MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022119	TTGA	2	8	54580	54587	25 %	50 %	25 %	0 %	532423991
1002	NC_022119	GTA	2	6	54620	54625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423991
1003	NC_022119	CTT	2	6	54634	54639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423991
1004	NC_022119	A	6	6	54769	54774	100 %	0 %	0 %	0 %	532423991
1005	NC_022119	G	6	6	54825	54830	0 %	0 %	100 %	0 %	532423991
1006	NC_022119	AAT	2	6	54922	54927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423991
1007	NC_022119	GGAA	2	8	54936	54943	50 %	0 %	50 %	0 %	532423991
1008	NC_022119	GATCTG	2	12	54971	54982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532423991
1009	NC_022119	GGTTCA	2	12	55108	55119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532423991
1010	NC_022119	TTATC	2	10	55209	55218	20 %	60 %	0 %	20 %	532423991
1011	NC_022119	TGAGT	2	10	55230	55239	20 %	40 %	40 %	0 %	532423991
1012	NC_022119	TCA	3	9	55243	55251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423991
1013	NC_022119	GTT	2	6	55258	55263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423991
1014	NC_022119	TCT	2	6	55303	55308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423991
1015	NC_022119	GGA	2	6	55309	55314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423991
1016	NC_022119	TGC	2	6	55344	55349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423991
1017	NC_022119	AT	3	6	55554	55559	50 %	50 %	0 %	0 %	532423991
1018	NC_022119	TTA	2	6	55569	55574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423991
1019	NC_022119	GTT	2	6	55737	55742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424785
1020	NC_022119	TGT	2	6	55787	55792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424785
1021	NC_022119	CTGG	3	12	55847	55858	0 %	25 %	50 %	25 %	532424785
1022	NC_022119	ATT	2	6	55862	55867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424785
1023	NC_022119	GAT	2	6	55875	55880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424785
1024	NC_022119	TCT	2	6	55893	55898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424785
1025	NC_022119	TCC	2	6	55928	55933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424785
1026	NC_022119	TTA	2	6	55941	55946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424785
1027	NC_022119	TTGC	2	8	55984	55991	0 %	50 %	25 %	25 %	532424785
1028	NC_022119	T	6	6	56036	56041	0 %	100 %	0 %	0 %	532424785
1029	NC_022119	GTA	2	6	56067	56072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424785
1030	NC_022119	GTT	2	6	56178	56183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424785
1031	NC_022119	AG	3	6	56190	56195	50 %	0 %	50 %	0 %	532424785
1032	NC_022119	TGG	2	6	56198	56203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424785
1033	NC_022119	GTTGT	2	10	56277	56286	0 %	60 %	40 %	0 %	532424785
1034	NC_022119	T	6	6	56332	56337	0 %	100 %	0 %	0 %	532424785
1035	NC_022119	A	7	7	56374	56380	100 %	0 %	0 %	0 %	532424785
1036	NC_022119	TCC	2	6	56382	56387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424785
1037	NC_022119	AGT	3	9	56471	56479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424785
1038	NC_022119	AGCT	2	8	56483	56490	25 %	25 %	25 %	25 %	532424785
1039	NC_022119	CT	3	6	56489	56494	0 %	50 %	0 %	50 %	532424785
1040	NC_022119	TGG	2	6	56525	56530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424785
1041	NC_022119	GT	3	6	56539	56544	0 %	50 %	50 %	0 %	532424785
1042	NC_022119	TGT	2	6	56548	56553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424785
1043	NC_022119	AGT	2	6	56558	56563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424785
1044	NC_022119	GTT	2	6	56651	56656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424785
1045	NC_022119	T	6	6	56655	56660	0 %	100 %	0 %	0 %	532424785
1046	NC_022119	AGA	2	6	56811	56816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424785
1047	NC_022119	CAG	2	6	56974	56979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424785
1048	NC_022119	TTG	2	6	56996	57001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424785
1049	NC_022119	TGT	2	6	57074	57079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424785
1050	NC_022119	TG	3	6	57177	57182	0 %	50 %	50 %	0 %	532424785
1051	NC_022119	GGTT	2	8	57186	57193	0 %	50 %	50 %	0 %	532424785
1052	NC_022119	TAA	2	6	57242	57247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424785
1053	NC_022119	ACT	2	6	57258	57263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424785
1054	NC_022119	TTA	2	6	57264	57269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424785
1055	NC_022119	GAA	3	9	57282	57290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424785
1056	NC_022119	ATT	2	6	57293	57298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424785
1057	NC_022119	T	6	6	57297	57302	0 %	100 %	0 %	0 %	532424785
1058	NC_022119	ATT	2	6	57312	57317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424785
1059	NC_022119	TGA	2	6	57453	57458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424786
1060	NC_022119	TGT	2	6	57483	57488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424786
1061	NC_022119	GGA	2	6	57490	57495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424786
1062	NC_022119	GTT	2	6	57496	57501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424786
1063	NC_022119	GCT	2	6	57535	57540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424786
1064	NC_022119	GAT	2	6	57553	57558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424786
1065	NC_022119	TGA	2	6	57570	57575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424786
1066	NC_022119	TCC	2	6	57585	57590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424786
1067	NC_022119	AGTTGT	2	12	57649	57660	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532424786
