MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 20481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022121	GAC	2	6	232010	232015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431356
4502	NC_022121	A	8	8	232052	232059	100 %	0 %	0 %	0 %	532431356
4503	NC_022121	TAA	2	6	232088	232093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431356
4504	NC_022121	AGA	2	6	232124	232129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431356
4505	NC_022121	GGA	2	6	232169	232174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431356
4506	NC_022121	TGA	2	6	232184	232189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431356
4507	NC_022121	TCC	2	6	232193	232198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431356
4508	NC_022121	AATG	2	8	232221	232228	50 %	25 %	25 %	0 %	532431356
4509	NC_022121	ATT	2	6	232270	232275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431356
4510	NC_022121	ATG	2	6	232316	232321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431357
4511	NC_022121	CAA	2	6	232322	232327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431357
4512	NC_022121	A	6	6	232348	232353	100 %	0 %	0 %	0 %	532431357
4513	NC_022121	A	6	6	232422	232427	100 %	0 %	0 %	0 %	532431357
4514	NC_022121	AAG	2	6	232518	232523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431357
4515	NC_022121	A	6	6	232617	232622	100 %	0 %	0 %	0 %	532431357
4516	NC_022121	AGG	2	6	232687	232692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431357
4517	NC_022121	TGC	2	6	232738	232743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431357
4518	NC_022121	AGA	2	6	232780	232785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431357
4519	NC_022121	CT	3	6	232807	232812	0 %	50 %	0 %	50 %	532431357
4520	NC_022121	C	6	6	232819	232824	0 %	0 %	0 %	100 %	532431357
4521	NC_022121	A	6	6	232859	232864	100 %	0 %	0 %	0 %	532431357
4522	NC_022121	AAG	2	6	232920	232925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431357
4523	NC_022121	TTAC	2	8	232936	232943	25 %	50 %	0 %	25 %	532431357
4524	NC_022121	TCA	2	6	232975	232980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431357
4525	NC_022121	AT	3	6	233024	233029	50 %	50 %	0 %	0 %	532431357
4526	NC_022121	TCA	2	6	233041	233046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431357
4527	NC_022121	ATT	2	6	233101	233106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431357
4528	NC_022121	CT	3	6	233125	233130	0 %	50 %	0 %	50 %	532431357
4529	NC_022121	CTT	2	6	233228	233233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431358
4530	NC_022121	GCTA	2	8	233253	233260	25 %	25 %	25 %	25 %	532431358
4531	NC_022121	CTT	3	9	233315	233323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431358
4532	NC_022121	AGG	2	6	233355	233360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431358
4533	NC_022121	ATT	2	6	233394	233399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431358
4534	NC_022121	TAA	2	6	233418	233423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431358
4535	NC_022121	TTA	2	6	233444	233449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431358
4536	NC_022121	TA	3	6	233477	233482	50 %	50 %	0 %	0 %	532431358
4537	NC_022121	ATT	2	6	233510	233515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431358
4538	NC_022121	CT	3	6	233539	233544	0 %	50 %	0 %	50 %	532431358
4539	NC_022121	A	6	6	233555	233560	100 %	0 %	0 %	0 %	532431358
4540	NC_022121	CAAAA	2	10	233562	233571	80 %	0 %	0 %	20 %	532431358
4541	NC_022121	AGA	2	6	233576	233581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431358
4542	NC_022121	A	8	8	233601	233608	100 %	0 %	0 %	0 %	532431358
4543	NC_022121	AGG	2	6	233634	233639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431358
4544	NC_022121	CAG	2	6	233702	233707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431358
4545	NC_022121	A	6	6	233742	233747	100 %	0 %	0 %	0 %	532431358
4546	NC_022121	TTCT	2	8	233828	233835	0 %	75 %	0 %	25 %	532431358
4547	NC_022121	CAT	2	6	233848	233853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431358
4548	NC_022121	GAA	2	6	233938	233943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431358
4549	NC_022121	CAAA	2	8	234060	234067	75 %	0 %	0 %	25 %	532431358
4550	NC_022121	CAA	2	6	234145	234150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431358
4551	NC_022121	TCTCT	2	10	234176	234185	0 %	60 %	0 %	40 %	532431358
4552	NC_022121	CTT	2	6	234275	234280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431358
4553	NC_022121	GCT	2	6	234412	234417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431358
4554	NC_022121	TC	3	6	234418	234423	0 %	50 %	0 %	50 %	532431358
4555	NC_022121	ATG	2	6	234520	234525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431358
4556	NC_022121	TCAA	2	8	234542	234549	50 %	25 %	0 %	25 %	532431358
4557	NC_022121	TTA	2	6	234631	234636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431358
4558	NC_022121	GAA	2	6	234676	234681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431358
