MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022121	TCC	2	6	79165	79170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431235
1502	NC_022121	GCT	2	6	79197	79202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431235
1503	NC_022121	TCT	2	6	79208	79213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431235
1504	NC_022121	T	7	7	79903	79909	0 %	100 %	0 %	0 %	532431236
1505	NC_022121	TGA	2	6	80008	80013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431236
1506	NC_022121	TGTCT	2	10	80023	80032	0 %	60 %	20 %	20 %	532431236
1507	NC_022121	TGAT	2	8	80097	80104	25 %	50 %	25 %	0 %	532431236
1508	NC_022121	TCAT	2	8	80119	80126	25 %	50 %	0 %	25 %	532431236
1509	NC_022121	T	6	6	80175	80180	0 %	100 %	0 %	0 %	532431236
1510	NC_022121	GGTTTA	2	12	80186	80197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532431236
1511	NC_022121	TCT	2	6	80287	80292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431236
1512	NC_022121	GAA	2	6	80297	80302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431236
1513	NC_022121	TGC	2	6	80347	80352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431236
1514	NC_022121	CAA	2	6	80381	80386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431236
1515	NC_022121	GAA	2	6	80399	80404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431236
1516	NC_022121	GGA	2	6	80443	80448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431236
1517	NC_022121	TC	4	8	80471	80478	0 %	50 %	0 %	50 %	532431236
1518	NC_022121	A	7	7	80490	80496	100 %	0 %	0 %	0 %	532431236
1519	NC_022121	TTACT	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	532431236
1520	NC_022121	TATC	2	8	80546	80553	25 %	50 %	0 %	25 %	532431236
1521	NC_022121	GA	3	6	80564	80569	50 %	0 %	50 %	0 %	532431236
1522	NC_022121	TAT	2	6	80644	80649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431236
1523	NC_022121	TA	3	6	80784	80789	50 %	50 %	0 %	0 %	532431236
1524	NC_022121	AGA	2	6	80848	80853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431236
1525	NC_022121	GGGA	2	8	80857	80864	25 %	0 %	75 %	0 %	532431236
1526	NC_022121	TCTG	2	8	80960	80967	0 %	50 %	25 %	25 %	532431237
1527	NC_022121	GCT	2	6	80979	80984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431237
1528	NC_022121	ATT	2	6	80985	80990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431237
1529	NC_022121	CTT	2	6	81028	81033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431237
1530	NC_022121	CTT	2	6	81049	81054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431237
1531	NC_022121	CAT	2	6	81096	81101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431237
1532	NC_022121	TGA	2	6	81218	81223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431237
1533	NC_022121	AGG	2	6	81229	81234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431237
1534	NC_022121	GGTT	2	8	81254	81261	0 %	50 %	50 %	0 %	532431237
1535	NC_022121	CT	3	6	81294	81299	0 %	50 %	0 %	50 %	532431237
1536	NC_022121	GGA	2	6	81300	81305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431237
1537	NC_022121	CAA	2	6	81306	81311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431237
1538	NC_022121	AG	3	6	81313	81318	50 %	0 %	50 %	0 %	532431237
1539	NC_022121	T	6	6	81320	81325	0 %	100 %	0 %	0 %	532431237
1540	NC_022121	CGAT	2	8	81382	81389	25 %	25 %	25 %	25 %	532431237
1541	NC_022121	TCAT	2	8	81457	81464	25 %	50 %	0 %	25 %	532431237
1542	NC_022121	TTA	2	6	81507	81512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431237
1543	NC_022121	TG	3	6	81524	81529	0 %	50 %	50 %	0 %	532431237
1544	NC_022121	AGA	2	6	81542	81547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431237
1545	NC_022121	AAG	2	6	81559	81564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431237
1546	NC_022121	AC	3	6	81607	81612	50 %	0 %	0 %	50 %	532431237
1547	NC_022121	T	6	6	81692	81697	0 %	100 %	0 %	0 %	532431238
1548	NC_022121	GAC	2	6	81719	81724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431238
