MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022119	ATC	2	6	103654	103659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424028
2002	NC_022119	GA	3	6	103709	103714	50 %	0 %	50 %	0 %	532424028
2003	NC_022119	AGTA	2	8	103758	103765	50 %	25 %	25 %	0 %	532424028
2004	NC_022119	GGAA	2	8	103919	103926	50 %	0 %	50 %	0 %	532424028
2005	NC_022119	GAA	2	6	103992	103997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424028
2006	NC_022119	GAA	2	6	104009	104014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424028
2007	NC_022119	GCA	2	6	104104	104109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424028
2008	NC_022119	GTAA	2	8	104115	104122	50 %	25 %	25 %	0 %	532424028
2009	NC_022119	TCT	2	6	104152	104157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424028
2010	NC_022119	TGG	2	6	104181	104186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424028
2011	NC_022119	CAG	2	6	104217	104222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424028
2012	NC_022119	AAGG	2	8	104245	104252	50 %	0 %	50 %	0 %	532424028
2013	NC_022119	GTAC	2	8	104260	104267	25 %	25 %	25 %	25 %	532424028
2014	NC_022119	AG	3	6	104303	104308	50 %	0 %	50 %	0 %	532424028
2015	NC_022119	ATCAT	2	10	104326	104335	40 %	40 %	0 %	20 %	532424028
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2018	NC_022119	GTA	3	9	104476	104484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424028
2019	NC_022119	T	6	6	104499	104504	0 %	100 %	0 %	0 %	532424028
2020	NC_022119	GAA	2	6	104595	104600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424028
2021	NC_022119	AG	3	6	104743	104748	50 %	0 %	50 %	0 %	532424028
2022	NC_022119	TCC	2	6	104847	104852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424028
2023	NC_022119	CTTT	2	8	104941	104948	0 %	75 %	0 %	25 %	532424028
2024	NC_022119	ATCA	2	8	104985	104992	50 %	25 %	0 %	25 %	532424028
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2053	NC_022119	AAGA	2	8	106664	106671	75 %	0 %	25 %	0 %	532424791
2054	NC_022119	T	8	8	106734	106741	0 %	100 %	0 %	0 %	532424791
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2062	NC_022119	TGT	2	6	107168	107173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424030
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2094	NC_022119	A	6	6	108795	108800	100 %	0 %	0 %	0 %	532424031
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2116	NC_022119	GCATT	2	10	109920	109929	20 %	40 %	20 %	20 %	532424032
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2124	NC_022119	TCT	2	6	110261	110266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424033
2125	NC_022119	GAT	2	6	110323	110328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424033
2126	NC_022119	TG	3	6	110392	110397	0 %	50 %	50 %	0 %	532424033
2127	NC_022119	T	6	6	110611	110616	0 %	100 %	0 %	0 %	532424033
2128	NC_022119	TTG	2	6	110635	110640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424033
2129	NC_022119	TAA	2	6	110658	110663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424033
2130	NC_022119	T	6	6	110684	110689	0 %	100 %	0 %	0 %	532424033
2131	NC_022119	TCA	2	6	110786	110791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424033
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2133	NC_022119	TAG	2	6	111030	111035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424033
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2139	NC_022119	GAA	2	6	111533	111538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424033
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2143	NC_022119	AAC	2	6	111733	111738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424033
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2146	NC_022119	TCT	2	6	111791	111796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424033
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2153	NC_022119	AAG	2	6	111930	111935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424033
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2203	NC_022119	TAC	2	6	114275	114280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424034
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2208	NC_022119	T	6	6	114446	114451	0 %	100 %	0 %	0 %	532424034
2209	NC_022119	CTG	2	6	114541	114546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424034
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2214	NC_022119	ACT	2	6	114657	114662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424034
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2222	NC_022119	GAT	2	6	114914	114919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424034
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2230	NC_022119	ACC	2	6	115289	115294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424034
2231	NC_022119	TTG	2	6	115375	115380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424034
2232	NC_022119	AAC	2	6	115397	115402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424034
2233	NC_022119	ACTTCG	2	12	115437	115448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532424034
2234	NC_022119	ACA	3	9	115527	115535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424034
2235	NC_022119	CAA	2	6	115552	115557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424034
2236	NC_022119	TTC	3	9	115601	115609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2237	NC_022119	TCT	2	6	115662	115667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424034