4559	NC_022121	TTG	2	6	234689	234694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431358
4560	NC_022121	TTC	2	6	235068	235073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431359
4561	NC_022121	A	6	6	235081	235086	100 %	0 %	0 %	0 %	532431359
4562	NC_022121	T	7	7	235117	235123	0 %	100 %	0 %	0 %	532431359
4563	NC_022121	GAA	2	6	235130	235135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431359
4564	NC_022121	CTT	2	6	235184	235189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431359
4565	NC_022121	AATA	2	8	235223	235230	75 %	25 %	0 %	0 %	532431359
4566	NC_022121	TAA	2	6	235272	235277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431359
4567	NC_022121	CCT	2	6	235285	235290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431359
4568	NC_022121	TCC	2	6	235308	235313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431359
4569	NC_022121	CTG	2	6	235328	235333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431359
4570	NC_022121	AAG	2	6	235394	235399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431359
4571	NC_022121	TAG	2	6	235440	235445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431359
4572	NC_022121	AGA	2	6	235500	235505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431359
4573	NC_022121	AG	3	6	235636	235641	50 %	0 %	50 %	0 %	532431359
4574	NC_022121	GTT	2	6	235712	235717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431359
4575	NC_022121	GTA	2	6	235733	235738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431359
4576	NC_022121	TTCC	2	8	235765	235772	0 %	50 %	0 %	50 %	532431359
4577	NC_022121	A	6	6	235783	235788	100 %	0 %	0 %	0 %	532431359
4578	NC_022121	A	6	6	235867	235872	100 %	0 %	0 %	0 %	532431359
4579	NC_022121	TAA	2	6	235937	235942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431359
4580	NC_022121	ACG	2	6	235998	236003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431359
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4582	NC_022121	TC	3	6	236065	236070	0 %	50 %	0 %	50 %	532431359
4583	NC_022121	AAG	2	6	236079	236084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431359
4584	NC_022121	GACT	2	8	236096	236103	25 %	25 %	25 %	25 %	532431359
4585	NC_022121	AT	3	6	236194	236199	50 %	50 %	0 %	0 %	532431359
4586	NC_022121	A	6	6	236222	236227	100 %	0 %	0 %	0 %	532431359
4587	NC_022121	A	7	7	236244	236250	100 %	0 %	0 %	0 %	532431359
4588	NC_022121	CAT	2	6	236267	236272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431359
4589	NC_022121	ACA	2	6	236304	236309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431359
4590	NC_022121	TTCAC	2	10	236346	236355	20 %	40 %	0 %	40 %	532431360
4591	NC_022121	CTT	3	9	236401	236409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
4592	NC_022121	ATA	2	6	236424	236429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431360
4593	NC_022121	CTGT	2	8	236476	236483	0 %	50 %	25 %	25 %	532431360
4594	NC_022121	AAC	2	6	236547	236552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431360
4595	NC_022121	AGA	2	6	236780	236785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431360
4596	NC_022121	TCT	2	6	237015	237020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
4597	NC_022121	AT	5	10	237035	237044	50 %	50 %	0 %	0 %	532431360
4598	NC_022121	TTGA	2	8	237086	237093	25 %	50 %	25 %	0 %	532431360
4599	NC_022121	CTT	2	6	237098	237103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
4600	NC_022121	AAGT	2	8	237167	237174	50 %	25 %	25 %	0 %	532431360
4601	NC_022121	TTCCTT	2	12	237230	237241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
4602	NC_022121	GAC	2	6	237469	237474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431360
4603	NC_022121	C	6	6	237511	237516	0 %	0 %	0 %	100 %	532431360
4604	NC_022121	TGC	2	6	237566	237571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431360
4605	NC_022121	GAT	2	6	237577	237582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431360
4606	NC_022121	TCT	2	6	237585	237590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
4607	NC_022121	A	6	6	237591	237596	100 %	0 %	0 %	0 %	532431360
4608	NC_022121	CTT	2	6	237616	237621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
4609	NC_022121	ATCC	2	8	237631	237638	25 %	25 %	0 %	50 %	532431360
4610	NC_022121	CTT	2	6	237676	237681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
4611	NC_022121	TCA	2	6	237948	237953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431360
4612	NC_022121	GAG	2	6	237959	237964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431360
4613	NC_022121	A	6	6	237996	238001	100 %	0 %	0 %	0 %	532431360
4614	NC_022121	TTG	2	6	238027	238032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431360
4615	NC_022121	TTC	2	6	238101	238106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431360
4616	NC_022121	GCA	2	6	238183	238188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431360
4617	NC_022121	C	6	6	238223	238228	0 %	0 %	0 %	100 %	532431360
