MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022121	GATA	2	8	633856	633863	50 %	25 %	25 %	0 %	532431702
12502	NC_022121	A	6	6	634067	634072	100 %	0 %	0 %	0 %	532432064
12503	NC_022121	CCTG	2	8	634158	634165	0 %	25 %	25 %	50 %	532432064
12504	NC_022121	AT	3	6	634220	634225	50 %	50 %	0 %	0 %	532431703
12505	NC_022121	GTC	2	6	634238	634243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431703
12506	NC_022121	TAA	2	6	634246	634251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431703
12507	NC_022121	A	6	6	634250	634255	100 %	0 %	0 %	0 %	532431703
12508	NC_022121	TC	3	6	634258	634263	0 %	50 %	0 %	50 %	532431703
12509	NC_022121	AAG	2	6	634317	634322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431703
12510	NC_022121	GAA	2	6	634352	634357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431703
12511	NC_022121	AGGA	2	8	634398	634405	50 %	0 %	50 %	0 %	532431703
12512	NC_022121	TTA	2	6	634437	634442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431703
12513	NC_022121	CCTC	2	8	634476	634483	0 %	25 %	0 %	75 %	532431703
12514	NC_022121	ATC	2	6	634514	634519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431703
12515	NC_022121	AAC	2	6	634641	634646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431703
12516	NC_022121	A	7	7	634660	634666	100 %	0 %	0 %	0 %	532431703
12517	NC_022121	CT	3	6	634694	634699	0 %	50 %	0 %	50 %	532431703
12518	NC_022121	A	6	6	634820	634825	100 %	0 %	0 %	0 %	532431703
12519	NC_022121	ACA	2	6	634841	634846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431703
12520	NC_022121	AAGA	2	8	634862	634869	75 %	0 %	25 %	0 %	532431703
12521	NC_022121	GATT	2	8	634890	634897	25 %	50 %	25 %	0 %	532431704
12522	NC_022121	TCT	2	6	634908	634913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431704
12523	NC_022121	GCA	2	6	634961	634966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431704
12524	NC_022121	CTT	2	6	634977	634982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431704
12525	NC_022121	CTC	2	6	635001	635006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431704
12526	NC_022121	A	6	6	635031	635036	100 %	0 %	0 %	0 %	532431704
12527	NC_022121	CCT	2	6	635096	635101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431704
12528	NC_022121	AAG	2	6	635103	635108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431704
12529	NC_022121	TCC	2	6	635114	635119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431704
12530	NC_022121	CCT	2	6	635211	635216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431704
12531	NC_022121	ATT	2	6	635228	635233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431704
12532	NC_022121	ACA	2	6	635266	635271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431704
12533	NC_022121	CCT	2	6	635276	635281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431704
12534	NC_022121	A	6	6	635363	635368	100 %	0 %	0 %	0 %	532431704
12535	NC_022121	TCGAG	2	10	635373	635382	20 %	20 %	40 %	20 %	532431704
12536	NC_022121	T	6	6	635400	635405	0 %	100 %	0 %	0 %	532431704
12537	NC_022121	TTG	2	6	635430	635435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431704
12538	NC_022121	TTA	2	6	635472	635477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431704
12539	NC_022121	CAA	2	6	635549	635554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431704
12540	NC_022121	ATC	2	6	635576	635581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431704
12541	NC_022121	TCA	2	6	635592	635597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431704
12542	NC_022121	CTTT	2	8	635646	635653	0 %	75 %	0 %	25 %	532431704
12543	NC_022121	ATG	3	9	635696	635704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431704
12544	NC_022121	TC	4	8	635721	635728	0 %	50 %	0 %	50 %	532431704
12545	NC_022121	CTA	2	6	635774	635779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431704
12546	NC_022121	TGA	2	6	635787	635792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431704
12547	NC_022121	CAA	2	6	635831	635836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431705
12548	NC_022121	TTTG	2	8	635850	635857	0 %	75 %	25 %	0 %	532431705
12549	NC_022121	TTA	2	6	635878	635883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431705
12550	NC_022121	CTC	2	6	635900	635905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431705
12551	NC_022121	TAT	2	6	635907	635912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431705
12552	NC_022121	TGG	2	6	635936	635941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431705
12553	NC_022121	AGC	2	6	635952	635957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431705
12554	NC_022121	TTG	2	6	635999	636004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431705
12555	NC_022121	GGCT	2	8	636034	636041	0 %	25 %	50 %	25 %	532431705
12556	NC_022121	TGC	2	6	636063	636068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431705
