MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022121	CCT	2	6	180261	180266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431316
3502	NC_022121	CAG	2	6	180312	180317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431316
3503	NC_022121	TAG	2	6	180423	180428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431316
3504	NC_022121	TTG	2	6	180434	180439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431316
3505	NC_022121	CTC	2	6	180457	180462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431316
3506	NC_022121	AG	3	6	180534	180539	50 %	0 %	50 %	0 %	532431316
3507	NC_022121	ATT	2	6	180575	180580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431316
3508	NC_022121	AAG	2	6	180587	180592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431316
3509	NC_022121	TGA	2	6	180831	180836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431316
3510	NC_022121	AGAGT	2	10	180839	180848	40 %	20 %	40 %	0 %	532431316
3511	NC_022121	GAA	2	6	180894	180899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431316
3512	NC_022121	AGG	2	6	180916	180921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431316
3513	NC_022121	AAG	3	9	180922	180930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431316
3514	NC_022121	T	6	6	181346	181351	0 %	100 %	0 %	0 %	532431317
3515	NC_022121	TTGAA	2	10	181372	181381	40 %	40 %	20 %	0 %	532431317
3516	NC_022121	TTTG	2	8	181386	181393	0 %	75 %	25 %	0 %	532431317
3517	NC_022121	TGCA	2	8	181504	181511	25 %	25 %	25 %	25 %	532431317
3518	NC_022121	TGT	2	6	181522	181527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431317
3519	NC_022121	AGT	2	6	181541	181546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431317
3520	NC_022121	CT	3	6	181586	181591	0 %	50 %	0 %	50 %	532431317
3521	NC_022121	T	6	6	181591	181596	0 %	100 %	0 %	0 %	532431317
3522	NC_022121	CTC	2	6	181620	181625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431317
3523	NC_022121	GA	3	6	181665	181670	50 %	0 %	50 %	0 %	532431317
3524	NC_022121	GAT	2	6	181720	181725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431317
3525	NC_022121	AAAG	2	8	181873	181880	75 %	0 %	25 %	0 %	532431317
3526	NC_022121	CA	3	6	181978	181983	50 %	0 %	0 %	50 %	532431317
3527	NC_022121	TCCCAA	2	12	181994	182005	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532431317
3528	NC_022121	ACA	2	6	182036	182041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431317
3529	NC_022121	CGA	2	6	182054	182059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431317
3530	NC_022121	AAT	2	6	182080	182085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431317
3531	NC_022121	ATT	2	6	182120	182125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431317
3532	NC_022121	GTTT	2	8	182176	182183	0 %	75 %	25 %	0 %	532431317
3533	NC_022121	CTT	2	6	182264	182269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431317
3534	NC_022121	AGA	2	6	182344	182349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431317
3535	NC_022121	TG	3	6	182377	182382	0 %	50 %	50 %	0 %	532431317
3536	NC_022121	G	7	7	182384	182390	0 %	0 %	100 %	0 %	532431317
3537	NC_022121	GA	3	6	182421	182426	50 %	0 %	50 %	0 %	532431317
3538	NC_022121	AGA	2	6	182449	182454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431317
3539	NC_022121	GAA	2	6	182462	182467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431317
3540	NC_022121	AGA	3	9	182506	182514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431317
3541	NC_022121	GATG	2	8	182781	182788	25 %	25 %	50 %	0 %	532432027
3542	NC_022121	TCT	2	6	182798	182803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432027
3543	NC_022121	AGG	2	6	182852	182857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432027
3544	NC_022121	GGA	2	6	182886	182891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432027
3545	NC_022121	TTGAG	2	10	182932	182941	20 %	40 %	40 %	0 %	532432027
3546	NC_022121	GAATG	2	10	182957	182966	40 %	20 %	40 %	0 %	532432027
3547	NC_022121	CT	3	6	183007	183012	0 %	50 %	0 %	50 %	532432027
3548	NC_022121	TGA	2	6	183021	183026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432027
3549	NC_022121	GA	4	8	183049	183056	50 %	0 %	50 %	0 %	532432027
3550	NC_022121	AAC	2	6	183104	183109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432027
3551	NC_022121	TGA	2	6	183123	183128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432027
3552	NC_022121	TGC	2	6	183159	183164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432027
3553	NC_022121	CCAG	2	8	183179	183186	25 %	0 %	25 %	50 %	532432027
3554	NC_022121	TTG	2	6	183188	183193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432027
3555	NC_022121	GAC	2	6	183197	183202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432027
3556	NC_022121	GAT	2	6	183227	183232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432027
3557	NC_022121	GA	3	6	183253	183258	50 %	0 %	50 %	0 %	532432027