4618	NC_022121	A	7	7	238341	238347	100 %	0 %	0 %	0 %	532431360
4619	NC_022121	TCG	2	6	238401	238406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431360
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4621	NC_022121	GT	3	6	238475	238480	0 %	50 %	50 %	0 %	532431360
4622	NC_022121	TCC	2	6	238680	238685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431360
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4624	NC_022121	CAT	2	6	238886	238891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431361
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4871	NC_022121	CT	3	6	250312	250317	0 %	50 %	0 %	50 %	532431372
4872	NC_022121	GAT	2	6	250328	250333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431372
4873	NC_022121	TCCGT	2	10	250344	250353	0 %	40 %	20 %	40 %	532431372
4874	NC_022121	CTC	2	6	250360	250365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431372
4875	NC_022121	AAT	2	6	250373	250378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431372
4876	NC_022121	CCA	2	6	250407	250412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431372
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4878	NC_022121	ATC	2	6	250524	250529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431372
4879	NC_022121	ATG	2	6	250569	250574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431372
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4881	NC_022121	GGAA	2	8	250605	250612	50 %	0 %	50 %	0 %	532431372
4882	NC_022121	GCT	2	6	250632	250637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431372
4883	NC_022121	CCA	2	6	250659	250664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431372
4884	NC_022121	GTATG	2	10	250783	250792	20 %	40 %	40 %	0 %	532431372
4885	NC_022121	ACA	2	6	251151	251156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431373
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4889	NC_022121	TTG	2	6	251228	251233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431373
4890	NC_022121	CAAA	2	8	251392	251399	75 %	0 %	0 %	25 %	532431374
4891	NC_022121	ATA	2	6	251415	251420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431374
4892	NC_022121	CAAT	2	8	251502	251509	50 %	25 %	0 %	25 %	532431374
4893	NC_022121	CTTT	3	12	251554	251565	0 %	75 %	0 %	25 %	532431374
4894	NC_022121	CGA	2	6	251596	251601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431374
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4897	NC_022121	CAT	4	12	251811	251822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431375
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4900	NC_022121	AGT	2	6	252012	252017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431375
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4902	NC_022121	TCTT	2	8	252076	252083	0 %	75 %	0 %	25 %	532431375
4903	NC_022121	AGA	2	6	252104	252109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431375
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4955	NC_022121	TTCA	2	8	254662	254669	25 %	50 %	0 %	25 %	532431379
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4961	NC_022121	A	6	6	255021	255026	100 %	0 %	0 %	0 %	532431379
4962	NC_022121	AAG	2	6	255309	255314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431380
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4981	NC_022121	TCTG	2	8	256180	256187	0 %	50 %	25 %	25 %	532431381
4982	NC_022121	TCC	2	6	256210	256215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431381
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4984	NC_022121	CTTA	2	8	256287	256294	25 %	50 %	0 %	25 %	532431381
4985	NC_022121	CGA	2	6	256300	256305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431381
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4987	NC_022121	ACG	2	6	256407	256412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431381
4988	NC_022121	AACC	2	8	256451	256458	50 %	0 %	0 %	50 %	532431381
4989	NC_022121	CAG	2	6	256475	256480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431381
4990	NC_022121	AAG	2	6	256484	256489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431381
4991	NC_022121	CTG	2	6	256508	256513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431381
4992	NC_022121	GCT	2	6	256636	256641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431381
4993	NC_022121	ATTT	2	8	256693	256700	25 %	75 %	0 %	0 %	532431381
4994	NC_022121	TC	3	6	256945	256950	0 %	50 %	0 %	50 %	532431382
4995	NC_022121	A	6	6	256954	256959	100 %	0 %	0 %	0 %	532431382
4996	NC_022121	ATG	2	6	256965	256970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431382
4997	NC_022121	ATCT	2	8	257014	257021	25 %	50 %	0 %	25 %	532431382
4998	NC_022121	T	7	7	257056	257062	0 %	100 %	0 %	0 %	532431382
4999	NC_022121	GCT	2	6	257066	257071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431382
5000	NC_022121	CTT	2	6	257076	257081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431382

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