MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022121	TG	3	6	130009	130014	0 %	50 %	50 %	0 %	532431275
2502	NC_022121	T	6	6	130033	130038	0 %	100 %	0 %	0 %	532431275
2503	NC_022121	GAGG	2	8	130098	130105	25 %	0 %	75 %	0 %	532431275
2504	NC_022121	ATG	2	6	130146	130151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431275
2505	NC_022121	AAG	2	6	130157	130162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431275
2506	NC_022121	CTT	2	6	130188	130193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431275
2507	NC_022121	TCA	2	6	130208	130213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431275
2508	NC_022121	TAAG	2	8	130214	130221	50 %	25 %	25 %	0 %	532431275
2509	NC_022121	AGC	2	6	130277	130282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431275
2510	NC_022121	GAAGA	2	10	130287	130296	60 %	0 %	40 %	0 %	532431275
2511	NC_022121	GTT	2	6	130299	130304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431275
2512	NC_022121	T	7	7	130363	130369	0 %	100 %	0 %	0 %	532431275
2513	NC_022121	CAG	2	6	130418	130423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431275
2514	NC_022121	AGT	2	6	130468	130473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431275
2515	NC_022121	ATC	2	6	130529	130534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432022
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2517	NC_022121	AG	3	6	130591	130596	50 %	0 %	50 %	0 %	532432022
2518	NC_022121	TTTG	2	8	130918	130925	0 %	75 %	25 %	0 %	532431276
2519	NC_022121	CTG	2	6	130966	130971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431276
2520	NC_022121	GAC	2	6	130974	130979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431276
2521	NC_022121	CAG	2	6	131043	131048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431276
2522	NC_022121	TTG	2	6	131049	131054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431276
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2525	NC_022121	AATT	2	8	131197	131204	50 %	50 %	0 %	0 %	532431276
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2530	NC_022121	TGTA	2	8	131494	131501	25 %	50 %	25 %	0 %	532431276
2531	NC_022121	GAG	2	6	131539	131544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431276
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2535	NC_022121	AT	3	6	131747	131752	50 %	50 %	0 %	0 %	532431276
2536	NC_022121	CTT	2	6	131806	131811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431276
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2538	NC_022121	TTCT	2	8	131908	131915	0 %	75 %	0 %	25 %	532431276
2539	NC_022121	TTC	2	6	131938	131943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431276
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2541	NC_022121	TGA	2	6	132020	132025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431276
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2544	NC_022121	GAA	2	6	132174	132179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431276
2545	NC_022121	AAAAG	2	10	132200	132209	80 %	0 %	20 %	0 %	532431276
2546	NC_022121	CTT	2	6	132304	132309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431276
2547	NC_022121	GGA	2	6	132311	132316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431276
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2551	NC_022121	GGAG	2	8	132443	132450	25 %	0 %	75 %	0 %	532431276
2552	NC_022121	GGA	2	6	132473	132478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431276
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2554	NC_022121	CAGT	2	8	132523	132530	25 %	25 %	25 %	25 %	532431276
2555	NC_022121	GATTC	2	10	132531	132540	20 %	40 %	20 %	20 %	532431276
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2559	NC_022121	GAT	2	6	132671	132676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431276
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2590	NC_022121	TGC	2	6	133884	133889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431277
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2597	NC_022121	TTC	2	6	134303	134308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431277
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2600	NC_022121	AT	3	6	134481	134486	50 %	50 %	0 %	0 %	532431277
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2603	NC_022121	AAG	2	6	134578	134583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431277
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2609	NC_022121	CT	3	6	134698	134703	0 %	50 %	0 %	50 %	532431277
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2612	NC_022121	CT	3	6	134828	134833	0 %	50 %	0 %	50 %	532431277
2613	NC_022121	AG	4	8	135139	135146	50 %	0 %	50 %	0 %	532431278
2614	NC_022121	GGATA	2	10	135151	135160	40 %	20 %	40 %	0 %	532431278
2615	NC_022121	AG	3	6	135169	135174	50 %	0 %	50 %	0 %	532431278
2616	NC_022121	TGG	2	6	135216	135221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431278
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2872	NC_022121	GA	3	6	148355	148360	50 %	0 %	50 %	0 %	532431293
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2993	NC_022121	AGC	2	6	153964	153969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431298
2994	NC_022121	AATC	2	8	153977	153984	50 %	25 %	0 %	25 %	532431298
2995	NC_022121	GAA	2	6	153989	153994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431298
2996	NC_022121	TA	3	6	154022	154027	50 %	50 %	0 %	0 %	532431298
2997	NC_022121	GAT	2	6	154043	154048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431298
2998	NC_022121	TA	3	6	154080	154085	50 %	50 %	0 %	0 %	532431298
2999	NC_022121	CTT	2	6	154098	154103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431298
3000	NC_022121	GGA	2	6	154130	154135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431298

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