MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022119	TCTG	2	8	255654	255661	0 %	50 %	25 %	25 %	532424153
5002	NC_022119	TCC	2	6	255684	255689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424153
5003	NC_022119	TTC	2	6	255740	255745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424153
5004	NC_022119	CGA	2	6	255774	255779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5005	NC_022119	TTC	2	6	255821	255826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424153
5006	NC_022119	ACG	2	6	255881	255886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5007	NC_022119	AACC	2	8	255925	255932	50 %	0 %	0 %	50 %	532424153
5008	NC_022119	AAG	2	6	255958	255963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424153
5009	NC_022119	CTG	2	6	255982	255987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5010	NC_022119	GCT	2	6	256110	256115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5011	NC_022119	ATTT	2	8	256167	256174	25 %	75 %	0 %	0 %	532424153
5012	NC_022119	TC	3	6	256419	256424	0 %	50 %	0 %	50 %	532424154
5013	NC_022119	A	6	6	256428	256433	100 %	0 %	0 %	0 %	532424154
5014	NC_022119	ATG	2	6	256439	256444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424154
5015	NC_022119	ATCT	2	8	256488	256495	25 %	50 %	0 %	25 %	532424154
5016	NC_022119	T	7	7	256530	256536	0 %	100 %	0 %	0 %	532424154
5017	NC_022119	GCT	2	6	256540	256545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424154
5018	NC_022119	CTT	2	6	256550	256555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424154
5019	NC_022119	T	6	6	256571	256576	0 %	100 %	0 %	0 %	532424154
5020	NC_022119	CT	4	8	256639	256646	0 %	50 %	0 %	50 %	532424154
5021	NC_022119	TTA	2	6	256704	256709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424154
5022	NC_022119	GCC	2	6	256838	256843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424154
5023	NC_022119	TTCG	2	8	256901	256908	0 %	50 %	25 %	25 %	532424154
5024	NC_022119	CTT	2	6	256937	256942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424154
5025	NC_022119	CTA	2	6	256973	256978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424154
5026	NC_022119	TC	3	6	256992	256997	0 %	50 %	0 %	50 %	532424154
5027	NC_022119	TTC	2	6	257100	257105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424154
5028	NC_022119	CTT	2	6	257108	257113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424154
5029	NC_022119	TC	3	6	257130	257135	0 %	50 %	0 %	50 %	532424154
5030	NC_022119	TCT	2	6	257192	257197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424154
5031	NC_022119	CAA	2	6	257253	257258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424154
5032	NC_022119	GTTTT	2	10	257265	257274	0 %	80 %	20 %	0 %	532424154
5033	NC_022119	TTA	2	6	257289	257294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424154
5034	NC_022119	CATT	2	8	257313	257320	25 %	50 %	0 %	25 %	532424154
5035	NC_022119	CAC	2	6	257323	257328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424154
5036	NC_022119	GCT	2	6	257408	257413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424154
5037	NC_022119	TCA	2	6	257456	257461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424154
5038	NC_022119	TCT	2	6	257491	257496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424154
5039	NC_022119	TTC	2	6	257505	257510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424154
5040	NC_022119	TGC	2	6	257564	257569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424154
5041	NC_022119	GTT	2	6	257570	257575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424154
5042	NC_022119	TAAT	2	8	257580	257587	50 %	50 %	0 %	0 %	532424154
5043	NC_022119	A	6	6	257588	257593	100 %	0 %	0 %	0 %	532424154
5044	NC_022119	AGA	2	6	257605	257610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424154
5045	NC_022119	A	8	8	257831	257838	100 %	0 %	0 %	0 %	532424155
5046	NC_022119	TCA	2	6	257849	257854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424155
5047	NC_022119	ATTT	2	8	257863	257870	25 %	75 %	0 %	0 %	532424155
5048	NC_022119	GAT	2	6	257875	257880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424155
5049	NC_022119	GGC	2	6	257939	257944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424155
5050	NC_022119	TTC	2	6	257955	257960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424155
5051	NC_022119	ATT	2	6	257978	257983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424155
5052	NC_022119	CT	3	6	258011	258016	0 %	50 %	0 %	50 %	532424155
5053	NC_022119	AGG	2	6	258088	258093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424155
5054	NC_022119	TAC	2	6	258128	258133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424155
5055	NC_022119	CTT	2	6	258163	258168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424155
