MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain Ia20-97 genome

Total Repeats: 20530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2004	NC_022120	CTT	2	6	103523	103528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427207
2005	NC_022120	AGG	2	6	103614	103619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427207
2006	NC_022120	TCC	2	6	103623	103628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532427207
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2009	NC_022120	ATC	2	6	103738	103743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427207
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2011	NC_022120	AGTA	2	8	103842	103849	50 %	25 %	25 %	0 %	532427207
2012	NC_022120	GGAA	2	8	104003	104010	50 %	0 %	50 %	0 %	532427207
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2023	NC_022120	ATCAT	2	10	104410	104419	40 %	40 %	0 %	20 %	532427207
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2033	NC_022120	GGCAT	2	10	105118	105127	20 %	20 %	40 %	20 %	532427207
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2125	NC_022120	AT	3	6	110091	110096	50 %	50 %	0 %	0 %	532427212
2126	NC_022120	TGCT	2	8	110107	110114	0 %	50 %	25 %	25 %	532427212
2127	NC_022120	T	6	6	110149	110154	0 %	100 %	0 %	0 %	532427212
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2132	NC_022120	GAT	2	6	110407	110412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427212
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2135	NC_022120	TTG	2	6	110719	110724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532427212
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2140	NC_022120	TAG	2	6	111114	111119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427212
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2230	NC_022120	GAT	2	6	114998	115003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427213
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2232	NC_022120	TCT	2	6	115220	115225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427213
2233	NC_022120	ACA	2	6	115230	115235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427213
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2238	NC_022120	ACC	2	6	115373	115378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532427213
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2241	NC_022120	ACTTCG	2	12	115521	115532	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427213
2242	NC_022120	ACA	3	9	115611	115619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427213
2243	NC_022120	CAA	2	6	115636	115641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427213
2244	NC_022120	TTC	3	9	115685	115693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427213
2245	NC_022120	TCT	2	6	115746	115751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427213
2246	NC_022120	AAGC	2	8	115755	115762	50 %	0 %	25 %	25 %	532427213
2247	NC_022120	TATCG	2	10	115763	115772	20 %	40 %	20 %	20 %	532427213
2248	NC_022120	T	6	6	115779	115784	0 %	100 %	0 %	0 %	532427213
2249	NC_022120	ATG	2	6	115820	115825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427213
2250	NC_022120	GGTT	2	8	116087	116094	0 %	50 %	50 %	0 %	532427214
2251	NC_022120	T	7	7	116103	116109	0 %	100 %	0 %	0 %	532427214
2252	NC_022120	GCT	2	6	116229	116234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427214
2253	NC_022120	TTTCT	2	10	116279	116288	0 %	80 %	0 %	20 %	532427214
2254	NC_022120	ACA	2	6	116316	116321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427214
2255	NC_022120	TAT	2	6	116504	116509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532427214
2256	NC_022120	TATC	2	8	116536	116543	25 %	50 %	0 %	25 %	532427214
2257	NC_022120	TTTG	2	8	116633	116640	0 %	75 %	25 %	0 %	532427214
2258	NC_022120	AGG	3	9	116645	116653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427214
2259	NC_022120	AGA	2	6	116666	116671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427214
2260	NC_022120	GA	3	6	116720	116725	50 %	0 %	50 %	0 %	532427214
2261	NC_022120	A	6	6	116773	116778	100 %	0 %	0 %	0 %	532427214
2262	NC_022120	GTTC	2	8	116829	116836	0 %	50 %	25 %	25 %	532427214
2263	NC_022120	TAA	2	6	116849	116854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427214
2264	NC_022120	ACC	2	6	116865	116870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532427214
2265	NC_022120	GCT	2	6	116883	116888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427214
2266	NC_022120	AGG	2	6	116933	116938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427214
2267	NC_022120	ATT	2	6	116967	116972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532427214
2268	NC_022120	TTC	2	6	116984	116989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427214
