MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022118	TGTCT	2	10	79920	79929	0 %	60 %	20 %	20 %	532421888
1502	NC_022118	TGAT	2	8	79994	80001	25 %	50 %	25 %	0 %	532421888
1503	NC_022118	TCAT	2	8	80016	80023	25 %	50 %	0 %	25 %	532421888
1504	NC_022118	T	6	6	80072	80077	0 %	100 %	0 %	0 %	532421888
1505	NC_022118	TCT	2	6	80184	80189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421888
1506	NC_022118	GAA	2	6	80194	80199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421888
1507	NC_022118	TGC	2	6	80244	80249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421888
1508	NC_022118	CAA	2	6	80278	80283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421888
1509	NC_022118	GAA	2	6	80296	80301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421888
1510	NC_022118	GGA	2	6	80340	80345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421888
1511	NC_022118	TC	4	8	80368	80375	0 %	50 %	0 %	50 %	532421888
1512	NC_022118	A	7	7	80387	80393	100 %	0 %	0 %	0 %	532421888
1513	NC_022118	TTACT	2	10	80427	80436	20 %	60 %	0 %	20 %	532421888
1514	NC_022118	TATC	2	8	80443	80450	25 %	50 %	0 %	25 %	532421888
1515	NC_022118	GA	3	6	80461	80466	50 %	0 %	50 %	0 %	532421888
1516	NC_022118	TAT	2	6	80541	80546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421888
1517	NC_022118	TA	3	6	80681	80686	50 %	50 %	0 %	0 %	532421888
1518	NC_022118	AGA	2	6	80745	80750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421888
1519	NC_022118	GGGA	2	8	80754	80761	25 %	0 %	75 %	0 %	532421888
1520	NC_022118	CTGC	2	8	80858	80865	0 %	25 %	25 %	50 %	532421889
1521	NC_022118	GCT	2	6	80876	80881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421889
1522	NC_022118	ATT	2	6	80882	80887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421889
1523	NC_022118	CTT	2	6	80925	80930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421889
1524	NC_022118	CTT	2	6	80946	80951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421889
1525	NC_022118	CAT	2	6	80993	80998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421889
1526	NC_022118	TGA	2	6	81115	81120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421889
1527	NC_022118	AGG	2	6	81126	81131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421889
1528	NC_022118	GGTT	2	8	81151	81158	0 %	50 %	50 %	0 %	532421889
1529	NC_022118	CT	3	6	81191	81196	0 %	50 %	0 %	50 %	532421889
1530	NC_022118	GGA	2	6	81197	81202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421889
1531	NC_022118	CAA	2	6	81203	81208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421889
1532	NC_022118	AG	3	6	81210	81215	50 %	0 %	50 %	0 %	532421889
1533	NC_022118	T	6	6	81217	81222	0 %	100 %	0 %	0 %	532421889
1534	NC_022118	CGAT	2	8	81279	81286	25 %	25 %	25 %	25 %	532421889
1535	NC_022118	TCAT	2	8	81354	81361	25 %	50 %	0 %	25 %	532421889
1536	NC_022118	TTA	2	6	81404	81409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421889
1537	NC_022118	TG	3	6	81421	81426	0 %	50 %	50 %	0 %	532421889
1538	NC_022118	AGA	2	6	81439	81444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421889
1539	NC_022118	AAG	2	6	81456	81461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421889
1540	NC_022118	AC	3	6	81504	81509	50 %	0 %	0 %	50 %	532421889
1541	NC_022118	T	6	6	81589	81594	0 %	100 %	0 %	0 %	532421890
1542	NC_022118	GAC	2	6	81616	81621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421890
1543	NC_022118	GA	3	6	81650	81655	50 %	0 %	50 %	0 %	532421890
1544	NC_022118	TTA	2	6	81662	81667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421890
1545	NC_022118	CTT	2	6	81716	81721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421890
1546	NC_022118	TTA	2	6	81759	81764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421890