3558	NC_022121	GCG	2	6	183261	183266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532432027
3559	NC_022121	ACT	2	6	183309	183314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432028
3560	NC_022121	TAG	2	6	183343	183348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432028
3561	NC_022121	GCA	2	6	183398	183403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432028
3562	NC_022121	TCGC	2	8	183441	183448	0 %	25 %	25 %	50 %	532432028
3563	NC_022121	AGA	2	6	183452	183457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432028
3564	NC_022121	GCA	2	6	183461	183466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432028
3565	NC_022121	GAA	2	6	183489	183494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432028
3566	NC_022121	AGA	2	6	183528	183533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432028
3567	NC_022121	GA	3	6	183567	183572	50 %	0 %	50 %	0 %	532432028
3568	NC_022121	GTT	2	6	183584	183589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432028
3569	NC_022121	GTT	2	6	183619	183624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432028
3570	NC_022121	CTT	2	6	183627	183632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432028
3571	NC_022121	GA	3	6	183670	183675	50 %	0 %	50 %	0 %	532432028
3572	NC_022121	GTT	2	6	183681	183686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432028
3573	NC_022121	GAG	2	6	183702	183707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432028
3574	NC_022121	GAA	2	6	183722	183727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432028
3575	NC_022121	TTG	2	6	183733	183738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432028
3576	NC_022121	AGG	2	6	183772	183777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432028
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3578	NC_022121	TGA	2	6	183890	183895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432028
3579	NC_022121	CAG	3	9	183963	183971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432028
3580	NC_022121	GTA	2	6	184006	184011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432028
3581	NC_022121	GTTG	2	8	184046	184053	0 %	50 %	50 %	0 %	532432028
3582	NC_022121	GGA	3	9	184061	184069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432028
3583	NC_022121	TC	3	6	184077	184082	0 %	50 %	0 %	50 %	532432028
3584	NC_022121	ATT	2	6	184096	184101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432028
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3587	NC_022121	TTTC	2	8	184552	184559	0 %	75 %	0 %	25 %	532431318
3588	NC_022121	CTG	2	6	184600	184605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431318
3589	NC_022121	GGA	2	6	184627	184632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431318
3590	NC_022121	TAG	2	6	184652	184657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431318
3591	NC_022121	AGT	2	6	184782	184787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431318
3592	NC_022121	ATCG	2	8	184809	184816	25 %	25 %	25 %	25 %	532431318
3593	NC_022121	TCA	2	6	184892	184897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431319
3594	NC_022121	GGA	2	6	184907	184912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431319
3595	NC_022121	AGAGA	2	10	185000	185009	60 %	0 %	40 %	0 %	532431319
3596	NC_022121	GCA	2	6	185096	185101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431319
3597	NC_022121	TTA	2	6	185393	185398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431319
3598	NC_022121	GAA	2	6	185462	185467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431319
3599	NC_022121	ATA	2	6	185522	185527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431319
3600	NC_022121	TGC	2	6	185759	185764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431320
3601	NC_022121	CA	3	6	185780	185785	50 %	0 %	0 %	50 %	532431320
3602	NC_022121	AGA	2	6	185895	185900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431320
3603	NC_022121	T	7	7	186245	186251	0 %	100 %	0 %	0 %	532431321
3604	NC_022121	TCT	2	6	186269	186274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431321
3605	NC_022121	TG	3	6	186279	186284	0 %	50 %	50 %	0 %	532431321
3606	NC_022121	GTC	2	6	186370	186375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431321
3607	NC_022121	ATT	2	6	186440	186445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431321
3608	NC_022121	TCT	2	6	186459	186464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431321
3609	NC_022121	CTT	2	6	186475	186480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431321
3610	NC_022121	AAGC	2	8	186513	186520	50 %	0 %	25 %	25 %	532431321
3611	NC_022121	GAA	2	6	186543	186548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431321
3612	NC_022121	AAC	2	6	186620	186625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431321
3613	NC_022121	TA	3	6	186697	186702	50 %	50 %	0 %	0 %	532431321
