MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022117	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	532419037
2	NC_022117	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	532419038
3	NC_022117	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	532419038
4	NC_022117	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	532419038
5	NC_022117	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	532419038
6	NC_022117	GTCTT	2	10	5218	5227	0 %	60 %	20 %	20 %	532419039
7	NC_022117	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	532419041
8	NC_022117	CGAAA	2	10	9099	9108	60 %	0 %	20 %	20 %	532419042
9	NC_022117	GGCTG	2	10	9735	9744	0 %	20 %	60 %	20 %	532419043
10	NC_022117	CCTCT	2	10	10527	10536	0 %	40 %	0 %	60 %	532419044
11	NC_022117	AAAGG	2	10	10686	10695	60 %	0 %	40 %	0 %	532419044
12	NC_022117	AAGAA	2	10	11806	11815	80 %	0 %	20 %	0 %	532419045
13	NC_022117	AAAGA	2	10	13204	13213	80 %	0 %	20 %	0 %	532419046
14	NC_022117	GGTGT	2	10	13308	13317	0 %	40 %	60 %	0 %	532419046
15	NC_022117	GATTT	2	10	15051	15060	20 %	60 %	20 %	0 %	532419048
16	NC_022117	CGTTC	2	10	16162	16171	0 %	40 %	20 %	40 %	532419049
17	NC_022117	GCTTC	2	10	16535	16544	0 %	40 %	20 %	40 %	532419049
18	NC_022117	GAAGG	2	10	16906	16915	40 %	0 %	60 %	0 %	532419049
19	NC_022117	GTTGT	2	10	20332	20341	0 %	60 %	40 %	0 %	532419052
20	NC_022117	AAGAT	2	10	21444	21453	60 %	20 %	20 %	0 %	532419053
21	NC_022117	TTTGC	2	10	22055	22064	0 %	60 %	20 %	20 %	532419053
22	NC_022117	GGAAA	2	10	23809	23818	60 %	0 %	40 %	0 %	532419053
23	NC_022117	AGAGG	2	10	25535	25544	40 %	0 %	60 %	0 %	532419054
24	NC_022117	GGAGA	2	10	27314	27323	40 %	0 %	60 %	0 %	532419055
25	NC_022117	ATCCG	2	10	28065	28074	20 %	20 %	20 %	40 %	532419057
26	NC_022117	AGGGT	2	10	28583	28592	20 %	20 %	60 %	0 %	532419057
27	NC_022117	CCTAT	2	10	29623	29632	20 %	40 %	0 %	40 %	532419058
28	NC_022117	AAGGA	2	10	30423	30432	60 %	0 %	40 %	0 %	532419059
29	NC_022117	GAGCT	2	10	31462	31471	20 %	20 %	40 %	20 %	532419060
30	NC_022117	TCAGT	2	10	35701	35710	20 %	40 %	20 %	20 %	532419066
31	NC_022117	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	532419066
32	NC_022117	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	532419066
33	NC_022117	ACGAT	2	10	38098	38107	40 %	20 %	20 %	20 %	532419067
34	NC_022117	TTTGA	2	10	38463	38472	20 %	60 %	20 %	0 %	532419067
35	NC_022117	AGCAA	2	10	42114	42123	60 %	0 %	20 %	20 %	532419070
36	NC_022117	CGATG	2	10	42171	42180	20 %	20 %	40 %	20 %	532419070
37	NC_022117	TTTAT	2	10	44243	44252	20 %	80 %	0 %	0 %	532419074
38	NC_022117	CTTTC	2	10	46340	46349	0 %	60 %	0 %	40 %	532419076
39	NC_022117	AGTTT	2	10	46879	46888	20 %	60 %	20 %	0 %	532419076