1547	NC_022118	T	6	6	81767	81772	0 %	100 %	0 %	0 %	532421890
1548	NC_022118	AGAAA	2	10	81817	81826	80 %	0 %	20 %	0 %	532421890
1549	NC_022118	T	6	6	81872	81877	0 %	100 %	0 %	0 %	532421890
1550	NC_022118	GTTA	2	8	81896	81903	25 %	50 %	25 %	0 %	532421890
1551	NC_022118	ACA	2	6	81930	81935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421890
1552	NC_022118	GCG	2	6	81962	81967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421890
1553	NC_022118	T	6	6	82005	82010	0 %	100 %	0 %	0 %	532421890
1554	NC_022118	TGG	3	9	82031	82039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421890
1555	NC_022118	CAG	2	6	82107	82112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421890
1556	NC_022118	GTT	2	6	82118	82123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421890
1557	NC_022118	TATT	2	8	82128	82135	25 %	75 %	0 %	0 %	532421890
1558	NC_022118	GTG	2	6	82152	82157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421890
1559	NC_022118	CCT	2	6	82202	82207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421890
1560	NC_022118	GGAAG	2	10	82330	82339	40 %	0 %	60 %	0 %	532421890
1561	NC_022118	ATT	2	6	82349	82354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421890
1562	NC_022118	TTG	2	6	82371	82376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421890
1563	NC_022118	TTC	2	6	82379	82384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421890
1564	NC_022118	T	6	6	82413	82418	0 %	100 %	0 %	0 %	532421890
1565	NC_022118	GAA	2	6	82452	82457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421890
1566	NC_022118	GAA	2	6	82481	82486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421890
1567	NC_022118	GA	3	6	82543	82548	50 %	0 %	50 %	0 %	532421890
1568	NC_022118	GTTC	2	8	82553	82560	0 %	50 %	25 %	25 %	532421890
1569	NC_022118	GCT	2	6	82688	82693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421890
1570	NC_022118	GTGC	2	8	82700	82707	0 %	25 %	50 %	25 %	532421890
1571	NC_022118	TAA	2	6	82750	82755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421890
1572	NC_022118	CAT	2	6	82766	82771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421890
1573	NC_022118	GAA	2	6	82778	82783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421890
1574	NC_022118	GA	3	6	82863	82868	50 %	0 %	50 %	0 %	532421890
1575	NC_022118	TAC	2	6	82914	82919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421891
1576	NC_022118	T	6	6	82938	82943	0 %	100 %	0 %	0 %	532421891
1577	NC_022118	T	7	7	82950	82956	0 %	100 %	0 %	0 %	532421891
1578	NC_022118	T	6	6	82963	82968	0 %	100 %	0 %	0 %	532421891
1579	NC_022118	GTA	2	6	83049	83054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421891
1580	NC_022118	T	6	6	83060	83065	0 %	100 %	0 %	0 %	532421891
1581	NC_022118	TATG	2	8	83084	83091	25 %	50 %	25 %	0 %	532421891
1582	NC_022118	TAT	2	6	83113	83118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421891
1583	NC_022118	GTCTGT	2	12	83127	83138	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532421891
1584	NC_022118	TCA	2	6	83147	83152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421891
1585	NC_022118	TCAT	2	8	83155	83162	25 %	50 %	0 %	25 %	532421891
1586	NC_022118	CAA	2	6	83197	83202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421891
1587	NC_022118	ACTG	2	8	83207	83214	25 %	25 %	25 %	25 %	532421891
1588	NC_022118	CATT	2	8	83222	83229	25 %	50 %	0 %	25 %	532421891
1589	NC_022118	AGA	2	6	83255	83260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421891
1590	NC_022118	AGCA	2	8	83261	83268	50 %	0 %	25 %	25 %	532421891
1591	NC_022118	TC	3	6	83283	83288	0 %	50 %	0 %	50 %	532421891
1592	NC_022118	ATTA	2	8	83414	83421	50 %	50 %	0 %	0 %	532421891
1593	NC_022118	TTTG	2	8	83454	83461	0 %	75 %	25 %	0 %	532421891
