MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022119	GCA	2	6	28402	28407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423965
502	NC_022119	TC	3	6	28431	28436	0 %	50 %	0 %	50 %	532423965
503	NC_022119	AGGGT	2	10	28565	28574	20 %	20 %	60 %	0 %	532423965
504	NC_022119	TTC	2	6	28601	28606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423965
505	NC_022119	CAG	2	6	28613	28618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423965
506	NC_022119	GAA	2	6	28627	28632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423965
507	NC_022119	TGA	2	6	28641	28646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423965
508	NC_022119	TTC	2	6	28674	28679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423965
509	NC_022119	GC	4	8	28845	28852	0 %	0 %	50 %	50 %	532423965
510	NC_022119	AAG	2	6	28853	28858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423965
511	NC_022119	TA	3	6	28967	28972	50 %	50 %	0 %	0 %	532423965
512	NC_022119	GAA	2	6	29056	29061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423965
513	NC_022119	TGT	2	6	29088	29093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423966
514	NC_022119	TTA	2	6	29144	29149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423966
515	NC_022119	TCT	2	6	29156	29161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423966
516	NC_022119	ACA	2	6	29384	29389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423966
517	NC_022119	ATG	2	6	29394	29399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423966
518	NC_022119	CTTT	2	8	29536	29543	0 %	75 %	0 %	25 %	532423966
519	NC_022119	TTTG	2	8	29551	29558	0 %	75 %	25 %	0 %	532423966
520	NC_022119	TTGT	2	8	29586	29593	0 %	75 %	25 %	0 %	532423966
521	NC_022119	CCTAT	2	10	29605	29614	20 %	40 %	0 %	40 %	532423966
522	NC_022119	T	6	6	29621	29626	0 %	100 %	0 %	0 %	532423966
523	NC_022119	ATC	2	6	29700	29705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423966
524	NC_022119	TGGC	2	8	29749	29756	0 %	25 %	50 %	25 %	532423966
525	NC_022119	T	8	8	29855	29862	0 %	100 %	0 %	0 %	532423966
526	NC_022119	ATG	2	6	29880	29885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423966
527	NC_022119	GA	3	6	29918	29923	50 %	0 %	50 %	0 %	532423966
528	NC_022119	AG	3	6	30016	30021	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
529	NC_022119	GTT	2	6	30097	30102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423967
530	NC_022119	GAA	2	6	30106	30111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423967
531	NC_022119	TC	3	6	30125	30130	0 %	50 %	0 %	50 %	532423967
532	NC_022119	TCT	2	6	30172	30177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423967
533	NC_022119	ACT	2	6	30262	30267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423967
534	NC_022119	TTC	2	6	30290	30295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423967
535	NC_022119	AAAG	2	8	30309	30316	75 %	0 %	25 %	0 %	532423967
536	NC_022119	CCT	2	6	30326	30331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423967
537	NC_022119	AAAC	2	8	30379	30386	75 %	0 %	0 %	25 %	532423967
538	NC_022119	T	6	6	30396	30401	0 %	100 %	0 %	0 %	532423967
539	NC_022119	AAGGA	2	10	30405	30414	60 %	0 %	40 %	0 %	532423967
540	NC_022119	GGC	2	6	30432	30437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532423967
541	NC_022119	GAT	2	6	30511	30516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423967
542	NC_022119	GATG	2	8	30522	30529	25 %	25 %	50 %	0 %	532423967
543	NC_022119	TAG	2	6	30533	30538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423967
544	NC_022119	GTT	2	6	30607	30612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423967
545	NC_022119	TAA	2	6	30717	30722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423967
546	NC_022119	GA	3	6	30746	30751	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
547	NC_022119	AGA	2	6	30876	30881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423967
548	NC_022119	TCG	2	6	30939	30944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423967
549	NC_022119	ATG	2	6	30973	30978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423967
550	NC_022119	TGG	2	6	30987	30992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423967
551	NC_022119	GAA	2	6	31018	31023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423967
552	NC_022119	ATT	2	6	31054	31059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423967
553	NC_022119	ATG	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423967
554	NC_022119	AAG	2	6	31189	31194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423967
555	NC_022119	T	6	6	31195	31200	0 %	100 %	0 %	0 %	532423967
556	NC_022119	GA	3	6	31214	31219	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
557	NC_022119	A	7	7	31237	31243	100 %	0 %	0 %	0 %	532423967
558	NC_022119	ACA	2	6	31283	31288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423968
559	NC_022119	TGT	2	6	31304	31309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423968
560	NC_022119	T	6	6	31423	31428	0 %	100 %	0 %	0 %	532423968
561	NC_022119	GAGCT	2	10	31444	31453	20 %	20 %	40 %	20 %	532423968
562	NC_022119	A	6	6	31518	31523	100 %	0 %	0 %	0 %	532423968
563	NC_022119	A	6	6	31549	31554	100 %	0 %	0 %	0 %	532423968
564	NC_022119	TGC	2	6	31577	31582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423968
565	NC_022119	AGC	2	6	31595	31600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423968
