MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022118	ATC	2	6	153484	153489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421951
3002	NC_022118	T	6	6	153494	153499	0 %	100 %	0 %	0 %	532421951
3003	NC_022118	TGTGCG	2	12	153508	153519	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532421951
3004	NC_022118	TCT	2	6	153633	153638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421951
3005	NC_022118	CAG	2	6	153672	153677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421951
3006	NC_022118	GATC	2	8	153744	153751	25 %	25 %	25 %	25 %	532421951
3007	NC_022118	ATT	2	6	153759	153764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421951
3008	NC_022118	ATG	2	6	153786	153791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421951
3009	NC_022118	ACG	2	6	153792	153797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421951
3010	NC_022118	TTC	2	6	153809	153814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421951
3011	NC_022118	AGC	2	6	153851	153856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421951
3012	NC_022118	AATC	2	8	153864	153871	50 %	25 %	0 %	25 %	532421951
3013	NC_022118	GAA	2	6	153876	153881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421951
3014	NC_022118	TA	3	6	153909	153914	50 %	50 %	0 %	0 %	532421951
3015	NC_022118	GAT	2	6	153930	153935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421951
3016	NC_022118	TA	3	6	153967	153972	50 %	50 %	0 %	0 %	532421951
3017	NC_022118	CTT	2	6	153985	153990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421951
3018	NC_022118	GGA	2	6	154017	154022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421951
3019	NC_022118	TGT	2	6	154034	154039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421951
3020	NC_022118	ATG	2	6	154041	154046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421951
3021	NC_022118	GCA	2	6	154118	154123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421952
3022	NC_022118	GAG	2	6	154128	154133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421952
3023	NC_022118	ATT	2	6	154223	154228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421952
3024	NC_022118	AGA	2	6	154283	154288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421952
3025	NC_022118	TTC	2	6	154348	154353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421952
3026	NC_022118	ATA	2	6	154381	154386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421952
3027	NC_022118	ATC	2	6	154429	154434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421952
3028	NC_022118	GCA	2	6	154442	154447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421952
3029	NC_022118	CTG	2	6	154516	154521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421952
3030	NC_022118	GAA	2	6	154545	154550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421952
3031	NC_022118	GAG	2	6	154611	154616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421952
3032	NC_022118	A	6	6	154714	154719	100 %	0 %	0 %	0 %	532421952
3033	NC_022118	TGT	2	6	154730	154735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421952
3034	NC_022118	CCTCAT	2	12	154806	154817	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532421952
3035	NC_022118	AGGC	2	8	154836	154843	25 %	0 %	50 %	25 %	532421952
3036	NC_022118	GAGT	2	8	154924	154931	25 %	25 %	50 %	0 %	532421952
3037	NC_022118	CAC	2	6	155076	155081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421953
3038	NC_022118	TTCTT	2	10	155104	155113	0 %	80 %	0 %	20 %	532421953
3039	NC_022118	GACT	2	8	155132	155139	25 %	25 %	25 %	25 %	532421953
3040	NC_022118	GTA	2	6	155186	155191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421953
3041	NC_022118	TGT	2	6	155255	155260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421953
3042	NC_022118	TA	3	6	155284	155289	50 %	50 %	0 %	0 %	532421953
3043	NC_022118	TGG	3	9	155319	155327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421953
3044	NC_022118	TTG	2	6	155377	155382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421953
3045	NC_022118	GAT	2	6	155434	155439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421953
3046	NC_022118	CG	3	6	155503	155508	0 %	0 %	50 %	50 %	532421953
3047	NC_022118	TTA	2	6	155530	155535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421953
3048	NC_022118	T	7	7	155689	155695	0 %	100 %	0 %	0 %	532421953
3049	NC_022118	GAA	2	6	155704	155709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421953
3050	NC_022118	AC	3	6	155754	155759	50 %	0 %	0 %	50 %	532421953
3051	NC_022118	AGG	2	6	155768	155773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421953
3052	NC_022118	AAAG	2	8	155850	155857	75 %	0 %	25 %	0 %	532421953
3053	NC_022118	ATT	2	6	156191	156196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421954
3054	NC_022118	AT	3	6	156200	156205	50 %	50 %	0 %	0 %	532421954
3055	NC_022118	CTT	2	6	156238	156243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421954
3056	NC_022118	TGGAGA	2	12	156263	156274	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532421954
3057	NC_022118	GCTT	2	8	156306	156313	0 %	50 %	25 %	25 %	532421954
3058	NC_022118	GCA	2	6	156336	156341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421954
3059	NC_022118	TAGA	2	8	156358	156365	50 %	25 %	25 %	0 %	532421954
3060	NC_022118	AG	3	6	156433	156438	50 %	0 %	50 %	0 %	532421954
3061	NC_022118	CCCA	2	8	156486	156493	25 %	0 %	0 %	75 %	532421954
3062	NC_022118	CTT	2	6	156507	156512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421954
3063	NC_022118	ATG	2	6	156543	156548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421954
3064	NC_022118	TAA	2	6	156591	156596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421954
3065	NC_022118	T	7	7	156600	156606	0 %	100 %	0 %	0 %	532421954
3066	NC_022118	AGA	2	6	156656	156661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421954
3067	NC_022118	A	6	6	156692	156697	100 %	0 %	0 %	0 %	532421954
3068	NC_022118	GAA	3	9	156759	156767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421954