2269	NC_022120	TGC	2	6	117014	117019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427214
2270	NC_022120	CTG	2	6	117061	117066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427214
2271	NC_022120	GCA	2	6	117266	117271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427215
2272	NC_022120	TGC	2	6	117277	117282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427215
2273	NC_022120	AAG	2	6	117285	117290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427215
2274	NC_022120	GAAA	2	8	117337	117344	75 %	0 %	25 %	0 %	532427215
2275	NC_022120	GTT	2	6	117380	117385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532427215
2276	NC_022120	TAT	2	6	117396	117401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532427215
2277	NC_022120	TCC	2	6	117423	117428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532427215
2278	NC_022120	TAA	3	9	117486	117494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427215
2279	NC_022120	AGA	2	6	117569	117574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427970
2280	NC_022120	AGC	2	6	117591	117596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427970
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2282	NC_022120	CAA	2	6	117617	117622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427970
2283	NC_022120	AGA	2	6	117623	117628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427970
2284	NC_022120	AAG	2	6	117669	117674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427971
2285	NC_022120	TAA	2	6	117682	117687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427971
2286	NC_022120	T	6	6	117703	117708	0 %	100 %	0 %	0 %	532427971
2287	NC_022120	CA	3	6	117890	117895	50 %	0 %	0 %	50 %	532427971
2288	NC_022120	ATC	2	6	117938	117943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427971
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2291	NC_022120	AGA	3	9	118111	118119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427216
2292	NC_022120	CTTT	2	8	118148	118155	0 %	75 %	0 %	25 %	532427216
2293	NC_022120	GTAG	2	8	118193	118200	25 %	25 %	50 %	0 %	532427216
2294	NC_022120	ATGCT	2	10	118202	118211	20 %	40 %	20 %	20 %	532427216
2295	NC_022120	G	6	6	118241	118246	0 %	0 %	100 %	0 %	532427216
2296	NC_022120	T	6	6	118264	118269	0 %	100 %	0 %	0 %	532427216
2297	NC_022120	GTT	2	6	118382	118387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532427216
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2299	NC_022120	TTA	2	6	118412	118417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532427216
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2301	NC_022120	A	8	8	118467	118474	100 %	0 %	0 %	0 %	532427216
2302	NC_022120	CTC	2	6	118482	118487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532427216
2303	NC_022120	AAAGA	2	10	118523	118532	80 %	0 %	20 %	0 %	532427216
2304	NC_022120	AAT	2	6	118533	118538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427216
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2306	NC_022120	T	6	6	118692	118697	0 %	100 %	0 %	0 %	532427217
2307	NC_022120	TTC	2	6	118778	118783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427217
2308	NC_022120	TCC	2	6	118791	118796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532427217
2309	NC_022120	TTTA	2	8	118809	118816	25 %	75 %	0 %	0 %	532427217
2310	NC_022120	CTG	2	6	119007	119012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427217
2311	NC_022120	AGA	2	6	119036	119041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427217
2312	NC_022120	TTGCCA	2	12	119059	119070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532427217
2313	NC_022120	GA	4	8	119082	119089	50 %	0 %	50 %	0 %	532427217
2314	NC_022120	GAA	2	6	119096	119101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427217
2315	NC_022120	TTC	2	6	119135	119140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427217
2316	NC_022120	TACT	2	8	119197	119204	25 %	50 %	0 %	25 %	532427217
2317	NC_022120	GTT	2	6	119241	119246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532427217
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2319	NC_022120	GAT	2	6	119292	119297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427217
2320	NC_022120	GAG	2	6	119323	119328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427217
2321	NC_022120	TC	3	6	119414	119419	0 %	50 %	0 %	50 %	532427217
2322	NC_022120	AG	3	6	119517	119522	50 %	0 %	50 %	0 %	532427218
2323	NC_022120	GCTA	2	8	119539	119546	25 %	25 %	25 %	25 %	532427218
2324	NC_022120	GA	3	6	119550	119555	50 %	0 %	50 %	0 %	532427218
2325	NC_022120	AAG	2	6	119558	119563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427218
2326	NC_022120	GCT	3	9	119564	119572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427218
