MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 20375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022117	GAT	3	9	28321	28329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419057
502	NC_022117	GAG	2	6	28364	28369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419057
503	NC_022117	TG	3	6	28396	28401	0 %	50 %	50 %	0 %	532419057
504	NC_022117	GCA	2	6	28420	28425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419057
505	NC_022117	TC	3	6	28449	28454	0 %	50 %	0 %	50 %	532419057
506	NC_022117	AGGGT	2	10	28583	28592	20 %	20 %	60 %	0 %	532419057
507	NC_022117	TTC	2	6	28619	28624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419057
508	NC_022117	CAG	2	6	28631	28636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419057
509	NC_022117	GAA	2	6	28645	28650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419057
510	NC_022117	TGA	2	6	28659	28664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419057
511	NC_022117	TTC	2	6	28692	28697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419057
512	NC_022117	GC	4	8	28863	28870	0 %	0 %	50 %	50 %	532419057
513	NC_022117	AAG	2	6	28871	28876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419057
514	NC_022117	TA	3	6	28985	28990	50 %	50 %	0 %	0 %	532419057
515	NC_022117	GAA	2	6	29074	29079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419057
516	NC_022117	TGT	2	6	29106	29111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419058
517	NC_022117	TCT	2	6	29174	29179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419058
518	NC_022117	ACA	2	6	29402	29407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419058
519	NC_022117	ATG	2	6	29412	29417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419058
520	NC_022117	CTTT	2	8	29554	29561	0 %	75 %	0 %	25 %	532419058
521	NC_022117	TTTG	2	8	29569	29576	0 %	75 %	25 %	0 %	532419058
522	NC_022117	TTGT	2	8	29604	29611	0 %	75 %	25 %	0 %	532419058
523	NC_022117	CCTAT	2	10	29623	29632	20 %	40 %	0 %	40 %	532419058
524	NC_022117	T	6	6	29639	29644	0 %	100 %	0 %	0 %	532419058
525	NC_022117	ATC	2	6	29718	29723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419058
526	NC_022117	TGGC	2	8	29767	29774	0 %	25 %	50 %	25 %	532419058
527	NC_022117	T	8	8	29873	29880	0 %	100 %	0 %	0 %	532419058
528	NC_022117	ATG	2	6	29898	29903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419058
529	NC_022117	GA	3	6	29936	29941	50 %	0 %	50 %	0 %	532419058
530	NC_022117	AG	3	6	30034	30039	50 %	0 %	50 %	0 %	532419059
531	NC_022117	GTT	2	6	30115	30120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419059
532	NC_022117	GAA	2	6	30124	30129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419059
533	NC_022117	TC	3	6	30143	30148	0 %	50 %	0 %	50 %	532419059
534	NC_022117	TCT	2	6	30190	30195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419059
535	NC_022117	ACT	2	6	30280	30285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419059
536	NC_022117	TTC	2	6	30308	30313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419059
537	NC_022117	AAAG	2	8	30327	30334	75 %	0 %	25 %	0 %	532419059
538	NC_022117	CCT	2	6	30344	30349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419059
539	NC_022117	AAAC	2	8	30397	30404	75 %	0 %	0 %	25 %	532419059
540	NC_022117	T	6	6	30414	30419	0 %	100 %	0 %	0 %	532419059
541	NC_022117	AAGGA	2	10	30423	30432	60 %	0 %	40 %	0 %	532419059
542	NC_022117	GGC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532419059
543	NC_022117	GAT	2	6	30529	30534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419059
544	NC_022117	GATG	2	8	30540	30547	25 %	25 %	50 %	0 %	532419059
545	NC_022117	TAG	2	6	30551	30556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419059
546	NC_022117	GTT	2	6	30625	30630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419059
547	NC_022117	TAA	2	6	30735	30740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419059
548	NC_022117	GA	3	6	30764	30769	50 %	0 %	50 %	0 %	532419059
549	NC_022117	AGA	2	6	30894	30899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419059
550	NC_022117	TCG	2	6	30957	30962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419059
551	NC_022117	ATG	2	6	30991	30996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419059
552	NC_022117	TGG	2	6	31005	31010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419059
553	NC_022117	GAA	2	6	31036	31041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419059
554	NC_022117	ATT	2	6	31072	31077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419059
555	NC_022117	ATG	2	6	31195	31200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419059
556	NC_022117	AAG	2	6	31207	31212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419059
557	NC_022117	T	6	6	31213	31218	0 %	100 %	0 %	0 %	532419059
558	NC_022117	GA	3	6	31232	31237	50 %	0 %	50 %	0 %	532419059
559	NC_022117	A	7	7	31255	31261	100 %	0 %	0 %	0 %	532419059
560	NC_022117	ACA	2	6	31301	31306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419060
561	NC_022117	TGT	2	6	31322	31327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419060
562	NC_022117	T	6	6	31441	31446	0 %	100 %	0 %	0 %	532419060
563	NC_022117	GAGCT	2	10	31462	31471	20 %	20 %	40 %	20 %	532419060
564	NC_022117	A	6	6	31536	31541	100 %	0 %	0 %	0 %	532419060
565	NC_022117	A	6	6	31567	31572	100 %	0 %	0 %	0 %	532419060
566	NC_022117	TGC	2	6	31595	31600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419060
