MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 20375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022117	CA	3	6	312519	312524	50 %	0 %	0 %	50 %	532419290
6002	NC_022117	CTC	2	6	312538	312543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419290
6003	NC_022117	TTC	2	6	312584	312589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419290
6004	NC_022117	TAT	2	6	312626	312631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419290
6005	NC_022117	TGG	2	6	312665	312670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419290
6006	NC_022117	TGG	2	6	312697	312702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419290
6007	NC_022117	ATGGCT	2	12	312805	312816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532419290
6008	NC_022117	AGA	2	6	312924	312929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419290
6009	NC_022117	GCC	2	6	312959	312964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532419290
6010	NC_022117	ATT	2	6	313050	313055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419291
6011	NC_022117	GAA	2	6	313061	313066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419291
6012	NC_022117	ATC	2	6	313068	313073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419291
6013	NC_022117	CTT	2	6	313169	313174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419291
6014	NC_022117	TAA	2	6	313175	313180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419291
6015	NC_022117	AAG	2	6	313190	313195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419291
6016	NC_022117	GAT	2	6	313240	313245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419291
6017	NC_022117	GAAT	2	8	313267	313274	50 %	25 %	25 %	0 %	532419291
6018	NC_022117	AAT	2	6	313301	313306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419291
6019	NC_022117	T	6	6	313308	313313	0 %	100 %	0 %	0 %	532419291
6020	NC_022117	ATA	2	6	313321	313326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419291
6021	NC_022117	A	8	8	313357	313364	100 %	0 %	0 %	0 %	532419291
6022	NC_022117	ATA	2	6	313416	313421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419292
6023	NC_022117	CAA	2	6	313448	313453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419292
6024	NC_022117	CTT	2	6	313521	313526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6025	NC_022117	GAG	2	6	313554	313559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419292
6026	NC_022117	A	6	6	313608	313613	100 %	0 %	0 %	0 %	532419292
6027	NC_022117	CTAA	2	8	313658	313665	50 %	25 %	0 %	25 %	532419292
6028	NC_022117	CTT	2	6	313707	313712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6029	NC_022117	TCT	2	6	313742	313747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6030	NC_022117	T	7	7	313771	313777	0 %	100 %	0 %	0 %	532419292
6031	NC_022117	CTT	2	6	313794	313799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6032	NC_022117	TGC	2	6	313892	313897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419292
6033	NC_022117	TTC	2	6	313972	313977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6034	NC_022117	GAA	2	6	314031	314036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419292
6035	NC_022117	AGA	2	6	314104	314109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419292
6036	NC_022117	TTC	2	6	314143	314148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6037	NC_022117	GGAA	2	8	314326	314333	50 %	0 %	50 %	0 %	532419292
6038	NC_022117	AGGT	2	8	314348	314355	25 %	25 %	50 %	0 %	532419292
6039	NC_022117	TCT	2	6	314372	314377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6040	NC_022117	AAACT	2	10	314388	314397	60 %	20 %	0 %	20 %	532419292
6041	NC_022117	TA	3	6	314511	314516	50 %	50 %	0 %	0 %	532419292
6042	NC_022117	ATAC	2	8	314530	314537	50 %	25 %	0 %	25 %	532419292
6043	NC_022117	GCT	2	6	314589	314594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419292
6044	NC_022117	CTT	2	6	314673	314678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6045	NC_022117	AAG	2	6	314682	314687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419292
6046	NC_022117	CTT	2	6	314698	314703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6047	NC_022117	T	7	7	314702	314708	0 %	100 %	0 %	0 %	532419292
6048	NC_022117	AACAT	2	10	314721	314730	60 %	20 %	0 %	20 %	532419292
6049	NC_022117	AGA	2	6	314743	314748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419292
6050	NC_022117	GAC	2	6	314850	314855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419292
6051	NC_022117	T	8	8	314893	314900	0 %	100 %	0 %	0 %	532419292
6052	NC_022117	AGC	2	6	314923	314928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419292
6053	NC_022117	GA	3	6	314940	314945	50 %	0 %	50 %	0 %	532419292
6054	NC_022117	AT	3	6	314967	314972	50 %	50 %	0 %	0 %	532419292
6055	NC_022117	CTT	2	6	315012	315017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6056	NC_022117	GAA	2	6	315020	315025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419292