2327	NC_022120	GTA	2	6	119623	119628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427218
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2329	NC_022120	TC	3	6	119638	119643	0 %	50 %	0 %	50 %	532427218
2330	NC_022120	GCTA	2	8	119671	119678	25 %	25 %	25 %	25 %	532427218
2331	NC_022120	CGGC	2	8	119720	119727	0 %	0 %	50 %	50 %	532427218
2332	NC_022120	AGC	2	6	119761	119766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427218
2333	NC_022120	TGC	2	6	119770	119775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427218
2334	NC_022120	TCC	2	6	119782	119787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532427218
2335	NC_022120	AG	3	6	119828	119833	50 %	0 %	50 %	0 %	532427218
2336	NC_022120	GA	4	8	119871	119878	50 %	0 %	50 %	0 %	532427218
2337	NC_022120	GGC	2	6	119911	119916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532427218
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2339	NC_022120	TCT	2	6	120095	120100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427218
2340	NC_022120	GA	3	6	120204	120209	50 %	0 %	50 %	0 %	532427218
2341	NC_022120	ATC	2	6	120298	120303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427218
2342	NC_022120	TTGGTA	2	12	120599	120610	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532427219
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2344	NC_022120	TCA	2	6	120646	120651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427219
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2348	NC_022120	CTG	2	6	120725	120730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427219
2349	NC_022120	AGC	2	6	120748	120753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427219
2350	NC_022120	CTTC	2	8	120946	120953	0 %	50 %	0 %	50 %	532427219
2351	NC_022120	GTA	2	6	120955	120960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427219
2352	NC_022120	AGGATC	2	12	120978	120989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532427219
2353	NC_022120	CTT	2	6	121130	121135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427219
2354	NC_022120	CAG	2	6	121172	121177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427219
2355	NC_022120	AGG	2	6	121203	121208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427219
2356	NC_022120	CT	3	6	121263	121268	0 %	50 %	0 %	50 %	532427219
2357	NC_022120	GAA	2	6	121317	121322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427219
2358	NC_022120	TCC	2	6	121408	121413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532427219
2359	NC_022120	ATG	2	6	121517	121522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427219
2360	NC_022120	TGC	2	6	121534	121539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427219
2361	NC_022120	CTT	2	6	121559	121564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427219
2362	NC_022120	AGA	2	6	121656	121661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427219
2363	NC_022120	GAA	2	6	121672	121677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427219
2364	NC_022120	TTTC	2	8	121754	121761	0 %	75 %	0 %	25 %	532427219
2365	NC_022120	AAC	2	6	121805	121810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427219
2366	NC_022120	AAG	2	6	121826	121831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427219
2367	NC_022120	TGA	2	6	121853	121858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427219
2368	NC_022120	AT	3	6	121965	121970	50 %	50 %	0 %	0 %	532427219
2369	NC_022120	GTT	2	6	122005	122010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532427219
2370	NC_022120	CAA	2	6	122022	122027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427219
2371	NC_022120	AAG	2	6	122030	122035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427219
2372	NC_022120	AGA	2	6	122097	122102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427219
2373	NC_022120	TGA	2	6	122109	122114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427219
2374	NC_022120	CTT	2	6	122152	122157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427219
2375	NC_022120	TC	3	6	122175	122180	0 %	50 %	0 %	50 %	532427219
2376	NC_022120	ATC	2	6	122358	122363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427219
2377	NC_022120	AAAG	2	8	122485	122492	75 %	0 %	25 %	0 %	532427219
2378	NC_022120	GA	3	6	122505	122510	50 %	0 %	50 %	0 %	532427219
2379	NC_022120	GCTTC	2	10	122513	122522	0 %	40 %	20 %	40 %	532427219
2380	NC_022120	TCTA	2	8	122554	122561	25 %	50 %	0 %	25 %	532427219
2381	NC_022120	ACT	2	6	122715	122720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427220
2382	NC_022120	AAGGGT	2	12	122785	122796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532427220
2383	NC_022120	AG	3	6	122811	122816	50 %	0 %	50 %	0 %	532427220
2384	NC_022120	T	6	6	122827	122832	0 %	100 %	0 %	0 %	532427220
