MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022118	TTGA	2	8	54596	54603	25 %	50 %	25 %	0 %	532421872
1002	NC_022118	GTA	2	6	54636	54641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421872
1003	NC_022118	CTT	2	6	54650	54655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421872
1004	NC_022118	A	6	6	54785	54790	100 %	0 %	0 %	0 %	532421872
1005	NC_022118	G	6	6	54841	54846	0 %	0 %	100 %	0 %	532421872
1006	NC_022118	AAT	2	6	54938	54943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421872
1007	NC_022118	GGAA	2	8	54952	54959	50 %	0 %	50 %	0 %	532421872
1008	NC_022118	GATCTG	2	12	54987	54998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532421872
1009	NC_022118	GGTTCA	2	12	55124	55135	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532421872
1010	NC_022118	TTATC	2	10	55225	55234	20 %	60 %	0 %	20 %	532421872
1011	NC_022118	TGAGT	2	10	55246	55255	20 %	40 %	40 %	0 %	532421872
1012	NC_022118	TCA	3	9	55259	55267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421872
1013	NC_022118	GTT	2	6	55274	55279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421872
1014	NC_022118	TCT	2	6	55319	55324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421872
1015	NC_022118	GGA	2	6	55325	55330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421872
1016	NC_022118	TGC	2	6	55360	55365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421872
1017	NC_022118	AT	3	6	55570	55575	50 %	50 %	0 %	0 %	532421872
1018	NC_022118	TTA	2	6	55585	55590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421872
1019	NC_022118	GTT	2	6	55753	55758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422665
1020	NC_022118	TGT	2	6	55802	55807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422665
1021	NC_022118	CTGG	3	12	55862	55873	0 %	25 %	50 %	25 %	532422665
1022	NC_022118	ATT	2	6	55877	55882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422665
1023	NC_022118	GAT	2	6	55890	55895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422665
1024	NC_022118	TCT	2	6	55908	55913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422665
1025	NC_022118	TCC	2	6	55943	55948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422665
1026	NC_022118	TTA	2	6	55956	55961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422665
1027	NC_022118	TTGC	2	8	55999	56006	0 %	50 %	25 %	25 %	532422665
1028	NC_022118	T	6	6	56051	56056	0 %	100 %	0 %	0 %	532422665
1029	NC_022118	GTA	2	6	56082	56087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422665
1030	NC_022118	GTT	2	6	56193	56198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422665
1031	NC_022118	AG	3	6	56205	56210	50 %	0 %	50 %	0 %	532422665
1032	NC_022118	TGG	2	6	56213	56218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422665
1033	NC_022118	GTTGT	2	10	56292	56301	0 %	60 %	40 %	0 %	532422665
1034	NC_022118	T	6	6	56347	56352	0 %	100 %	0 %	0 %	532422665
1035	NC_022118	A	7	7	56389	56395	100 %	0 %	0 %	0 %	532422665
1036	NC_022118	TCC	2	6	56397	56402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422665
1037	NC_022118	AGT	3	9	56486	56494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422665
1038	NC_022118	AGCT	2	8	56498	56505	25 %	25 %	25 %	25 %	532422665
1039	NC_022118	CT	3	6	56504	56509	0 %	50 %	0 %	50 %	532422665
1040	NC_022118	TGG	2	6	56540	56545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422665
1041	NC_022118	GT	3	6	56554	56559	0 %	50 %	50 %	0 %	532422665
1042	NC_022118	TGT	2	6	56563	56568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422665
1043	NC_022118	AGT	2	6	56573	56578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422665
1044	NC_022118	GTT	2	6	56666	56671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422665
1045	NC_022118	T	6	6	56670	56675	0 %	100 %	0 %	0 %	532422665
1046	NC_022118	AGA	2	6	56826	56831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422665
1047	NC_022118	CAG	2	6	56989	56994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422665
1048	NC_022118	TTG	2	6	57011	57016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422665
1049	NC_022118	TGT	2	6	57089	57094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422665
1050	NC_022118	TG	3	6	57192	57197	0 %	50 %	50 %	0 %	532422665
1051	NC_022118	GGTT	2	8	57201	57208	0 %	50 %	50 %	0 %	532422665
1052	NC_022118	TAA	2	6	57257	57262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422665
1053	NC_022118	ACT	2	6	57273	57278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422665
1054	NC_022118	TTA	2	6	57279	57284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422665
1055	NC_022118	GAA	3	9	57297	57305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422665
1056	NC_022118	ATT	2	6	57308	57313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422665
1057	NC_022118	T	6	6	57312	57317	0 %	100 %	0 %	0 %	532422665
1058	NC_022118	ATT	2	6	57327	57332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422665
1059	NC_022118	TGA	2	6	57468	57473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422666
1060	NC_022118	TGT	2	6	57498	57503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422666
1061	NC_022118	GGA	2	6	57505	57510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422666
1062	NC_022118	GTT	2	6	57511	57516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422666
1063	NC_022118	GCT	2	6	57550	57555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422666
1064	NC_022118	GAT	2	6	57568	57573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422666
1065	NC_022118	TGA	2	6	57585	57590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422666
1066	NC_022118	TCC	2	6	57600	57605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422666
1067	NC_022118	AGTTGT	2	12	57664	57675	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532422666
1068	NC_022118	AGA	2	6	57735	57740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422666
1069	NC_022118	CTA	2	6	57751	57756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422666