1549	NC_022121	GA	3	6	81753	81758	50 %	0 %	50 %	0 %	532431238
1550	NC_022121	TTA	2	6	81765	81770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431238
1551	NC_022121	CTT	2	6	81819	81824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431238
1552	NC_022121	TTA	2	6	81862	81867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431238
1553	NC_022121	T	6	6	81870	81875	0 %	100 %	0 %	0 %	532431238
1554	NC_022121	AGAAA	2	10	81920	81929	80 %	0 %	20 %	0 %	532431238
1555	NC_022121	TTTAGT	2	12	81959	81970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532431238
1556	NC_022121	T	6	6	81975	81980	0 %	100 %	0 %	0 %	532431238
1557	NC_022121	GTTA	2	8	81999	82006	25 %	50 %	25 %	0 %	532431238
1558	NC_022121	ACA	2	6	82033	82038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431238
1559	NC_022121	GCG	2	6	82065	82070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431238
1560	NC_022121	T	6	6	82108	82113	0 %	100 %	0 %	0 %	532431238
1561	NC_022121	TGG	3	9	82134	82142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431238
1562	NC_022121	CAG	2	6	82210	82215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431238
1563	NC_022121	GTT	2	6	82221	82226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431238
1564	NC_022121	TATT	2	8	82231	82238	25 %	75 %	0 %	0 %	532431238
1565	NC_022121	GTG	2	6	82255	82260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431238
1566	NC_022121	CCT	2	6	82305	82310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431238
1567	NC_022121	GGAAG	2	10	82433	82442	40 %	0 %	60 %	0 %	532431238
1568	NC_022121	ATT	2	6	82452	82457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431238
1569	NC_022121	TTG	2	6	82474	82479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431238
1570	NC_022121	TTC	2	6	82482	82487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431238
1571	NC_022121	T	6	6	82516	82521	0 %	100 %	0 %	0 %	532431238
1572	NC_022121	GAA	2	6	82555	82560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431238
1573	NC_022121	GAA	2	6	82584	82589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431238
1574	NC_022121	GA	3	6	82646	82651	50 %	0 %	50 %	0 %	532431238
1575	NC_022121	GTTC	2	8	82656	82663	0 %	50 %	25 %	25 %	532431238
1576	NC_022121	GCT	2	6	82791	82796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431238
1577	NC_022121	GTGC	2	8	82803	82810	0 %	25 %	50 %	25 %	532431238
1578	NC_022121	TAA	2	6	82853	82858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431238
1579	NC_022121	CAT	2	6	82869	82874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431238
1580	NC_022121	GAA	2	6	82881	82886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431238
1581	NC_022121	GA	3	6	82966	82971	50 %	0 %	50 %	0 %	532431238
1582	NC_022121	TAC	2	6	83017	83022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431239
1583	NC_022121	T	6	6	83041	83046	0 %	100 %	0 %	0 %	532431239
1584	NC_022121	T	7	7	83053	83059	0 %	100 %	0 %	0 %	532431239
1585	NC_022121	T	6	6	83066	83071	0 %	100 %	0 %	0 %	532431239
1586	NC_022121	GTA	2	6	83152	83157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431239
1587	NC_022121	T	6	6	83163	83168	0 %	100 %	0 %	0 %	532431239
1588	NC_022121	TATG	2	8	83187	83194	25 %	50 %	25 %	0 %	532431239
1589	NC_022121	TAT	2	6	83216	83221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431239
1590	NC_022121	GTCTGT	2	12	83230	83241	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532431239
1591	NC_022121	TCA	2	6	83250	83255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431239
1592	NC_022121	TCAT	2	8	83258	83265	25 %	50 %	0 %	25 %	532431239
1593	NC_022121	CAA	2	6	83300	83305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431239
1594	NC_022121	ACTG	2	8	83310	83317	25 %	25 %	25 %	25 %	532431239
1595	NC_022121	CATT	2	8	83325	83332	25 %	50 %	0 %	25 %	532431239
1596	NC_022121	AGA	2	6	83358	83363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431239