12557	NC_022121	GGCTC	2	10	636137	636146	0 %	20 %	40 %	40 %	532431706
12558	NC_022121	TA	3	6	636160	636165	50 %	50 %	0 %	0 %	532431706
12559	NC_022121	AGCC	2	8	636173	636180	25 %	0 %	25 %	50 %	532431706
12560	NC_022121	TCTT	2	8	636197	636204	0 %	75 %	0 %	25 %	532431706
12561	NC_022121	ATC	2	6	636238	636243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431706
12562	NC_022121	CT	3	6	636295	636300	0 %	50 %	0 %	50 %	532431706
12563	NC_022121	TGC	2	6	636311	636316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431706
12564	NC_022121	CTT	2	6	636379	636384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431706
12565	NC_022121	TGC	2	6	636441	636446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431706
12566	NC_022121	ACCA	2	8	636469	636476	50 %	0 %	0 %	50 %	532431706
12567	NC_022121	CT	3	6	636507	636512	0 %	50 %	0 %	50 %	532431706
12568	NC_022121	ATT	2	6	636554	636559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431706
12569	NC_022121	AGG	2	6	636585	636590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431706
12570	NC_022121	ATC	2	6	636631	636636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431706
12571	NC_022121	ATG	2	6	636664	636669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431706
12572	NC_022121	CAG	2	6	636749	636754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431706
12573	NC_022121	ATC	2	6	636790	636795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431706
12574	NC_022121	CTC	2	6	636806	636811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431706
12575	NC_022121	CTAC	2	8	636825	636832	25 %	25 %	0 %	50 %	532431706
12576	NC_022121	TGG	2	6	636880	636885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431706
12577	NC_022121	ATT	2	6	636905	636910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431706
12578	NC_022121	CTA	2	6	636938	636943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431706
12579	NC_022121	TCC	2	6	636960	636965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431706
12580	NC_022121	TGC	2	6	637084	637089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431707
12581	NC_022121	AAT	2	6	637110	637115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431707
12582	NC_022121	CAA	2	6	637283	637288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431707
12583	NC_022121	CAC	2	6	637343	637348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431707
12584	NC_022121	C	6	6	637389	637394	0 %	0 %	0 %	100 %	532431707
12585	NC_022121	TG	3	6	637407	637412	0 %	50 %	50 %	0 %	532431707
12586	NC_022121	GAG	2	6	637468	637473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431707
12587	NC_022121	CT	3	6	637474	637479	0 %	50 %	0 %	50 %	532431707
12588	NC_022121	TCT	2	6	637602	637607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431708
12589	NC_022121	CAG	2	6	637670	637675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431708
12590	NC_022121	CTT	2	6	637698	637703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431708
12591	NC_022121	AAAG	2	8	637711	637718	75 %	0 %	25 %	0 %	532431708
12592	NC_022121	GCA	2	6	637801	637806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431708
12593	NC_022121	CTG	2	6	637836	637841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431708
12594	NC_022121	CG	3	6	637843	637848	0 %	0 %	50 %	50 %	532431708
12595	NC_022121	GAA	2	6	637916	637921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431708
12596	NC_022121	CAAC	2	8	638034	638041	50 %	0 %	0 %	50 %	532431708
12597	NC_022121	GGA	2	6	638057	638062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431708
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12599	NC_022121	AGCA	2	8	638124	638131	50 %	0 %	25 %	25 %	532431708
12600	NC_022121	GAA	2	6	638224	638229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431708
12601	NC_022121	ATT	2	6	638286	638291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431708
12602	NC_022121	GGC	2	6	638293	638298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431708
12603	NC_022121	AAC	2	6	638340	638345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431708
12604	NC_022121	GCTCT	2	10	638378	638387	0 %	40 %	20 %	40 %	532431708
12605	NC_022121	TCGTT	2	10	638406	638415	0 %	60 %	20 %	20 %	532431708
12606	NC_022121	TTG	2	6	638448	638453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431708
12607	NC_022121	CTT	2	6	638468	638473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431708
12608	NC_022121	GCA	2	6	638518	638523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431708
12609	NC_022121	TAG	2	6	638559	638564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431708
12610	NC_022121	AAAAT	2	10	638569	638578	80 %	20 %	0 %	0 %	532431708
12611	NC_022121	TGG	2	6	638624	638629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431709
12612	NC_022121	CCTT	2	8	638641	638648	0 %	50 %	0 %	50 %	532431709
