MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022118	GAG	2	6	28362	28367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421846
502	NC_022118	TG	3	6	28394	28399	0 %	50 %	50 %	0 %	532421846
503	NC_022118	GCA	2	6	28418	28423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421846
504	NC_022118	TC	3	6	28447	28452	0 %	50 %	0 %	50 %	532421846
505	NC_022118	AGGGT	2	10	28581	28590	20 %	20 %	60 %	0 %	532421846
506	NC_022118	TTC	2	6	28617	28622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421846
507	NC_022118	CAG	2	6	28629	28634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421846
508	NC_022118	GAA	2	6	28643	28648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421846
509	NC_022118	TGA	2	6	28657	28662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421846
510	NC_022118	TTC	2	6	28690	28695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421846
511	NC_022118	GC	4	8	28861	28868	0 %	0 %	50 %	50 %	532421846
512	NC_022118	AAG	2	6	28869	28874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421846
513	NC_022118	TA	3	6	28983	28988	50 %	50 %	0 %	0 %	532421846
514	NC_022118	GAA	2	6	29072	29077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421846
515	NC_022118	TGT	2	6	29104	29109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421847
516	NC_022118	TCT	2	6	29172	29177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421847
517	NC_022118	ACA	2	6	29400	29405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421847
518	NC_022118	ATG	2	6	29410	29415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421847
519	NC_022118	CTTT	2	8	29552	29559	0 %	75 %	0 %	25 %	532421847
520	NC_022118	TTTG	2	8	29567	29574	0 %	75 %	25 %	0 %	532421847
521	NC_022118	TTGT	2	8	29602	29609	0 %	75 %	25 %	0 %	532421847
522	NC_022118	CCTAT	2	10	29621	29630	20 %	40 %	0 %	40 %	532421847
523	NC_022118	T	6	6	29637	29642	0 %	100 %	0 %	0 %	532421847
524	NC_022118	ATC	2	6	29716	29721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421847
525	NC_022118	TGGC	2	8	29765	29772	0 %	25 %	50 %	25 %	532421847
526	NC_022118	T	8	8	29871	29878	0 %	100 %	0 %	0 %	532421847
527	NC_022118	ATG	2	6	29896	29901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421847
528	NC_022118	GA	3	6	29934	29939	50 %	0 %	50 %	0 %	532421847
529	NC_022118	AG	3	6	30032	30037	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
530	NC_022118	GTT	2	6	30113	30118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421848
531	NC_022118	GAA	2	6	30122	30127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421848
532	NC_022118	TC	3	6	30141	30146	0 %	50 %	0 %	50 %	532421848
533	NC_022118	TCT	2	6	30188	30193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421848
534	NC_022118	ACT	2	6	30278	30283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421848
535	NC_022118	TTC	2	6	30306	30311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421848
536	NC_022118	AAAG	2	8	30325	30332	75 %	0 %	25 %	0 %	532421848
537	NC_022118	CCT	2	6	30342	30347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421848
538	NC_022118	AAAC	2	8	30395	30402	75 %	0 %	0 %	25 %	532421848
539	NC_022118	T	6	6	30412	30417	0 %	100 %	0 %	0 %	532421848
540	NC_022118	AAGGA	2	10	30421	30430	60 %	0 %	40 %	0 %	532421848
541	NC_022118	GGC	2	6	30448	30453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421848
542	NC_022118	GAT	2	6	30527	30532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421848
543	NC_022118	GATG	2	8	30538	30545	25 %	25 %	50 %	0 %	532421848
544	NC_022118	TAG	2	6	30549	30554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421848
545	NC_022118	GTT	2	6	30623	30628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421848
546	NC_022118	TAA	2	6	30733	30738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421848
547	NC_022118	GA	3	6	30762	30767	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
548	NC_022118	AGA	2	6	30892	30897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421848
549	NC_022118	TCG	2	6	30955	30960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421848
550	NC_022118	ATG	2	6	30989	30994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421848
551	NC_022118	TGG	2	6	31003	31008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421848
552	NC_022118	GAA	2	6	31034	31039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421848
553	NC_022118	ATT	2	6	31070	31075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421848
554	NC_022118	ATG	2	6	31193	31198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421848
555	NC_022118	AAG	2	6	31205	31210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421848
556	NC_022118	T	6	6	31211	31216	0 %	100 %	0 %	0 %	532421848
557	NC_022118	GA	3	6	31230	31235	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
558	NC_022118	A	7	7	31253	31259	100 %	0 %	0 %	0 %	532421848
559	NC_022118	ACA	2	6	31299	31304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421849
560	NC_022118	TGT	2	6	31320	31325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421849
561	NC_022118	T	6	6	31439	31444	0 %	100 %	0 %	0 %	532421849
562	NC_022118	GAGCT	2	10	31460	31469	20 %	20 %	40 %	20 %	532421849
563	NC_022118	A	6	6	31534	31539	100 %	0 %	0 %	0 %	532421849
564	NC_022118	A	6	6	31565	31570	100 %	0 %	0 %	0 %	532421849
565	NC_022118	AGC	2	6	31611	31616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421849
566	NC_022118	GATA	2	8	31647	31654	50 %	25 %	25 %	0 %	532421850
567	NC_022118	TC	3	6	31656	31661	0 %	50 %	0 %	50 %	532421850
568	NC_022118	AAG	2	6	31860	31865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421850
569	NC_022118	AAG	2	6	31867	31872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421850