1597	NC_022121	AGCA	2	8	83364	83371	50 %	0 %	25 %	25 %	532431239
1598	NC_022121	TC	3	6	83386	83391	0 %	50 %	0 %	50 %	532431239
1599	NC_022121	TTA	2	6	83407	83412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431239
1600	NC_022121	ATTA	2	8	83517	83524	50 %	50 %	0 %	0 %	532431239
1601	NC_022121	TTTG	2	8	83557	83564	0 %	75 %	25 %	0 %	532431239
1602	NC_022121	TTG	2	6	83654	83659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431239
1603	NC_022121	GAT	2	6	83751	83756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431239
1604	NC_022121	TCTA	2	8	83841	83848	25 %	50 %	0 %	25 %	532431239
1605	NC_022121	CTA	2	6	83869	83874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431239
1606	NC_022121	TAT	2	6	83922	83927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431239
1607	NC_022121	TAAG	2	8	83946	83953	50 %	25 %	25 %	0 %	532431239
1608	NC_022121	AGT	2	6	84035	84040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431240
1609	NC_022121	TAT	2	6	84062	84067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431240
1610	NC_022121	TGC	2	6	84077	84082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431240
1611	NC_022121	AAG	2	6	84097	84102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431240
1612	NC_022121	TC	3	6	84109	84114	0 %	50 %	0 %	50 %	532431240
1613	NC_022121	AG	3	6	84120	84125	50 %	0 %	50 %	0 %	532431240
1614	NC_022121	GAA	2	6	84153	84158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431240
1615	NC_022121	CAG	2	6	84292	84297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431240
1616	NC_022121	TAA	2	6	84338	84343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431240
1617	NC_022121	AG	3	6	84387	84392	50 %	0 %	50 %	0 %	532431240
1618	NC_022121	TTC	2	6	84406	84411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431240
1619	NC_022121	GAAG	2	8	84450	84457	50 %	0 %	50 %	0 %	532431240
1620	NC_022121	A	6	6	84474	84479	100 %	0 %	0 %	0 %	532431240
1621	NC_022121	AGA	2	6	84524	84529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431240
1622	NC_022121	TTC	2	6	84602	84607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431240
1623	NC_022121	TAAA	2	8	84616	84623	75 %	25 %	0 %	0 %	532431240
1624	NC_022121	ATCC	2	8	84687	84694	25 %	25 %	0 %	50 %	532431240
1625	NC_022121	TGG	2	6	84715	84720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431240
1626	NC_022121	TGA	2	6	84748	84753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431240
1627	NC_022121	TCC	2	6	84755	84760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431240
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1629	NC_022121	TTTC	2	8	84834	84841	0 %	75 %	0 %	25 %	532431240
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1878	NC_022121	T	7	7	97693	97699	0 %	100 %	0 %	0 %	532431251
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1884	NC_022121	AG	4	8	98085	98092	50 %	0 %	50 %	0 %	532431252
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1905	NC_022121	GCC	2	6	99180	99185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431252
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1992	NC_022121	TCA	2	6	103121	103126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431256
1993	NC_022121	CGAA	2	8	103128	103135	50 %	0 %	25 %	25 %	532431256
1994	NC_022121	TCT	2	6	103154	103159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431256
1995	NC_022121	TCT	2	6	103178	103183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431256
1996	NC_022121	TTTCT	2	10	103234	103243	0 %	80 %	0 %	20 %	532431256
1997	NC_022121	CGA	2	6	103265	103270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431256
1998	NC_022121	CTTCT	2	10	103288	103297	0 %	60 %	0 %	40 %	532431256
1999	NC_022121	T	9	9	103297	103305	0 %	100 %	0 %	0 %	532431256
2000	NC_022121	GCA	2	6	103412	103417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431256

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