MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 2081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022119	AG	3	6	2152	2157	50 %	0 %	50 %	0 %	532423945
2	NC_022119	GA	3	6	2820	2825	50 %	0 %	50 %	0 %	532423945
3	NC_022119	AT	3	6	4513	4518	50 %	50 %	0 %	0 %	532423946
4	NC_022119	TC	3	6	5261	5266	0 %	50 %	0 %	50 %	532423947
5	NC_022119	GA	3	6	5272	5277	50 %	0 %	50 %	0 %	532423947
6	NC_022119	AT	3	6	5376	5381	50 %	50 %	0 %	0 %	532423947
7	NC_022119	TG	3	6	5529	5534	0 %	50 %	50 %	0 %	532423947
8	NC_022119	AG	3	6	5937	5942	50 %	0 %	50 %	0 %	532423947
9	NC_022119	AG	3	6	6411	6416	50 %	0 %	50 %	0 %	532423948
10	NC_022119	AC	3	6	7646	7651	50 %	0 %	0 %	50 %	532423949
11	NC_022119	AG	3	6	8389	8394	50 %	0 %	50 %	0 %	532423950
12	NC_022119	CT	4	8	8508	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	532423950
13	NC_022119	GT	3	6	8590	8595	0 %	50 %	50 %	0 %	532423950
14	NC_022119	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	532423952
15	NC_022119	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	532423952
16	NC_022119	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	532423953
17	NC_022119	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	532423953
18	NC_022119	TG	3	6	12772	12777	0 %	50 %	50 %	0 %	532423954
19	NC_022119	AG	3	6	12921	12926	50 %	0 %	50 %	0 %	532423954
20	NC_022119	TC	3	6	13055	13060	0 %	50 %	0 %	50 %	532423954
21	NC_022119	AG	4	8	13077	13084	50 %	0 %	50 %	0 %	532423954
22	NC_022119	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	532423955
23	NC_022119	AG	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	532423956
24	NC_022119	TC	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	532423956
25	NC_022119	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	532423957
26	NC_022119	AG	3	6	16385	16390	50 %	0 %	50 %	0 %	532423957
27	NC_022119	GA	3	6	17169	17174	50 %	0 %	50 %	0 %	532423957
28	NC_022119	GA	3	6	17772	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	532423958
29	NC_022119	TC	3	6	18222	18227	0 %	50 %	0 %	50 %	532423958
30	NC_022119	TC	3	6	18635	18640	0 %	50 %	0 %	50 %	532423959
31	NC_022119	GA	3	6	18650	18655	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
32	NC_022119	GA	3	6	18749	18754	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
33	NC_022119	AG	3	6	19215	19220	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
34	NC_022119	AG	4	8	19501	19508	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
35	NC_022119	GT	3	6	19764	19769	0 %	50 %	50 %	0 %	532423959
36	NC_022119	TG	3	6	20105	20110	0 %	50 %	50 %	0 %	532423960
37	NC_022119	CT	4	8	21902	21909	0 %	50 %	0 %	50 %	532423961
38	NC_022119	AT	3	6	22172	22177	50 %	50 %	0 %	0 %	532423961
39	NC_022119	AT	3	6	22496	22501	50 %	50 %	0 %	0 %	532423961
40	NC_022119	GA	3	6	23815	23820	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
41	NC_022119	GA	3	6	23907	23912	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
42	NC_022119	AG	3	6	24288	24293	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
43	NC_022119	GA	3	6	25705	25710	50 %	0 %	50 %	0 %	532423962
44	NC_022119	GT	3	6	25725	25730	0 %	50 %	50 %	0 %	532423962
45	NC_022119	GA	3	6	26373	26378	50 %	0 %	50 %	0 %	532423962
46	NC_022119	AT	3	6	26790	26795	50 %	50 %	0 %	0 %	532423963
47	NC_022119	GA	3	6	27004	27009	50 %	0 %	50 %	0 %	532423963
48	NC_022119	TG	3	6	28378	28383	0 %	50 %	50 %	0 %	532423965
49	NC_022119	TC	3	6	28431	28436	0 %	50 %	0 %	50 %	532423965
50	NC_022119	GC	4	8	28845	28852	0 %	0 %	50 %	50 %	532423965
51	NC_022119	TA	3	6	28967	28972	50 %	50 %	0 %	0 %	532423965
52	NC_022119	GA	3	6	29918	29923	50 %	0 %	50 %	0 %	532423966
53	NC_022119	AG	3	6	30016	30021	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