566	NC_022119	GATA	2	8	31631	31638	50 %	25 %	25 %	0 %	532423969
567	NC_022119	TC	3	6	31640	31645	0 %	50 %	0 %	50 %	532423969
568	NC_022119	AAG	2	6	31844	31849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423969
569	NC_022119	AAG	2	6	31851	31856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423969
570	NC_022119	CTT	2	6	31890	31895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423969
571	NC_022119	CGT	2	6	31921	31926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423969
572	NC_022119	TGA	2	6	31967	31972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423969
573	NC_022119	GAG	2	6	31998	32003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423969
574	NC_022119	GCG	2	6	32040	32045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532423969
575	NC_022119	CT	3	6	32120	32125	0 %	50 %	0 %	50 %	532423969
576	NC_022119	AGA	2	6	32218	32223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423969
577	NC_022119	AG	3	6	32252	32257	50 %	0 %	50 %	0 %	532423969
578	NC_022119	AAG	2	6	32406	32411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423969
579	NC_022119	ATT	2	6	32456	32461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423969
580	NC_022119	T	6	6	32561	32566	0 %	100 %	0 %	0 %	532423969
581	NC_022119	GGA	2	6	32586	32591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423969
582	NC_022119	AGG	2	6	32811	32816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423970
583	NC_022119	GGT	2	6	32866	32871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423970
584	NC_022119	GCT	2	6	33028	33033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423970
585	NC_022119	GCT	2	6	33061	33066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423970
586	NC_022119	GAA	2	6	33172	33177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423971
587	NC_022119	A	6	6	33176	33181	100 %	0 %	0 %	0 %	532423971
588	NC_022119	TGT	2	6	33267	33272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423971
589	NC_022119	TGA	2	6	33318	33323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423971
590	NC_022119	GTT	2	6	33406	33411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423971
591	NC_022119	AGG	2	6	33455	33460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423971
592	NC_022119	CTT	2	6	33479	33484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423971
593	NC_022119	T	6	6	33501	33506	0 %	100 %	0 %	0 %	532423971
594	NC_022119	GTT	2	6	33519	33524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423971
595	NC_022119	TGA	2	6	33626	33631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423971
596	NC_022119	CAG	2	6	33689	33694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423971
597	NC_022119	TC	3	6	33749	33754	0 %	50 %	0 %	50 %	532423971
598	NC_022119	AG	3	6	33762	33767	50 %	0 %	50 %	0 %	532423971
599	NC_022119	CTG	2	6	33859	33864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423972
600	NC_022119	ACA	2	6	33876	33881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423972
601	NC_022119	AG	3	6	33900	33905	50 %	0 %	50 %	0 %	532423972
602	NC_022119	GTC	2	6	33932	33937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423972
603	NC_022119	ATT	2	6	33979	33984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423972
604	NC_022119	T	6	6	34031	34036	0 %	100 %	0 %	0 %	532423972
605	NC_022119	TTA	2	6	34061	34066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423972
606	NC_022119	TGAT	2	8	34126	34133	25 %	50 %	25 %	0 %	532423972
607	NC_022119	GAA	2	6	34154	34159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423972
608	NC_022119	AAG	2	6	34201	34206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423972
609	NC_022119	AGA	2	6	34252	34257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423972
610	NC_022119	AAGA	3	12	34254	34265	75 %	0 %	25 %	0 %	532423972
611	NC_022119	TGC	2	6	34289	34294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423972
612	NC_022119	TGT	2	6	34313	34318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423972
613	NC_022119	ATG	2	6	34324	34329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423972
614	NC_022119	AAG	2	6	34355	34360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423972
615	NC_022119	GAA	2	6	34374	34379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423972
616	NC_022119	AAGC	2	8	34474	34481	50 %	0 %	25 %	25 %	532423973
617	NC_022119	GTTC	2	8	34507	34514	0 %	50 %	25 %	25 %	532423973
618	NC_022119	GAT	2	6	34585	34590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423973
619	NC_022119	AG	3	6	34593	34598	50 %	0 %	50 %	0 %	532423973
620	NC_022119	GA	4	8	34616	34623	50 %	0 %	50 %	0 %	532423973
621	NC_022119	AGA	2	6	34651	34656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423973
622	NC_022119	TTA	2	6	34714	34719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423974
623	NC_022119	TGA	2	6	34847	34852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423974
624	NC_022119	GGCA	2	8	34886	34893	25 %	0 %	50 %	25 %	532423974
625	NC_022119	GAA	2	6	34946	34951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423974
626	NC_022119	ATC	2	6	34996	35001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423974
627	NC_022119	GAA	2	6	35085	35090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423974
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