3069	NC_022118	GT	3	6	156822	156827	0 %	50 %	50 %	0 %	532421954
3070	NC_022118	AGC	2	6	156833	156838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421954
3071	NC_022118	TCT	2	6	156846	156851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421954
3072	NC_022118	AG	3	6	156861	156866	50 %	0 %	50 %	0 %	532421954
3073	NC_022118	AGG	2	6	156934	156939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421954
3074	NC_022118	AG	3	6	156962	156967	50 %	0 %	50 %	0 %	532421954
3075	NC_022118	AG	3	6	156979	156984	50 %	0 %	50 %	0 %	532421954
3076	NC_022118	AG	3	6	157044	157049	50 %	0 %	50 %	0 %	532421954
3077	NC_022118	ATC	2	6	157055	157060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421954
3078	NC_022118	GGA	2	6	157089	157094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421954
3079	NC_022118	ATA	2	6	157125	157130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421954
3080	NC_022118	A	6	6	157133	157138	100 %	0 %	0 %	0 %	532421954
3081	NC_022118	ACAT	2	8	157149	157156	50 %	25 %	0 %	25 %	532421954
3082	NC_022118	ATT	2	6	157346	157351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421955
3083	NC_022118	T	7	7	157388	157394	0 %	100 %	0 %	0 %	532421955
3084	NC_022118	CTTG	2	8	157531	157538	0 %	50 %	25 %	25 %	532421955
3085	NC_022118	GA	3	6	157547	157552	50 %	0 %	50 %	0 %	532421955
3086	NC_022118	GCA	2	6	157600	157605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421955
3087	NC_022118	CTTT	2	8	157608	157615	0 %	75 %	0 %	25 %	532421955
3088	NC_022118	CTCCAT	2	12	157632	157643	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532421955
3089	NC_022118	ATT	2	6	157710	157715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421955
3090	NC_022118	GAT	2	6	157736	157741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421955
3091	NC_022118	A	6	6	157779	157784	100 %	0 %	0 %	0 %	532421955
3092	NC_022118	T	6	6	157858	157863	0 %	100 %	0 %	0 %	532421955
3093	NC_022118	ATG	2	6	157908	157913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421955
3094	NC_022118	TG	3	6	157959	157964	0 %	50 %	50 %	0 %	532421955
3095	NC_022118	T	6	6	157978	157983	0 %	100 %	0 %	0 %	532421955
3096	NC_022118	AGA	2	6	158000	158005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421955
3097	NC_022118	TCCTTG	2	12	158228	158239	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532421956
3098	NC_022118	GAA	2	6	158249	158254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421956
3099	NC_022118	GTT	2	6	158266	158271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421956
3100	NC_022118	AAGTTT	2	12	158313	158324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532421956
3101	NC_022118	TTA	2	6	158437	158442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421956
3102	NC_022118	CG	3	6	158469	158474	0 %	0 %	50 %	50 %	532421956
3103	NC_022118	AGA	2	6	158495	158500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421956
3104	NC_022118	CAT	2	6	158504	158509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421956
3105	NC_022118	TTC	2	6	158599	158604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421956
3106	NC_022118	AGA	3	9	158609	158617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421956
3107	NC_022118	ATT	2	6	159066	159071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421957
3108	NC_022118	CAT	2	6	159218	159223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421957
3109	NC_022118	TCAA	2	8	159279	159286	50 %	25 %	0 %	25 %	532421957
3110	NC_022118	TGA	2	6	159476	159481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421957
3111	NC_022118	GAA	2	6	159504	159509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421957
3112	NC_022118	TC	3	6	159539	159544	0 %	50 %	0 %	50 %	532421957
3113	NC_022118	GT	3	6	159577	159582	0 %	50 %	50 %	0 %	532421957
3114	NC_022118	AAT	2	6	159621	159626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421957
3115	NC_022118	GGA	2	6	159633	159638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421957
3116	NC_022118	AGGAA	2	10	159662	159671	60 %	0 %	40 %	0 %	532421957
3117	NC_022118	TAG	2	6	159692	159697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421957
3118	NC_022118	AGG	2	6	159698	159703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421957
3119	NC_022118	CTG	2	6	159718	159723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421957
3120	NC_022118	AG	3	6	159749	159754	50 %	0 %	50 %	0 %	532421957
3121	NC_022118	TCT	2	6	159777	159782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421957
3122	NC_022118	AGG	2	6	159896	159901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421957
3123	NC_022118	GAA	2	6	159909	159914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421957
3124	NC_022118	AGA	2	6	159957	159962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421958
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3129	NC_022118	GA	3	6	160230	160235	50 %	0 %	50 %	0 %	532421958
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3359	NC_022118	AG	3	6	171553	171558	50 %	0 %	50 %	0 %	532421963
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3491	NC_022118	AGC	2	6	178939	178944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422679
3492	NC_022118	GA	3	6	179040	179045	50 %	0 %	50 %	0 %	532422679
3493	NC_022118	ACT	2	6	179074	179079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422679
3494	NC_022118	T	7	7	179102	179108	0 %	100 %	0 %	0 %	532422679
3495	NC_022118	TTC	2	6	179120	179125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422679
3496	NC_022118	GAC	2	6	179142	179147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422679
3497	NC_022118	TCA	2	6	179245	179250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422679
3498	NC_022118	GAT	2	6	179251	179256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422679
3499	NC_022118	ATT	3	9	179325	179333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422679
3500	NC_022118	CTG	3	9	179334	179342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422679

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