570	NC_022118	CTT	2	6	31906	31911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421850
571	NC_022118	CGT	2	6	31937	31942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421850
572	NC_022118	TGA	2	6	31983	31988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421850
573	NC_022118	GAG	2	6	32014	32019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421850
574	NC_022118	GCG	2	6	32056	32061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421850
575	NC_022118	CT	3	6	32136	32141	0 %	50 %	0 %	50 %	532421850
576	NC_022118	AGA	2	6	32234	32239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421850
577	NC_022118	AG	3	6	32268	32273	50 %	0 %	50 %	0 %	532421850
578	NC_022118	AAG	2	6	32422	32427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421850
579	NC_022118	ATT	2	6	32472	32477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421850
580	NC_022118	T	6	6	32577	32582	0 %	100 %	0 %	0 %	532421850
581	NC_022118	GGA	2	6	32602	32607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421850
582	NC_022118	AGG	2	6	32827	32832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421851
583	NC_022118	GGT	2	6	32882	32887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421851
584	NC_022118	GCT	2	6	33044	33049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421851
585	NC_022118	GCT	2	6	33077	33082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421851
586	NC_022118	GAA	2	6	33188	33193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421852
587	NC_022118	A	6	6	33192	33197	100 %	0 %	0 %	0 %	532421852
588	NC_022118	TGT	2	6	33283	33288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421852
589	NC_022118	TGA	2	6	33334	33339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421852
590	NC_022118	GTT	2	6	33422	33427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421852
591	NC_022118	AGG	2	6	33471	33476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421852
592	NC_022118	CTT	2	6	33495	33500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421852
593	NC_022118	T	6	6	33517	33522	0 %	100 %	0 %	0 %	532421852
594	NC_022118	GTT	2	6	33535	33540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421852
595	NC_022118	TGA	2	6	33642	33647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421852
596	NC_022118	CAG	2	6	33705	33710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421852
597	NC_022118	TC	3	6	33765	33770	0 %	50 %	0 %	50 %	532421852
598	NC_022118	AG	3	6	33778	33783	50 %	0 %	50 %	0 %	532421852
599	NC_022118	CTG	2	6	33874	33879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421853
600	NC_022118	ACA	2	6	33891	33896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421853
601	NC_022118	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	532421853
602	NC_022118	GTC	2	6	33947	33952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421853
603	NC_022118	ATT	2	6	33994	33999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421853
604	NC_022118	T	6	6	34046	34051	0 %	100 %	0 %	0 %	532421853
605	NC_022118	TTA	2	6	34076	34081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421853
606	NC_022118	TGAT	2	8	34141	34148	25 %	50 %	25 %	0 %	532421853
607	NC_022118	GAA	2	6	34169	34174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421853
608	NC_022118	AAG	2	6	34216	34221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421853
609	NC_022118	AGA	2	6	34267	34272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421853
610	NC_022118	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	532421853
611	NC_022118	TGC	2	6	34304	34309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421853
612	NC_022118	TGT	2	6	34328	34333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421853
613	NC_022118	ATG	2	6	34339	34344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421853
614	NC_022118	AAG	2	6	34370	34375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421853
615	NC_022118	GAA	2	6	34389	34394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421853
616	NC_022118	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	532421854
617	NC_022118	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	532421854
618	NC_022118	GAT	2	6	34600	34605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421854
619	NC_022118	AG	3	6	34608	34613	50 %	0 %	50 %	0 %	532421854
620	NC_022118	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	532421854
621	NC_022118	AGA	2	6	34666	34671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421854
622	NC_022118	TTA	2	6	34729	34734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421855
623	NC_022118	TGA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421855
624	NC_022118	GGCA	2	8	34901	34908	25 %	0 %	50 %	25 %	532421855
625	NC_022118	GAA	2	6	34961	34966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421855
626	NC_022118	ATC	2	6	35011	35016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421855
627	NC_022118	GAA	2	6	35100	35105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421855
628	NC_022118	TGT	2	6	35129	35134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421855
629	NC_022118	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	532421855
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752	NC_022118	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	532421859
753	NC_022118	A	7	7	42085	42091	100 %	0 %	0 %	0 %	532421859
754	NC_022118	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	532421859
755	NC_022118	CGG	2	6	42142	42147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421859
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998	NC_022118	GAAT	2	8	54526	54533	50 %	25 %	25 %	0 %	532421872
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