3614	NC_022121	CTT	2	6	186718	186723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431321
3615	NC_022121	TAG	2	6	186724	186729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431321
3616	NC_022121	CAT	2	6	186768	186773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431321
3617	NC_022121	T	6	6	186775	186780	0 %	100 %	0 %	0 %	532431321
3618	NC_022121	GCTT	2	8	186794	186801	0 %	50 %	25 %	25 %	532431321
3619	NC_022121	CAC	2	6	186826	186831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431321
3620	NC_022121	GAA	2	6	186861	186866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431321
3621	NC_022121	AAG	2	6	186967	186972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431321
3622	NC_022121	TGT	2	6	186989	186994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431321
3623	NC_022121	ACGAT	2	10	187061	187070	40 %	20 %	20 %	20 %	532431321
3624	NC_022121	TTTA	2	8	187079	187086	25 %	75 %	0 %	0 %	532431321
3625	NC_022121	AAG	2	6	187090	187095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431321
3626	NC_022121	AGA	2	6	187175	187180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431321
3627	NC_022121	A	6	6	187230	187235	100 %	0 %	0 %	0 %	532431321
3628	NC_022121	AGG	2	6	187258	187263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431321
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3630	NC_022121	T	7	7	187292	187298	0 %	100 %	0 %	0 %	532431321
3631	NC_022121	A	6	6	187333	187338	100 %	0 %	0 %	0 %	532431321
3632	NC_022121	GCT	2	6	187422	187427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431321
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3635	NC_022121	TAG	2	6	187759	187764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431321
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3639	NC_022121	ATC	2	6	187839	187844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431321
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3644	NC_022121	TTA	2	6	189076	189081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432030
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3656	NC_022121	CAA	2	6	189407	189412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432031
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3720	NC_022121	T	6	6	192900	192905	0 %	100 %	0 %	0 %	532431322
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3723	NC_022121	AG	3	6	192992	192997	50 %	0 %	50 %	0 %	532431322
3724	NC_022121	GATCT	2	10	193096	193105	20 %	40 %	20 %	20 %	532431322
3725	NC_022121	ATGC	2	8	193143	193150	25 %	25 %	25 %	25 %	532432035
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3728	NC_022121	CTTT	2	8	193284	193291	0 %	75 %	0 %	25 %	532432035
3729	NC_022121	AAACAT	2	12	193457	193468	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532431323
3730	NC_022121	TTCC	2	8	193484	193491	0 %	50 %	0 %	50 %	532431323
3731	NC_022121	GAA	2	6	193493	193498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431323
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3733	NC_022121	CTC	2	6	193608	193613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431323
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3735	NC_022121	TGCT	2	8	193728	193735	0 %	50 %	25 %	25 %	532431323
3736	NC_022121	ACA	2	6	193780	193785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431323
3737	NC_022121	AGCAAC	2	12	193792	193803	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532431323
3738	NC_022121	GTA	2	6	193832	193837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431323
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3740	NC_022121	T	6	6	194048	194053	0 %	100 %	0 %	0 %	532431323
3741	NC_022121	CAT	2	6	194165	194170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431323
3742	NC_022121	AATT	2	8	194193	194200	50 %	50 %	0 %	0 %	532431323
3743	NC_022121	GGA	2	6	194213	194218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431323
3744	NC_022121	TTC	2	6	194227	194232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431323
3745	NC_022121	GCA	2	6	194243	194248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431323
3746	NC_022121	TCT	2	6	194296	194301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431323
3747	NC_022121	ACTC	2	8	194330	194337	25 %	25 %	0 %	50 %	532431323
3748	NC_022121	GATTA	2	10	194349	194358	40 %	40 %	20 %	0 %	532431323
3749	NC_022121	T	6	6	194446	194451	0 %	100 %	0 %	0 %	532431323
3750	NC_022121	ATT	2	6	194474	194479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431323
3751	NC_022121	ATC	2	6	194597	194602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431323
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3753	NC_022121	GGC	2	6	194711	194716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431324
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3757	NC_022121	CTA	2	6	194909	194914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431324