5056	NC_022119	TAA	2	6	258325	258330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424155
5057	NC_022119	CTT	3	9	258512	258520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424155
5058	NC_022119	AAAC	2	8	258542	258549	75 %	0 %	0 %	25 %	532424155
5059	NC_022119	AAT	2	6	258587	258592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424155
5060	NC_022119	TTTCT	2	10	258597	258606	0 %	80 %	0 %	20 %	532424155
5061	NC_022119	TTTA	2	8	258704	258711	25 %	75 %	0 %	0 %	532424155
5062	NC_022119	TC	3	6	258751	258756	0 %	50 %	0 %	50 %	532424155
5063	NC_022119	T	6	6	258761	258766	0 %	100 %	0 %	0 %	532424155
5064	NC_022119	TCT	3	9	258774	258782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424155
5065	NC_022119	GGC	2	6	258796	258801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424155
5066	NC_022119	GAT	2	6	258811	258816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424155
5067	NC_022119	TCT	2	6	258829	258834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424155
5068	NC_022119	A	6	6	258863	258868	100 %	0 %	0 %	0 %	532424155
5069	NC_022119	TCT	2	6	258881	258886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424155
5070	NC_022119	TGC	2	6	258895	258900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424155
5071	NC_022119	T	6	6	258938	258943	0 %	100 %	0 %	0 %	532424155
5072	NC_022119	TATT	2	8	258997	259004	25 %	75 %	0 %	0 %	532424155
5073	NC_022119	ACTT	2	8	259079	259086	25 %	50 %	0 %	25 %	532424155
5074	NC_022119	TGG	2	6	259178	259183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424155
5075	NC_022119	TCTT	2	8	259248	259255	0 %	75 %	0 %	25 %	532424155
5076	NC_022119	AAC	2	6	259289	259294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424155
5077	NC_022119	A	6	6	259483	259488	100 %	0 %	0 %	0 %	532424156
5078	NC_022119	GCA	2	6	259531	259536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424156
5079	NC_022119	TCT	2	6	259578	259583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424156
5080	NC_022119	TGC	2	6	259584	259589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424156
5081	NC_022119	TTA	2	6	259654	259659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424156
5082	NC_022119	CTT	2	6	259660	259665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424156
5083	NC_022119	CAA	2	6	259730	259735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424156
5084	NC_022119	GTC	2	6	259750	259755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424156
5085	NC_022119	CA	3	6	259851	259856	50 %	0 %	0 %	50 %	532424157
5086	NC_022119	CTT	2	6	259981	259986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424157
5087	NC_022119	CAA	2	6	260006	260011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424157
5088	NC_022119	TGCAA	2	10	260017	260026	40 %	20 %	20 %	20 %	532424157
5089	NC_022119	AAC	2	6	260027	260032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424157
5090	NC_022119	A	6	6	260069	260074	100 %	0 %	0 %	0 %	532424157
5091	NC_022119	TGC	2	6	260143	260148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424157
5092	NC_022119	TTC	2	6	260202	260207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424157
5093	NC_022119	TTGT	2	8	260217	260224	0 %	75 %	25 %	0 %	532424157
5094	NC_022119	CTGG	2	8	260225	260232	0 %	25 %	50 %	25 %	532424157
5095	NC_022119	TTG	2	6	260284	260289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424157
5096	NC_022119	TCT	2	6	260307	260312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424157
5097	NC_022119	CTT	2	6	260423	260428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424158
5098	NC_022119	T	6	6	260464	260469	0 %	100 %	0 %	0 %	532424158
5099	NC_022119	TAT	2	6	260505	260510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424158
5100	NC_022119	TTC	2	6	260511	260516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424158
5101	NC_022119	AGA	2	6	260581	260586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424158
5102	NC_022119	CTT	2	6	260629	260634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424158
5103	NC_022119	CT	3	6	260669	260674	0 %	50 %	0 %	50 %	532424158
5104	NC_022119	TC	3	6	260685	260690	0 %	50 %	0 %	50 %	532424158
5105	NC_022119	CT	3	6	260697	260702	0 %	50 %	0 %	50 %	532424158
5106	NC_022119	ACCTTT	2	12	260736	260747	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532424158
5107	NC_022119	T	6	6	260745	260750	0 %	100 %	0 %	0 %	532424158
5108	NC_022119	T	6	6	260864	260869	0 %	100 %	0 %	0 %	532424158
5109	NC_022119	T	6	6	260929	260934	0 %	100 %	0 %	0 %	532424158
5110	NC_022119	TTC	2	6	260982	260987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424158
5111	NC_022119	AGA	2	6	261061	261066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424158
5112	NC_022119	CAAA	2	8	261106	261113	75 %	0 %	0 %	25 %	532424158
5113	NC_022119	CTT	2	6	261179	261184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424158