1070	NC_022118	TGA	2	6	57921	57926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422666
1071	NC_022118	TGT	2	6	57993	57998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422666
1072	NC_022118	AGAA	2	8	58062	58069	75 %	0 %	25 %	0 %	532422666
1073	NC_022118	CT	3	6	58073	58078	0 %	50 %	0 %	50 %	532422666
1074	NC_022118	GTT	2	6	58082	58087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422666
1075	NC_022118	AGGT	2	8	58102	58109	25 %	25 %	50 %	0 %	532422666
1076	NC_022118	CAC	2	6	58215	58220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422666
1077	NC_022118	AGG	2	6	58266	58271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422666
1078	NC_022118	TCT	2	6	58282	58287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422666
1079	NC_022118	TCT	2	6	58402	58407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422666
1080	NC_022118	T	6	6	58410	58415	0 %	100 %	0 %	0 %	532422666
1081	NC_022118	GCT	2	6	58492	58497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422666
1082	NC_022118	ATC	2	6	58530	58535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422666
1083	NC_022118	TCT	2	6	58541	58546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422666
1084	NC_022118	TGT	2	6	58565	58570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422666
1085	NC_022118	TTGTTC	2	12	58584	58595	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532422666
1086	NC_022118	T	6	6	58604	58609	0 %	100 %	0 %	0 %	532422666
1087	NC_022118	CTT	2	6	58622	58627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422666
1088	NC_022118	TTC	2	6	58653	58658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422666
1089	NC_022118	TGG	2	6	58679	58684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422666
1090	NC_022118	TCC	2	6	58740	58745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422666
1091	NC_022118	TAGA	2	8	58781	58788	50 %	25 %	25 %	0 %	532422666
1092	NC_022118	TTA	2	6	58867	58872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422666
1093	NC_022118	TGAA	2	8	58886	58893	50 %	25 %	25 %	0 %	532422666
1094	NC_022118	T	8	8	58963	58970	0 %	100 %	0 %	0 %	532422666
1095	NC_022118	T	6	6	58983	58988	0 %	100 %	0 %	0 %	532422666
1096	NC_022118	T	6	6	58994	58999	0 %	100 %	0 %	0 %	532422666
1097	NC_022118	AGA	2	6	59067	59072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421873
1098	NC_022118	TCT	2	6	59083	59088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421873
1099	NC_022118	T	6	6	59115	59120	0 %	100 %	0 %	0 %	532421873
1100	NC_022118	CGTT	2	8	59266	59273	0 %	50 %	25 %	25 %	532421873
1101	NC_022118	GGAG	2	8	59275	59282	25 %	0 %	75 %	0 %	532421873
1102	NC_022118	GTAA	2	8	59327	59334	50 %	25 %	25 %	0 %	532421873
1103	NC_022118	TCCTAA	2	12	59394	59405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421873
1104	NC_022118	AGT	2	6	59423	59428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421873
1105	NC_022118	T	6	6	59455	59460	0 %	100 %	0 %	0 %	532421873
1106	NC_022118	TAG	2	6	59502	59507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421873
1107	NC_022118	GCT	2	6	59515	59520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421873
1108	NC_022118	GTC	2	6	59541	59546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421873
1109	NC_022118	ATGG	2	8	59554	59561	25 %	25 %	50 %	0 %	532421873
1110	NC_022118	AGG	2	6	59588	59593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421873
1111	NC_022118	GA	3	6	59640	59645	50 %	0 %	50 %	0 %	532421873
1112	NC_022118	CAA	2	6	59663	59668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421873
1113	NC_022118	ATAA	2	8	59700	59707	75 %	25 %	0 %	0 %	532421873
1114	NC_022118	GAGCA	2	10	59740	59749	40 %	0 %	40 %	20 %	532421873
1115	NC_022118	GT	3	6	59778	59783	0 %	50 %	50 %	0 %	532421873
1116	NC_022118	TAG	2	6	59790	59795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421873
1117	NC_022118	AAG	2	6	59975	59980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421873
1118	NC_022118	AAC	2	6	60020	60025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421873
1119	NC_022118	T	7	7	60039	60045	0 %	100 %	0 %	0 %	532421873
1120	NC_022118	CTT	2	6	60089	60094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421873
1121	NC_022118	AAT	2	6	60119	60124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421873
1122	NC_022118	TTC	2	6	60130	60135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421873
1123	NC_022118	ATGT	2	8	60150	60157	25 %	50 %	25 %	0 %	532421873
1124	NC_022118	CATT	2	8	60179	60186	25 %	50 %	0 %	25 %	532421873
1125	NC_022118	ATG	2	6	60200	60205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421874
1126	NC_022118	CCT	2	6	60206	60211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421874
1127	NC_022118	AGT	2	6	60261	60266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421874
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1132	NC_022118	TTCT	2	8	60475	60482	0 %	75 %	0 %	25 %	532421874
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1246	NC_022118	GTTAA	2	10	66341	66350	40 %	40 %	20 %	0 %	532421878
1247	NC_022118	AGG	2	6	66376	66381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421878
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1252	NC_022118	AAG	2	6	66562	66567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421878
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1254	NC_022118	CAT	2	6	66735	66740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421878
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1256	NC_022118	TCA	2	6	66912	66917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421878
1257	NC_022118	TCA	2	6	66944	66949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421878
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1372	NC_022118	CTC	2	6	72690	72695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421883
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