MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_022119	TA	3	6	1039833	1039838	50 %	50 %	0 %	0 %	532424781
20502	NC_022119	TAA	2	6	1039859	1039864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424781
20503	NC_022119	AGAA	2	8	1039907	1039914	75 %	0 %	25 %	0 %	532424781
20504	NC_022119	ATG	2	6	1039965	1039970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424781
20505	NC_022119	CAG	2	6	1040024	1040029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424781
20506	NC_022119	ATAG	2	8	1040045	1040052	50 %	25 %	25 %	0 %	532424781
20507	NC_022119	CTC	2	6	1040054	1040059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424781
20508	NC_022119	TGT	2	6	1040067	1040072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424781
20509	NC_022119	ATC	2	6	1040077	1040082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424781
20510	NC_022119	TCA	2	6	1040203	1040208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424781
20511	NC_022119	AG	3	6	1040256	1040261	50 %	0 %	50 %	0 %	532424781
20512	NC_022119	AG	4	8	1040298	1040305	50 %	0 %	50 %	0 %	532424781
20513	NC_022119	AG	3	6	1040379	1040384	50 %	0 %	50 %	0 %	532424781
20514	NC_022119	T	6	6	1040429	1040434	0 %	100 %	0 %	0 %	532424781
20515	NC_022119	AAG	2	6	1040498	1040503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424781
20516	NC_022119	GAG	2	6	1040520	1040525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424781
20517	NC_022119	GA	5	10	1040540	1040549	50 %	0 %	50 %	0 %	532424781
20518	NC_022119	GCT	2	6	1040609	1040614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424781
20519	NC_022119	T	6	6	1040642	1040647	0 %	100 %	0 %	0 %	532424781
20520	NC_022119	CTT	2	6	1040648	1040653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424781
20521	NC_022119	AGG	2	6	1040759	1040764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424781
20522	NC_022119	TGC	2	6	1040780	1040785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424781
20523	NC_022119	AAAGA	2	10	1040808	1040817	80 %	0 %	20 %	0 %	532424781
20524	NC_022119	GAA	2	6	1040842	1040847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424781
20525	NC_022119	GAACA	2	10	1040922	1040931	60 %	0 %	20 %	20 %	532424781
20526	NC_022119	AG	3	6	1040952	1040957	50 %	0 %	50 %	0 %	532424781
20527	NC_022119	CTCC	2	8	1040959	1040966	0 %	25 %	0 %	75 %	532424781
20528	NC_022119	TGT	2	6	1041002	1041007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424781
20529	NC_022119	TTGC	2	8	1041085	1041092	0 %	50 %	25 %	25 %	532424781
20530	NC_022119	CAAG	2	8	1041112	1041119	50 %	0 %	25 %	25 %	532424781
20531	NC_022119	AG	6	12	1041118	1041129	50 %	0 %	50 %	0 %	532424781
20532	NC_022119	ACA	2	6	1041159	1041164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424781
20533	NC_022119	AG	3	6	1041203	1041208	50 %	0 %	50 %	0 %	532424781
20534	NC_022119	TAC	2	6	1041236	1041241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424781
20535	NC_022119	GCC	2	6	1041252	1041257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424781
20536	NC_022119	GAAA	2	8	1041282	1041289	75 %	0 %	25 %	0 %	532424781
20537	NC_022119	AGA	2	6	1041351	1041356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424781
20538	NC_022119	CTC	2	6	1041419	1041424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424781
20539	NC_022119	ATT	2	6	1041465	1041470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424781
20540	NC_022119	TGA	2	6	1041496	1041501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424781
20541	NC_022119	ATA	2	6	1041502	1041507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424781
20542	NC_022119	AAGGA	2	10	1041541	1041550	60 %	0 %	40 %	0 %	532424781
20543	NC_022119	TACA	2	8	1041654	1041661	50 %	25 %	0 %	25 %	532424781
20544	NC_022119	ATC	2	6	1041666	1041671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424781
20545	NC_022119	A	6	6	1041726	1041731	100 %	0 %	0 %	0 %	532424781
20546	NC_022119	GAC	2	6	1041738	1041743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424781
20547	NC_022119	GAG	2	6	1041762	1041767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424781
20548	NC_022119	AGC	2	6	1041822	1041827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424781
20549	NC_022119	ACA	2	6	1041834	1041839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424781

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.