MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20001	NC_022121	TAAG	2	8	1019604	1019611	50 %	25 %	25 %	0 %	532431999
20002	NC_022121	CGAGT	2	10	1019648	1019657	20 %	20 %	40 %	20 %	532431999
20003	NC_022121	TTC	2	6	1019660	1019665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431999
20004	NC_022121	ATC	2	6	1019688	1019693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431999
20005	NC_022121	GCG	2	6	1019767	1019772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431999
20006	NC_022121	TGCT	2	8	1019777	1019784	0 %	50 %	25 %	25 %	532431999
20007	NC_022121	TAA	2	6	1019823	1019828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431999
20008	NC_022121	CTT	2	6	1019837	1019842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431999
20009	NC_022121	CT	3	6	1020022	1020027	0 %	50 %	0 %	50 %	532431999
20010	NC_022121	GA	3	6	1020130	1020135	50 %	0 %	50 %	0 %	532431999
20011	NC_022121	T	6	6	1020546	1020551	0 %	100 %	0 %	0 %	532432000
20012	NC_022121	CTT	2	6	1020552	1020557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432000
20013	NC_022121	GGA	2	6	1020638	1020643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432000
20014	NC_022121	TAT	2	6	1020671	1020676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432000
20015	NC_022121	CTT	2	6	1020726	1020731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432000
20016	NC_022121	A	6	6	1020783	1020788	100 %	0 %	0 %	0 %	532432000
20017	NC_022121	AGA	3	9	1020791	1020799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432000
20018	NC_022121	TCCT	2	8	1020816	1020823	0 %	50 %	0 %	50 %	532432000
20019	NC_022121	GTT	2	6	1020844	1020849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432000
20020	NC_022121	TAA	2	6	1020931	1020936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432000
20021	NC_022121	AG	3	6	1020958	1020963	50 %	0 %	50 %	0 %	532432000
20022	NC_022121	ATG	2	6	1021008	1021013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432000
20023	NC_022121	GGA	2	6	1021104	1021109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432000
20024	NC_022121	AG	3	6	1021120	1021125	50 %	0 %	50 %	0 %	532432000
20025	NC_022121	GTT	2	6	1021133	1021138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432000
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20027	NC_022121	TCC	2	6	1021156	1021161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432000
20028	NC_022121	CGGT	2	8	1021174	1021181	0 %	25 %	50 %	25 %	532432000
20029	NC_022121	TTTC	2	8	1021215	1021222	0 %	75 %	0 %	25 %	532432000
20030	NC_022121	GAA	2	6	1021325	1021330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432000
20031	NC_022121	TAAAA	2	10	1021351	1021360	80 %	20 %	0 %	0 %	532432000
20032	NC_022121	A	6	6	1021357	1021362	100 %	0 %	0 %	0 %	532432000
20033	NC_022121	TAAA	2	8	1021420	1021427	75 %	25 %	0 %	0 %	532432000
20034	NC_022121	T	6	6	1021449	1021454	0 %	100 %	0 %	0 %	532432001
20035	NC_022121	TTG	2	6	1021586	1021591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432001
20036	NC_022121	T	6	6	1021637	1021642	0 %	100 %	0 %	0 %	532432001
20037	NC_022121	ATC	2	6	1021688	1021693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432001
20038	NC_022121	G	6	6	1021739	1021744	0 %	0 %	100 %	0 %	532432001
20039	NC_022121	T	6	6	1021755	1021760	0 %	100 %	0 %	0 %	532432001
20040	NC_022121	TCA	2	6	1021776	1021781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432001
20041	NC_022121	TGTT	2	8	1021955	1021962	0 %	75 %	25 %	0 %	532432001
20042	NC_022121	CAG	2	6	1021973	1021978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432001
20043	NC_022121	T	6	6	1022050	1022055	0 %	100 %	0 %	0 %	532432001
20044	NC_022121	TCC	3	9	1022058	1022066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432001
20045	NC_022121	GTT	2	6	1022080	1022085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432001
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20048	NC_022121	AGGA	2	8	1022195	1022202	50 %	0 %	50 %	0 %	532432001
20049	NC_022121	AG	3	6	1022218	1022223	50 %	0 %	50 %	0 %	532432001
20050	NC_022121	AGCT	2	8	1022234	1022241	25 %	25 %	25 %	25 %	532432001
20051	NC_022121	CT	3	6	1022240	1022245	0 %	50 %	0 %	50 %	532432001
20052	NC_022121	TGAA	2	8	1022303	1022310	50 %	25 %	25 %	0 %	532432001
20053	NC_022121	AAC	2	6	1022325	1022330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432001
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20055	NC_022121	TGG	2	6	1022703	1022708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532432001
20056	NC_022121	AG	3	6	1022710	1022715	50 %	0 %	50 %	0 %	532432001
20057	NC_022121	TTC	2	6	1022735	1022740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432001
20058	NC_022121	GAA	2	6	1022833	1022838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432001
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20060	NC_022121	ATT	2	6	1022894	1022899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432001
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20063	NC_022121	TAT	2	6	1023077	1023082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432001
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20065	NC_022121	G	6	6	1023126	1023131	0 %	0 %	100 %	0 %	532432001
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20067	NC_022121	ATT	2	6	1023183	1023188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432001
20068	NC_022121	ATC	2	6	1023200	1023205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432001
20069	NC_022121	CTC	2	6	1023285	1023290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432001
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20071	NC_022121	GCTTT	2	10	1023370	1023379	0 %	60 %	20 %	20 %	532432001
20072	NC_022121	CAT	2	6	1023385	1023390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432001
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20080	NC_022121	TTC	2	6	1023911	1023916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432002
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20082	NC_022121	GATA	2	8	1023946	1023953	50 %	25 %	25 %	0 %	532432002
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20087	NC_022121	CTT	2	6	1024135	1024140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432002
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20090	NC_022121	GGA	2	6	1024230	1024235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432002
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20092	NC_022121	TGTT	2	8	1024365	1024372	0 %	75 %	25 %	0 %	532432002