12613	NC_022121	TCCAT	2	10	638707	638716	20 %	40 %	0 %	40 %	532431709
12614	NC_022121	AGAA	2	8	638717	638724	75 %	0 %	25 %	0 %	532431709
12615	NC_022121	CCT	2	6	638758	638763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431709
12616	NC_022121	CT	3	6	638762	638767	0 %	50 %	0 %	50 %	532431709
12617	NC_022121	CTA	2	6	638776	638781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431709
12618	NC_022121	GAAA	2	8	638870	638877	75 %	0 %	25 %	0 %	532431709
12619	NC_022121	A	6	6	638875	638880	100 %	0 %	0 %	0 %	532431709
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12621	NC_022121	ATATCC	2	12	638995	639006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431709
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12742	NC_022121	C	9	9	644549	644557	0 %	0 %	0 %	100 %	532431714
12743	NC_022121	GTT	2	6	644603	644608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431714
12744	NC_022121	TC	3	6	644657	644662	0 %	50 %	0 %	50 %	532431714
12745	NC_022121	GA	3	6	644673	644678	50 %	0 %	50 %	0 %	532431714
12746	NC_022121	CTT	2	6	644684	644689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431714
12747	NC_022121	CAT	2	6	644708	644713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431714
12748	NC_022121	CAAA	2	8	644841	644848	75 %	0 %	0 %	25 %	532431714
12749	NC_022121	TCC	2	6	644892	644897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431715
12750	NC_022121	CAA	2	6	644990	644995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431715
12751	NC_022121	TCT	2	6	645103	645108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431715
12752	NC_022121	ATC	2	6	645162	645167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431715
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12754	NC_022121	CTG	2	6	645194	645199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431715
12755	NC_022121	TAA	2	6	645200	645205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431715
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12757	NC_022121	CTG	2	6	645300	645305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431715
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12760	NC_022121	ATC	2	6	645351	645356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431715
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12770	NC_022121	CTT	2	6	645854	645859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431715
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12772	NC_022121	TTA	2	6	645919	645924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431715
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12775	NC_022121	CTG	2	6	646025	646030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431715
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12781	NC_022121	CT	3	6	646435	646440	0 %	50 %	0 %	50 %	532431716
12782	NC_022121	ATGA	2	8	646462	646469	50 %	25 %	25 %	0 %	532431716
12783	NC_022121	TCCAT	2	10	646478	646487	20 %	40 %	0 %	40 %	532431716
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12798	NC_022121	CAAGC	2	10	647410	647419	40 %	0 %	20 %	40 %	532431717
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12855	NC_022121	GCT	2	6	650018	650023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431718
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12857	NC_022121	A	6	6	650070	650075	100 %	0 %	0 %	0 %	532431719
12858	NC_022121	CAAG	2	8	650084	650091	50 %	0 %	25 %	25 %	532431719
12859	NC_022121	CA	3	6	650092	650097	50 %	0 %	0 %	50 %	532431719
12860	NC_022121	CTT	2	6	650098	650103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431719
12861	NC_022121	A	6	6	650136	650141	100 %	0 %	0 %	0 %	532431719
12862	NC_022121	GAT	2	6	650174	650179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431719
12863	NC_022121	ATG	2	6	650250	650255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431719
12864	NC_022121	GCA	2	6	650256	650261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431719
12865	NC_022121	CT	3	6	650279	650284	0 %	50 %	0 %	50 %	532431719
12866	NC_022121	TAAA	2	8	650395	650402	75 %	25 %	0 %	0 %	532431719
12867	NC_022121	TGA	2	6	650411	650416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431719
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12972	NC_022121	GA	3	6	656125	656130	50 %	0 %	50 %	0 %	532431723
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12981	NC_022121	A	7	7	657193	657199	100 %	0 %	0 %	0 %	532431724
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12984	NC_022121	GCT	2	6	657294	657299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431724
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12987	NC_022121	CTT	2	6	657382	657387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431724
12988	NC_022121	GCT	2	6	657417	657422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431724
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