MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022121	TGT	2	6	154147	154152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431298
3002	NC_022121	ATG	2	6	154154	154159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431298
3003	NC_022121	GAG	2	6	154241	154246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431299
3004	NC_022121	ATT	2	6	154336	154341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431299
3005	NC_022121	AGA	2	6	154396	154401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431299
3006	NC_022121	TTC	2	6	154461	154466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431299
3007	NC_022121	ATA	2	6	154494	154499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431299
3008	NC_022121	ATC	2	6	154542	154547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431299
3009	NC_022121	GCA	2	6	154555	154560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431299
3010	NC_022121	CTG	2	6	154629	154634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431299
3011	NC_022121	GAA	2	6	154658	154663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431299
3012	NC_022121	GAG	2	6	154724	154729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431299
3013	NC_022121	A	6	6	154827	154832	100 %	0 %	0 %	0 %	532431299
3014	NC_022121	TGT	2	6	154843	154848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431299
3015	NC_022121	CCTCAT	2	12	154919	154930	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431299
3016	NC_022121	AGGC	2	8	154949	154956	25 %	0 %	50 %	25 %	532431299
3017	NC_022121	GAGT	2	8	155037	155044	25 %	25 %	50 %	0 %	532431299
3018	NC_022121	CAC	2	6	155189	155194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431300
3019	NC_022121	TTCTT	2	10	155217	155226	0 %	80 %	0 %	20 %	532431300
3020	NC_022121	GACT	2	8	155245	155252	25 %	25 %	25 %	25 %	532431300
3021	NC_022121	GTA	2	6	155299	155304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431300
3022	NC_022121	TGT	2	6	155368	155373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431300
3023	NC_022121	TA	3	6	155397	155402	50 %	50 %	0 %	0 %	532431300
3024	NC_022121	TGG	3	9	155432	155440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431300
3025	NC_022121	TTG	2	6	155490	155495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431300
3026	NC_022121	GAT	2	6	155547	155552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431300
3027	NC_022121	CG	3	6	155616	155621	0 %	0 %	50 %	50 %	532431300
3028	NC_022121	TTA	2	6	155643	155648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431300
3029	NC_022121	GGA	2	6	155729	155734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431300
3030	NC_022121	T	7	7	155802	155808	0 %	100 %	0 %	0 %	532431300
3031	NC_022121	GAA	2	6	155817	155822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431300
3032	NC_022121	AGG	2	6	155881	155886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431300
3033	NC_022121	AAAG	2	8	155963	155970	75 %	0 %	25 %	0 %	532431300
3034	NC_022121	ATT	2	6	156305	156310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431301
3035	NC_022121	AT	3	6	156314	156319	50 %	50 %	0 %	0 %	532431301
3036	NC_022121	CTT	2	6	156352	156357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431301
3037	NC_022121	TGGAGA	2	12	156377	156388	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532431301
3038	NC_022121	GCTT	2	8	156420	156427	0 %	50 %	25 %	25 %	532431301
3039	NC_022121	GCA	2	6	156450	156455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431301
3040	NC_022121	TAGA	2	8	156472	156479	50 %	25 %	25 %	0 %	532431301
3041	NC_022121	AG	3	6	156547	156552	50 %	0 %	50 %	0 %	532431301
3042	NC_022121	CCCA	2	8	156600	156607	25 %	0 %	0 %	75 %	532431301
3043	NC_022121	CTT	2	6	156621	156626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431301
3044	NC_022121	ATG	2	6	156657	156662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431301
3045	NC_022121	TAA	2	6	156705	156710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431301
3046	NC_022121	T	7	7	156714	156720	0 %	100 %	0 %	0 %	532431301
3047	NC_022121	AGA	2	6	156770	156775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431301
3048	NC_022121	A	6	6	156806	156811	100 %	0 %	0 %	0 %	532431301
3049	NC_022121	GAA	3	9	156873	156881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431301
3050	NC_022121	GT	3	6	156933	156938	0 %	50 %	50 %	0 %	532431301
3051	NC_022121	AGC	2	6	156944	156949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431301
3052	NC_022121	TCT	2	6	156957	156962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431301
3053	NC_022121	AG	3	6	156972	156977	50 %	0 %	50 %	0 %	532431301
3054	NC_022121	AGG	2	6	157045	157050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431301
3055	NC_022121	AG	3	6	157073	157078	50 %	0 %	50 %	0 %	532431301
3056	NC_022121	AG	3	6	157090	157095	50 %	0 %	50 %	0 %	532431301
3057	NC_022121	AG	3	6	157155	157160	50 %	0 %	50 %	0 %	532431301
3058	NC_022121	ATC	2	6	157166	157171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431301
3059	NC_022121	GGA	2	6	157200	157205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431301
3060	NC_022121	ATA	2	6	157236	157241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431301
3061	NC_022121	A	6	6	157244	157249	100 %	0 %	0 %	0 %	532431301
3062	NC_022121	ACAT	2	8	157260	157267	50 %	25 %	0 %	25 %	532431301
