MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022118	GAA	2	6	104017	104022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421909
2002	NC_022118	GCA	2	6	104112	104117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421909
2003	NC_022118	GTAA	2	8	104123	104130	50 %	25 %	25 %	0 %	532421909
2004	NC_022118	TCT	2	6	104160	104165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421909
2005	NC_022118	TGG	2	6	104189	104194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421909
2006	NC_022118	CAG	2	6	104225	104230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421909
2007	NC_022118	AAGG	2	8	104253	104260	50 %	0 %	50 %	0 %	532421909
2008	NC_022118	GTAC	2	8	104268	104275	25 %	25 %	25 %	25 %	532421909
2009	NC_022118	AG	3	6	104311	104316	50 %	0 %	50 %	0 %	532421909
2010	NC_022118	ATCAT	2	10	104334	104343	40 %	40 %	0 %	20 %	532421909
2011	NC_022118	GTT	2	6	104371	104376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421909
2012	NC_022118	ATC	2	6	104435	104440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421909
2013	NC_022118	GTA	3	9	104484	104492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421909
2014	NC_022118	T	6	6	104507	104512	0 %	100 %	0 %	0 %	532421909
2015	NC_022118	GAA	2	6	104603	104608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421909
2016	NC_022118	AG	3	6	104751	104756	50 %	0 %	50 %	0 %	532421909
2017	NC_022118	TCC	2	6	104855	104860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421909
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2019	NC_022118	ATCA	2	8	104993	105000	50 %	25 %	0 %	25 %	532421909
2020	NC_022118	GGCAT	2	10	105042	105051	20 %	20 %	40 %	20 %	532421909
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2022	NC_022118	ATG	2	6	105117	105122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421909
2023	NC_022118	TGA	2	6	105124	105129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421909
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2025	NC_022118	TCC	2	6	105161	105166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421909
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2057	NC_022118	TGT	2	6	107176	107181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421911
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2122	NC_022118	T	6	6	110619	110624	0 %	100 %	0 %	0 %	532421914
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2124	NC_022118	TAA	2	6	110666	110671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421914
2125	NC_022118	T	6	6	110692	110697	0 %	100 %	0 %	0 %	532421914
2126	NC_022118	TCA	2	6	110794	110799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421914
2127	NC_022118	CAAG	2	8	110993	111000	50 %	0 %	25 %	25 %	532421914
2128	NC_022118	TAG	2	6	111038	111043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421914
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2135	NC_022118	CAT	2	6	111611	111616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421914
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2161	NC_022118	TCT	2	6	112231	112236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421914
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2226	NC_022118	ACC	2	6	115297	115302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421915
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2229	NC_022118	ACTTCG	2	12	115445	115456	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532421915
2230	NC_022118	ACA	3	9	115535	115543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421915
2231	NC_022118	CAA	2	6	115560	115565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421915
2232	NC_022118	TTC	3	9	115609	115617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2233	NC_022118	TCT	2	6	115670	115675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421915
2234	NC_022118	AAGC	2	8	115679	115686	50 %	0 %	25 %	25 %	532421915
2235	NC_022118	TATCG	2	10	115687	115696	20 %	40 %	20 %	20 %	532421915
2236	NC_022118	T	6	6	115703	115708	0 %	100 %	0 %	0 %	532421915
2237	NC_022118	ATG	2	6	115744	115749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421915
2238	NC_022118	GGTT	2	8	116011	116018	0 %	50 %	50 %	0 %	532421916
2239	NC_022118	T	7	7	116027	116033	0 %	100 %	0 %	0 %	532421916
2240	NC_022118	GCT	2	6	116153	116158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421916
2241	NC_022118	TTTCT	2	10	116203	116212	0 %	80 %	0 %	20 %	532421916
2242	NC_022118	ACA	2	6	116240	116245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421916
2243	NC_022118	TAT	2	6	116428	116433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421916
2244	NC_022118	TATC	2	8	116460	116467	25 %	50 %	0 %	25 %	532421916
2245	NC_022118	TTTG	2	8	116557	116564	0 %	75 %	25 %	0 %	532421916
2246	NC_022118	AGG	3	9	116569	116577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421916
2247	NC_022118	AGA	2	6	116590	116595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421916
2248	NC_022118	GA	3	6	116644	116649	50 %	0 %	50 %	0 %	532421916
2249	NC_022118	A	6	6	116697	116702	100 %	0 %	0 %	0 %	532421916
2250	NC_022118	GTTC	2	8	116753	116760	0 %	50 %	25 %	25 %	532421916
2251	NC_022118	TAA	2	6	116773	116778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421916
2252	NC_022118	ACC	2	6	116789	116794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421916