2385	NC_022120	AGCT	2	8	122860	122867	25 %	25 %	25 %	25 %	532427220
2386	NC_022120	CAA	2	6	122929	122934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427220
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2389	NC_022120	ATA	2	6	123085	123090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427220
2390	NC_022120	TAA	2	6	123214	123219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427220
2391	NC_022120	TGA	2	6	123303	123308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427220
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2394	NC_022120	T	7	7	123502	123508	0 %	100 %	0 %	0 %	532427220
2395	NC_022120	AGA	2	6	123539	123544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427220
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2398	NC_022120	AAC	2	6	125151	125156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427221
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2400	NC_022120	GGA	2	6	125282	125287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532427221
2401	NC_022120	TCT	2	6	125300	125305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427221
2402	NC_022120	CAG	2	6	125357	125362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427221
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2404	NC_022120	TGA	2	6	125389	125394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427221
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2407	NC_022120	T	7	7	125630	125636	0 %	100 %	0 %	0 %	532427222
2408	NC_022120	AGA	2	6	125657	125662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427222
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2410	NC_022120	GA	3	6	125819	125824	50 %	0 %	50 %	0 %	532427222
2411	NC_022120	GTA	2	6	125835	125840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427222
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2420	NC_022120	TACAA	2	10	126302	126311	60 %	20 %	0 %	20 %	532427222
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2426	NC_022120	TTG	2	6	126702	126707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532427223
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2452	NC_022120	ATTC	2	8	127530	127537	25 %	50 %	0 %	25 %	532427223
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2463	NC_022120	ACA	2	6	127996	128001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532427223
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2470	NC_022120	GAA	2	6	128355	128360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427224
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2476	NC_022120	ATCCA	2	10	128707	128716	40 %	20 %	0 %	40 %	532427225
2477	NC_022120	T	6	6	128719	128724	0 %	100 %	0 %	0 %	532427225
2478	NC_022120	CCG	2	6	128750	128755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532427225
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2480	NC_022120	CTT	2	6	128790	128795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427225
2481	NC_022120	AGAA	2	8	128800	128807	75 %	0 %	25 %	0 %	532427225
2482	NC_022120	GTA	2	6	128869	128874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532427225
2483	NC_022120	TCA	2	6	128912	128917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427225
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2485	NC_022120	TTC	2	6	128977	128982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427225
2486	NC_022120	AGC	2	6	129031	129036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532427225
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2488	NC_022120	TCT	2	6	129099	129104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427225
2489	NC_022120	CTT	2	6	129105	129110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427225
2490	NC_022120	ACC	2	6	129247	129252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532427225
2491	NC_022120	CGT	2	6	129273	129278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427225
2492	NC_022120	GAA	2	6	129300	129305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532427225
2493	NC_022120	CATC	2	8	129380	129387	25 %	25 %	0 %	50 %	532427225
2494	NC_022120	CTT	2	6	129465	129470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532427225
2495	NC_022120	AAT	2	6	129477	129482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532427225
2496	NC_022120	CAT	2	6	129519	129524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532427225
2497	NC_022120	GA	3	6	129539	129544	50 %	0 %	50 %	0 %	532427225
2498	NC_022120	GT	5	10	129586	129595	0 %	50 %	50 %	0 %	532427225
2499	NC_022120	TGC	2	6	129655	129660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532427225
2500	NC_022120	GA	3	6	129736	129741	50 %	0 %	50 %	0 %	532427225

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