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20102	NC_022121	TC	3	6	1025040	1025045	0 %	50 %	0 %	50 %	532432003
20103	NC_022121	CCT	2	6	1025110	1025115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432003
20104	NC_022121	TGC	2	6	1025117	1025122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432003
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20108	NC_022121	TAGC	2	8	1025317	1025324	25 %	25 %	25 %	25 %	532432003
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20113	NC_022121	AG	3	6	1025448	1025453	50 %	0 %	50 %	0 %	532432003
20114	NC_022121	T	6	6	1025483	1025488	0 %	100 %	0 %	0 %	532432003
20115	NC_022121	TCT	2	6	1025490	1025495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432003
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20117	NC_022121	G	6	6	1025538	1025543	0 %	0 %	100 %	0 %	532432003
20118	NC_022121	AAT	2	6	1025603	1025608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432003
20119	NC_022121	GAT	2	6	1025639	1025644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432003
20120	NC_022121	TCG	2	6	1025648	1025653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432003
20121	NC_022121	AGG	2	6	1025703	1025708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432003
20122	NC_022121	TCT	2	6	1025709	1025714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432003
20123	NC_022121	AGG	2	6	1025741	1025746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432003
20124	NC_022121	AGG	3	9	1025750	1025758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432003
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20126	NC_022121	G	8	8	1025847	1025854	0 %	0 %	100 %	0 %	532432003
20127	NC_022121	AGG	2	6	1025879	1025884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432003
20128	NC_022121	TAG	2	6	1025926	1025931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432003
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20132	NC_022121	AAG	2	6	1026017	1026022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432003
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20229	NC_022121	GAA	2	6	1030342	1030347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432005
20230	NC_022121	TTA	3	9	1030348	1030356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432005
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20233	NC_022121	GA	3	6	1030424	1030429	50 %	0 %	50 %	0 %	532432005
20234	NC_022121	CAT	2	6	1030475	1030480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432005
20235	NC_022121	GTT	2	6	1030505	1030510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432005
20236	NC_022121	TAC	2	6	1030610	1030615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432005
20237	NC_022121	AAT	2	6	1030707	1030712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432005
20238	NC_022121	AAG	2	6	1030791	1030796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432005
20239	NC_022121	CAT	2	6	1030844	1030849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432005
20240	NC_022121	AGT	2	6	1030878	1030883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432005
20241	NC_022121	CTT	2	6	1030889	1030894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432005
20242	NC_022121	ACA	2	6	1030960	1030965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432005
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20245	NC_022121	GA	3	6	1031106	1031111	50 %	0 %	50 %	0 %	532432005
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20338	NC_022121	ATC	2	6	1034895	1034900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432006
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20342	NC_022121	GA	3	6	1035072	1035077	50 %	0 %	50 %	0 %	532432006
20343	NC_022121	AC	3	6	1035275	1035280	50 %	0 %	0 %	50 %	532432006
20344	NC_022121	TAA	2	6	1035283	1035288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432006
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20346	NC_022121	ACA	2	6	1035377	1035382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432006
20347	NC_022121	TATG	2	8	1035427	1035434	25 %	50 %	25 %	0 %	532432006
20348	NC_022121	CAT	2	6	1035591	1035596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432007
20349	NC_022121	T	6	6	1035601	1035606	0 %	100 %	0 %	0 %	532432007
20350	NC_022121	TTGT	2	8	1035610	1035617	0 %	75 %	25 %	0 %	532432007
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20352	NC_022121	TTC	2	6	1035834	1035839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432007
20353	NC_022121	CAG	2	6	1035858	1035863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432007
20354	NC_022121	GA	3	6	1035864	1035869	50 %	0 %	50 %	0 %	532432007
20355	NC_022121	T	6	6	1035981	1035986	0 %	100 %	0 %	0 %	532432007
20356	NC_022121	CTC	2	6	1036041	1036046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432007
20357	NC_022121	CAGCAC	2	12	1036047	1036058	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532432007
20358	NC_022121	CTG	2	6	1036065	1036070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432007
20359	NC_022121	T	6	6	1036119	1036124	0 %	100 %	0 %	0 %	532432007
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20372	NC_022121	GGA	2	6	1036466	1036471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432007
20373	NC_022121	GAT	2	6	1036487	1036492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432007
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20458	NC_022121	CTCC	2	8	1041426	1041433	0 %	25 %	0 %	75 %	532432008
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20468	NC_022121	AGA	2	6	1041818	1041823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432008
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20471	NC_022121	ATT	2	6	1041932	1041937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432008
20472	NC_022121	TGA	2	6	1041963	1041968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432008
20473	NC_022121	ATA	2	6	1041969	1041974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432008
20474	NC_022121	AAGGA	2	10	1042008	1042017	60 %	0 %	40 %	0 %	532432008
20475	NC_022121	TACA	2	8	1042121	1042128	50 %	25 %	0 %	25 %	532432008
20476	NC_022121	ATC	2	6	1042133	1042138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432008
20477	NC_022121	A	6	6	1042193	1042198	100 %	0 %	0 %	0 %	532432008
20478	NC_022121	GAC	2	6	1042205	1042210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432008
20479	NC_022121	GAG	2	6	1042229	1042234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432008
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