MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter coli CVM N29710

Total Repeats: 908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022347	TGCAAA	2	12	1694	1705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543939973
2	NC_022347	TATAGA	2	12	2757	2768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543939974
3	NC_022347	TGCTAG	2	12	3474	3485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543939974
4	NC_022347	AGTGAA	2	12	3820	3831	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543939974
5	NC_022347	AATGAA	2	12	4489	4500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543939974
6	NC_022347	CTATAG	2	12	7704	7715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543939977
7	NC_022347	TGGATT	2	12	8766	8777	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	543939977
8	NC_022347	AGAAAT	2	12	10168	10179	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543939979
9	NC_022347	ATTTAA	2	12	13051	13062	50 %	50 %	0 %	0 %	543939980
10	NC_022347	AAGAAA	2	12	21462	21473	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543939986
11	NC_022347	AAGATA	2	12	22381	22392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543939987
12	NC_022347	AGCAAA	2	12	23155	23166	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543939987
13	NC_022347	TTTTCT	2	12	23665	23676	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543939988
14	NC_022347	GCAAGG	2	12	25203	25214	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	543939990
15	NC_022347	CATTTT	2	12	25703	25714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543939990
16	NC_022347	CGAGCT	2	12	27193	27204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	543939992
17	NC_022347	CGCCAC	2	12	33136	33147	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	543939995
18	NC_022347	TAAAAA	2	12	34720	34731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543939996
19	NC_022347	TTTCAT	2	12	45989	46000	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543939998
20	NC_022347	TTAAGG	2	12	46190	46201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543939998
21	NC_022347	GAAAAG	2	12	49817	49828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543939999
22	NC_022347	CTTATG	2	12	50013	50024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543939999
23	NC_022347	TGAAAA	2	12	55541	55552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543940004
24	NC_022347	TAAACT	2	12	55994	56005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543940004
25	NC_022347	AGTTTT	2	12	56931	56942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543940005
26	NC_022347	TTCTTT	2	12	57147	57158	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543940006
27	NC_022347	CGCCTT	2	12	57552	57563	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543940006
28	NC_022347	TTAATT	2	12	61046	61057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940008
29	NC_022347	CAAAAT	2	12	61174	61185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543940008
30	NC_022347	TAATTT	2	12	63880	63891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940011
31	NC_022347	ATTTTA	2	12	64132	64143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940011
32	NC_022347	AAATAT	2	12	64489	64500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543940011
33	NC_022347	GTTGGA	2	12	65429	65440	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	543940011
34	NC_022347	ATTTTA	2	12	65984	65995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940012
35	NC_022347	GCTATT	2	12	67053	67064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543940013
36	NC_022347	TTGCTT	2	12	68082	68093	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543940013
37	NC_022347	GCTTTA	2	12	77908	77919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543940027
38	NC_022347	AATATC	2	12	79316	79327	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543940028
39	NC_022347	TCATTT	2	12	80264	80275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543940030
40	NC_022347	CATCTT	2	12	81979	81990	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543940031
41	NC_022347	TTCTTT	2	12	82429	82440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543940032
42	NC_022347	TTTAAA	2	12	84416	84427	50 %	50 %	0 %	0 %	543940034
43	NC_022347	TTGGAT	2	12	87621	87632	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	543940039
44	NC_022347	TTTTTG	2	12	93499	93510	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	543940044
45	NC_022347	TGGTTA	2	12	94705	94716	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	543940045
46	NC_022347	CGAGTT	2	12	96128	96139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543940046
47	NC_022347	CAGGAA	2	12	100951	100962	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	543940053
48	NC_022347	GATTAT	2	12	102702	102713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543940054
49	NC_022347	TTTTGA	2	12	103022	103033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543940054
50	NC_022347	TTTTTA	2	12	104060	104071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543940056
51	NC_022347	AGCTTA	2	12	106329	106340	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543940059
52	NC_022347	AAAAAT	2	12	107898	107909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543940061
53	NC_022347	TATCAA	2	12	109544	109555	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543940063
54	NC_022347	CAAAAT	2	12	112165	112176	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543940065
55	NC_022347	AAAAAC	2	12	113177	113188	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	543940067
56	NC_022347	TCCAAG	2	12	113291	113302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543940067
57	NC_022347	AGCCGC	2	12	114458	114469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	543940067
58	NC_022347	GCTTCT	2	12	114579	114590	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	543940067
59	NC_022347	CTTTAT	2	12	114760	114771	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543940067
60	NC_022347	TCTAGC	2	12	115376	115387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	543940068
61	NC_022347	TAAAAA	2	12	116253	116264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543940069
62	NC_022347	TTTGCT	2	12	117486	117497	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543940070
63	NC_022347	TAAAGA	2	12	118445	118456	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543940072
64	NC_022347	ATAAAA	2	12	118639	118650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543940072
65	NC_022347	CTATAG	2	12	119401	119412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543940073
66	NC_022347	GCGCAA	2	12	119635	119646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543940073
67	NC_022347	CTAAAA	2	12	120317	120328	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543940074
68	NC_022347	TTCAAA	2	12	120342	120353	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543940074
69	NC_022347	ATTTTC	2	12	120903	120914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543940075
70	NC_022347	CAAAAA	2	12	122158	122169	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	543940076
71	NC_022347	TAGCAA	2	12	122475	122486	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543940077