1594	NC_022118	TTG	2	6	83551	83556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421891
1595	NC_022118	GAT	2	6	83648	83653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421891
1596	NC_022118	TCTA	2	8	83738	83745	25 %	50 %	0 %	25 %	532421891
1597	NC_022118	CTA	2	6	83766	83771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421891
1598	NC_022118	TAT	2	6	83819	83824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421891
1599	NC_022118	TAAG	2	8	83843	83850	50 %	25 %	25 %	0 %	532421891
1600	NC_022118	AGT	2	6	83932	83937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421892
1601	NC_022118	TAT	2	6	83959	83964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421892
1602	NC_022118	TGC	2	6	83974	83979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421892
1603	NC_022118	AAG	2	6	83994	83999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421892
1604	NC_022118	TC	3	6	84006	84011	0 %	50 %	0 %	50 %	532421892
1605	NC_022118	AG	3	6	84017	84022	50 %	0 %	50 %	0 %	532421892
1606	NC_022118	GAA	2	6	84050	84055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421892
1607	NC_022118	CAG	2	6	84189	84194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421892
1608	NC_022118	TAA	2	6	84235	84240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421892
1609	NC_022118	AG	3	6	84284	84289	50 %	0 %	50 %	0 %	532421892
1610	NC_022118	TTC	2	6	84303	84308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421892
1611	NC_022118	GAAG	2	8	84347	84354	50 %	0 %	50 %	0 %	532421892
1612	NC_022118	A	6	6	84371	84376	100 %	0 %	0 %	0 %	532421892
1613	NC_022118	AGA	2	6	84421	84426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421892
1614	NC_022118	TTC	2	6	84499	84504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421892
1615	NC_022118	TAAA	2	8	84513	84520	75 %	25 %	0 %	0 %	532421892
1616	NC_022118	ATCC	2	8	84584	84591	25 %	25 %	0 %	50 %	532421892
1617	NC_022118	TGG	2	6	84612	84617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421892
1618	NC_022118	TCC	2	6	84652	84657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421892
1619	NC_022118	ACA	2	6	84676	84681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421892
1620	NC_022118	TTTC	2	8	84731	84738	0 %	75 %	0 %	25 %	532421892
1621	NC_022118	AGAT	2	8	84772	84779	50 %	25 %	25 %	0 %	532421892
1622	NC_022118	AGCGA	2	10	84796	84805	40 %	0 %	40 %	20 %	532421892
1623	NC_022118	CTT	2	6	84809	84814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421892
1624	NC_022118	T	6	6	84835	84840	0 %	100 %	0 %	0 %	532421892
1625	NC_022118	GAA	2	6	84962	84967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421892
1626	NC_022118	AAT	2	6	85216	85221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421893
1627	NC_022118	AT	3	6	85220	85225	50 %	50 %	0 %	0 %	532421893
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1629	NC_022118	AG	3	6	85315	85320	50 %	0 %	50 %	0 %	532421893
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1990	NC_022118	TTC	2	6	103411	103416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421909
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1994	NC_022118	AGG	2	6	103553	103558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421909
1995	NC_022118	GTTT	2	8	103641	103648	0 %	75 %	25 %	0 %	532421909
1996	NC_022118	ATC	2	6	103662	103667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421909
1997	NC_022118	GA	3	6	103717	103722	50 %	0 %	50 %	0 %	532421909
1998	NC_022118	AGTA	2	8	103766	103773	50 %	25 %	25 %	0 %	532421909
1999	NC_022118	GGAA	2	8	103927	103934	50 %	0 %	50 %	0 %	532421909
2000	NC_022118	GAA	2	6	104000	104005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421909

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