MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 20375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022117	TCGAG	2	10	634698	634707	20 %	20 %	40 %	20 %	532419563
12502	NC_022117	T	6	6	634725	634730	0 %	100 %	0 %	0 %	532419563
12503	NC_022117	TTG	2	6	634755	634760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419563
12504	NC_022117	TTA	2	6	634797	634802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419563
12505	NC_022117	CAA	2	6	634874	634879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419563
12506	NC_022117	ATC	2	6	634901	634906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419563
12507	NC_022117	TCA	2	6	634917	634922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419563
12508	NC_022117	CTTT	2	8	634971	634978	0 %	75 %	0 %	25 %	532419563
12509	NC_022117	ATG	3	9	635021	635029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419563
12510	NC_022117	TC	4	8	635046	635053	0 %	50 %	0 %	50 %	532419563
12511	NC_022117	CTA	2	6	635099	635104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419563
12512	NC_022117	TGA	2	6	635112	635117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419563
12513	NC_022117	CAA	2	6	635156	635161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419563
12514	NC_022117	TTTG	2	8	635175	635182	0 %	75 %	25 %	0 %	532419563
12515	NC_022117	TTA	2	6	635203	635208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419564
12516	NC_022117	CTC	2	6	635225	635230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419564
12517	NC_022117	TAT	2	6	635232	635237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419564
12518	NC_022117	TGG	2	6	635261	635266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419564
12519	NC_022117	AGC	2	6	635277	635282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419564
12520	NC_022117	GGCT	2	8	635359	635366	0 %	25 %	50 %	25 %	532419564
12521	NC_022117	TGC	2	6	635388	635393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419564
12522	NC_022117	GGCTC	2	10	635462	635471	0 %	20 %	40 %	40 %	532419564
12523	NC_022117	TA	3	6	635485	635490	50 %	50 %	0 %	0 %	532419564
12524	NC_022117	AGCC	2	8	635498	635505	25 %	0 %	25 %	50 %	532419565
12525	NC_022117	TCTT	2	8	635522	635529	0 %	75 %	0 %	25 %	532419565
12526	NC_022117	ATC	2	6	635563	635568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419565
12527	NC_022117	CT	3	6	635620	635625	0 %	50 %	0 %	50 %	532419565
12528	NC_022117	TGC	2	6	635636	635641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419565
12529	NC_022117	CTT	2	6	635704	635709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419565
12530	NC_022117	ACCA	2	8	635794	635801	50 %	0 %	0 %	50 %	532419565
12531	NC_022117	CT	3	6	635832	635837	0 %	50 %	0 %	50 %	532419565
12532	NC_022117	ATT	2	6	635879	635884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419565
12533	NC_022117	AGG	2	6	635910	635915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419565
12534	NC_022117	ATC	2	6	635956	635961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419565
12535	NC_022117	ATG	2	6	635989	635994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419565
12536	NC_022117	CAG	2	6	636074	636079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419565
12537	NC_022117	ATC	2	6	636115	636120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419565
12538	NC_022117	CTC	2	6	636131	636136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419565
12539	NC_022117	CTAC	2	8	636150	636157	25 %	25 %	0 %	50 %	532419565
12540	NC_022117	TGG	2	6	636205	636210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419565
12541	NC_022117	ATT	2	6	636230	636235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419565
12542	NC_022117	CTA	2	6	636263	636268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419565
12543	NC_022117	TCC	2	6	636285	636290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419565
12544	NC_022117	A	8	8	636307	636314	100 %	0 %	0 %	0 %	532419565
12545	NC_022117	T	6	6	636325	636330	0 %	100 %	0 %	0 %	532419565
12546	NC_022117	GGAG	2	8	636331	636338	25 %	0 %	75 %	0 %	532419565
12547	NC_022117	TTC	2	6	636339	636344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419565
12548	NC_022117	CAA	2	6	636608	636613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419566
12549	NC_022117	CAC	2	6	636668	636673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419566
12550	NC_022117	C	6	6	636714	636719	0 %	0 %	0 %	100 %	532419566
12551	NC_022117	TG	3	6	636732	636737	0 %	50 %	50 %	0 %	532419566
12552	NC_022117	GAG	2	6	636793	636798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419566
12553	NC_022117	CT	3	6	636799	636804	0 %	50 %	0 %	50 %	532419566
12554	NC_022117	T	7	7	636838	636844	0 %	100 %	0 %	0 %	532419566
12555	NC_022117	ATTAA	2	10	636851	636860	60 %	40 %	0 %	0 %	532419566
12556	NC_022117	CAG	2	6	636995	637000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419567
12557	NC_022117	CTT	2	6	637023	637028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419567
12558	NC_022117	AAAG	2	8	637036	637043	75 %	0 %	25 %	0 %	532419567
12559	NC_022117	GCA	2	6	637126	637131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419567
12560	NC_022117	CTG	2	6	637161	637166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419567
12561	NC_022117	CG	3	6	637168	637173	0 %	0 %	50 %	50 %	532419567
12562	NC_022117	GAA	2	6	637241	637246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419567
12563	NC_022117	CAAC	2	8	637359	637366	50 %	0 %	0 %	50 %	532419567