2253	NC_022118	GCT	2	6	116807	116812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421916
2254	NC_022118	AGG	2	6	116857	116862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421916
2255	NC_022118	ATT	2	6	116891	116896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421916
2256	NC_022118	TTC	2	6	116908	116913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421916
2257	NC_022118	TGC	2	6	116938	116943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421916
2258	NC_022118	CTG	2	6	116985	116990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421916
2259	NC_022118	GCA	2	6	117190	117195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421917
2260	NC_022118	TGC	2	6	117201	117206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421917
2261	NC_022118	AAG	2	6	117209	117214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421917
2262	NC_022118	GAAA	2	8	117261	117268	75 %	0 %	25 %	0 %	532421917
2263	NC_022118	GTT	2	6	117304	117309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421917
2264	NC_022118	TAT	2	6	117320	117325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421917
2265	NC_022118	TCC	2	6	117347	117352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421917
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2268	NC_022118	AGC	2	6	117515	117520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422674
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2270	NC_022118	CAA	2	6	117541	117546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422674
2271	NC_022118	AGA	2	6	117547	117552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422674
2272	NC_022118	AAG	2	6	117593	117598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422675
2273	NC_022118	TAA	2	6	117606	117611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422675
2274	NC_022118	T	6	6	117627	117632	0 %	100 %	0 %	0 %	532422675
2275	NC_022118	CA	3	6	117814	117819	50 %	0 %	0 %	50 %	532422675
2276	NC_022118	ATC	2	6	117862	117867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422675
2277	NC_022118	AT	3	6	118020	118025	50 %	50 %	0 %	0 %	532421918
2278	NC_022118	T	6	6	118030	118035	0 %	100 %	0 %	0 %	532421918
2279	NC_022118	AGA	3	9	118036	118044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421918
2280	NC_022118	CTTT	2	8	118073	118080	0 %	75 %	0 %	25 %	532421918
2281	NC_022118	GTAG	2	8	118118	118125	25 %	25 %	50 %	0 %	532421918
2282	NC_022118	G	6	6	118166	118171	0 %	0 %	100 %	0 %	532421918
2283	NC_022118	T	6	6	118189	118194	0 %	100 %	0 %	0 %	532421918
2284	NC_022118	GTT	2	6	118307	118312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421918
2285	NC_022118	GA	3	6	118316	118321	50 %	0 %	50 %	0 %	532421918
2286	NC_022118	TTA	2	6	118337	118342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421918
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2288	NC_022118	A	8	8	118392	118399	100 %	0 %	0 %	0 %	532421918
2289	NC_022118	CTC	2	6	118407	118412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421918
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2293	NC_022118	T	6	6	118617	118622	0 %	100 %	0 %	0 %	532421919
2294	NC_022118	TTC	2	6	118703	118708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421919
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2296	NC_022118	TTTA	2	8	118734	118741	25 %	75 %	0 %	0 %	532421919
2297	NC_022118	CTG	2	6	118932	118937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421919
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2300	NC_022118	GA	4	8	119007	119014	50 %	0 %	50 %	0 %	532421919
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2303	NC_022118	TACT	2	8	119122	119129	25 %	50 %	0 %	25 %	532421919
2304	NC_022118	GTT	2	6	119166	119171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421919
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2312	NC_022118	AAG	2	6	119483	119488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421920
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2317	NC_022118	GCTA	2	8	119596	119603	25 %	25 %	25 %	25 %	532421920
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2322	NC_022118	AG	3	6	119753	119758	50 %	0 %	50 %	0 %	532421920
2323	NC_022118	GA	4	8	119796	119803	50 %	0 %	50 %	0 %	532421920
2324	NC_022118	GGC	2	6	119836	119841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421920
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2331	NC_022118	TCA	2	6	120571	120576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421921
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2334	NC_022118	TGC	2	6	120642	120647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421921
2335	NC_022118	CTG	2	6	120650	120655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421921
2336	NC_022118	AGC	2	6	120673	120678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421921
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2338	NC_022118	GTA	2	6	120880	120885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421921
2339	NC_022118	AGGATC	2	12	120903	120914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532421921
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2342	NC_022118	AGG	2	6	121128	121133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421921
2343	NC_022118	CT	3	6	121188	121193	0 %	50 %	0 %	50 %	532421921
2344	NC_022118	GAA	2	6	121242	121247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421921
