MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022351	A	6	6	204298	204303	100 %	0 %	0 %	0 %	543945620
4502	NC_022351	TAT	2	6	204415	204420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945620
4503	NC_022351	GCT	2	6	204433	204438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945620
4504	NC_022351	T	8	8	204479	204486	0 %	100 %	0 %	0 %	543945620
4505	NC_022351	TGAA	2	8	204719	204726	50 %	25 %	25 %	0 %	543945620
4506	NC_022351	A	6	6	204725	204730	100 %	0 %	0 %	0 %	543945620
4507	NC_022351	AT	3	6	204830	204835	50 %	50 %	0 %	0 %	543945620
4508	NC_022351	TGA	2	6	204846	204851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945620
4509	NC_022351	T	6	6	204883	204888	0 %	100 %	0 %	0 %	543945620
4510	NC_022351	GCAC	2	8	204897	204904	25 %	0 %	25 %	50 %	543945620
4511	NC_022351	TAA	2	6	204971	204976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945620
4512	NC_022351	AGCA	2	8	204987	204994	50 %	0 %	25 %	25 %	543945620
4513	NC_022351	GTA	2	6	205019	205024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945620
4514	NC_022351	TGG	2	6	205029	205034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945620
4515	NC_022351	AGA	2	6	205083	205088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945620
4516	NC_022351	A	6	6	205088	205093	100 %	0 %	0 %	0 %	543945620
4517	NC_022351	A	6	6	205171	205176	100 %	0 %	0 %	0 %	543945620
4518	NC_022351	TAA	2	6	205271	205276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945620
4519	NC_022351	CCT	2	6	205306	205311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945620
4520	NC_022351	TGA	2	6	205335	205340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945620
4521	NC_022351	TAA	2	6	205378	205383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945620
4522	NC_022351	CTA	2	6	205413	205418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945621
4523	NC_022351	TTC	2	6	205435	205440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945621
4524	NC_022351	T	6	6	205469	205474	0 %	100 %	0 %	0 %	543945621
4525	NC_022351	TGA	2	6	205485	205490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945621
4526	NC_022351	AAAAT	2	10	205584	205593	80 %	20 %	0 %	0 %	543945621
4527	NC_022351	CAT	2	6	205632	205637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945621
4528	NC_022351	T	6	6	205690	205695	0 %	100 %	0 %	0 %	543945621
4529	NC_022351	A	6	6	205914	205919	100 %	0 %	0 %	0 %	543945621
4530	NC_022351	TTC	2	6	205954	205959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945621
4531	NC_022351	TTC	2	6	205984	205989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945621
4532	NC_022351	T	6	6	206007	206012	0 %	100 %	0 %	0 %	543945621
4533	NC_022351	A	7	7	206111	206117	100 %	0 %	0 %	0 %	543945622
4534	NC_022351	TTG	2	6	206166	206171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945622
4535	NC_022351	GAAATA	2	12	206195	206206	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945622
4536	NC_022351	AGT	2	6	206216	206221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945622
4537	NC_022351	TGA	2	6	206326	206331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945622
4538	NC_022351	AAT	2	6	206365	206370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945622
4539	NC_022351	GAT	2	6	206375	206380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945622
4540	NC_022351	TG	3	6	206414	206419	0 %	50 %	50 %	0 %	543945622
4541	NC_022351	A	6	6	206422	206427	100 %	0 %	0 %	0 %	543945622
4542	NC_022351	GAAT	2	8	206442	206449	50 %	25 %	25 %	0 %	543945622
4543	NC_022351	AGA	3	9	206476	206484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945622
4544	NC_022351	A	6	6	206522	206527	100 %	0 %	0 %	0 %	543945622
4545	NC_022351	GAA	2	6	206588	206593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945622
4546	NC_022351	A	6	6	206722	206727	100 %	0 %	0 %	0 %	543945623
4547	NC_022351	AAG	2	6	206793	206798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945623
4548	NC_022351	T	6	6	206801	206806	0 %	100 %	0 %	0 %	543945623
4549	NC_022351	TCA	2	6	206884	206889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945623
4550	NC_022351	T	6	6	206897	206902	0 %	100 %	0 %	0 %	543945623
4551	NC_022351	TGATTT	2	12	206972	206983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945623
4552	NC_022351	TCT	2	6	207001	207006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945623
4553	NC_022351	T	6	6	207111	207116	0 %	100 %	0 %	0 %	543945623
4554	NC_022351	TCA	2	6	207127	207132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945623
4555	NC_022351	ACTCA	2	10	207201	207210	40 %	20 %	0 %	40 %	543945623
4556	NC_022351	CGC	2	6	207236	207241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543945623
4557	NC_022351	CTT	2	6	207242	207247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945623
4558	NC_022351	ATCA	2	8	207312	207319	50 %	25 %	0 %	25 %	543945623
4559	NC_022351	A	7	7	207319	207325	100 %	0 %	0 %	0 %	543945623
4560	NC_022351	T	6	6	207331	207336	0 %	100 %	0 %	0 %	543945623
4561	NC_022351	CCT	2	6	207469	207474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945623
4562	NC_022351	GCT	2	6	207481	207486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945623
4563	NC_022351	GCT	2	6	207502	207507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945623
4564	NC_022351	GCAC	2	8	207562	207569	25 %	0 %	25 %	50 %	543945623
4565	NC_022351	TGG	2	6	207601	207606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945623
4566	NC_022351	A	6	6	207622	207627	100 %	0 %	0 %	0 %	543945623