5114	NC_022119	ATT	2	6	261204	261209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424158
5115	NC_022119	CTC	2	6	261277	261282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424158
5116	NC_022119	CAT	2	6	261358	261363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424158
5117	NC_022119	CTT	2	6	261382	261387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424158
5118	NC_022119	TGT	2	6	261398	261403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424158
5119	NC_022119	CAA	2	6	261432	261437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424158
5120	NC_022119	GCTT	2	8	261460	261467	0 %	50 %	25 %	25 %	532424158
5121	NC_022119	GAT	2	6	261476	261481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424158
5122	NC_022119	AAT	2	6	261482	261487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424158
5123	NC_022119	TTA	2	6	261494	261499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424158
5124	NC_022119	TAA	2	6	261514	261519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424158
5125	NC_022119	TTG	2	6	261555	261560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424158
5126	NC_022119	ACT	2	6	261586	261591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424158
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5128	NC_022119	TAT	2	6	261625	261630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424158
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5132	NC_022119	ATGA	2	8	261755	261762	50 %	25 %	25 %	0 %	532424158
5133	NC_022119	A	6	6	261805	261810	100 %	0 %	0 %	0 %	532424158
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5141	NC_022119	TAA	2	6	262221	262226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424158
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5233	NC_022119	TTG	2	6	267665	267670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424164
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5236	NC_022119	GTT	2	6	267864	267869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424810
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5238	NC_022119	TTC	2	6	267893	267898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424810
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5240	NC_022119	TTCT	2	8	268160	268167	0 %	75 %	0 %	25 %	532424165
5241	NC_022119	GA	3	6	268222	268227	50 %	0 %	50 %	0 %	532424165
5242	NC_022119	TAAAA	2	10	268253	268262	80 %	20 %	0 %	0 %	532424165
5243	NC_022119	GTT	2	6	268277	268282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424165
5244	NC_022119	TGA	2	6	268298	268303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424165
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5371	NC_022119	ATGG	2	8	274147	274154	25 %	25 %	50 %	0 %	532424169
5372	NC_022119	TCTT	2	8	274226	274233	0 %	75 %	0 %	25 %	532424169
5373	NC_022119	ATTT	2	8	274255	274262	25 %	75 %	0 %	0 %	532424169
5374	NC_022119	CAC	2	6	274293	274298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424169
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5378	NC_022119	ATCCT	2	10	274420	274429	20 %	40 %	0 %	40 %	532424169
5379	NC_022119	GAT	2	6	274473	274478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424169
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5383	NC_022119	GCT	2	6	274771	274776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424170
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5402	NC_022119	TTGTC	2	10	275358	275367	0 %	60 %	20 %	20 %	532424170
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5471	NC_022119	TC	3	6	278227	278232	0 %	50 %	0 %	50 %	532424172
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5486	NC_022119	CCAT	2	8	279186	279193	25 %	25 %	0 %	50 %	532424172
5487	NC_022119	GAG	2	6	279246	279251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424172
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5492	NC_022119	GCA	2	6	279621	279626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424173
5493	NC_022119	TTA	2	6	279736	279741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424173
5494	NC_022119	AGC	2	6	279752	279757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424173
5495	NC_022119	ACG	2	6	279802	279807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424173
5496	NC_022119	GTA	2	6	279836	279841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424173
5497	NC_022119	TCT	2	6	279897	279902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424174
5498	NC_022119	TGA	2	6	279926	279931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424174
5499	NC_022119	CT	3	6	279974	279979	0 %	50 %	0 %	50 %	532424174
5500	NC_022119	ATC	2	6	279980	279985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424174

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