72	NC_022347	AGCATT	2	12	122777	122788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543940077
73	NC_022347	ATCTTT	2	12	124106	124117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543940079
74	NC_022347	AAATTT	2	12	125106	125117	50 %	50 %	0 %	0 %	543940079
75	NC_022347	TAAATT	2	12	126428	126439	50 %	50 %	0 %	0 %	543940080
76	NC_022347	TTTTGG	2	12	127096	127107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543940081
77	NC_022347	TATCTC	2	12	128501	128512	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543940083
78	NC_022347	AAAGAT	2	12	133681	133692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543940089
79	NC_022347	AGTAAA	2	12	136516	136527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543940092
80	NC_022347	TAAAAA	2	12	138261	138272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543940093
81	NC_022347	TTATAG	2	12	138284	138295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543940093
82	NC_022347	AATTTA	2	12	140246	140257	50 %	50 %	0 %	0 %	543940095
83	NC_022347	TATCAA	2	12	140533	140544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543940095
84	NC_022347	AAATTT	2	12	140830	140841	50 %	50 %	0 %	0 %	543940095
85	NC_022347	CAATAT	2	12	141040	141051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543940095
86	NC_022347	CAAGTT	2	12	143381	143392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543940098
87	NC_022347	GCCATA	2	12	143682	143693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543940098
88	NC_022347	CTTTTG	2	12	144050	144061	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543940099
89	NC_022347	AAAGAA	2	12	144832	144843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543940100
90	NC_022347	TAATTT	2	12	146457	146468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940103
91	NC_022347	AAATTA	2	12	147051	147062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543940104
92	NC_022347	TACAAA	2	12	150372	150383	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543940106
93	NC_022347	TAAAAA	2	12	150698	150709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543940107
94	NC_022347	TCTCAT	2	12	151583	151594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543940108
95	NC_022347	GTTTGT	2	12	152085	152096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543940109
96	NC_022347	ATAACT	2	12	152245	152256	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543940109
97	NC_022347	AGCATT	2	12	160475	160486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543940118
98	NC_022347	CAAAAT	2	12	162321	162332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543940120
99	NC_022347	TATAAT	2	12	163011	163022	50 %	50 %	0 %	0 %	543940121
100	NC_022347	TATCCA	2	12	163833	163844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543940121
101	NC_022347	ATAATT	2	12	164263	164274	50 %	50 %	0 %	0 %	543940121
102	NC_022347	TTATAT	2	12	165572	165583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940122
103	NC_022347	GAAAAT	2	12	165885	165896	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543940122
104	NC_022347	AAATCA	2	12	168488	168499	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543940126
105	NC_022347	AGTTTT	2	12	169515	169526	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543940127
106	NC_022347	ATCTTT	2	12	174197	174208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543940133
107	NC_022347	GATATT	2	12	175252	175263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543940134
108	NC_022347	TTTTCT	2	12	176180	176191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543940135
109	NC_022347	AAAATA	2	12	177314	177325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543940137
110	NC_022347	CTAAAG	2	12	178074	178085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543940138
111	NC_022347	ATTTTC	2	12	178486	178497	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543940138
112	NC_022347	GTTTTT	2	12	180026	180037	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	543940139
113	NC_022347	TAACTT	2	12	180414	180425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543940140
114	NC_022347	AACTTT	2	12	184341	184352	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543940147
115	NC_022347	TGCAAC	2	12	188985	188996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543940152
116	NC_022347	CTAAAG	2	12	189373	189384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543940152
117	NC_022347	TACTTA	2	12	190274	190285	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543940154
118	NC_022347	TAAATT	2	12	191311	191322	50 %	50 %	0 %	0 %	543940155
119	NC_022347	GAAAAA	2	12	191932	191943	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543940155
120	NC_022347	AATTTG	2	12	193816	193827	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543940157
121	NC_022347	TGGCTT	2	12	199255	199266	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	543940160
122	NC_022347	ATATTT	2	12	204827	204838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940169
123	NC_022347	TTTTGC	2	12	206249	206260	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543940170
124	NC_022347	GTGCAA	2	12	207643	207654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543940170
125	NC_022347	TTTAAT	2	12	208824	208835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940171
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127	NC_022347	TGCTTT	2	12	213721	213732	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543940177
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142	NC_022347	ATGCGT	2	12	263140	263151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543940219
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231	NC_022347	TTGCCT	2	12	422492	422503	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	543940367
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233	NC_022347	TAAGAT	2	12	425585	425596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543940370
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235	NC_022347	AAATTT	2	12	429159	429170	50 %	50 %	0 %	0 %	543940374
236	NC_022347	GAAAAA	2	12	429768	429779	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543940375
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238	NC_022347	GTTCAA	2	12	438345	438356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543940383
239	NC_022347	GTTCAA	2	12	440227	440238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543940384
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341	NC_022347	ATCCTG	2	12	596215	596226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	543940536
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349	NC_022347	TTTAGA	2	12	611350	611361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543940550
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353	NC_022347	AAATGA	2	12	614903	614914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543940553
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463	NC_022347	AAATTT	2	12	823402	823413	50 %	50 %	0 %	0 %	543940755
464	NC_022347	TTTTAA	2	12	823439	823450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543940755
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