MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022119	T	7	7	153386	153392	0 %	100 %	0 %	0 %	532424070
3002	NC_022119	T	6	6	153457	153462	0 %	100 %	0 %	0 %	532424070
3003	NC_022119	ATC	2	6	153487	153492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424070
3004	NC_022119	T	6	6	153497	153502	0 %	100 %	0 %	0 %	532424070
3005	NC_022119	TGTGCG	2	12	153511	153522	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532424070
3006	NC_022119	TCT	2	6	153636	153641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424070
3007	NC_022119	CAG	2	6	153675	153680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424070
3008	NC_022119	GATC	2	8	153747	153754	25 %	25 %	25 %	25 %	532424070
3009	NC_022119	ATT	2	6	153762	153767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424070
3010	NC_022119	ATG	2	6	153789	153794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424070
3011	NC_022119	ACG	2	6	153795	153800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424070
3012	NC_022119	TTC	2	6	153812	153817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424070
3013	NC_022119	AGC	2	6	153854	153859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424070
3014	NC_022119	AATC	2	8	153867	153874	50 %	25 %	0 %	25 %	532424070
3015	NC_022119	GAA	2	6	153879	153884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424070
3016	NC_022119	TA	3	6	153912	153917	50 %	50 %	0 %	0 %	532424070
3017	NC_022119	GAT	2	6	153933	153938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424070
3018	NC_022119	TA	3	6	153970	153975	50 %	50 %	0 %	0 %	532424070
3019	NC_022119	CTT	2	6	153988	153993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424070
3020	NC_022119	GGA	2	6	154020	154025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424070
3021	NC_022119	TGT	2	6	154037	154042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424070
3022	NC_022119	ATG	2	6	154044	154049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424070
3023	NC_022119	GCA	2	6	154121	154126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424071
3024	NC_022119	GAG	2	6	154131	154136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424071
3025	NC_022119	ATT	2	6	154226	154231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424071
3026	NC_022119	AGA	2	6	154286	154291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424071
3027	NC_022119	TTC	2	6	154351	154356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424071
3028	NC_022119	ATA	2	6	154384	154389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424071
3029	NC_022119	ATC	2	6	154432	154437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424071
3030	NC_022119	GCA	2	6	154445	154450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424071
3031	NC_022119	CTG	2	6	154519	154524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424071
3032	NC_022119	GAA	2	6	154548	154553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424071
3033	NC_022119	GAG	2	6	154614	154619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424071
3034	NC_022119	A	6	6	154717	154722	100 %	0 %	0 %	0 %	532424071
3035	NC_022119	TGT	2	6	154733	154738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424071
3036	NC_022119	CCTCAT	2	12	154809	154820	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532424071
3037	NC_022119	AGGC	2	8	154839	154846	25 %	0 %	50 %	25 %	532424071
3038	NC_022119	GAGT	2	8	154927	154934	25 %	25 %	50 %	0 %	532424071
3039	NC_022119	CAC	2	6	155079	155084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424072
3040	NC_022119	TTCTT	2	10	155107	155116	0 %	80 %	0 %	20 %	532424072
3041	NC_022119	GACT	2	8	155135	155142	25 %	25 %	25 %	25 %	532424072
3042	NC_022119	GTA	2	6	155189	155194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424072
3043	NC_022119	TGT	2	6	155258	155263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424072
3044	NC_022119	TA	3	6	155287	155292	50 %	50 %	0 %	0 %	532424072
3045	NC_022119	TGG	3	9	155322	155330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424072
3046	NC_022119	TTG	2	6	155380	155385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424072
3047	NC_022119	GAT	2	6	155437	155442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424072
3048	NC_022119	CG	3	6	155506	155511	0 %	0 %	50 %	50 %	532424072
3049	NC_022119	TTA	2	6	155533	155538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424072
3050	NC_022119	T	7	7	155692	155698	0 %	100 %	0 %	0 %	532424072
3051	NC_022119	GAA	2	6	155707	155712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424072
3052	NC_022119	AC	3	6	155757	155762	50 %	0 %	0 %	50 %	532424072
3053	NC_022119	AGG	2	6	155771	155776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424072
3054	NC_022119	AAAG	2	8	155853	155860	75 %	0 %	25 %	0 %	532424072
3055	NC_022119	ATT	2	6	156195	156200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424073
3056	NC_022119	AT	3	6	156204	156209	50 %	50 %	0 %	0 %	532424073
3057	NC_022119	CTT	2	6	156242	156247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424073
3058	NC_022119	TGGAGA	2	12	156267	156278	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532424073
3059	NC_022119	GCTT	2	8	156310	156317	0 %	50 %	25 %	25 %	532424073
3060	NC_022119	GCA	2	6	156340	156345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424073
3061	NC_022119	TAGA	2	8	156362	156369	50 %	25 %	25 %	0 %	532424073
3062	NC_022119	AG	3	6	156437	156442	50 %	0 %	50 %	0 %	532424073
3063	NC_022119	CCCA	2	8	156490	156497	25 %	0 %	0 %	75 %	532424073
3064	NC_022119	CTT	2	6	156511	156516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424073
3065	NC_022119	ATG	2	6	156547	156552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424073
3066	NC_022119	TAA	2	6	156595	156600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424073