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2346	NC_022118	ATG	2	6	121442	121447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421921
2347	NC_022118	TGC	2	6	121459	121464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421921
2348	NC_022118	CTT	2	6	121484	121489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421921
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2350	NC_022118	GAA	2	6	121597	121602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421921
2351	NC_022118	TTTC	2	8	121679	121686	0 %	75 %	0 %	25 %	532421921
2352	NC_022118	AAC	2	6	121730	121735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421921
2353	NC_022118	AAG	2	6	121751	121756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421921
2354	NC_022118	TGA	2	6	121778	121783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421921
2355	NC_022118	AT	3	6	121890	121895	50 %	50 %	0 %	0 %	532421921
2356	NC_022118	GTT	2	6	121930	121935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421921
2357	NC_022118	CAA	2	6	121947	121952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421921
2358	NC_022118	AAG	2	6	121955	121960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421921
2359	NC_022118	AGA	2	6	122022	122027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421921
2360	NC_022118	TGA	2	6	122034	122039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421921
2361	NC_022118	CTT	2	6	122077	122082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421921
2362	NC_022118	TC	3	6	122100	122105	0 %	50 %	0 %	50 %	532421921
2363	NC_022118	ATC	2	6	122283	122288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421921
2364	NC_022118	AAAG	2	8	122410	122417	75 %	0 %	25 %	0 %	532421921
2365	NC_022118	GA	3	6	122430	122435	50 %	0 %	50 %	0 %	532421921
2366	NC_022118	GCTTC	2	10	122438	122447	0 %	40 %	20 %	40 %	532421921
2367	NC_022118	TCTA	2	8	122479	122486	25 %	50 %	0 %	25 %	532421921
2368	NC_022118	ACT	2	6	122640	122645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421922
2369	NC_022118	AAGGGT	2	12	122710	122721	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532421922
2370	NC_022118	AG	3	6	122736	122741	50 %	0 %	50 %	0 %	532421922
2371	NC_022118	T	6	6	122752	122757	0 %	100 %	0 %	0 %	532421922
2372	NC_022118	AGCT	2	8	122785	122792	25 %	25 %	25 %	25 %	532421922
2373	NC_022118	CAA	2	6	122854	122859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421922
2374	NC_022118	GGC	2	6	122917	122922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421922
2375	NC_022118	AAG	2	6	122924	122929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421922
2376	NC_022118	ATA	2	6	123010	123015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421922
2377	NC_022118	TAA	2	6	123139	123144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421922
2378	NC_022118	TGA	2	6	123228	123233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421922
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2380	NC_022118	GAT	2	6	123320	123325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421922
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2382	NC_022118	AGA	2	6	123464	123469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421922
2383	NC_022118	T	6	6	123572	123577	0 %	100 %	0 %	0 %	532421923
2384	NC_022118	GA	3	6	123650	123655	50 %	0 %	50 %	0 %	532421923
2385	NC_022118	GGGTTT	2	12	123673	123684	0 %	50 %	50 %	0 %	532421923
2386	NC_022118	CAA	2	6	123699	123704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421923
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2389	NC_022118	TGGA	2	8	123741	123748	25 %	25 %	50 %	0 %	532421923
2390	NC_022118	GCAA	2	8	123776	123783	50 %	0 %	25 %	25 %	532421923
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2392	NC_022118	TTA	2	6	123862	123867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421923
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2397	NC_022118	CTG	2	6	123982	123987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421923
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2402	NC_022118	AGC	2	6	124250	124255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421923
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2471	NC_022118	ATTC	2	8	127456	127463	25 %	50 %	0 %	25 %	532421926
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2490	NC_022118	AGCT	2	8	128564	128571	25 %	25 %	25 %	25 %	532421928
2491	NC_022118	TTC	2	6	128574	128579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421928
2492	NC_022118	TGA	2	6	128622	128627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421928
2493	NC_022118	ATCCA	2	10	128634	128643	40 %	20 %	0 %	40 %	532421928
2494	NC_022118	T	6	6	128646	128651	0 %	100 %	0 %	0 %	532421928
2495	NC_022118	CCG	2	6	128677	128682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532421928
2496	NC_022118	CTT	2	6	128705	128710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421928
2497	NC_022118	CTT	2	6	128717	128722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421928
2498	NC_022118	AGAA	2	8	128727	128734	75 %	0 %	25 %	0 %	532421928
2499	NC_022118	GTA	2	6	128796	128801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421928
2500	NC_022118	TCA	2	6	128839	128844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421928

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