MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022121	TGT	2	6	54598	54603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431220
1002	NC_022121	GAT	2	6	54626	54631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431220
1003	NC_022121	TTGA	2	8	54632	54639	25 %	50 %	25 %	0 %	532431220
1004	NC_022121	GTA	2	6	54672	54677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431220
1005	NC_022121	TCA	2	6	54687	54692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431220
1006	NC_022121	GAG	2	6	54710	54715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431220
1007	NC_022121	TCAGA	2	10	54725	54734	40 %	20 %	20 %	20 %	532431220
1008	NC_022121	A	6	6	54824	54829	100 %	0 %	0 %	0 %	532431220
1009	NC_022121	G	6	6	54880	54885	0 %	0 %	100 %	0 %	532431220
1010	NC_022121	GGAA	2	8	54991	54998	50 %	0 %	50 %	0 %	532431220
1011	NC_022121	GATCTG	2	12	55014	55025	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532431220
1012	NC_022121	GTGTAA	2	12	55062	55073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431220
1013	NC_022121	GCA	2	6	55076	55081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431220
1014	NC_022121	TGG	2	6	55128	55133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431220
1015	NC_022121	GGTTCA	2	12	55151	55162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532431220
1016	NC_022121	TTATC	2	10	55252	55261	20 %	60 %	0 %	20 %	532431220
1017	NC_022121	TGAGT	2	10	55273	55282	20 %	40 %	40 %	0 %	532431220
1018	NC_022121	TCA	3	9	55286	55294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431220
1019	NC_022121	GTT	2	6	55301	55306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431220
1020	NC_022121	CTG	2	6	55347	55352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431220
1021	NC_022121	GAG	2	6	55353	55358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431220
1022	NC_022121	TGC	2	6	55387	55392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431220
1023	NC_022121	AT	3	6	55597	55602	50 %	50 %	0 %	0 %	532431220
1024	NC_022121	TTA	2	6	55612	55617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431220
1025	NC_022121	TGG	2	6	55788	55793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532432012
1026	NC_022121	TGT	2	6	55830	55835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432012
1027	NC_022121	CTGG	3	12	55890	55901	0 %	25 %	50 %	25 %	532432012
1028	NC_022121	ATT	2	6	55905	55910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432012
1029	NC_022121	GAT	2	6	55918	55923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432012
1030	NC_022121	TCT	2	6	55936	55941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432012
1031	NC_022121	TCC	2	6	55971	55976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432012
1032	NC_022121	TTA	2	6	55984	55989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432012
1033	NC_022121	TTGC	2	8	56027	56034	0 %	50 %	25 %	25 %	532432012
1034	NC_022121	AGCG	2	8	56067	56074	25 %	0 %	50 %	25 %	532432012
1035	NC_022121	T	6	6	56079	56084	0 %	100 %	0 %	0 %	532432012
1036	NC_022121	GTA	2	6	56110	56115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432012
1037	NC_022121	GTT	2	6	56221	56226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432012
1038	NC_022121	TGG	2	6	56241	56246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532432012
1039	NC_022121	GTTGT	2	10	56320	56329	0 %	60 %	40 %	0 %	532432012
1040	NC_022121	T	6	6	56375	56380	0 %	100 %	0 %	0 %	532432012
1041	NC_022121	GAAAAG	2	12	56410	56421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432012
1042	NC_022121	TCC	2	6	56425	56430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432012
1043	NC_022121	AGT	3	9	56514	56522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432012
1044	NC_022121	AGCT	2	8	56526	56533	25 %	25 %	25 %	25 %	532432012
1045	NC_022121	CT	3	6	56532	56537	0 %	50 %	0 %	50 %	532432012
1046	NC_022121	GAG	2	6	56545	56550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432012
1047	NC_022121	TGG	2	6	56568	56573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532432012
1048	NC_022121	GT	3	6	56582	56587	0 %	50 %	50 %	0 %	532432012
1049	NC_022121	TGT	2	6	56591	56596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432012
1050	NC_022121	AGT	2	6	56601	56606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432012
1051	NC_022121	GAA	2	6	56644	56649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432012
1052	NC_022121	GTT	2	6	56760	56765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432012
1053	NC_022121	T	6	6	56764	56769	0 %	100 %	0 %	0 %	532432012
1054	NC_022121	TTTG	2	8	56838	56845	0 %	75 %	25 %	0 %	532432012
1055	NC_022121	CAG	2	6	57083	57088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432012
