MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 20375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022117	GAA	2	6	158339	158344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419164
3002	NC_022117	GTT	2	6	158356	158361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419164
3003	NC_022117	TTA	2	6	158527	158532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419164
3004	NC_022117	CG	3	6	158559	158564	0 %	0 %	50 %	50 %	532419164
3005	NC_022117	AGA	2	6	158585	158590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419164
3006	NC_022117	CAT	2	6	158594	158599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419164
3007	NC_022117	TTC	2	6	158689	158694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419164
3008	NC_022117	AGA	3	9	158699	158707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419164
3009	NC_022117	ATT	2	6	159155	159160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419165
3010	NC_022117	CAT	2	6	159307	159312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419165
3011	NC_022117	TCAA	2	8	159368	159375	50 %	25 %	0 %	25 %	532419165
3012	NC_022117	TGA	2	6	159565	159570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419165
3013	NC_022117	GAA	2	6	159593	159598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419165
3014	NC_022117	TC	3	6	159628	159633	0 %	50 %	0 %	50 %	532419165
3015	NC_022117	GT	3	6	159666	159671	0 %	50 %	50 %	0 %	532419165
3016	NC_022117	AAT	2	6	159710	159715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419165
3017	NC_022117	GGA	2	6	159722	159727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419165
3018	NC_022117	AGGAA	2	10	159751	159760	60 %	0 %	40 %	0 %	532419165
3019	NC_022117	TAG	2	6	159781	159786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419165
3020	NC_022117	AGG	2	6	159787	159792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419165
3021	NC_022117	CTG	2	6	159807	159812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419165
3022	NC_022117	AG	3	6	159838	159843	50 %	0 %	50 %	0 %	532419165
3023	NC_022117	TCT	2	6	159866	159871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419165
3024	NC_022117	AGG	2	6	159985	159990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419165
3025	NC_022117	GAA	2	6	159998	160003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419165
3026	NC_022117	AGA	2	6	160046	160051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419166
3027	NC_022117	ATAC	2	8	160170	160177	50 %	25 %	0 %	25 %	532419166
3028	NC_022117	AGG	2	6	160196	160201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419166
3029	NC_022117	AGG	2	6	160211	160216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419166
3030	NC_022117	CT	3	6	160309	160314	0 %	50 %	0 %	50 %	532419166
3031	NC_022117	GA	3	6	160319	160324	50 %	0 %	50 %	0 %	532419166
3032	NC_022117	ATT	2	6	160339	160344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419166
3033	NC_022117	ATA	2	6	160435	160440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419166
3034	NC_022117	AC	3	6	160459	160464	50 %	0 %	0 %	50 %	532419166
3035	NC_022117	A	8	8	160504	160511	100 %	0 %	0 %	0 %	532419166
3036	NC_022117	ATG	2	6	160585	160590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419166
3037	NC_022117	TCT	2	6	160600	160605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419166
3038	NC_022117	TTC	2	6	160814	160819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419166
3039	NC_022117	AGG	2	6	160825	160830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419166
3040	NC_022117	ACA	2	6	160841	160846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419166
3041	NC_022117	ATA	3	9	160851	160859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419167
3042	NC_022117	TTTC	2	8	160869	160876	0 %	75 %	0 %	25 %	532419167
3043	NC_022117	AACAGC	2	12	160954	160965	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532419167
3044	NC_022117	AGT	2	6	160997	161002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419167
3045	NC_022117	TGG	2	6	161083	161088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419167
3046	NC_022117	TC	3	6	161410	161415	0 %	50 %	0 %	50 %	532419167
3047	NC_022117	A	6	6	161428	161433	100 %	0 %	0 %	0 %	532419167
3048	NC_022117	CTG	2	6	161496	161501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419167
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3051	NC_022117	GCA	2	6	161582	161587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419167
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3053	NC_022117	ATTG	2	8	161620	161627	25 %	50 %	25 %	0 %	532419167
3054	NC_022117	TCT	2	6	161651	161656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419167
3055	NC_022117	CT	4	8	161655	161662	0 %	50 %	0 %	50 %	532419167
3056	NC_022117	TGT	2	6	161683	161688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419167
3057	NC_022117	TGG	2	6	162098	162103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419168
3058	NC_022117	TGT	2	6	162141	162146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419168
3059	NC_022117	GAA	2	6	162151	162156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419168
3060	NC_022117	GGAA	2	8	162193	162200	50 %	0 %	50 %	0 %	532419168
3061	NC_022117	GAA	3	9	162208	162216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419168
3062	NC_022117	TTTC	2	8	162311	162318	0 %	75 %	0 %	25 %	532419168
3063	NC_022117	ATCT	2	8	162337	162344	25 %	50 %	0 %	25 %	532419168
3064	NC_022117	CTT	2	6	162362	162367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419168