40	NC_022117	GAAGA	2	10	48012	48021	60 %	0 %	40 %	0 %	532419076
41	NC_022117	CTTTT	2	10	50042	50051	0 %	80 %	0 %	20 %	532419079
42	NC_022117	CCGTA	2	10	53925	53934	20 %	20 %	20 %	40 %	532419082
43	NC_022117	TTATC	2	10	55334	55343	20 %	60 %	0 %	20 %	532419083
44	NC_022117	TGAGT	2	10	55355	55364	20 %	40 %	40 %	0 %	532419083
45	NC_022117	GTTGT	2	10	56402	56411	0 %	60 %	40 %	0 %	532419868
46	NC_022117	GAGCA	2	10	59850	59859	40 %	0 %	40 %	20 %	532419084
47	NC_022117	TGTGA	2	10	62299	62308	20 %	40 %	40 %	0 %	532419086
48	NC_022117	AGTGA	2	10	63820	63829	40 %	20 %	40 %	0 %	532419087
49	NC_022117	CCTTC	2	10	64094	64103	0 %	40 %	0 %	60 %	532419087
50	NC_022117	AGGAG	2	10	66322	66331	40 %	0 %	60 %	0 %	532419089
51	NC_022117	GTTAA	2	10	66452	66461	40 %	40 %	20 %	0 %	532419089
52	NC_022117	GGAGC	2	10	69700	69709	20 %	0 %	60 %	20 %	532419092
53	NC_022117	GCGAT	2	10	69890	69899	20 %	20 %	40 %	20 %	532419092
54	NC_022117	CTCTT	2	10	70244	70253	0 %	60 %	0 %	40 %	532419092
55	NC_022117	AGGGG	2	10	70890	70899	20 %	0 %	80 %	0 %	532419092
56	NC_022117	AAGAA	2	10	70932	70941	80 %	0 %	20 %	0 %	532419092
57	NC_022117	CTTGC	2	10	72021	72030	0 %	40 %	20 %	40 %	532419871
58	NC_022117	ATTGG	2	10	72222	72231	20 %	40 %	40 %	0 %	532419094
59	NC_022117	GAAAA	2	10	73294	73303	80 %	0 %	20 %	0 %	532419094
60	NC_022117	TGGGA	2	10	73711	73720	20 %	20 %	60 %	0 %	532419095
61	NC_022117	TATTT	2	10	76238	76247	20 %	80 %	0 %	0 %	532419096
62	NC_022117	TGTCT	2	10	80032	80041	0 %	60 %	20 %	20 %	532419099
63	NC_022117	TTACT	2	10	80539	80548	20 %	60 %	0 %	20 %	532419099
64	NC_022117	AGAAA	2	10	81929	81938	80 %	0 %	20 %	0 %	532419101
65	NC_022117	GGAAG	2	10	82442	82451	40 %	0 %	60 %	0 %	532419101
66	NC_022117	AGCGA	2	10	84908	84917	40 %	0 %	40 %	20 %	532419103
67	NC_022117	GATCC	2	10	85993	86002	20 %	20 %	20 %	40 %	532419104
68	NC_022117	AGAGC	2	10	87328	87337	40 %	0 %	40 %	20 %	532419873
69	NC_022117	TTTTC	2	10	91060	91069	0 %	80 %	0 %	20 %	532419107
70	NC_022117	GGATG	2	10	91320	91329	20 %	20 %	60 %	0 %	532419108
71	NC_022117	CAACA	2	10	92859	92868	60 %	0 %	0 %	40 %	532419109
72	NC_022117	ACAGC	2	10	93903	93912	40 %	0 %	20 %	40 %	532419111
73	NC_022117	GGAAC	2	10	94616	94625	40 %	0 %	40 %	20 %	532419112
74	NC_022117	GGATT	2	10	95516	95525	20 %	40 %	40 %	0 %	532419112
75	NC_022117	TTTGC	2	10	96752	96761	0 %	60 %	20 %	20 %	532419114
76	NC_022117	ATTCA	2	10	97016	97025	40 %	40 %	0 %	20 %	532419114
77	NC_022117	GATCC	2	10	97275	97284	20 %	20 %	20 %	40 %	532419114
78	NC_022117	GTTTT	2	10	97696	97705	0 %	80 %	20 %	0 %	532419114
79	NC_022117	AAGCT	2	10	98897	98906	40 %	20 %	20 %	20 %	532419115
80	NC_022117	AGGGG	2	10	99256	99265	20 %	0 %	80 %	0 %	532419115