1056	NC_022121	CAT	2	6	57092	57097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432012
1057	NC_022121	TTG	2	6	57105	57110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432012
1058	NC_022121	TGT	2	6	57186	57191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432012
1059	NC_022121	TG	3	6	57289	57294	0 %	50 %	50 %	0 %	532432012
1060	NC_022121	GGTT	2	8	57298	57305	0 %	50 %	50 %	0 %	532432012
1061	NC_022121	TAA	2	6	57354	57359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432012
1062	NC_022121	ACT	2	6	57370	57375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432012
1063	NC_022121	TTA	2	6	57376	57381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432012
1064	NC_022121	GAA	3	9	57394	57402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432012
1065	NC_022121	ATT	2	6	57405	57410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432012
1066	NC_022121	T	6	6	57409	57414	0 %	100 %	0 %	0 %	532432012
1067	NC_022121	ATT	2	6	57424	57429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432012
1068	NC_022121	TGA	2	6	57565	57570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432013
1069	NC_022121	TGT	2	6	57595	57600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432013
1070	NC_022121	GGA	2	6	57602	57607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432013
1071	NC_022121	GTT	2	6	57608	57613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432013
1072	NC_022121	GCT	2	6	57647	57652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432013
1073	NC_022121	GAT	2	6	57665	57670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432013
1074	NC_022121	TGA	2	6	57682	57687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432013
1075	NC_022121	TCC	2	6	57697	57702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432013
1076	NC_022121	AGTTGT	2	12	57761	57772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532432013
1077	NC_022121	AGA	2	6	57832	57837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432013
1078	NC_022121	CTA	2	6	57848	57853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432013
1079	NC_022121	TGA	2	6	58018	58023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432013
1080	NC_022121	TGT	2	6	58090	58095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432013
1081	NC_022121	AGAA	2	8	58159	58166	75 %	0 %	25 %	0 %	532432013
1082	NC_022121	CT	3	6	58170	58175	0 %	50 %	0 %	50 %	532432013
1083	NC_022121	GTT	2	6	58179	58184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432013
1084	NC_022121	AGGT	2	8	58199	58206	25 %	25 %	50 %	0 %	532432013
1085	NC_022121	CAC	2	6	58312	58317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532432013
1086	NC_022121	AGG	2	6	58363	58368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432013
1087	NC_022121	TCT	2	6	58379	58384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432013
1088	NC_022121	ATTTT	2	10	58493	58502	20 %	80 %	0 %	0 %	532432013
1089	NC_022121	T	6	6	58507	58512	0 %	100 %	0 %	0 %	532432013
1090	NC_022121	GCT	2	6	58589	58594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432013
1091	NC_022121	ATC	2	6	58627	58632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432013
1092	NC_022121	TCT	2	6	58638	58643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432013
1093	NC_022121	TGT	2	6	58662	58667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432013
1094	NC_022121	TTGTTC	2	12	58681	58692	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532432013
1095	NC_022121	T	6	6	58701	58706	0 %	100 %	0 %	0 %	532432013
1096	NC_022121	CTT	2	6	58719	58724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432013
1097	NC_022121	TTC	2	6	58750	58755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432013
1098	NC_022121	TGG	2	6	58776	58781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532432013
1099	NC_022121	TCC	2	6	58837	58842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432013
1100	NC_022121	TAGA	2	8	58878	58885	50 %	25 %	25 %	0 %	532432013
1101	NC_022121	TGAA	2	8	58983	58990	50 %	25 %	25 %	0 %	532432013
1102	NC_022121	TGT	2	6	58997	59002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532432013
1103	NC_022121	T	8	8	59060	59067	0 %	100 %	0 %	0 %	532432013
1104	NC_022121	T	6	6	59080	59085	0 %	100 %	0 %	0 %	532432013
1105	NC_022121	T	6	6	59091	59096	0 %	100 %	0 %	0 %	532432013
1106	NC_022121	TGAAAA	2	12	59151	59162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532431221
1107	NC_022121	AGA	2	6	59163	59168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431221
1108	NC_022121	TCT	2	6	59179	59184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431221
1109	NC_022121	T	6	6	59211	59216	0 %	100 %	0 %	0 %	532431221
1110	NC_022121	CGTT	2	8	59362	59369	0 %	50 %	25 %	25 %	532431221
1111	NC_022121	GGAG	2	8	59371	59378	25 %	0 %	75 %	0 %	532431221
