MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 20375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022117	TCC	2	6	79173	79178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419098
1502	NC_022117	GCT	2	6	79205	79210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419098
1503	NC_022117	TCT	2	6	79216	79221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419098
1504	NC_022117	T	7	7	79912	79918	0 %	100 %	0 %	0 %	532419099
1505	NC_022117	TGA	2	6	80017	80022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419099
1506	NC_022117	TGTCT	2	10	80032	80041	0 %	60 %	20 %	20 %	532419099
1507	NC_022117	TGAT	2	8	80106	80113	25 %	50 %	25 %	0 %	532419099
1508	NC_022117	TCAT	2	8	80128	80135	25 %	50 %	0 %	25 %	532419099
1509	NC_022117	T	6	6	80184	80189	0 %	100 %	0 %	0 %	532419099
1510	NC_022117	TCT	2	6	80296	80301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419099
1511	NC_022117	GAA	2	6	80306	80311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419099
1512	NC_022117	TGC	2	6	80356	80361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419099
1513	NC_022117	CAA	2	6	80390	80395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419099
1514	NC_022117	GAA	2	6	80408	80413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419099
1515	NC_022117	GGA	2	6	80452	80457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419099
1516	NC_022117	TC	4	8	80480	80487	0 %	50 %	0 %	50 %	532419099
1517	NC_022117	A	7	7	80499	80505	100 %	0 %	0 %	0 %	532419099
1518	NC_022117	TTACT	2	10	80539	80548	20 %	60 %	0 %	20 %	532419099
1519	NC_022117	TATC	2	8	80555	80562	25 %	50 %	0 %	25 %	532419099
1520	NC_022117	GA	3	6	80573	80578	50 %	0 %	50 %	0 %	532419099
1521	NC_022117	TAT	2	6	80653	80658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419099
1522	NC_022117	TA	3	6	80793	80798	50 %	50 %	0 %	0 %	532419099
1523	NC_022117	AGA	2	6	80857	80862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419099
1524	NC_022117	GGGA	2	8	80866	80873	25 %	0 %	75 %	0 %	532419099
1525	NC_022117	CTGC	2	8	80970	80977	0 %	25 %	25 %	50 %	532419100
1526	NC_022117	GCT	2	6	80988	80993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419100
1527	NC_022117	ATT	2	6	80994	80999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419100
1528	NC_022117	CTT	2	6	81037	81042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419100
1529	NC_022117	CTT	2	6	81058	81063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419100
1530	NC_022117	CAT	2	6	81105	81110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419100
1531	NC_022117	TGA	2	6	81227	81232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419100
1532	NC_022117	AGG	2	6	81238	81243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419100
1533	NC_022117	GGTT	2	8	81263	81270	0 %	50 %	50 %	0 %	532419100
1534	NC_022117	CT	3	6	81303	81308	0 %	50 %	0 %	50 %	532419100
1535	NC_022117	GGA	2	6	81309	81314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419100
1536	NC_022117	CAA	2	6	81315	81320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419100
1537	NC_022117	AG	3	6	81322	81327	50 %	0 %	50 %	0 %	532419100
1538	NC_022117	T	6	6	81329	81334	0 %	100 %	0 %	0 %	532419100
1539	NC_022117	CGAT	2	8	81391	81398	25 %	25 %	25 %	25 %	532419100
1540	NC_022117	TCAT	2	8	81466	81473	25 %	50 %	0 %	25 %	532419100
1541	NC_022117	TTA	2	6	81516	81521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419100
1542	NC_022117	TG	3	6	81533	81538	0 %	50 %	50 %	0 %	532419100
1543	NC_022117	AGA	2	6	81551	81556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419100
1544	NC_022117	AAG	2	6	81568	81573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419100
1545	NC_022117	AC	3	6	81616	81621	50 %	0 %	0 %	50 %	532419100
1546	NC_022117	T	6	6	81701	81706	0 %	100 %	0 %	0 %	532419101
1547	NC_022117	GAC	2	6	81728	81733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419101
1548	NC_022117	GA	3	6	81762	81767	50 %	0 %	50 %	0 %	532419101
1549	NC_022117	TTA	2	6	81774	81779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419101
1550	NC_022117	CTT	2	6	81828	81833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419101
1551	NC_022117	TTA	2	6	81871	81876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419101
1552	NC_022117	T	6	6	81879	81884	0 %	100 %	0 %	0 %	532419101
1553	NC_022117	AGAAA	2	10	81929	81938	80 %	0 %	20 %	0 %	532419101
1554	NC_022117	T	6	6	81984	81989	0 %	100 %	0 %	0 %	532419101
1555	NC_022117	GTTA	2	8	82008	82015	25 %	50 %	25 %	0 %	532419101
1556	NC_022117	ACA	2	6	82042	82047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419101
1557	NC_022117	GCG	2	6	82074	82079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532419101
1558	NC_022117	T	6	6	82117	82122	0 %	100 %	0 %	0 %	532419101
1559	NC_022117	TGG	3	9	82143	82151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419101
1560	NC_022117	CAG	2	6	82219	82224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419101
1561	NC_022117	GTT	2	6	82230	82235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419101
1562	NC_022117	TATT	2	8	82240	82247	25 %	75 %	0 %	0 %	532419101
1563	NC_022117	GTG	2	6	82264	82269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419101
1564	NC_022117	CCT	2	6	82314	82319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419101
1565	NC_022117	GGAAG	2	10	82442	82451	40 %	0 %	60 %	0 %	532419101
1566	NC_022117	ATT	2	6	82461	82466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419101
1567	NC_022117	TTG	2	6	82483	82488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419101
1568	NC_022117	TTC	2	6	82491	82496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419101
1569	NC_022117	T	6	6	82525	82530	0 %	100 %	0 %	0 %	532419101
