MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022119	ATTT	2	8	230258	230265	25 %	75 %	0 %	0 %	532424128
4502	NC_022119	TGG	2	6	230336	230341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424128
4503	NC_022119	AAT	3	9	230436	230444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424128
4504	NC_022119	GAA	2	6	230535	230540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424128
4505	NC_022119	GC	3	6	230547	230552	0 %	0 %	50 %	50 %	532424128
4506	NC_022119	ATT	2	6	230595	230600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424128
4507	NC_022119	GCA	2	6	230708	230713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424128
4508	NC_022119	CTA	2	6	230749	230754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424128
4509	NC_022119	CATC	2	8	230764	230771	25 %	25 %	0 %	50 %	532424128
4510	NC_022119	TTA	2	6	230821	230826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424128
4511	NC_022119	TCT	3	9	230841	230849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424128
4512	NC_022119	A	6	6	230917	230922	100 %	0 %	0 %	0 %	532424128
4513	NC_022119	GCT	2	6	230976	230981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424128
4514	NC_022119	TCT	2	6	231111	231116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424128
4515	NC_022119	T	6	6	231290	231295	0 %	100 %	0 %	0 %	532424128
4516	NC_022119	GC	3	6	231449	231454	0 %	0 %	50 %	50 %	532424128
4517	NC_022119	GAC	2	6	231476	231481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424128
4518	NC_022119	A	8	8	231518	231525	100 %	0 %	0 %	0 %	532424128
4519	NC_022119	TAA	2	6	231554	231559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424128
4520	NC_022119	AGA	2	6	231590	231595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424128
4521	NC_022119	GGA	2	6	231635	231640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424128
4522	NC_022119	TGA	2	6	231650	231655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424128
4523	NC_022119	TCC	2	6	231659	231664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424128
4524	NC_022119	AATG	2	8	231687	231694	50 %	25 %	25 %	0 %	532424128
4525	NC_022119	ATT	2	6	231736	231741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424128
4526	NC_022119	ATG	2	6	231782	231787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424129
4527	NC_022119	CAA	2	6	231788	231793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424129
4528	NC_022119	A	6	6	231814	231819	100 %	0 %	0 %	0 %	532424129
4529	NC_022119	A	6	6	231888	231893	100 %	0 %	0 %	0 %	532424129
4530	NC_022119	AAG	2	6	231984	231989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424129
4531	NC_022119	A	6	6	232083	232088	100 %	0 %	0 %	0 %	532424129
4532	NC_022119	AGG	2	6	232153	232158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424129
4533	NC_022119	TGC	2	6	232204	232209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424129
4534	NC_022119	AGA	2	6	232246	232251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424129
4535	NC_022119	CT	3	6	232273	232278	0 %	50 %	0 %	50 %	532424129
4536	NC_022119	C	6	6	232285	232290	0 %	0 %	0 %	100 %	532424129
4537	NC_022119	A	6	6	232325	232330	100 %	0 %	0 %	0 %	532424129
4538	NC_022119	AAG	2	6	232386	232391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424129
4539	NC_022119	TTAC	2	8	232402	232409	25 %	50 %	0 %	25 %	532424129
4540	NC_022119	TCA	2	6	232441	232446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424129
4541	NC_022119	AT	3	6	232490	232495	50 %	50 %	0 %	0 %	532424129
4542	NC_022119	TCA	2	6	232507	232512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424129
4543	NC_022119	ATT	2	6	232567	232572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424129
4544	NC_022119	CT	3	6	232591	232596	0 %	50 %	0 %	50 %	532424129
4545	NC_022119	CTT	2	6	232694	232699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424130
4546	NC_022119	GCTA	2	8	232719	232726	25 %	25 %	25 %	25 %	532424130
4547	NC_022119	CTT	3	9	232781	232789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424130
4548	NC_022119	AGG	2	6	232821	232826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424130
4549	NC_022119	ATT	2	6	232860	232865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424130
4550	NC_022119	TAA	2	6	232884	232889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424130
4551	NC_022119	TTA	2	6	232910	232915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424130
4552	NC_022119	TA	3	6	232943	232948	50 %	50 %	0 %	0 %	532424130
4553	NC_022119	ATT	2	6	232976	232981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424130
4554	NC_022119	CT	3	6	233005	233010	0 %	50 %	0 %	50 %	532424130
4555	NC_022119	A	6	6	233021	233026	100 %	0 %	0 %	0 %	532424130
4556	NC_022119	CAAAA	2	10	233028	233037	80 %	0 %	0 %	20 %	532424130
4557	NC_022119	AGA	2	6	233042	233047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424130
4558	NC_022119	A	8	8	233067	233074	100 %	0 %	0 %	0 %	532424130
4559	NC_022119	AGG	2	6	233100	233105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424130
4560	NC_022119	CAG	2	6	233168	233173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424130
4561	NC_022119	A	6	6	233208	233213	100 %	0 %	0 %	0 %	532424130
4562	NC_022119	TTCT	2	8	233294	233301	0 %	75 %	0 %	25 %	532424130
4563	NC_022119	CAT	2	6	233314	233319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424130
4564	NC_022119	GAA	2	6	233404	233409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424130
4565	NC_022119	CAAA	2	8	233526	233533	75 %	0 %	0 %	25 %	532424130
4566	NC_022119	CAA	2	6	233611	233616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424130
4567	NC_022119	TCTCT	2	10	233642	233651	0 %	60 %	0 %	40 %	532424130
4568	NC_022119	CTT	2	6	233741	233746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424130
4569	NC_022119	TC	3	6	233884	233889	0 %	50 %	0 %	50 %	532424130
4570	NC_022119	ATG	2	6	233986	233991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424130
