MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 12729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022117	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419035
2	NC_022117	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419035
3	NC_022117	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419035
4	NC_022117	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419035
5	NC_022117	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419035
6	NC_022117	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419035
7	NC_022117	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419035
8	NC_022117	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419035
9	NC_022117	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419035
10	NC_022117	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419035
11	NC_022117	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419036
12	NC_022117	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419036
13	NC_022117	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419036
14	NC_022117	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419036
15	NC_022117	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419036
16	NC_022117	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419036
17	NC_022117	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419036
18	NC_022117	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419037
19	NC_022117	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419037
20	NC_022117	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419037
21	NC_022117	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419037
22	NC_022117	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419037
23	NC_022117	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419037
24	NC_022117	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419037
25	NC_022117	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419037
26	NC_022117	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419037
27	NC_022117	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419037
28	NC_022117	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419037
29	NC_022117	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419037
30	NC_022117	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419037
31	NC_022117	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419037
32	NC_022117	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419037
33	NC_022117	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419037
34	NC_022117	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419037
35	NC_022117	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419037
36	NC_022117	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419037
37	NC_022117	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419037
38	NC_022117	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419037
39	NC_022117	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419037
40	NC_022117	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419038
41	NC_022117	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419038
42	NC_022117	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419038
43	NC_022117	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419038
44	NC_022117	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419038
45	NC_022117	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419038
46	NC_022117	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419038
47	NC_022117	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419038
48	NC_022117	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419038
49	NC_022117	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419038
50	NC_022117	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419038
51	NC_022117	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419038
52	NC_022117	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419038
53	NC_022117	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419038
54	NC_022117	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419038
55	NC_022117	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419038
56	NC_022117	ATT	2	6	5148	5153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419039
57	NC_022117	TCT	2	6	5166	5171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419039
58	NC_022117	GCT	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419039
59	NC_022117	GAT	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419039
60	NC_022117	ACG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419039
61	NC_022117	GAA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419039
62	NC_022117	AGA	3	9	5386	5394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419039
63	NC_022117	GCT	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419039
64	NC_022117	AGA	2	6	5404	5409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419039
65	NC_022117	TGG	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419039
66	NC_022117	AGA	3	9	5458	5466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419039
67	NC_022117	GGA	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419039
68	NC_022117	TCA	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419039
69	NC_022117	GGA	2	6	5689	5694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419039
70	NC_022117	CTT	2	6	5749	5754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419039
71	NC_022117	CTG	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419039
72	NC_022117	CAG	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419039
73	NC_022117	GCA	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419039
74	NC_022117	AGG	2	6	6439	6444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419040
75	NC_022117	GAA	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419040
76	NC_022117	GCA	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419040
77	NC_022117	AAG	2	6	6788	6793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419040
78	NC_022117	TGC	2	6	6821	6826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419040
79	NC_022117	TTA	2	6	7153	7158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419866
80	NC_022117	GAA	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419866
81	NC_022117	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419041
82	NC_022117	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419041
83	NC_022117	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419041
84	NC_022117	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419041
85	NC_022117	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419041
86	NC_022117	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419042
87	NC_022117	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419042
88	NC_022117	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419042
89	NC_022117	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419042
90	NC_022117	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419042
91	NC_022117	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419042
92	NC_022117	GAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419042
93	NC_022117	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419042
94	NC_022117	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419042
95	NC_022117	GAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419042
96	NC_022117	TAC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419042
97	NC_022117	GTT	2	6	9059	9064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419042
98	NC_022117	AAG	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419042
99	NC_022117	GAG	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419042
100	NC_022117	TTA	2	6	9399	9404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419043
101	NC_022117	AGA	2	6	9434	9439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419043
102	NC_022117	TGC	2	6	9664	9669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419043
103	NC_022117	GAA	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419043
104	NC_022117	TCG	2	6	9751	9756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419043
105	NC_022117	TGG	2	6	9774	9779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419043
106	NC_022117	GTA	2	6	9825	9830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419044
107	NC_022117	AGC	2	6	9985	9990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419044
108	NC_022117	CTT	2	6	9999	10004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419044
109	NC_022117	ATG	2	6	10160	10165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419044
110	NC_022117	CGT	2	6	10187	10192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419044
111	NC_022117	GAC	2	6	10357	10362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419044
112	NC_022117	GGT	2	6	10444	10449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419044
113	NC_022117	GAA	2	6	10490	10495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419044
114	NC_022117	CAA	2	6	10512	10517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419044
115	NC_022117	GGA	2	6	10574	10579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419044
116	NC_022117	CGA	2	6	10631	10636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419044
117	NC_022117	CTT	2	6	10737	10742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419044
118	NC_022117	TTG	2	6	10777	10782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419044
119	NC_022117	CTT	2	6	10791	10796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419044
120	NC_022117	ATC	2	6	10901	10906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419044
121	NC_022117	TGT	2	6	10907	10912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419044
122	NC_022117	AGA	2	6	11013	11018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419044
123	NC_022117	AGG	2	6	11052	11057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419044
124	NC_022117	GAT	2	6	11112	11117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419044
125	NC_022117	CGA	2	6	11118	11123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419044
126	NC_022117	AAT	2	6	11331	11336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419045
127	NC_022117	AGG	2	6	11574	11579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419045
128	NC_022117	ATA	3	9	11584	11592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419045
129	NC_022117	TAT	2	6	11603	11608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419045
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254	NC_022117	GAG	2	6	23733	23738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419053
255	NC_022117	TTC	2	6	23796	23801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419053
256	NC_022117	GAA	2	6	24055	24060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419053
257	NC_022117	GTT	2	6	24149	24154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419053
258	NC_022117	CTT	2	6	24243	24248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419053
259	NC_022117	TAA	2	6	24316	24321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419053
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261	NC_022117	AAG	2	6	24477	24482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419053
262	NC_022117	AGA	2	6	24750	24755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419054
263	NC_022117	TAA	2	6	24882	24887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419054
264	NC_022117	GGA	3	9	24914	24922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419054
265	NC_022117	GAT	2	6	24959	24964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419054
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273	NC_022117	TGT	2	6	26101	26106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419054
274	NC_022117	GCA	2	6	26213	26218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419054
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283	NC_022117	TTC	2	6	27127	27132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419055
284	NC_022117	CTA	2	6	27146	27151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419055
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