MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022121	AGGGT	2	10	28577	28586	20 %	20 %	60 %	0 %	532431194
502	NC_022121	TTC	2	6	28613	28618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431194
503	NC_022121	CAG	2	6	28625	28630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431194
504	NC_022121	GAA	2	6	28639	28644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431194
505	NC_022121	TGA	2	6	28653	28658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431194
506	NC_022121	TTC	2	6	28686	28691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431194
507	NC_022121	GC	4	8	28857	28864	0 %	0 %	50 %	50 %	532431194
508	NC_022121	AAG	2	6	28865	28870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431194
509	NC_022121	TA	3	6	28979	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	532431194
510	NC_022121	GAA	2	6	29068	29073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431194
511	NC_022121	TGT	2	6	29100	29105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431195
512	NC_022121	TCT	2	6	29168	29173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431195
513	NC_022121	ACA	2	6	29396	29401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431195
514	NC_022121	ATG	2	6	29406	29411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431195
515	NC_022121	CTTT	2	8	29548	29555	0 %	75 %	0 %	25 %	532431195
516	NC_022121	TTTG	2	8	29563	29570	0 %	75 %	25 %	0 %	532431195
517	NC_022121	TTGT	2	8	29598	29605	0 %	75 %	25 %	0 %	532431195
518	NC_022121	CCTAT	2	10	29617	29626	20 %	40 %	0 %	40 %	532431195
519	NC_022121	T	6	6	29633	29638	0 %	100 %	0 %	0 %	532431195
520	NC_022121	ATC	2	6	29712	29717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431195
521	NC_022121	TGGC	2	8	29761	29768	0 %	25 %	50 %	25 %	532431195
522	NC_022121	T	8	8	29867	29874	0 %	100 %	0 %	0 %	532431195
523	NC_022121	ATG	2	6	29892	29897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431195
524	NC_022121	GA	3	6	29930	29935	50 %	0 %	50 %	0 %	532431195
525	NC_022121	AG	3	6	30028	30033	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
526	NC_022121	GTT	2	6	30109	30114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431196
527	NC_022121	GAA	2	6	30118	30123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431196
528	NC_022121	TC	3	6	30137	30142	0 %	50 %	0 %	50 %	532431196
529	NC_022121	TCT	2	6	30184	30189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431196
530	NC_022121	ACT	2	6	30274	30279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431196
531	NC_022121	TTC	2	6	30302	30307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431196
532	NC_022121	AAAG	2	8	30321	30328	75 %	0 %	25 %	0 %	532431196
533	NC_022121	CCT	2	6	30338	30343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431196
534	NC_022121	AAAC	2	8	30391	30398	75 %	0 %	0 %	25 %	532431196
535	NC_022121	T	6	6	30408	30413	0 %	100 %	0 %	0 %	532431196
536	NC_022121	GAAGG	2	10	30416	30425	40 %	0 %	60 %	0 %	532431196
537	NC_022121	GGC	2	6	30444	30449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431196
538	NC_022121	GAT	2	6	30523	30528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431196
539	NC_022121	GATG	2	8	30534	30541	25 %	25 %	50 %	0 %	532431196
540	NC_022121	TAG	2	6	30545	30550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431196
541	NC_022121	GTT	2	6	30619	30624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431196
542	NC_022121	TAA	2	6	30729	30734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431196
543	NC_022121	GA	3	6	30758	30763	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
544	NC_022121	GAA	2	6	30868	30873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431196
545	NC_022121	AGA	2	6	30888	30893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431196
546	NC_022121	TCG	2	6	30951	30956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431196
547	NC_022121	ATG	2	6	30985	30990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431196
548	NC_022121	TGG	2	6	30999	31004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431196
549	NC_022121	GAA	2	6	31030	31035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431196