81	NC_022117	ATAGC	2	10	99955	99964	40 %	20 %	20 %	20 %	532419116
82	NC_022117	AGCGA	2	10	102882	102891	40 %	0 %	40 %	20 %	532419118
83	NC_022117	TTTCT	2	10	103240	103249	0 %	80 %	0 %	20 %	532419118
84	NC_022117	ATCAT	2	10	104446	104455	40 %	40 %	0 %	20 %	532419119
85	NC_022117	GGCAT	2	10	105154	105163	20 %	20 %	40 %	20 %	532419119
86	NC_022117	AAAGC	2	10	108880	108889	60 %	0 %	20 %	20 %	532419122
87	NC_022117	GCATT	2	10	110040	110049	20 %	40 %	20 %	20 %	532419123
88	NC_022117	TGTTT	2	10	114726	114735	0 %	80 %	20 %	0 %	532419125
89	NC_022117	CATGT	2	10	115104	115113	20 %	40 %	20 %	20 %	532419125
90	NC_022117	TATCG	2	10	115808	115817	20 %	40 %	20 %	20 %	532419125
91	NC_022117	TTTCT	2	10	116324	116333	0 %	80 %	0 %	20 %	532419126
92	NC_022117	AAAGA	2	10	118569	118578	80 %	0 %	20 %	0 %	532419128
93	NC_022117	TACAA	2	10	126304	126313	60 %	20 %	0 %	20 %	532419133
94	NC_022117	ATCCA	2	10	128712	128721	40 %	20 %	0 %	40 %	532419136
95	NC_022117	GAAGA	2	10	130262	130271	60 %	0 %	40 %	0 %	532419136
96	NC_022117	AAAAG	2	10	132175	132184	80 %	0 %	20 %	0 %	532419137
97	NC_022117	GATTC	2	10	132506	132515	20 %	40 %	20 %	20 %	532419137
98	NC_022117	ATTGG	2	10	135791	135800	20 %	40 %	40 %	0 %	532419140
99	NC_022117	TGTTT	2	10	136250	136259	0 %	80 %	20 %	0 %	532419141
100	NC_022117	TCCAG	2	10	139996	140005	20 %	20 %	20 %	40 %	532419146
101	NC_022117	GTACA	2	10	140727	140736	40 %	20 %	20 %	20 %	532419147
102	NC_022117	TAGAT	2	10	141100	141109	40 %	40 %	20 %	0 %	532419147
103	NC_022117	AAAAG	2	10	141512	141521	80 %	0 %	20 %	0 %	532419881
104	NC_022117	AAAAC	2	10	141992	142001	80 %	0 %	0 %	20 %	532419148
105	NC_022117	TGCTA	2	10	143078	143087	20 %	40 %	20 %	20 %	532419150
106	NC_022117	GGAGC	2	10	143125	143134	20 %	0 %	60 %	20 %	532419150
107	NC_022117	CTGGG	2	10	144539	144548	0 %	20 %	60 %	20 %	532419152
108	NC_022117	GTTTT	2	10	145286	145295	0 %	80 %	20 %	0 %	532419153
109	NC_022117	GAACC	2	10	149020	149029	40 %	0 %	20 %	40 %	532419154
110	NC_022117	ATTCT	2	10	152516	152525	20 %	60 %	0 %	20 %	532419158
111	NC_022117	CTGTG	2	10	152720	152729	0 %	40 %	40 %	20 %	532419158
112	NC_022117	TTCTT	2	10	155193	155202	0 %	80 %	0 %	20 %	532419161
113	NC_022117	AGGAA	2	10	159751	159760	60 %	0 %	40 %	0 %	532419165
114	NC_022117	AGAGA	2	10	162982	162991	60 %	0 %	40 %	0 %	532419168
115	NC_022117	AGCAA	2	10	163417	163426	60 %	0 %	20 %	20 %	532419168
116	NC_022117	CAAAA	2	10	166920	166929	80 %	0 %	0 %	20 %	532419170
117	NC_022117	AAGAG	2	10	167753	167762	60 %	0 %	40 %	0 %	532419170
118	NC_022117	GATTG	2	10	168098	168107	20 %	40 %	40 %	0 %	532419170
119	NC_022117	GTTTT	2	10	174580	174589	0 %	80 %	20 %	0 %	532419174