12564	NC_022117	GGA	2	6	637382	637387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419567
12565	NC_022117	AAT	2	6	637431	637436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419567
12566	NC_022117	AGCA	2	8	637449	637456	50 %	0 %	25 %	25 %	532419567
12567	NC_022117	GAA	2	6	637549	637554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419567
12568	NC_022117	ATT	2	6	637611	637616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419567
12569	NC_022117	GGC	2	6	637618	637623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532419567
12570	NC_022117	AAC	2	6	637665	637670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419567
12571	NC_022117	GCTCT	2	10	637703	637712	0 %	40 %	20 %	40 %	532419567
12572	NC_022117	TCGTT	2	10	637731	637740	0 %	60 %	20 %	20 %	532419567
12573	NC_022117	TTG	2	6	637773	637778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419567
12574	NC_022117	CTT	2	6	637793	637798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419567
12575	NC_022117	GCA	2	6	637843	637848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419567
12576	NC_022117	TAG	2	6	637884	637889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419567
12577	NC_022117	AAAAT	2	10	637894	637903	80 %	20 %	0 %	0 %	532419567
12578	NC_022117	TGG	2	6	637949	637954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419567
12579	NC_022117	CCTT	2	8	637966	637973	0 %	50 %	0 %	50 %	532419567
12580	NC_022117	TCCAT	2	10	638032	638041	20 %	40 %	0 %	40 %	532419568
12581	NC_022117	AGAA	2	8	638042	638049	75 %	0 %	25 %	0 %	532419568
12582	NC_022117	CCT	2	6	638083	638088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419568
12583	NC_022117	CT	3	6	638087	638092	0 %	50 %	0 %	50 %	532419568
12584	NC_022117	CTA	2	6	638101	638106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419568
12585	NC_022117	GAAA	2	8	638195	638202	75 %	0 %	25 %	0 %	532419568
12586	NC_022117	A	6	6	638200	638205	100 %	0 %	0 %	0 %	532419568
12587	NC_022117	CTCTTT	2	12	638303	638314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419568
12588	NC_022117	ATATCC	2	12	638320	638331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419568
12589	NC_022117	AGC	2	6	638358	638363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419568
12590	NC_022117	T	6	6	638418	638423	0 %	100 %	0 %	0 %	532419568
12591	NC_022117	TAAACA	2	12	638431	638442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532419568
12592	NC_022117	AGG	2	6	638540	638545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419569
12593	NC_022117	ACAT	2	8	638597	638604	50 %	25 %	0 %	25 %	532419569
12594	NC_022117	CAA	2	6	638607	638612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419569
12595	NC_022117	GA	3	6	638633	638638	50 %	0 %	50 %	0 %	532419569
12596	NC_022117	TCC	2	6	638669	638674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419569
12597	NC_022117	A	7	7	638680	638686	100 %	0 %	0 %	0 %	532419569
12598	NC_022117	ATGC	2	8	638696	638703	25 %	25 %	25 %	25 %	532419569
12599	NC_022117	ACGA	2	8	638736	638743	50 %	0 %	25 %	25 %	532419569
12600	NC_022117	GA	4	8	638795	638802	50 %	0 %	50 %	0 %	532419569
12601	NC_022117	AAG	2	6	638803	638808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419569
12602	NC_022117	CTA	2	6	638814	638819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419569
12603	NC_022117	A	6	6	638822	638827	100 %	0 %	0 %	0 %	532419569
12604	NC_022117	ACA	2	6	638898	638903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419569
12605	NC_022117	ATC	2	6	638906	638911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419569
12606	NC_022117	TCAT	2	8	638919	638926	25 %	50 %	0 %	25 %	532419569
12607	NC_022117	AAG	2	6	638933	638938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419569
12608	NC_022117	TCT	2	6	638940	638945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419570
12609	NC_022117	AAG	2	6	638960	638965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419570
12610	NC_022117	TTTC	2	8	638966	638973	0 %	75 %	0 %	25 %	532419570
12611	NC_022117	CAC	2	6	638982	638987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419570
12612	NC_022117	TCT	2	6	638994	638999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419570
12613	NC_022117	CAT	2	6	639059	639064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419570
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12615	NC_022117	ATA	2	6	639159	639164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419570
12616	NC_022117	CAT	2	6	639185	639190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419570
12617	NC_022117	T	8	8	639217	639224	0 %	100 %	0 %	0 %	532419570
12618	NC_022117	TTC	2	6	639228	639233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419570
12619	NC_022117	CCT	2	6	639242	639247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419570
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12621	NC_022117	ACC	2	6	639415	639420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419571
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12983	NC_022117	AAG	2	6	658343	658348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419585
12984	NC_022117	GAA	2	6	658375	658380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419585
12985	NC_022117	ATC	2	6	658417	658422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419585
12986	NC_022117	GAT	2	6	658431	658436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419585
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