2238	NC_022119	AAGC	2	8	115671	115678	50 %	0 %	25 %	25 %	532424034
2239	NC_022119	TATCG	2	10	115679	115688	20 %	40 %	20 %	20 %	532424034
2240	NC_022119	T	6	6	115695	115700	0 %	100 %	0 %	0 %	532424034
2241	NC_022119	ATG	2	6	115736	115741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424034
2242	NC_022119	GGTT	2	8	116003	116010	0 %	50 %	50 %	0 %	532424035
2243	NC_022119	T	7	7	116019	116025	0 %	100 %	0 %	0 %	532424035
2244	NC_022119	GCT	2	6	116145	116150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424035
2245	NC_022119	TTTCT	2	10	116195	116204	0 %	80 %	0 %	20 %	532424035
2246	NC_022119	ACA	2	6	116232	116237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424035
2247	NC_022119	TAT	2	6	116420	116425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424035
2248	NC_022119	TATC	2	8	116452	116459	25 %	50 %	0 %	25 %	532424035
2249	NC_022119	TTTG	2	8	116549	116556	0 %	75 %	25 %	0 %	532424035
2250	NC_022119	AGG	3	9	116561	116569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424035
2251	NC_022119	AGA	2	6	116582	116587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424035
2252	NC_022119	GA	3	6	116636	116641	50 %	0 %	50 %	0 %	532424035
2253	NC_022119	A	6	6	116689	116694	100 %	0 %	0 %	0 %	532424035
2254	NC_022119	GTTC	2	8	116745	116752	0 %	50 %	25 %	25 %	532424035
2255	NC_022119	TAA	2	6	116765	116770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424035
2256	NC_022119	ACC	2	6	116781	116786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424035
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2267	NC_022119	GTT	2	6	117296	117301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424036
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2276	NC_022119	AAG	2	6	117585	117590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424795
2277	NC_022119	TAA	2	6	117598	117603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424795
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2282	NC_022119	T	6	6	118022	118027	0 %	100 %	0 %	0 %	532424037
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2284	NC_022119	CTTT	2	8	118065	118072	0 %	75 %	0 %	25 %	532424037
2285	NC_022119	GTAG	2	8	118110	118117	25 %	25 %	50 %	0 %	532424037
2286	NC_022119	G	6	6	118158	118163	0 %	0 %	100 %	0 %	532424037
2287	NC_022119	T	6	6	118181	118186	0 %	100 %	0 %	0 %	532424037
2288	NC_022119	GTT	2	6	118299	118304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424037
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2301	NC_022119	CTG	2	6	118924	118929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424038
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2321	NC_022119	GCTA	2	8	119588	119595	25 %	25 %	25 %	25 %	532424039
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2355	NC_022119	TTTC	2	8	121671	121678	0 %	75 %	0 %	25 %	532424040
2356	NC_022119	AAC	2	6	121722	121727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424040
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2364	NC_022119	TGA	2	6	122026	122031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424040
2365	NC_022119	CTT	2	6	122069	122074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424040
2366	NC_022119	TC	3	6	122092	122097	0 %	50 %	0 %	50 %	532424040
2367	NC_022119	ATC	2	6	122275	122280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424040
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2369	NC_022119	GA	3	6	122422	122427	50 %	0 %	50 %	0 %	532424040
2370	NC_022119	GCTTC	2	10	122430	122439	0 %	40 %	20 %	40 %	532424040
2371	NC_022119	TCTA	2	8	122471	122478	25 %	50 %	0 %	25 %	532424040
2372	NC_022119	ACT	2	6	122632	122637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424041
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2374	NC_022119	AG	3	6	122728	122733	50 %	0 %	50 %	0 %	532424041
2375	NC_022119	T	6	6	122744	122749	0 %	100 %	0 %	0 %	532424041
2376	NC_022119	AGCT	2	8	122777	122784	25 %	25 %	25 %	25 %	532424041
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2389	NC_022119	GGGTTT	2	12	123665	123676	0 %	50 %	50 %	0 %	532424042
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2401	NC_022119	CTG	2	6	123974	123979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424042
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2490	NC_022119	ATC	2	6	128206	128211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424046
2491	NC_022119	T	6	6	128212	128217	0 %	100 %	0 %	0 %	532424046
2492	NC_022119	GAA	2	6	128274	128279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424046
2493	NC_022119	CTT	3	9	128304	128312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424046
2494	NC_022119	AGCT	2	8	128556	128563	25 %	25 %	25 %	25 %	532424047
2495	NC_022119	TTC	2	6	128566	128571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424047
2496	NC_022119	TGA	2	6	128614	128619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424047
2497	NC_022119	ATCCA	2	10	128626	128635	40 %	20 %	0 %	40 %	532424047
2498	NC_022119	T	6	6	128638	128643	0 %	100 %	0 %	0 %	532424047
2499	NC_022119	CCG	2	6	128669	128674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424047
2500	NC_022119	CTT	2	6	128697	128702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424047

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