MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_022351	AGCA	2	8	833733	833740	50 %	0 %	25 %	25 %	543946280
18003	NC_022351	TTGATT	2	12	833819	833830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543946281
18004	NC_022351	ACTT	2	8	833845	833852	25 %	50 %	0 %	25 %	543946281
18005	NC_022351	T	6	6	833863	833868	0 %	100 %	0 %	0 %	543946281
18006	NC_022351	TG	3	6	833906	833911	0 %	50 %	50 %	0 %	543946281
18007	NC_022351	TA	3	6	833912	833917	50 %	50 %	0 %	0 %	543946281
18008	NC_022351	GGT	2	6	833945	833950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543946281
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18010	NC_022351	T	6	6	833991	833996	0 %	100 %	0 %	0 %	543946281
18011	NC_022351	TAGCT	2	10	834001	834010	20 %	40 %	20 %	20 %	543946281
18012	NC_022351	TGGCT	2	10	834023	834032	0 %	40 %	40 %	20 %	543946281
18013	NC_022351	GATG	2	8	834101	834108	25 %	25 %	50 %	0 %	543946281
18014	NC_022351	ATTTA	2	10	834130	834139	40 %	60 %	0 %	0 %	543946281
18015	NC_022351	GGAT	2	8	834189	834196	25 %	25 %	50 %	0 %	543946281
18016	NC_022351	ATC	2	6	834225	834230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946281
18017	NC_022351	T	6	6	834248	834253	0 %	100 %	0 %	0 %	543946281
18018	NC_022351	TGGT	2	8	834295	834302	0 %	50 %	50 %	0 %	543946281
18019	NC_022351	TGT	2	6	834362	834367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946281
18020	NC_022351	TTG	2	6	834447	834452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946281
18021	NC_022351	TTTGGT	2	12	834454	834465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946281
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18023	NC_022351	TAG	2	6	834666	834671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946282
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18027	NC_022351	TAA	2	6	834814	834819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946282
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18029	NC_022351	TA	3	6	835369	835374	50 %	50 %	0 %	0 %	543946283
18030	NC_022351	T	6	6	835377	835382	0 %	100 %	0 %	0 %	543946283
18031	NC_022351	A	6	6	835404	835409	100 %	0 %	0 %	0 %	543946283
18032	NC_022351	ATT	2	6	835415	835420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946283
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18040	NC_022351	TAGG	2	8	835684	835691	25 %	25 %	50 %	0 %	543946283
18041	NC_022351	TGA	2	6	835899	835904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946284
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18046	NC_022351	TTA	2	6	836173	836178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946285
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18049	NC_022351	AATG	2	8	836333	836340	50 %	25 %	25 %	0 %	543946285
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18052	NC_022351	TAAA	2	8	836539	836546	75 %	25 %	0 %	0 %	543946285
18053	NC_022351	T	6	6	836561	836566	0 %	100 %	0 %	0 %	543946285
18054	NC_022351	TGT	2	6	836648	836653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946285
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18093	NC_022351	TAT	2	6	838953	838958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946289
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18104	NC_022351	T	6	6	839376	839381	0 %	100 %	0 %	0 %	543946290
18105	NC_022351	TTTTC	2	10	839418	839427	0 %	80 %	0 %	20 %	543946290
18106	NC_022351	CAAG	2	8	839449	839456	50 %	0 %	25 %	25 %	543946290
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18108	NC_022351	A	7	7	839529	839535	100 %	0 %	0 %	0 %	543946290
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18123	NC_022351	CTA	2	6	840207	840212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946291
18124	NC_022351	ATC	2	6	840331	840336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946291
18125	NC_022351	ATC	2	6	840353	840358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946291
18126	NC_022351	AAT	2	6	840385	840390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946291
18127	NC_022351	T	6	6	840492	840497	0 %	100 %	0 %	0 %	543946291
18128	NC_022351	GAT	2	6	840538	840543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946291
18129	NC_022351	AAG	2	6	840568	840573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946291
18130	NC_022351	TGCG	2	8	840607	840614	0 %	25 %	50 %	25 %	543946291
18131	NC_022351	TA	3	6	840667	840672	50 %	50 %	0 %	0 %	543946291
18132	NC_022351	TCT	2	6	840764	840769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946291
18133	NC_022351	AC	3	6	840831	840836	50 %	0 %	0 %	50 %	543946291
18134	NC_022351	TCTTAT	2	12	840883	840894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543946291
18135	NC_022351	CTT	2	6	840929	840934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946291
