MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 20375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_022117	CAGAAT	2	12	996376	996387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532419838
19503	NC_022117	GGA	2	6	996402	996407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419839
19504	NC_022117	T	6	6	996465	996470	0 %	100 %	0 %	0 %	532419839
19505	NC_022117	GAA	2	6	996526	996531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419839
19506	NC_022117	AAT	2	6	996637	996642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419839
19507	NC_022117	CTG	2	6	996744	996749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419839
19508	NC_022117	TGA	2	6	996788	996793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419839
19509	NC_022117	AG	4	8	996805	996812	50 %	0 %	50 %	0 %	532419839
19510	NC_022117	A	7	7	996841	996847	100 %	0 %	0 %	0 %	532419839
19511	NC_022117	GGAGC	2	10	996872	996881	20 %	0 %	60 %	20 %	532419839
19512	NC_022117	AAG	2	6	996882	996887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419839
19513	NC_022117	TACTAG	2	12	996889	996900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532419839
19514	NC_022117	GTTT	2	8	996938	996945	0 %	75 %	25 %	0 %	532419839
19515	NC_022117	TGA	2	6	997000	997005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419839
19516	NC_022117	TAT	2	6	997013	997018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419839
19517	NC_022117	CCTT	2	8	997043	997050	0 %	50 %	0 %	50 %	532419839
19518	NC_022117	GTT	2	6	997244	997249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419840
19519	NC_022117	TCG	2	6	997345	997350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419840
19520	NC_022117	T	8	8	997360	997367	0 %	100 %	0 %	0 %	532419840
19521	NC_022117	TGT	2	6	997423	997428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419840
19522	NC_022117	ATA	2	6	997456	997461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419840
19523	NC_022117	TAGAG	2	10	997563	997572	40 %	20 %	40 %	0 %	532419840
19524	NC_022117	T	7	7	997588	997594	0 %	100 %	0 %	0 %	532419840
19525	NC_022117	GAT	2	6	997608	997613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419840
19526	NC_022117	ACT	2	6	997617	997622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419840
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19528	NC_022117	ATT	3	9	997722	997730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419841
19529	NC_022117	T	6	6	997873	997878	0 %	100 %	0 %	0 %	532419841
19530	NC_022117	CTT	2	6	997904	997909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419841
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19533	NC_022117	GTA	2	6	998004	998009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419841
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19536	NC_022117	GCAT	2	8	998122	998129	25 %	25 %	25 %	25 %	532419841
19537	NC_022117	TTTA	2	8	998187	998194	25 %	75 %	0 %	0 %	532419841
19538	NC_022117	TGC	2	6	998260	998265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419842
19539	NC_022117	TAATGT	2	12	998267	998278	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532419842
19540	NC_022117	GA	3	6	998291	998296	50 %	0 %	50 %	0 %	532419842
19541	NC_022117	TCT	2	6	998398	998403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419842
19542	NC_022117	ATTTG	2	10	998429	998438	20 %	60 %	20 %	0 %	532419842
19543	NC_022117	GCT	2	6	998486	998491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419842
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19546	NC_022117	GAG	2	6	998608	998613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419842
19547	NC_022117	TG	3	6	998620	998625	0 %	50 %	50 %	0 %	532419842
19548	NC_022117	A	6	6	998660	998665	100 %	0 %	0 %	0 %	532419842
19549	NC_022117	T	7	7	998666	998672	0 %	100 %	0 %	0 %	532419842
19550	NC_022117	T	7	7	998675	998681	0 %	100 %	0 %	0 %	532419842
19551	NC_022117	T	6	6	998683	998688	0 %	100 %	0 %	0 %	532419842
19552	NC_022117	TC	3	6	998704	998709	0 %	50 %	0 %	50 %	532419842
19553	NC_022117	TAA	2	6	998712	998717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419842
19554	NC_022117	ATA	2	6	998720	998725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419842
19555	NC_022117	AATG	2	8	999074	999081	50 %	25 %	25 %	0 %	532419843
19556	NC_022117	CTT	2	6	999142	999147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419843
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19559	NC_022117	GGAAA	2	10	999202	999211	60 %	0 %	40 %	0 %	532419843
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19561	NC_022117	TTG	2	6	999285	999290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419844
19562	NC_022117	GT	3	6	999302	999307	0 %	50 %	50 %	0 %	532419844
19563	NC_022117	TAG	2	6	999331	999336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419844
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19565	NC_022117	CT	3	6	999402	999407	0 %	50 %	0 %	50 %	532419844
19566	NC_022117	GGCT	2	8	999430	999437	0 %	25 %	50 %	25 %	532419844
19567	NC_022117	T	6	6	999463	999468	0 %	100 %	0 %	0 %	532419844
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19572	NC_022117	GAAAA	2	10	999631	999640	80 %	0 %	20 %	0 %	532419844
19573	NC_022117	CTT	2	6	999645	999650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419844
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19578	NC_022117	TTC	2	6	1000118	1000123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419844
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19584	NC_022117	AGA	3	9	1000343	1000351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419844
19585	NC_022117	AGA	2	6	1000364	1000369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419844
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19588	NC_022117	CAA	2	6	1000608	1000613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419845
19589	NC_022117	CAA	2	6	1000620	1000625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419845
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19592	NC_022117	CTTTT	2	10	1000743	1000752	0 %	80 %	0 %	20 %	532419845
19593	NC_022117	ATC	2	6	1000772	1000777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419845
19594	NC_022117	CAT	2	6	1000860	1000865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419845
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19602	NC_022117	CAAG	2	8	1001462	1001469	50 %	0 %	25 %	25 %	532419846
19603	NC_022117	TCC	2	6	1001510	1001515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419846
19604	NC_022117	GAA	2	6	1001575	1001580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419846
19605	NC_022117	GAAG	2	8	1001621	1001628	50 %	0 %	50 %	0 %	532419846
19606	NC_022117	TCA	2	6	1001634	1001639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419846
19607	NC_022117	CCT	2	6	1001669	1001674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419846
19608	NC_022117	TAG	2	6	1001740	1001745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419846
19609	NC_022117	ATG	2	6	1001780	1001785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419846
19610	NC_022117	T	6	6	1001794	1001799	0 %	100 %	0 %	0 %	532419846
19611	NC_022117	GAAA	2	8	1001800	1001807	75 %	0 %	25 %	0 %	532419846
19612	NC_022117	T	6	6	1001810	1001815	0 %	100 %	0 %	0 %	532419846
19613	NC_022117	AAT	2	6	1001816	1001821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419846
19614	NC_022117	AG	3	6	1001837	1001842	50 %	0 %	50 %	0 %	532419846
19615	NC_022117	A	6	6	1001865	1001870	100 %	0 %	0 %	0 %	532419846
19616	NC_022117	TGT	2	6	1001931	1001936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419846
19617	NC_022117	GAT	2	6	1002002	1002007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419847
19618	NC_022117	AGCC	2	8	1002016	1002023	25 %	0 %	25 %	50 %	532419847
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19620	NC_022117	TCA	3	9	1002058	1002066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419847
19621	NC_022117	TGC	2	6	1002111	1002116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419847
19622	NC_022117	GAA	2	6	1002241	1002246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419847
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