567	NC_022117	AGC	2	6	31613	31618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419060
568	NC_022117	GATA	2	8	31649	31656	50 %	25 %	25 %	0 %	532419061
569	NC_022117	TC	3	6	31658	31663	0 %	50 %	0 %	50 %	532419061
570	NC_022117	AAG	2	6	31862	31867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419061
571	NC_022117	AAG	2	6	31869	31874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419061
572	NC_022117	CTT	2	6	31908	31913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419061
573	NC_022117	CGT	2	6	31939	31944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419061
574	NC_022117	TGA	2	6	31985	31990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419061
575	NC_022117	GAG	2	6	32016	32021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419061
576	NC_022117	GCG	2	6	32058	32063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532419061
577	NC_022117	CT	3	6	32138	32143	0 %	50 %	0 %	50 %	532419061
578	NC_022117	AGA	2	6	32236	32241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419061
579	NC_022117	AG	3	6	32270	32275	50 %	0 %	50 %	0 %	532419061
580	NC_022117	AAG	2	6	32424	32429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419061
581	NC_022117	ATT	2	6	32474	32479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419061
582	NC_022117	T	6	6	32579	32584	0 %	100 %	0 %	0 %	532419061
583	NC_022117	GGA	2	6	32604	32609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419061
584	NC_022117	AGG	2	6	32829	32834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419062
585	NC_022117	GGT	2	6	32884	32889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419062
586	NC_022117	GCT	2	6	33046	33051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419062
587	NC_022117	GCT	2	6	33079	33084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419062
588	NC_022117	GAA	2	6	33189	33194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419063
589	NC_022117	A	6	6	33193	33198	100 %	0 %	0 %	0 %	532419063
590	NC_022117	TGT	2	6	33284	33289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419063
591	NC_022117	TGA	2	6	33335	33340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419063
592	NC_022117	GTT	2	6	33423	33428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419063
593	NC_022117	AGG	2	6	33472	33477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419063
594	NC_022117	CTT	2	6	33496	33501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419063
595	NC_022117	T	6	6	33518	33523	0 %	100 %	0 %	0 %	532419063
596	NC_022117	GTT	2	6	33536	33541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419063
597	NC_022117	TGA	2	6	33643	33648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419063
598	NC_022117	CAG	2	6	33706	33711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419063
599	NC_022117	TC	3	6	33766	33771	0 %	50 %	0 %	50 %	532419063
600	NC_022117	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	532419063
601	NC_022117	CTG	2	6	33876	33881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419064
602	NC_022117	ACA	2	6	33893	33898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419064
603	NC_022117	AG	3	6	33917	33922	50 %	0 %	50 %	0 %	532419064
604	NC_022117	GTC	2	6	33949	33954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419064
605	NC_022117	ATT	2	6	33996	34001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419064
606	NC_022117	T	6	6	34048	34053	0 %	100 %	0 %	0 %	532419064
607	NC_022117	TTA	2	6	34078	34083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419064
608	NC_022117	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	532419064
609	NC_022117	GAA	2	6	34171	34176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419064
610	NC_022117	AAG	2	6	34218	34223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419064
611	NC_022117	AGA	2	6	34269	34274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419064
612	NC_022117	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	532419064
613	NC_022117	TGC	2	6	34306	34311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419064
614	NC_022117	TGT	2	6	34330	34335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419064
615	NC_022117	ATG	2	6	34341	34346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419064
616	NC_022117	AAG	2	6	34372	34377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419064
617	NC_022117	GAA	2	6	34391	34396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419064
618	NC_022117	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	532419065
619	NC_022117	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	532419065
620	NC_022117	GAT	2	6	34602	34607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419065
621	NC_022117	AG	3	6	34610	34615	50 %	0 %	50 %	0 %	532419065
622	NC_022117	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	532419065
623	NC_022117	AGA	2	6	34668	34673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419065
624	NC_022117	TTA	2	6	34731	34736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419066
625	NC_022117	TGA	2	6	34864	34869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419066
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627	NC_022117	GAA	2	6	34963	34968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419066
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629	NC_022117	GAA	2	6	35102	35107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419066
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