550	NC_022121	ATT	2	6	31066	31071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431196
551	NC_022121	ATG	2	6	31189	31194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431196
552	NC_022121	AAG	2	6	31201	31206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431196
553	NC_022121	T	6	6	31207	31212	0 %	100 %	0 %	0 %	532431196
554	NC_022121	GA	3	6	31226	31231	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
555	NC_022121	A	7	7	31249	31255	100 %	0 %	0 %	0 %	532431196
556	NC_022121	ACA	2	6	31295	31300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431197
557	NC_022121	TGT	2	6	31316	31321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431197
558	NC_022121	AT	3	6	31367	31372	50 %	50 %	0 %	0 %	532431197
559	NC_022121	T	6	6	31435	31440	0 %	100 %	0 %	0 %	532431197
560	NC_022121	GAGCT	2	10	31456	31465	20 %	20 %	40 %	20 %	532431197
561	NC_022121	A	6	6	31530	31535	100 %	0 %	0 %	0 %	532431197
562	NC_022121	A	6	6	31561	31566	100 %	0 %	0 %	0 %	532431197
563	NC_022121	TGC	2	6	31589	31594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431197
564	NC_022121	AGC	2	6	31607	31612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431197
565	NC_022121	GATA	2	8	31643	31650	50 %	25 %	25 %	0 %	532431198
566	NC_022121	TC	3	6	31652	31657	0 %	50 %	0 %	50 %	532431198
567	NC_022121	AAG	2	6	31856	31861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431198
568	NC_022121	AAG	2	6	31863	31868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431198
569	NC_022121	CTT	2	6	31902	31907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431198
570	NC_022121	CGT	2	6	31933	31938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431198
571	NC_022121	TGA	2	6	31979	31984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431198
572	NC_022121	GAG	2	6	32010	32015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431198
573	NC_022121	GCG	2	6	32052	32057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431198
574	NC_022121	GC	3	6	32082	32087	0 %	0 %	50 %	50 %	532431198
575	NC_022121	CT	3	6	32132	32137	0 %	50 %	0 %	50 %	532431198
576	NC_022121	AGA	2	6	32230	32235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431198
577	NC_022121	AG	3	6	32264	32269	50 %	0 %	50 %	0 %	532431198
578	NC_022121	AAG	2	6	32418	32423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431198
579	NC_022121	ATT	2	6	32468	32473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431198
580	NC_022121	T	6	6	32573	32578	0 %	100 %	0 %	0 %	532431198
581	NC_022121	AGG	2	6	32823	32828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431199
582	NC_022121	GGT	2	6	32878	32883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431199
583	NC_022121	GCT	2	6	33040	33045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431199
584	NC_022121	GCT	2	6	33073	33078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431199
585	NC_022121	GAA	2	6	33184	33189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431200
586	NC_022121	A	6	6	33188	33193	100 %	0 %	0 %	0 %	532431200
587	NC_022121	TGT	2	6	33279	33284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431200
588	NC_022121	TGA	2	6	33330	33335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431200
589	NC_022121	AGG	2	6	33467	33472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431200
590	NC_022121	CTT	2	6	33491	33496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431200
591	NC_022121	T	6	6	33513	33518	0 %	100 %	0 %	0 %	532431200
592	NC_022121	GTT	2	6	33531	33536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431200
593	NC_022121	CAG	2	6	33701	33706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431200
594	NC_022121	TC	3	6	33761	33766	0 %	50 %	0 %	50 %	532431200
595	NC_022121	AG	3	6	33774	33779	50 %	0 %	50 %	0 %	532431200
596	NC_022121	CTG	2	6	33871	33876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431201
597	NC_022121	ACA	2	6	33888	33893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431201
598	NC_022121	AG	3	6	33912	33917	50 %	0 %	50 %	0 %	532431201
599	NC_022121	GTC	2	6	33944	33949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431201
600	NC_022121	ATT	2	6	33991	33996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431201
601	NC_022121	T	6	6	34043	34048	0 %	100 %	0 %	0 %	532431201