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3759	NC_022121	T	6	6	195030	195035	0 %	100 %	0 %	0 %	532431324
3760	NC_022121	TAT	2	6	195138	195143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431324
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3762	NC_022121	AGA	2	6	195185	195190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431324
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3764	NC_022121	A	6	6	195252	195257	100 %	0 %	0 %	0 %	532431324
3765	NC_022121	ATT	2	6	195277	195282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431324
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3776	NC_022121	ATT	2	6	195945	195950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432036
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3783	NC_022121	TCT	2	6	196246	196251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432037
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3853	NC_022121	GAA	2	6	199900	199905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431328
3854	NC_022121	TTC	2	6	199932	199937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431328
3855	NC_022121	TGG	2	6	200016	200021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431328
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3857	NC_022121	AC	3	6	200056	200061	50 %	0 %	0 %	50 %	532431328
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3861	NC_022121	A	8	8	200159	200166	100 %	0 %	0 %	0 %	532431328
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3863	NC_022121	A	8	8	200208	200215	100 %	0 %	0 %	0 %	532431328
3864	NC_022121	TC	3	6	200226	200231	0 %	50 %	0 %	50 %	532431328
3865	NC_022121	CTT	2	6	200235	200240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431328
3866	NC_022121	T	6	6	200283	200288	0 %	100 %	0 %	0 %	532431329
3867	NC_022121	T	7	7	200319	200325	0 %	100 %	0 %	0 %	532431329
3868	NC_022121	T	6	6	200365	200370	0 %	100 %	0 %	0 %	532431329
3869	NC_022121	ATT	2	6	200396	200401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431329
3870	NC_022121	GCG	2	6	200426	200431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431329
3871	NC_022121	TAT	2	6	200444	200449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431329
3872	NC_022121	TGT	2	6	200472	200477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431329
3873	NC_022121	TTTC	2	8	200510	200517	0 %	75 %	0 %	25 %	532431329
3874	NC_022121	TTC	2	6	200526	200531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431329
3875	NC_022121	CTA	2	6	200566	200571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431329
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3883	NC_022121	AGC	2	6	200925	200930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431329
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3903	NC_022121	GAAA	2	8	201921	201928	75 %	0 %	25 %	0 %	532431330
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3973	NC_022121	GTC	2	6	206198	206203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431334
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3979	NC_022121	GATG	2	8	206451	206458	25 %	25 %	50 %	0 %	532431334
3980	NC_022121	ATTC	2	8	206524	206531	25 %	50 %	0 %	25 %	532431334
3981	NC_022121	GCT	2	6	206534	206539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431334
3982	NC_022121	CAA	3	9	206583	206591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431335
3983	NC_022121	T	6	6	206594	206599	0 %	100 %	0 %	0 %	532431335
3984	NC_022121	A	6	6	206616	206621	100 %	0 %	0 %	0 %	532431335
3985	NC_022121	CT	3	6	206693	206698	0 %	50 %	0 %	50 %	532431335
3986	NC_022121	TAT	2	6	206726	206731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431335
3987	NC_022121	AGT	2	6	206753	206758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431335
3988	NC_022121	GAA	2	6	207134	207139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431336
3989	NC_022121	TCC	2	6	207172	207177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431336
3990	NC_022121	AGGA	2	8	207255	207262	50 %	0 %	50 %	0 %	532431336
3991	NC_022121	TTTG	2	8	207278	207285	0 %	75 %	25 %	0 %	532431336
3992	NC_022121	GAA	2	6	207329	207334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431336
3993	NC_022121	TC	3	6	207357	207362	0 %	50 %	0 %	50 %	532431336
3994	NC_022121	ACC	2	6	207417	207422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431336
3995	NC_022121	CTCTG	2	10	207451	207460	0 %	40 %	20 %	40 %	532431336
3996	NC_022121	CAA	2	6	207485	207490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431336
3997	NC_022121	T	6	6	207513	207518	0 %	100 %	0 %	0 %	532431336
3998	NC_022121	ACC	2	6	207529	207534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431336
3999	NC_022121	ATT	2	6	207537	207542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431336
4000	NC_022121	ATC	2	6	207551	207556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431336

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