4567	NC_022351	GCATA	2	10	207707	207716	40 %	20 %	20 %	20 %	543945623
4568	NC_022351	A	6	6	207745	207750	100 %	0 %	0 %	0 %	543945623
4569	NC_022351	TCT	2	6	207799	207804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945623
4570	NC_022351	CAA	2	6	207824	207829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945623
4571	NC_022351	A	6	6	207891	207896	100 %	0 %	0 %	0 %	543945623
4572	NC_022351	T	6	6	207921	207926	0 %	100 %	0 %	0 %	543945623
4573	NC_022351	AAG	2	6	207986	207991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945623
4574	NC_022351	TCA	2	6	208001	208006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945623
4575	NC_022351	TAC	2	6	208014	208019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945624
4576	NC_022351	AAT	2	6	208026	208031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945624
4577	NC_022351	TTACT	2	10	208035	208044	20 %	60 %	0 %	20 %	543945624
4578	NC_022351	ATC	2	6	208084	208089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945624
4579	NC_022351	TA	3	6	208116	208121	50 %	50 %	0 %	0 %	543945624
4580	NC_022351	AT	3	6	208169	208174	50 %	50 %	0 %	0 %	543945624
4581	NC_022351	TCT	2	6	208175	208180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945624
4582	NC_022351	ATC	2	6	208186	208191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945624
4583	NC_022351	TGATT	2	10	208203	208212	20 %	60 %	20 %	0 %	543945624
4584	NC_022351	T	6	6	208255	208260	0 %	100 %	0 %	0 %	543945624
4585	NC_022351	TCA	2	6	208289	208294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945624
4586	NC_022351	TCTT	2	8	208309	208316	0 %	75 %	0 %	25 %	543945624
4587	NC_022351	ATA	2	6	208344	208349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945624
4588	NC_022351	TG	3	6	208355	208360	0 %	50 %	50 %	0 %	543945624
4589	NC_022351	ATTTG	2	10	208472	208481	20 %	60 %	20 %	0 %	543945624
4590	NC_022351	CCA	2	6	208482	208487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945624
4591	NC_022351	TAT	2	6	208503	208508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945624
4592	NC_022351	TTC	2	6	208528	208533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945624
4593	NC_022351	T	7	7	208556	208562	0 %	100 %	0 %	0 %	543945624
4594	NC_022351	TCA	2	6	208574	208579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945624
4595	NC_022351	AAATC	2	10	208596	208605	60 %	20 %	0 %	20 %	543945624
4596	NC_022351	TAT	2	6	208608	208613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945624
4597	NC_022351	ATT	2	6	208735	208740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945624
4598	NC_022351	CCAAA	2	10	208774	208783	60 %	0 %	0 %	40 %	543945624
4599	NC_022351	T	6	6	208794	208799	0 %	100 %	0 %	0 %	543945624
4600	NC_022351	CTT	2	6	208851	208856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945624
4601	NC_022351	TTCTTT	2	12	209001	209012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543945624
4602	NC_022351	CTTT	2	8	209024	209031	0 %	75 %	0 %	25 %	543945625
4603	NC_022351	TAG	2	6	209038	209043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945625
4604	NC_022351	TAA	2	6	209134	209139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945625
4605	NC_022351	TTTC	2	8	209177	209184	0 %	75 %	0 %	25 %	543945625
4606	NC_022351	T	6	6	209241	209246	0 %	100 %	0 %	0 %	543945625
4607	NC_022351	A	7	7	209250	209256	100 %	0 %	0 %	0 %	543945625
4608	NC_022351	A	6	6	209277	209282	100 %	0 %	0 %	0 %	543945625
4609	NC_022351	GTT	2	6	209306	209311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945625
4610	NC_022351	A	6	6	209313	209318	100 %	0 %	0 %	0 %	543945625
4611	NC_022351	CTT	2	6	209320	209325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945625
4612	NC_022351	TAA	2	6	209333	209338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945625
4613	NC_022351	AAAAT	2	10	209339	209348	80 %	20 %	0 %	0 %	543945625
4614	NC_022351	ATAA	2	8	209366	209373	75 %	25 %	0 %	0 %	543945625
4615	NC_022351	T	6	6	209480	209485	0 %	100 %	0 %	0 %	543945626
4616	NC_022351	TTCAAA	2	12	209516	209527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543945626
4617	NC_022351	TGC	2	6	209627	209632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945626
4618	NC_022351	ACA	2	6	209640	209645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945626
4619	NC_022351	ACC	2	6	209648	209653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945626
4620	NC_022351	CT	3	6	209676	209681	0 %	50 %	0 %	50 %	543945626
4621	NC_022351	ACC	2	6	209690	209695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945626
4622	NC_022351	GTA	2	6	209697	209702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945626
4623	NC_022351	T	6	6	209736	209741	0 %	100 %	0 %	0 %	543945626
4624	NC_022351	TTTA	2	8	209771	209778	25 %	75 %	0 %	0 %	543945626
4625	NC_022351	TAC	2	6	209803	209808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945626
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4874	NC_022351	CTT	2	6	220932	220937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945640
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4886	NC_022351	T	6	6	221976	221981	0 %	100 %	0 %	0 %	543945641
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4990	NC_022351	A	7	7	226259	226265	100 %	0 %	0 %	0 %	543945647
4991	NC_022351	A	6	6	226272	226277	100 %	0 %	0 %	0 %	543945647
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4999	NC_022351	A	6	6	226555	226560	100 %	0 %	0 %	0 %	543945648
5000	NC_022351	ATCC	2	8	226646	226653	25 %	25 %	0 %	50 %	543945648

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