602	NC_022121	TTA	2	6	34073	34078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431201
603	NC_022121	TGAT	2	8	34138	34145	25 %	50 %	25 %	0 %	532431201
604	NC_022121	GAA	2	6	34166	34171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431201
605	NC_022121	AAG	2	6	34213	34218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431201
606	NC_022121	AGA	2	6	34264	34269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431201
607	NC_022121	AAGA	3	12	34266	34277	75 %	0 %	25 %	0 %	532431201
608	NC_022121	TGC	2	6	34301	34306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431201
609	NC_022121	TGT	2	6	34325	34330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431201
610	NC_022121	ATG	2	6	34336	34341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431201
611	NC_022121	AAG	2	6	34367	34372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431201
612	NC_022121	GAA	2	6	34386	34391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431201
613	NC_022121	AAGC	2	8	34486	34493	50 %	0 %	25 %	25 %	532431202
614	NC_022121	GTTC	2	8	34519	34526	0 %	50 %	25 %	25 %	532431202
615	NC_022121	GAT	2	6	34597	34602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431202
616	NC_022121	GA	4	8	34604	34611	50 %	0 %	50 %	0 %	532431202
617	NC_022121	GA	4	8	34628	34635	50 %	0 %	50 %	0 %	532431202
618	NC_022121	AGA	2	6	34663	34668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431202
619	NC_022121	TTA	2	6	34726	34731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431203
620	NC_022121	TGA	2	6	34859	34864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431203
621	NC_022121	GGCA	2	8	34898	34905	25 %	0 %	50 %	25 %	532431203
622	NC_022121	ATC	2	6	35008	35013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431203
623	NC_022121	GAA	2	6	35097	35102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431203
624	NC_022121	TGT	2	6	35126	35131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431203
625	NC_022121	TCGA	2	8	35155	35162	25 %	25 %	25 %	25 %	532431203
626	NC_022121	GAG	2	6	35167	35172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431203
627	NC_022121	CAG	2	6	35181	35186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431203
628	NC_022121	AGA	2	6	35300	35305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431203
629	NC_022121	TGCT	2	8	35308	35315	0 %	50 %	25 %	25 %	532431203
630	NC_022121	TATG	2	8	35451	35458	25 %	50 %	25 %	0 %	532431203
631	NC_022121	GCA	2	6	35502	35507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431203
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633	NC_022121	TTGG	2	8	35540	35547	0 %	50 %	50 %	0 %	532431203
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639	NC_022121	ATG	2	6	36076	36081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431203
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642	NC_022121	AGAT	2	8	36260	36267	50 %	25 %	25 %	0 %	532431203
643	NC_022121	T	6	6	36291	36296	0 %	100 %	0 %	0 %	532431203
644	NC_022121	ATT	2	6	36335	36340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431203
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656	NC_022121	TGC	2	6	37002	37007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431204
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746	NC_022121	GA	4	8	42010	42017	50 %	0 %	50 %	0 %	532431207
747	NC_022121	GGAT	2	8	42020	42027	25 %	25 %	50 %	0 %	532431207
748	NC_022121	A	7	7	42081	42087	100 %	0 %	0 %	0 %	532431207
749	NC_022121	AGCAA	2	10	42108	42117	60 %	0 %	20 %	20 %	532431207
750	NC_022121	CGG	2	6	42138	42143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532431207
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752	NC_022121	A	6	6	42203	42208	100 %	0 %	0 %	0 %	532431207
753	NC_022121	GTT	2	6	42223	42228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431207
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756	NC_022121	CT	3	6	42312	42317	0 %	50 %	0 %	50 %	532432011
757	NC_022121	TGCAA	2	10	42323	42332	40 %	20 %	20 %	20 %	532432011
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761	NC_022121	T	8	8	42479	42486	0 %	100 %	0 %	0 %	532432011
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