120	NC_022117	TATTG	2	10	174603	174612	20 %	60 %	20 %	0 %	532419174
121	NC_022117	CAGCA	2	10	174962	174971	40 %	0 %	20 %	40 %	532419174
122	NC_022117	TAGGA	2	10	175267	175276	40 %	20 %	40 %	0 %	532419175
123	NC_022117	TGATT	2	10	177194	177203	20 %	60 %	20 %	0 %	532419176
124	NC_022117	TCAAT	2	10	177835	177844	40 %	40 %	0 %	20 %	532419176
125	NC_022117	TTTTC	2	10	177874	177883	0 %	80 %	0 %	20 %	532419176
126	NC_022117	GGAAT	2	10	179439	179448	40 %	20 %	40 %	0 %	532419882
127	NC_022117	TTGAG	2	10	182485	182494	20 %	40 %	40 %	0 %	532419883
128	NC_022117	GAATG	2	10	182510	182519	40 %	20 %	40 %	0 %	532419883
129	NC_022117	AGAGA	2	10	184555	184564	60 %	0 %	40 %	0 %	532419177
130	NC_022117	ACGAT	2	10	186619	186628	40 %	20 %	20 %	20 %	532419179
131	NC_022117	GGATC	2	10	189715	189724	20 %	20 %	40 %	20 %	532419886
132	NC_022117	CAGAT	2	10	189830	189839	40 %	20 %	20 %	20 %	532419886
133	NC_022117	ACGAT	2	10	190749	190758	40 %	20 %	20 %	20 %	532419887
134	NC_022117	TTGTA	2	10	191729	191738	20 %	60 %	20 %	0 %	532419888
135	NC_022117	TATGC	2	10	192134	192143	20 %	40 %	20 %	20 %	532419889
136	NC_022117	CAAAG	2	10	192173	192182	60 %	0 %	20 %	20 %	532419889
137	NC_022117	AAGAA	2	10	192305	192314	80 %	0 %	20 %	0 %	532419890
138	NC_022117	AAAAG	2	10	192431	192440	80 %	0 %	20 %	0 %	532419180
139	NC_022117	TATCA	2	10	192504	192513	40 %	40 %	0 %	20 %	532419180
140	NC_022117	GATCT	2	10	192650	192659	20 %	40 %	20 %	20 %	532419180
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142	NC_022117	AGAAA	2	10	196604	196613	80 %	0 %	20 %	0 %	532419183
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150	NC_022117	CTTGT	2	10	214566	214575	0 %	60 %	20 %	20 %	532419199
151	NC_022117	TTTCT	2	10	215415	215424	0 %	80 %	0 %	20 %	532419199
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248	NC_022117	TACAC	2	10	376215	376224	40 %	20 %	0 %	40 %	532419341
249	NC_022117	CCAAT	2	10	379845	379854	40 %	20 %	0 %	40 %	532419341
250	NC_022117	ACAGC	2	10	382134	382143	40 %	0 %	20 %	40 %	532419342
251	NC_022117	AAATC	2	10	382578	382587	60 %	20 %	0 %	20 %	532419342
252	NC_022117	TATTC	2	10	386971	386980	20 %	60 %	0 %	20 %	532419347
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257	NC_022117	TTGTT	2	10	395027	395036	0 %	80 %	20 %	0 %	532419353
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261	NC_022117	CAAGT	2	10	398319	398328	40 %	20 %	20 %	20 %	532419356
262	NC_022117	GTCAA	2	10	398607	398616	40 %	20 %	20 %	20 %	532419356
263	NC_022117	AAAGT	2	10	400741	400750	60 %	20 %	20 %	0 %	532419358
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393	NC_022117	ATCCA	2	10	601760	601769	40 %	20 %	0 %	40 %	532419535
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