3067	NC_022119	T	7	7	156604	156610	0 %	100 %	0 %	0 %	532424073
3068	NC_022119	AGA	2	6	156660	156665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424073
3069	NC_022119	A	6	6	156696	156701	100 %	0 %	0 %	0 %	532424073
3070	NC_022119	GAA	3	9	156763	156771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424073
3071	NC_022119	GT	3	6	156826	156831	0 %	50 %	50 %	0 %	532424073
3072	NC_022119	AGC	2	6	156837	156842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424073
3073	NC_022119	TCT	2	6	156850	156855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424073
3074	NC_022119	AG	3	6	156865	156870	50 %	0 %	50 %	0 %	532424073
3075	NC_022119	AGG	2	6	156938	156943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424073
3076	NC_022119	AG	3	6	156966	156971	50 %	0 %	50 %	0 %	532424073
3077	NC_022119	AG	3	6	156983	156988	50 %	0 %	50 %	0 %	532424073
3078	NC_022119	AG	3	6	157048	157053	50 %	0 %	50 %	0 %	532424073
3079	NC_022119	ATC	2	6	157059	157064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424073
3080	NC_022119	GGA	2	6	157093	157098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424073
3081	NC_022119	ATA	2	6	157129	157134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424073
3082	NC_022119	A	6	6	157137	157142	100 %	0 %	0 %	0 %	532424073
3083	NC_022119	ACAT	2	8	157153	157160	50 %	25 %	0 %	25 %	532424073
3084	NC_022119	ATT	2	6	157350	157355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424074
3085	NC_022119	T	7	7	157392	157398	0 %	100 %	0 %	0 %	532424074
3086	NC_022119	CTTG	2	8	157535	157542	0 %	50 %	25 %	25 %	532424074
3087	NC_022119	GA	3	6	157551	157556	50 %	0 %	50 %	0 %	532424074
3088	NC_022119	GCA	2	6	157604	157609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424074
3089	NC_022119	CTTT	2	8	157612	157619	0 %	75 %	0 %	25 %	532424074
3090	NC_022119	CTCCAT	2	12	157636	157647	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532424074
3091	NC_022119	ATT	2	6	157714	157719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424074
3092	NC_022119	GAT	2	6	157740	157745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424074
3093	NC_022119	A	6	6	157783	157788	100 %	0 %	0 %	0 %	532424074
3094	NC_022119	T	6	6	157862	157867	0 %	100 %	0 %	0 %	532424074
3095	NC_022119	ATG	2	6	157912	157917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424074
3096	NC_022119	TG	3	6	157963	157968	0 %	50 %	50 %	0 %	532424074
3097	NC_022119	T	6	6	157982	157987	0 %	100 %	0 %	0 %	532424074
3098	NC_022119	AGA	2	6	158004	158009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424074
3099	NC_022119	TCCTTG	2	12	158232	158243	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532424075
3100	NC_022119	GAA	2	6	158253	158258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424075
3101	NC_022119	GTT	2	6	158270	158275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424075
3102	NC_022119	TTA	2	6	158441	158446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424075
3103	NC_022119	CG	3	6	158473	158478	0 %	0 %	50 %	50 %	532424075
3104	NC_022119	AGA	2	6	158499	158504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424075
3105	NC_022119	CAT	2	6	158508	158513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424075
3106	NC_022119	TTC	2	6	158603	158608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424075
3107	NC_022119	AGA	3	9	158613	158621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424075
3108	NC_022119	ATT	2	6	159069	159074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424076
3109	NC_022119	CAT	2	6	159221	159226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424076
3110	NC_022119	TCAA	2	8	159282	159289	50 %	25 %	0 %	25 %	532424076
3111	NC_022119	TGA	2	6	159479	159484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424076
3112	NC_022119	GAA	2	6	159507	159512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424076
3113	NC_022119	TC	3	6	159542	159547	0 %	50 %	0 %	50 %	532424076
3114	NC_022119	GT	3	6	159580	159585	0 %	50 %	50 %	0 %	532424076
3115	NC_022119	AAT	2	6	159624	159629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424076
3116	NC_022119	GGA	2	6	159636	159641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424076
3117	NC_022119	AGGAA	2	10	159665	159674	60 %	0 %	40 %	0 %	532424076
3118	NC_022119	TAG	2	6	159695	159700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424076
3119	NC_022119	AGG	2	6	159701	159706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424076
3120	NC_022119	CTG	2	6	159721	159726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424076
3121	NC_022119	AG	3	6	159752	159757	50 %	0 %	50 %	0 %	532424076
3122	NC_022119	TCT	2	6	159780	159785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424076
3123	NC_022119	AGG	2	6	159899	159904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424076
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3491	NC_022119	AAG	2	6	178818	178823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424799
3492	NC_022119	AAG	2	6	178836	178841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424799
3493	NC_022119	TGC	2	6	178904	178909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424799
3494	NC_022119	AGC	2	6	178944	178949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424799
3495	NC_022119	GA	3	6	179045	179050	50 %	0 %	50 %	0 %	532424799
3496	NC_022119	ACT	2	6	179079	179084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424799
3497	NC_022119	T	7	7	179107	179113	0 %	100 %	0 %	0 %	532424799
3498	NC_022119	TTC	2	6	179125	179130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424799
3499	NC_022119	GAC	2	6	179147	179152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424799
3500	NC_022119	TCA	2	6	179250	179255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424799

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