3065	NC_022117	GA	3	6	162416	162421	50 %	0 %	50 %	0 %	532419168
3066	NC_022117	TTG	2	6	162442	162447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419168
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3068	NC_022117	TTA	2	6	162519	162524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419168
3069	NC_022117	TAG	2	6	162530	162535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419168
3070	NC_022117	GTT	2	6	162617	162622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419168
3071	NC_022117	ACA	3	9	162624	162632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419168
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3073	NC_022117	TG	3	6	162803	162808	0 %	50 %	50 %	0 %	532419168
3074	NC_022117	AGC	2	6	162821	162826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419168
3075	NC_022117	TAG	2	6	162839	162844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419168
3076	NC_022117	TCGA	2	8	162853	162860	25 %	25 %	25 %	25 %	532419168
3077	NC_022117	AGAGA	2	10	162982	162991	60 %	0 %	40 %	0 %	532419168
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3079	NC_022117	GAGG	2	8	163030	163037	25 %	0 %	75 %	0 %	532419168
3080	NC_022117	TC	3	6	163043	163048	0 %	50 %	0 %	50 %	532419168
3081	NC_022117	TGT	2	6	163275	163280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419168
3082	NC_022117	CTT	3	9	163301	163309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419168
3083	NC_022117	TTG	2	6	163314	163319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419168
3084	NC_022117	AGC	2	6	163359	163364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419168
3085	NC_022117	AGG	2	6	163368	163373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419168
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3087	NC_022117	AGCAA	2	10	163417	163426	60 %	0 %	20 %	20 %	532419168
3088	NC_022117	TAC	2	6	163443	163448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419168
3089	NC_022117	TGGC	2	8	163493	163500	0 %	25 %	50 %	25 %	532419168
3090	NC_022117	CCT	2	6	163582	163587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419168
3091	NC_022117	GT	3	6	163601	163606	0 %	50 %	50 %	0 %	532419168
3092	NC_022117	GAG	2	6	163610	163615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419168
3093	NC_022117	GAT	2	6	163636	163641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419168
3094	NC_022117	AAT	2	6	163666	163671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419168
3095	NC_022117	GAT	2	6	163754	163759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419169
3096	NC_022117	TAT	2	6	163802	163807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419169
3097	NC_022117	TCAA	2	8	163812	163819	50 %	25 %	0 %	25 %	532419169
3098	NC_022117	CGA	2	6	163821	163826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419169
3099	NC_022117	ATG	2	6	163842	163847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419169
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3101	NC_022117	T	7	7	164018	164024	0 %	100 %	0 %	0 %	532419169
3102	NC_022117	ATT	2	6	164038	164043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419169
3103	NC_022117	GAG	2	6	164241	164246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419169
3104	NC_022117	TTTC	2	8	164252	164259	0 %	75 %	0 %	25 %	532419169
3105	NC_022117	GGA	2	6	164339	164344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419169
3106	NC_022117	TCT	2	6	164360	164365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419169
3107	NC_022117	GCT	2	6	164372	164377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419169
3108	NC_022117	A	8	8	164421	164428	100 %	0 %	0 %	0 %	532419169
3109	NC_022117	GGT	2	6	164515	164520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419169
3110	NC_022117	GA	3	6	164532	164537	50 %	0 %	50 %	0 %	532419169
3111	NC_022117	GC	3	6	164548	164553	0 %	0 %	50 %	50 %	532419169
3112	NC_022117	GTC	2	6	164579	164584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419169
3113	NC_022117	GGA	2	6	164692	164697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419169
3114	NC_022117	T	7	7	164757	164763	0 %	100 %	0 %	0 %	532419169
3115	NC_022117	A	8	8	164814	164821	100 %	0 %	0 %	0 %	532419169
3116	NC_022117	AGG	2	6	164857	164862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419169
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3118	NC_022117	AG	3	6	164911	164916	50 %	0 %	50 %	0 %	532419169
3119	NC_022117	TGT	2	6	164962	164967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419169
3120	NC_022117	G	6	6	165011	165016	0 %	0 %	100 %	0 %	532419169
3121	NC_022117	GA	3	6	165075	165080	50 %	0 %	50 %	0 %	532419169
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3123	NC_022117	AT	3	6	165129	165134	50 %	50 %	0 %	0 %	532419169
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3492	NC_022117	TTTA	2	8	186637	186644	25 %	75 %	0 %	0 %	532419179
3493	NC_022117	AAG	2	6	186648	186653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419179
3494	NC_022117	AGA	2	6	186733	186738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419179
3495	NC_022117	CTT	2	6	186770	186775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419179
3496	NC_022117	A	6	6	186788	186793	100 %	0 %	0 %	0 %	532419179
3497	NC_022117	AGG	2	6	186816	186821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419179
3498	NC_022117	GCTT	2	8	186844	186851	0 %	50 %	25 %	25 %	532419179
3499	NC_022117	T	7	7	186850	186856	0 %	100 %	0 %	0 %	532419179
3500	NC_022117	A	6	6	186891	186896	100 %	0 %	0 %	0 %	532419179

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