1112	NC_022121	GTAA	2	8	59423	59430	50 %	25 %	25 %	0 %	532431221
1113	NC_022121	TCCTAA	2	12	59490	59501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431221
1114	NC_022121	AGT	2	6	59519	59524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431221
1115	NC_022121	T	6	6	59551	59556	0 %	100 %	0 %	0 %	532431221
1116	NC_022121	TAG	2	6	59598	59603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431221
1117	NC_022121	GCT	2	6	59611	59616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431221
1118	NC_022121	GTC	2	6	59637	59642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431221
1119	NC_022121	ATGG	2	8	59650	59657	25 %	25 %	50 %	0 %	532431221
1120	NC_022121	AGG	2	6	59684	59689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431221
1121	NC_022121	GA	3	6	59736	59741	50 %	0 %	50 %	0 %	532431221
1122	NC_022121	CAA	2	6	59759	59764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431221
1123	NC_022121	ATAA	2	8	59796	59803	75 %	25 %	0 %	0 %	532431221
1124	NC_022121	GAGCA	2	10	59836	59845	40 %	0 %	40 %	20 %	532431221
1125	NC_022121	GT	3	6	59874	59879	0 %	50 %	50 %	0 %	532431221
1126	NC_022121	AAG	2	6	60071	60076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431221
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1141	NC_022121	TTCT	2	8	60571	60578	0 %	75 %	0 %	25 %	532431222
1142	NC_022121	TTC	2	6	60610	60615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431222
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1241	NC_022121	AG	3	6	65990	65995	50 %	0 %	50 %	0 %	532431226
1242	NC_022121	TAG	2	6	66014	66019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431226
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1245	NC_022121	A	7	7	66154	66160	100 %	0 %	0 %	0 %	532431226
1246	NC_022121	CGA	2	6	66162	66167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431226
1247	NC_022121	AG	3	6	66224	66229	50 %	0 %	50 %	0 %	532431226
1248	NC_022121	TCC	2	6	66234	66239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431226
1249	NC_022121	TCAT	2	8	66240	66247	25 %	50 %	0 %	25 %	532431226
1250	NC_022121	TCT	2	6	66267	66272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431226
1251	NC_022121	TTA	2	6	66273	66278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431226
1252	NC_022121	AAG	2	6	66284	66289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431226
1253	NC_022121	AGGAG	2	10	66314	66323	40 %	0 %	60 %	0 %	532431226
1254	NC_022121	GAA	2	6	66403	66408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431226
1255	NC_022121	GTTAA	2	10	66444	66453	40 %	40 %	20 %	0 %	532431226
1256	NC_022121	AGG	2	6	66479	66484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431226
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1259	NC_022121	TGT	2	6	66572	66577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431226
1260	NC_022121	AG	3	6	66630	66635	50 %	0 %	50 %	0 %	532431226
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1263	NC_022121	CAT	2	6	66838	66843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431226
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1270	NC_022121	ACGA	2	8	67259	67266	50 %	0 %	25 %	25 %	532431226
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1272	NC_022121	TGG	2	6	67324	67329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431226
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1277	NC_022121	T	6	6	67667	67672	0 %	100 %	0 %	0 %	532431227
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1285	NC_022121	GCA	2	6	68128	68133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431227
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1355	NC_022121	CTATTT	2	12	71732	71743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532431230
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1361	NC_022121	T	6	6	72230	72235	0 %	100 %	0 %	0 %	532431231
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1366	NC_022121	AAT	2	6	72417	72422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431231
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1369	NC_022121	AGC	2	6	72517	72522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431231
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1374	NC_022121	GATT	2	8	72665	72672	25 %	50 %	25 %	0 %	532431231
1375	NC_022121	GAA	2	6	72740	72745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431231
1376	NC_022121	CTGG	2	8	72773	72780	0 %	25 %	50 %	25 %	532431231
1377	NC_022121	CTC	2	6	72793	72798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431231
1378	NC_022121	ACTCTT	2	12	72861	72872	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532431231
1379	NC_022121	GAA	2	6	72882	72887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431231
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