18136	NC_022351	TTCT	2	8	840948	840955	0 %	75 %	0 %	25 %	543946291
18137	NC_022351	TAA	2	6	840978	840983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946291
18138	NC_022351	CAAGTT	2	12	840993	841004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543946291
18139	NC_022351	CTT	3	9	841044	841052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946291
18140	NC_022351	TCT	2	6	841061	841066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946291
18141	NC_022351	T	7	7	841140	841146	0 %	100 %	0 %	0 %	543946291
18142	NC_022351	CCTT	2	8	841169	841176	0 %	50 %	0 %	50 %	543946291
18143	NC_022351	CTA	2	6	841281	841286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946291
18144	NC_022351	TTGC	2	8	841352	841359	0 %	50 %	25 %	25 %	543946291
18145	NC_022351	TAA	2	6	841392	841397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946291
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18150	NC_022351	CTT	2	6	841608	841613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946291
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18152	NC_022351	GCATC	2	10	841689	841698	20 %	20 %	20 %	40 %	543946291
18153	NC_022351	CTTG	2	8	841709	841716	0 %	50 %	25 %	25 %	543946291
18154	NC_022351	TAC	2	6	841734	841739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946291
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18157	NC_022351	TGC	2	6	841831	841836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946291
18158	NC_022351	TCAC	2	8	841844	841851	25 %	25 %	0 %	50 %	543946291
18159	NC_022351	ATC	2	6	841883	841888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946291
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18161	NC_022351	GTT	2	6	841952	841957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946291
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18163	NC_022351	TAAT	2	8	841995	842002	50 %	50 %	0 %	0 %	543946291
18164	NC_022351	TAA	2	6	842064	842069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946291
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18168	NC_022351	T	6	6	842174	842179	0 %	100 %	0 %	0 %	543946291
18169	NC_022351	ATT	2	6	842183	842188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946291
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18181	NC_022351	A	6	6	842804	842809	100 %	0 %	0 %	0 %	543946293
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18185	NC_022351	AAAAG	2	10	842966	842975	80 %	0 %	20 %	0 %	543946293
18186	NC_022351	ATAA	2	8	843021	843028	75 %	25 %	0 %	0 %	543946293
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18229	NC_022351	TATT	2	8	844852	844859	25 %	75 %	0 %	0 %	543946294
18230	NC_022351	CAT	2	6	844889	844894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946294
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18232	NC_022351	T	6	6	844905	844910	0 %	100 %	0 %	0 %	543946294
18233	NC_022351	T	7	7	844980	844986	0 %	100 %	0 %	0 %	543946294
18234	NC_022351	TC	3	6	844994	844999	0 %	50 %	0 %	50 %	543946294
18235	NC_022351	CTT	2	6	845036	845041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946294
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18237	NC_022351	A	6	6	845143	845148	100 %	0 %	0 %	0 %	543946294
18238	NC_022351	CTT	2	6	845171	845176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946294
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18240	NC_022351	TCA	2	6	845197	845202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946294
18241	NC_022351	TTG	2	6	845247	845252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946294
18242	NC_022351	CTT	2	6	845272	845277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946294
18243	NC_022351	T	6	6	845329	845334	0 %	100 %	0 %	0 %	543946294
18244	NC_022351	T	6	6	845430	845435	0 %	100 %	0 %	0 %	543946294
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18492	NC_022351	AAG	2	6	855083	855088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946301
18493	NC_022351	ACC	2	6	855117	855122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946301
18494	NC_022351	AAG	2	6	855143	855148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946301
18495	NC_022351	TCA	2	6	855205	855210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946301
18496	NC_022351	GATT	2	8	855263	855270	25 %	50 %	25 %	0 %	543946301
18497	NC_022351	TTA	2	6	855533	855538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946301
18498	NC_022351	CCT	2	6	855634	855639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543946301
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18500	NC_022351	TCT	2	6	855694	855699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946301

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