT	2	10	70940	70949	0 %	60 %	0 %	40 %	543945471
1532	NC_022351	TTTTC	2	10	70981	70990	0 %	80 %	0 %	20 %	543945471
1533	NC_022351	ATA	2	6	71010	71015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945471
1534	NC_022351	T	6	6	71026	71031	0 %	100 %	0 %	0 %	543945471
1535	NC_022351	TTA	2	6	71043	71048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945471
1536	NC_022351	ATA	2	6	71088	71093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945471
1537	NC_022351	TAA	2	6	71125	71130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945471
1538	NC_022351	TAA	2	6	71170	71175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945471
1539	NC_022351	A	6	6	71195	71200	100 %	0 %	0 %	0 %	543945471
1540	NC_022351	AAT	2	6	71273	71278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945472
1541	NC_022351	A	7	7	71285	71291	100 %	0 %	0 %	0 %	543945472
1542	NC_022351	TA	3	6	71341	71346	50 %	50 %	0 %	0 %	543945472
1543	NC_022351	TCA	2	6	71373	71378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945472
1544	NC_022351	TAAA	2	8	71401	71408	75 %	25 %	0 %	0 %	543945472
1545	NC_022351	T	7	7	71413	71419	0 %	100 %	0 %	0 %	543945472
1546	NC_022351	TAC	2	6	71422	71427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945472
1547	NC_022351	T	6	6	71504	71509	0 %	100 %	0 %	0 %	543945472
1548	NC_022351	TTCATT	2	12	71534	71545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543945472
1549	NC_022351	T	6	6	71544	71549	0 %	100 %	0 %	0 %	543945472
1550	NC_022351	ACA	2	6	71550	71555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945472
1551	NC_022351	GTT	2	6	71592	71597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945472
1552	NC_022351	TGC	2	6	71624	71629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945472
1553	NC_022351	TAC	2	6	71645	71650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945472
1554	NC_022351	TCA	2	6	71658	71663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945472
1555	NC_022351	A	6	6	71673	71678	100 %	0 %	0 %	0 %	543945472
1556	NC_022351	CCA	2	6	71691	71696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945472
1557	NC_022351	ATA	2	6	71715	71720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945472
1558	NC_022351	CTTG	2	8	71745	71752	0 %	50 %	25 %	25 %	543945472
1559	NC_022351	TC	3	6	71762	71767	0 %	50 %	0 %	50 %	543945472
1560	NC_022351	ATCTC	2	10	71796	71805	20 %	40 %	0 %	40 %	543945472
1561	NC_022351	T	7	7	71895	71901	0 %	100 %	0 %	0 %	543945472
1562	NC_022351	GCCAA	2	10	71934	71943	40 %	0 %	20 %	40 %	543945472
1563	NC_022351	ATT	2	6	71975	71980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945472
1564	NC_022351	T	6	6	72071	72076	0 %	100 %	0 %	0 %	543945472
1565	NC_022351	ATT	2	6	72126	72131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945472
1566	NC_022351	T	6	6	72130	72135	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1567	NC_022351	ATC	2	6	72195	72200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945473
1568	NC_022351	CTT	2	6	72206	72211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945473
1569	NC_022351	AG	3	6	72256	72261	50 %	0 %	50 %	0 %	543945473
1570	NC_022351	TCA	2	6	72286	72291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945473
1571	NC_022351	TAA	2	6	72299	72304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945473
1572	NC_022351	ATT	2	6	72495	72500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945473
1573	NC_022351	AAT	2	6	72546	72551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945473
1574	NC_022351	TCA	2	6	72560	72565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945473
1575	NC_022351	TAA	2	6	72620	72625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945473
1576	NC_022351	GTT	3	9	72682	72690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945473
1577	NC_022351	CTA	2	6	72710	72715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945473
1578	NC_022351	CAT	2	6	72717	72722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945473
1579	NC_022351	T	6	6	72725	72730	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1580	NC_022351	T	7	7	72732	72738	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1581	NC_022351	AGTG	2	8	72778	72785	25 %	25 %	50 %	0 %	543945473
1582	NC_022351	TTG	2	6	72808	72813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945473
1583	NC_022351	AGC	2	6	72822	72827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945473
1584	NC_022351	GAT	2	6	72866	72871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945473
1585	NC_022351	CTTT	2	8	72886	72893	0 %	75 %	0 %	25 %	543945473
1586	NC_022351	AGG	2	6	72921	72926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543945473
1587	NC_022351	T	6	6	72937	72942	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1588	NC_022351	CAT	2	6	72966	72971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945473
1589	NC_022351	AAG	2	6	72978	72983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945473
1590	NC_022351	TTG	2	6	73003	73008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945473
1591	NC_022351	T	7	7	73043	73049	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1592	NC_022351	GT	3	6	73085	73090	0 %	50 %	50 %	0 %	543945473
1593	NC_022351	ATC	2	6	73140	73145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945473
1594	NC_022351	TGA	2	6	73165	73170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945473
1595	NC_022351	TTTTG	2	10	73178	73187	0 %	80 %	20 %	0 %	543945473
1596	NC_022351	T	7	7	73205	73211	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1597	NC_022351	T	6	6	73225	73230	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1598	NC_022351	CATCTT	2	12	73280	73291	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543945473
1599	NC_022351	T	6	6	73313	73318	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1600	NC_022351	AG	3	6	73327	73332	50 %	0 %	50 %	0 %	543945473
1601	NC_022351	T	8	8	73355	73362	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1602	NC_022351	T	7	7	73383	73389	0 %	100 %	0 %	0 %	543945473
1603	NC_022351	TTC	2	6	73395	73400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945473
1604	NC_022351	TCT	2	6	73411	73416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945473
1605	NC_022351	TCT	2	6	73507	73512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945473
1606	NC_022351	GTAT	2	8	73555	73562	25 %	50 %	25 %	0 %	543945473
1607	NC_022351	ACTC	2	8	73611	73618	25 %	25 %	0 %	50 %	543945474
1608	NC_022351	CAC	2	6	73648	73653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945474
1609	NC_022351	AGTAA	2	10	73751	73760	60 %	20 %	20 %	0 %	543945474
1610	NC_022351	TGCA	2	8	73779	73786	25 %	25 %	25 %	25 %	543945474
1611	NC_022351	ATC	2	6	73893	73898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945474
1612	NC_022351	CAT	2	6	73899	73904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945474
1613	NC_022351	T	9	9	73928	73936	0 %	100 %	0 %	0 %	543945474
1614	NC_022351	A	7	7	74001	74007	100 %	0 %	0 %	0 %	543945474
1615	NC_022351	A	7	7	74010	74016	100 %	0 %	0 %	0 %	543945474
1616	NC_022351	T	6	6	74021	74026	0 %	100 %	0 %	0 %	543945474
1617	NC_022351	ATT	3	9	74056	74064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945474
1618	NC_022351	CTG	2	6	74314	74319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945475
1619	NC_022351	ATA	2	6	74325	74330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945475
1620	NC_022351	TGC	2	6	74426	74431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945475
1621	NC_022351	TTC	2	6	74453	74458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945475
1622	NC_022351	ATT	2	6	74529	74534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945475
1623	NC_022351	ATTT	2	8	74556	74563	25 %	75 %	0 %	0 %	543945475
1624	NC_022351	TAT	2	6	74573	74578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945475
1625	NC_022351	AAAT	2	8	74589	74596	75 %	25 %	0 %	0 %	543945475
1626	NC_022351	TGC	2	6	74641	74646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945475
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