54	NC_022119	TC	3	6	30125	30130	0 %	50 %	0 %	50 %	532423967
55	NC_022119	GA	3	6	30746	30751	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
56	NC_022119	GA	3	6	31214	31219	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
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59	NC_022119	AG	3	6	32252	32257	50 %	0 %	50 %	0 %	532423969
60	NC_022119	TC	3	6	33749	33754	0 %	50 %	0 %	50 %	532423971
61	NC_022119	AG	3	6	33762	33767	50 %	0 %	50 %	0 %	532423971
62	NC_022119	AG	3	6	33900	33905	50 %	0 %	50 %	0 %	532423972
63	NC_022119	AG	3	6	34593	34598	50 %	0 %	50 %	0 %	532423973
64	NC_022119	GA	4	8	34616	34623	50 %	0 %	50 %	0 %	532423973
65	NC_022119	TG	3	6	35441	35446	0 %	50 %	50 %	0 %	532423974
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68	NC_022119	AG	3	6	37514	37519	50 %	0 %	50 %	0 %	532423975
69	NC_022119	AG	3	6	38060	38065	50 %	0 %	50 %	0 %	532423975
70	NC_022119	AG	3	6	38587	38592	50 %	0 %	50 %	0 %	532423975
71	NC_022119	GA	3	6	39371	39376	50 %	0 %	50 %	0 %	532423976
72	NC_022119	AG	3	6	39508	39513	50 %	0 %	50 %	0 %	532423976
73	NC_022119	AG	3	6	39608	39613	50 %	0 %	50 %	0 %	532423976
74	NC_022119	AG	3	6	40585	40590	50 %	0 %	50 %	0 %	532423977
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83	NC_022119	AG	3	6	42235	42240	50 %	0 %	50 %	0 %	532423978
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89	NC_022119	GA	3	6	45340	45345	50 %	0 %	50 %	0 %	532423983
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91	NC_022119	AG	3	6	45569	45574	50 %	0 %	50 %	0 %	532423983
92	NC_022119	AG	4	8	46011	46018	50 %	0 %	50 %	0 %	532423984
93	NC_022119	CT	3	6	46202	46207	0 %	50 %	0 %	50 %	532423984
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95	NC_022119	AG	3	6	46456	46461	50 %	0 %	50 %	0 %	532423984
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108	NC_022119	CT	3	6	58058	58063	0 %	50 %	0 %	50 %	532424786
109	NC_022119	GA	3	6	59625	59630	50 %	0 %	50 %	0 %	532423992
110	NC_022119	GT	3	6	59763	59768	0 %	50 %	50 %	0 %	532423992
111	NC_022119	TC	3	6	60509	60514	0 %	50 %	0 %	50 %	532423993
112	NC_022119	GA	3	6	60737	60742	50 %	0 %	50 %	0 %	532424787
113	NC_022119	CA	3	6	61135	61140	50 %	0 %	0 %	50 %	532423994
114	NC_022119	AT	3	6	61385	61390	50 %	50 %	0 %	0 %	532423994
115	NC_022119	GA	3	6	61408	61413	50 %	0 %	50 %	0 %	532423994
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118	NC_022119	GA	3	6	62614	62619	50 %	0 %	50 %	0 %	532423994
119	NC_022119	TC	3	6	62770	62775	0 %	50 %	0 %	50 %	532423994
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121	NC_022119	AG	3	6	63151	63156	50 %	0 %	50 %	0 %	532423994
122	NC_022119	TC	4	8	63158	63165	0 %	50 %	0 %	50 %	532423994
123	NC_022119	AG	3	6	63386	63391	50 %	0 %	50 %	0 %	532423994
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125	NC_022119	AG	3	6	63773	63778	50 %	0 %	50 %	0 %	532423995
126	NC_022119	AG	3	6	65069	65074	50 %	0 %	50 %	0 %	532423996
127	NC_022119	GA	3	6	65255	65260	50 %	0 %	50 %	0 %	532423996
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131	NC_022119	AG	3	6	66111	66116	50 %	0 %	50 %	0 %	532423997
132	NC_022119	AG	3	6	66517	66522	50 %	0 %	50 %	0 %	532423997
133	NC_022119	GA	3	6	66890	66895	50 %	0 %	50 %	0 %	532423997
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135	NC_022119	AT	3	6	69155	69160	50 %	50 %	0 %	0 %	532424000
136	NC_022119	CT	3	6	69707	69712	0 %	50 %	0 %	50 %	532424000
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139	NC_022119	GT	3	6	70592	70597	0 %	50 %	50 %	0 %	532424000
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141	NC_022119	GA	3	6	70694	70699	50 %	0 %	50 %	0 %	532424000
142	NC_022119	GA	3	6	73358	73363	50 %	0 %	50 %	0 %	532424003
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