4571	NC_022119	TCAA	2	8	234008	234015	50 %	25 %	0 %	25 %	532424130
4572	NC_022119	TTA	2	6	234097	234102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424130
4573	NC_022119	GAA	2	6	234142	234147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424130
4574	NC_022119	TTG	2	6	234155	234160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424130
4575	NC_022119	AAC	2	6	234232	234237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424130
4576	NC_022119	TTC	2	6	234534	234539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424131
4577	NC_022119	A	6	6	234547	234552	100 %	0 %	0 %	0 %	532424131
4578	NC_022119	T	7	7	234583	234589	0 %	100 %	0 %	0 %	532424131
4579	NC_022119	GAA	2	6	234596	234601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424131
4580	NC_022119	CTT	2	6	234650	234655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424131
4581	NC_022119	AATA	2	8	234689	234696	75 %	25 %	0 %	0 %	532424131
4582	NC_022119	TAA	2	6	234738	234743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424131
4583	NC_022119	CCT	2	6	234751	234756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424131
4584	NC_022119	TCC	2	6	234774	234779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424131
4585	NC_022119	CTG	2	6	234794	234799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424131
4586	NC_022119	AAG	2	6	234860	234865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424131
4587	NC_022119	TAG	2	6	234906	234911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424131
4588	NC_022119	AGA	2	6	234966	234971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424131
4589	NC_022119	AG	3	6	235102	235107	50 %	0 %	50 %	0 %	532424131
4590	NC_022119	GTT	2	6	235178	235183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424131
4591	NC_022119	GTA	2	6	235199	235204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424131
4592	NC_022119	TTCC	2	8	235231	235238	0 %	50 %	0 %	50 %	532424131
4593	NC_022119	A	6	6	235249	235254	100 %	0 %	0 %	0 %	532424131
4594	NC_022119	A	6	6	235333	235338	100 %	0 %	0 %	0 %	532424131
4595	NC_022119	TAA	2	6	235403	235408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424131
4596	NC_022119	ACG	2	6	235464	235469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424131
4597	NC_022119	AAC	2	6	235503	235508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424131
4598	NC_022119	TC	3	6	235531	235536	0 %	50 %	0 %	50 %	532424131
4599	NC_022119	AAG	2	6	235545	235550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424131
4600	NC_022119	GACT	2	8	235562	235569	25 %	25 %	25 %	25 %	532424131
4601	NC_022119	AT	3	6	235660	235665	50 %	50 %	0 %	0 %	532424131
4602	NC_022119	A	6	6	235688	235693	100 %	0 %	0 %	0 %	532424131
4603	NC_022119	A	7	7	235710	235716	100 %	0 %	0 %	0 %	532424131
4604	NC_022119	CAT	2	6	235733	235738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424131
4605	NC_022119	ACA	2	6	235770	235775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424131
4606	NC_022119	TTCAC	2	10	235812	235821	20 %	40 %	0 %	40 %	532424132
4607	NC_022119	CTT	3	9	235867	235875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424132
4608	NC_022119	ATA	2	6	235890	235895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424132
4609	NC_022119	CTGT	2	8	235942	235949	0 %	50 %	25 %	25 %	532424132
4610	NC_022119	AAC	2	6	236013	236018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424132
4611	NC_022119	AGA	2	6	236246	236251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424132
4612	NC_022119	TCT	2	6	236481	236486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424132
4613	NC_022119	AT	5	10	236501	236510	50 %	50 %	0 %	0 %	532424132
4614	NC_022119	TTGA	2	8	236552	236559	25 %	50 %	25 %	0 %	532424132
4615	NC_022119	CTT	2	6	236564	236569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424132
4616	NC_022119	AAGT	2	8	236633	236640	50 %	25 %	25 %	0 %	532424132
4617	NC_022119	TTCCTT	2	12	236696	236707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424132
4618	NC_022119	GAC	2	6	236935	236940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424132
4619	NC_022119	C	6	6	236977	236982	0 %	0 %	0 %	100 %	532424132
4620	NC_022119	TGC	2	6	237032	237037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424132
4621	NC_022119	GAT	2	6	237043	237048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424132
4622	NC_022119	TCT	2	6	237051	237056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424132
4623	NC_022119	CTT	2	6	237082	237087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424132
4624	NC_022119	ATCC	2	8	237097	237104	25 %	25 %	0 %	50 %	532424132
4625	NC_022119	CTT	2	6	237142	237147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424132
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4909	NC_022119	CTTT	3	12	251020	251031	0 %	75 %	0 %	25 %	532424146
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4982	NC_022119	A	6	6	254486	254491	100 %	0 %	0 %	0 %	532424151
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4988	NC_022119	T	6	6	255070	255075	0 %	100 %	0 %	0 %	532424152
4989	NC_022119	CA	3	6	255129	255134	50 %	0 %	0 %	50 %	532424152
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4993	NC_022119	TTG	2	6	255284	255289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424152
4994	NC_022119	AGA	2	6	255339	255344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424152
4995	NC_022119	TAG	2	6	255359	255364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424152
4996	NC_022119	T	6	6	255524	255529	0 %	100 %	0 %	0 %	532424153
4997	NC_022119	ACG	2	6	255530	255535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424153
4998	NC_022119	CCTGCA	2	12	255541	255552	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532424153
4999	NC_022119	CTG	2	6	255598	255603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424153
5000	NC_022119	TTG	2	6	255629	255634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424153

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