1068	NC_022119	AGA	2	6	57720	57725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424786
1069	NC_022119	CTA	2	6	57736	57741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424786
1070	NC_022119	TGA	2	6	57906	57911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424786
1071	NC_022119	TGT	2	6	57978	57983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424786
1072	NC_022119	AGAA	2	8	58047	58054	75 %	0 %	25 %	0 %	532424786
1073	NC_022119	CT	3	6	58058	58063	0 %	50 %	0 %	50 %	532424786
1074	NC_022119	GTT	2	6	58067	58072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424786
1075	NC_022119	AGGT	2	8	58087	58094	25 %	25 %	50 %	0 %	532424786
1076	NC_022119	CAC	2	6	58200	58205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424786
1077	NC_022119	AGG	2	6	58251	58256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424786
1078	NC_022119	TCT	2	6	58267	58272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424786
1079	NC_022119	TCT	2	6	58387	58392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424786
1080	NC_022119	T	6	6	58395	58400	0 %	100 %	0 %	0 %	532424786
1081	NC_022119	GCT	2	6	58477	58482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424786
1082	NC_022119	ATC	2	6	58515	58520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424786
1083	NC_022119	TCT	2	6	58526	58531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424786
1084	NC_022119	TGT	2	6	58550	58555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424786
1085	NC_022119	TTGTTC	2	12	58569	58580	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532424786
1086	NC_022119	T	6	6	58589	58594	0 %	100 %	0 %	0 %	532424786
1087	NC_022119	CTT	2	6	58607	58612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424786
1088	NC_022119	TTC	2	6	58638	58643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424786
1089	NC_022119	TGG	2	6	58664	58669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424786
1090	NC_022119	TCC	2	6	58725	58730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424786
1091	NC_022119	TAGA	2	8	58766	58773	50 %	25 %	25 %	0 %	532424786
1092	NC_022119	TTA	2	6	58852	58857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424786
1093	NC_022119	TGAA	2	8	58871	58878	50 %	25 %	25 %	0 %	532424786
1094	NC_022119	T	8	8	58948	58955	0 %	100 %	0 %	0 %	532424786
1095	NC_022119	T	6	6	58968	58973	0 %	100 %	0 %	0 %	532424786
1096	NC_022119	T	6	6	58979	58984	0 %	100 %	0 %	0 %	532424786
1097	NC_022119	AGA	2	6	59052	59057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423992
1098	NC_022119	TCT	2	6	59068	59073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423992
1099	NC_022119	T	6	6	59100	59105	0 %	100 %	0 %	0 %	532423992
1100	NC_022119	CGTT	2	8	59251	59258	0 %	50 %	25 %	25 %	532423992
1101	NC_022119	GGAG	2	8	59260	59267	25 %	0 %	75 %	0 %	532423992
1102	NC_022119	GTAA	2	8	59312	59319	50 %	25 %	25 %	0 %	532423992
1103	NC_022119	TCCTAA	2	12	59379	59390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423992
1104	NC_022119	AGT	2	6	59408	59413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423992
1105	NC_022119	T	6	6	59440	59445	0 %	100 %	0 %	0 %	532423992
1106	NC_022119	TAG	2	6	59487	59492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423992
1107	NC_022119	GCT	2	6	59500	59505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423992
1108	NC_022119	GTC	2	6	59526	59531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423992
1109	NC_022119	ATGG	2	8	59539	59546	25 %	25 %	50 %	0 %	532423992
1110	NC_022119	AGG	2	6	59573	59578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423992
1111	NC_022119	GA	3	6	59625	59630	50 %	0 %	50 %	0 %	532423992
1112	NC_022119	CAA	2	6	59648	59653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423992
1113	NC_022119	ATAA	2	8	59685	59692	75 %	25 %	0 %	0 %	532423992
1114	NC_022119	GAGCA	2	10	59725	59734	40 %	0 %	40 %	20 %	532423992
1115	NC_022119	GT	3	6	59763	59768	0 %	50 %	50 %	0 %	532423992
1116	NC_022119	TAG	2	6	59775	59780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423992
1117	NC_022119	AAG	2	6	59960	59965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423992
1118	NC_022119	AAC	2	6	60005	60010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423992
1119	NC_022119	T	7	7	60024	60030	0 %	100 %	0 %	0 %	532423992
1120	NC_022119	CTT	2	6	60074	60079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423992
1121	NC_022119	AAT	2	6	60104	60109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423992
1122	NC_022119	TTC	2	6	60115	60120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423992
1123	NC_022119	ATGT	2	8	60135	60142	25 %	50 %	25 %	0 %	532423992
1124	NC_022119	CATT	2	8	60164	60171	25 %	50 %	0 %	25 %	532423992
1125	NC_022119	ATG	2	6	60185	60190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423993
1126	NC_022119	CCT	2	6	60191	60196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423993
1127	NC_022119	AGT	2	6	60246	60251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423993
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1246	NC_022119	GTTAA	2	10	66331	66340	40 %	40 %	20 %	0 %	532423997
1247	NC_022119	AGG	2	6	66366	66371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423997
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1252	NC_022119	AAG	2	6	66552	66557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423997
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1257	NC_022119	TCA	2	6	66934	66939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423997
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1372	NC_022119	CTC	2	6	72680	72685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424002
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