3063	NC_022121	ATT	2	6	157458	157463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431302
3064	NC_022121	T	7	7	157500	157506	0 %	100 %	0 %	0 %	532431302
3065	NC_022121	CTTG	2	8	157643	157650	0 %	50 %	25 %	25 %	532431302
3066	NC_022121	GA	3	6	157659	157664	50 %	0 %	50 %	0 %	532431302
3067	NC_022121	GCA	2	6	157712	157717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431302
3068	NC_022121	CTTT	2	8	157720	157727	0 %	75 %	0 %	25 %	532431302
3069	NC_022121	CTCCAT	2	12	157744	157755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532431302
3070	NC_022121	ATT	2	6	157822	157827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431302
3071	NC_022121	GAT	2	6	157848	157853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431302
3072	NC_022121	TTG	2	6	157862	157867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431302
3073	NC_022121	A	6	6	157891	157896	100 %	0 %	0 %	0 %	532431302
3074	NC_022121	T	6	6	157970	157975	0 %	100 %	0 %	0 %	532431302
3075	NC_022121	ATG	2	6	158020	158025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431302
3076	NC_022121	TG	3	6	158071	158076	0 %	50 %	50 %	0 %	532431302
3077	NC_022121	T	6	6	158090	158095	0 %	100 %	0 %	0 %	532431302
3078	NC_022121	AGA	2	6	158112	158117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431302
3079	NC_022121	TCCTTG	2	12	158340	158351	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532431303
3080	NC_022121	GAA	2	6	158361	158366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431303
3081	NC_022121	GTT	2	6	158378	158383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431303
3082	NC_022121	T	6	6	158545	158550	0 %	100 %	0 %	0 %	532431303
3083	NC_022121	CG	3	6	158581	158586	0 %	0 %	50 %	50 %	532431303
3084	NC_022121	AGA	2	6	158607	158612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431303
3085	NC_022121	CAT	2	6	158616	158621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431303
3086	NC_022121	TTC	2	6	158711	158716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431303
3087	NC_022121	AGA	3	9	158721	158729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431303
3088	NC_022121	ATT	2	6	159178	159183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431304
3089	NC_022121	CAT	2	6	159330	159335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431304
3090	NC_022121	TCAA	2	8	159391	159398	50 %	25 %	0 %	25 %	532431304
3091	NC_022121	TGA	2	6	159588	159593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431304
3092	NC_022121	GAA	2	6	159616	159621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431304
3093	NC_022121	TC	3	6	159651	159656	0 %	50 %	0 %	50 %	532431304
3094	NC_022121	GT	3	6	159689	159694	0 %	50 %	50 %	0 %	532431304
3095	NC_022121	AAT	2	6	159733	159738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431304
3096	NC_022121	GGA	2	6	159745	159750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431304
3097	NC_022121	AGGAA	2	10	159774	159783	60 %	0 %	40 %	0 %	532431304
3098	NC_022121	TAG	2	6	159804	159809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431304
3099	NC_022121	AGG	2	6	159810	159815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431304
3100	NC_022121	CTG	2	6	159830	159835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431304
3101	NC_022121	AG	3	6	159861	159866	50 %	0 %	50 %	0 %	532431304
3102	NC_022121	TCT	2	6	159889	159894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431304
3103	NC_022121	AGG	2	6	160008	160013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431304
3104	NC_022121	GAA	2	6	160021	160026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431305
3105	NC_022121	AGA	2	6	160069	160074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431305
3106	NC_022121	ATAC	2	8	160193	160200	50 %	25 %	0 %	25 %	532431305
3107	NC_022121	AGG	2	6	160219	160224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431305
3108	NC_022121	AGG	2	6	160234	160239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431305
3109	NC_022121	CT	3	6	160332	160337	0 %	50 %	0 %	50 %	532431305
3110	NC_022121	GA	3	6	160342	160347	50 %	0 %	50 %	0 %	532431305
3111	NC_022121	ATT	2	6	160362	160367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431305
3112	NC_022121	ATA	2	6	160458	160463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431305
3113	NC_022121	AC	3	6	160482	160487	50 %	0 %	0 %	50 %	532431305
3114	NC_022121	A	8	8	160527	160534	100 %	0 %	0 %	0 %	532431305
3115	NC_022121	ATG	2	6	160608	160613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431305
3116	NC_022121	TCT	2	6	160623	160628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431305
3117	NC_022121	TTC	2	6	160837	160842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431305
3118	NC_022121	AGG	2	6	160848	160853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431305
3119	NC_022121	ACA	2	6	160864	160869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431306
3120	NC_022121	ATA	3	9	160874	160882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431306
3121	NC_022121	TTTC	2	8	160892	160899	0 %	75 %	0 %	25 %	532431306
3122	NC_022121	AACAGC	2	12	160977	160988	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532431306
3123	NC_022121	AGT	2	6	161020	161025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431306
3124	NC_022121	TGG	2	6	161106	161111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431306