1570	NC_022117	GAA	2	6	82564	82569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419101
1571	NC_022117	GAA	2	6	82593	82598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419101
1572	NC_022117	GA	3	6	82655	82660	50 %	0 %	50 %	0 %	532419101
1573	NC_022117	GTTC	2	8	82665	82672	0 %	50 %	25 %	25 %	532419101
1574	NC_022117	GCT	2	6	82800	82805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419101
1575	NC_022117	GTGC	2	8	82812	82819	0 %	25 %	50 %	25 %	532419101
1576	NC_022117	TAA	2	6	82862	82867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419101
1577	NC_022117	CAT	2	6	82878	82883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419101
1578	NC_022117	GAA	2	6	82890	82895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419101
1579	NC_022117	GA	3	6	82975	82980	50 %	0 %	50 %	0 %	532419101
1580	NC_022117	TAC	2	6	83026	83031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419102
1581	NC_022117	T	6	6	83050	83055	0 %	100 %	0 %	0 %	532419102
1582	NC_022117	T	7	7	83062	83068	0 %	100 %	0 %	0 %	532419102
1583	NC_022117	T	6	6	83075	83080	0 %	100 %	0 %	0 %	532419102
1584	NC_022117	GTA	2	6	83161	83166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419102
1585	NC_022117	T	6	6	83172	83177	0 %	100 %	0 %	0 %	532419102
1586	NC_022117	TATG	2	8	83196	83203	25 %	50 %	25 %	0 %	532419102
1587	NC_022117	TAT	2	6	83225	83230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419102
1588	NC_022117	GTCTGT	2	12	83239	83250	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532419102
1589	NC_022117	TCA	2	6	83259	83264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419102
1590	NC_022117	TCAT	2	8	83267	83274	25 %	50 %	0 %	25 %	532419102
1591	NC_022117	CAA	2	6	83309	83314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419102
1592	NC_022117	ACTG	2	8	83319	83326	25 %	25 %	25 %	25 %	532419102
1593	NC_022117	CATT	2	8	83334	83341	25 %	50 %	0 %	25 %	532419102
1594	NC_022117	AGA	2	6	83367	83372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419102
1595	NC_022117	AGCA	2	8	83373	83380	50 %	0 %	25 %	25 %	532419102
1596	NC_022117	TC	3	6	83395	83400	0 %	50 %	0 %	50 %	532419102
1597	NC_022117	ATTA	2	8	83526	83533	50 %	50 %	0 %	0 %	532419102
1598	NC_022117	TTTG	2	8	83566	83573	0 %	75 %	25 %	0 %	532419102
1599	NC_022117	TTG	2	6	83663	83668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419102
1600	NC_022117	GAT	2	6	83760	83765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419102
1601	NC_022117	TCTA	2	8	83850	83857	25 %	50 %	0 %	25 %	532419102
1602	NC_022117	CTA	2	6	83878	83883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419102
1603	NC_022117	TAT	2	6	83931	83936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419102
1604	NC_022117	TAAG	2	8	83955	83962	50 %	25 %	25 %	0 %	532419102
1605	NC_022117	AGT	2	6	84044	84049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419103
1606	NC_022117	TAT	2	6	84071	84076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419103
1607	NC_022117	TGC	2	6	84086	84091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419103
1608	NC_022117	AAG	2	6	84106	84111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419103
1609	NC_022117	TC	3	6	84118	84123	0 %	50 %	0 %	50 %	532419103
1610	NC_022117	AG	3	6	84129	84134	50 %	0 %	50 %	0 %	532419103
1611	NC_022117	GAA	2	6	84162	84167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419103
1612	NC_022117	CAG	2	6	84301	84306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419103
1613	NC_022117	TAA	2	6	84347	84352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419103
1614	NC_022117	AG	3	6	84396	84401	50 %	0 %	50 %	0 %	532419103
1615	NC_022117	TTC	2	6	84415	84420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419103
1616	NC_022117	GAAG	2	8	84459	84466	50 %	0 %	50 %	0 %	532419103
1617	NC_022117	A	6	6	84483	84488	100 %	0 %	0 %	0 %	532419103
1618	NC_022117	AGA	2	6	84533	84538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419103
1619	NC_022117	TTC	2	6	84611	84616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419103
1620	NC_022117	TAAA	2	8	84625	84632	75 %	25 %	0 %	0 %	532419103
1621	NC_022117	ATCC	2	8	84696	84703	25 %	25 %	0 %	50 %	532419103
1622	NC_022117	TGG	2	6	84724	84729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419103
1623	NC_022117	TGA	2	6	84757	84762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419103
1624	NC_022117	TCC	2	6	84764	84769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419103
1625	NC_022117	ACA	2	6	84788	84793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419103
1626	NC_022117	TTTC	2	8	84843	84850	0 %	75 %	0 %	25 %	532419103
1627	NC_022117	AGAT	2	8	84884	84891	50 %	25 %	25 %	0 %	532419103
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1629	NC_022117	CTT	2	6	84921	84926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419103
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1990	NC_022117	GAA	2	6	104715	104720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419119
1991	NC_022117	AG	3	6	104863	104868	50 %	0 %	50 %	0 %	532419119
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1993	NC_022117	CTTT	2	8	105061	105068	0 %	75 %	0 %	25 %	532419119
1994	NC_022117	ATCA	2	8	105105	105112	50 %	25 %	0 %	25 %	532419119
1995	NC_022117	GGCAT	2	10	105154	105163	20 %	20 %	40 %	20 %	532419119
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1998	NC_022117	TGA	2	6	105236	105241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419119
1999	NC_022117	ATA	2	6	105250	105255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419119
2000	NC_022117	TCC	2	6	105273	105278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419119

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