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3243	NC_022121	CTA	2	6	167265	167270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431309
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3247	NC_022121	GTTT	2	8	167512	167519	0 %	75 %	25 %	0 %	532431309
3248	NC_022121	GA	3	6	167557	167562	50 %	0 %	50 %	0 %	532431309
3249	NC_022121	A	6	6	167745	167750	100 %	0 %	0 %	0 %	532431309
3250	NC_022121	AAGAG	2	10	167776	167785	60 %	0 %	40 %	0 %	532431309
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3252	NC_022121	AGC	2	6	167823	167828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431309
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3255	NC_022121	TCT	2	6	167895	167900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431309
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3261	NC_022121	GCT	2	6	168218	168223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431309
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3336	NC_022121	GTT	2	6	171531	171536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431310
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3339	NC_022121	TGA	2	6	171625	171630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431310
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3342	NC_022121	AG	3	6	171665	171670	50 %	0 %	50 %	0 %	532431310
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3352	NC_022121	AGGT	2	8	172533	172540	25 %	25 %	50 %	0 %	532431311
3353	NC_022121	CAGC	2	8	172581	172588	25 %	0 %	25 %	50 %	532431311
3354	NC_022121	AAG	2	6	172625	172630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431311
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3356	NC_022121	AC	3	6	172902	172907	50 %	0 %	0 %	50 %	532431311
3357	NC_022121	AAG	2	6	173474	173479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431312
3358	NC_022121	ATT	3	9	173534	173542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431313
3359	NC_022121	AAAAAG	2	12	173564	173575	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532431313
3360	NC_022121	CTC	2	6	173579	173584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431313
3361	NC_022121	GCA	2	6	173669	173674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431313
3362	NC_022121	TGGG	2	8	173679	173686	0 %	25 %	75 %	0 %	532431313
3363	NC_022121	TAC	2	6	173748	173753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431313
3364	NC_022121	AT	3	6	173786	173791	50 %	50 %	0 %	0 %	532431313
3365	NC_022121	T	6	6	173855	173860	0 %	100 %	0 %	0 %	532431313
3366	NC_022121	GAT	2	6	173906	173911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431313
3367	NC_022121	TCT	2	6	173955	173960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431313
3368	NC_022121	TTG	2	6	173974	173979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431313
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3370	NC_022121	TCA	2	6	174072	174077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431313
3371	NC_022121	ATT	2	6	174121	174126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431313
3372	NC_022121	CTT	2	6	174154	174159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431313
3373	NC_022121	TGT	2	6	174227	174232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431313
3374	NC_022121	TGTC	2	8	174274	174281	0 %	50 %	25 %	25 %	532431313
3375	NC_022121	A	7	7	174290	174296	100 %	0 %	0 %	0 %	532431313
3376	NC_022121	GT	3	6	174346	174351	0 %	50 %	50 %	0 %	532431313
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3383	NC_022121	GTTTT	2	10	174600	174609	0 %	80 %	20 %	0 %	532431313
3384	NC_022121	TATTG	2	10	174623	174632	20 %	60 %	20 %	0 %	532431313
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3452	NC_022121	TAA	2	6	177960	177965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431315
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3483	NC_022121	TTGA	2	8	179525	179532	25 %	50 %	25 %	0 %	532432026
3484	NC_022121	ATG	2	6	179544	179549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432026
3485	NC_022121	TGA	3	9	179553	179561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432026
3486	NC_022121	TGA	2	6	179587	179592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432026
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3489	NC_022121	GAT	2	6	179833	179838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432026
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3491	NC_022121	GCG	2	6	179868	179873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532432026
3492	NC_022121	TGA	2	6	179922	179927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432026
3493	NC_022121	ATA	2	6	179941	179946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432026
3494	NC_022121	CTG	2	6	180038	180043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431316
3495	NC_022121	CTG	2	6	180046	180051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431316
3496	NC_022121	AGA	3	9	180080	180088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431316
3497	NC_022121	T	7	7	180113	180119	0 %	100 %	0 %	0 %	532431316
3498	NC_022121	TCA	2	6	180151	180156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431316
3499	NC_022121	TGTT	2	8	180163	180170	0 %	75 %	25 %	0 %	532431316
3500	NC_022121	TA	3	6	180173	180178	50 %	50 %	0 %	0 %	532431316

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