6057	NC_022117	CTC	2	6	315062	315067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419292
6058	NC_022117	TA	3	6	315098	315103	50 %	50 %	0 %	0 %	532419292
6059	NC_022117	A	6	6	315218	315223	100 %	0 %	0 %	0 %	532419292
6060	NC_022117	AAG	2	6	315232	315237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419292
6061	NC_022117	TTTG	2	8	315301	315308	0 %	75 %	25 %	0 %	532419292
6062	NC_022117	AAAC	2	8	315350	315357	75 %	0 %	0 %	25 %	532419292
6063	NC_022117	CTT	2	6	315382	315387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6064	NC_022117	A	6	6	315400	315405	100 %	0 %	0 %	0 %	532419292
6065	NC_022117	CTT	2	6	315421	315426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419292
6066	NC_022117	T	6	6	315425	315430	0 %	100 %	0 %	0 %	532419292
6067	NC_022117	AAT	2	6	315434	315439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419292
6068	NC_022117	A	9	9	315449	315457	100 %	0 %	0 %	0 %	532419292
6069	NC_022117	AAT	2	6	315648	315653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419293
6070	NC_022117	TCA	2	6	315683	315688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419293
6071	NC_022117	TAC	2	6	315727	315732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419293
6072	NC_022117	CTT	2	6	315750	315755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419293
6073	NC_022117	AATC	2	8	315759	315766	50 %	25 %	0 %	25 %	532419293
6074	NC_022117	CTT	2	6	315799	315804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419293
6075	NC_022117	ATC	2	6	315838	315843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419293
6076	NC_022117	TAAT	2	8	315980	315987	50 %	50 %	0 %	0 %	532419293
6077	NC_022117	AGCA	2	8	316077	316084	50 %	0 %	25 %	25 %	532419293
6078	NC_022117	AT	3	6	316099	316104	50 %	50 %	0 %	0 %	532419293
6079	NC_022117	A	6	6	316120	316125	100 %	0 %	0 %	0 %	532419293
6080	NC_022117	TTC	2	6	316177	316182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419293
6081	NC_022117	GTT	2	6	316192	316197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419293
6082	NC_022117	TCCGG	2	10	316205	316214	0 %	20 %	40 %	40 %	532419293
6083	NC_022117	GATT	2	8	316311	316318	25 %	50 %	25 %	0 %	532419293
6084	NC_022117	ATC	2	6	316336	316341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419293
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6086	NC_022117	TTC	2	6	316429	316434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419293
6087	NC_022117	CTC	2	6	316482	316487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419293
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6089	NC_022117	TTC	2	6	316712	316717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419293
6090	NC_022117	ATC	2	6	316726	316731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419293
6091	NC_022117	CTT	2	6	316776	316781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419293
6092	NC_022117	GCT	2	6	316788	316793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419293
6093	NC_022117	GAA	2	6	316803	316808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419293
6094	NC_022117	TC	3	6	316821	316826	0 %	50 %	0 %	50 %	532419293
6095	NC_022117	ACT	2	6	316867	316872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419293
6096	NC_022117	T	6	6	316933	316938	0 %	100 %	0 %	0 %	532419293
6097	NC_022117	ACA	2	6	316985	316990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419293
6098	NC_022117	TACAAA	2	12	316996	317007	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532419293
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6100	NC_022117	TTA	2	6	317037	317042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419293
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6102	NC_022117	CTT	2	6	317096	317101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419294
6103	NC_022117	A	6	6	317137	317142	100 %	0 %	0 %	0 %	532419294
6104	NC_022117	CTC	2	6	317279	317284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419294
6105	NC_022117	CGT	2	6	317309	317314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419294
6106	NC_022117	CA	3	6	317331	317336	50 %	0 %	0 %	50 %	532419294
6107	NC_022117	AGA	2	6	317343	317348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419294
6108	NC_022117	TCCAA	2	10	317392	317401	40 %	20 %	0 %	40 %	532419294
6109	NC_022117	ATTG	2	8	317409	317416	25 %	50 %	25 %	0 %	532419294
6110	NC_022117	TAT	2	6	317516	317521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419294
6111	NC_022117	ACC	3	9	317532	317540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532419294
6112	NC_022117	GAC	2	6	317546	317551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419294
6113	NC_022117	TC	3	6	317595	317600	0 %	50 %	0 %	50 %	532419294
6114	NC_022117	TAA	2	6	317606	317611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419294
6115	NC_022117	GAA	2	6	317657	317662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419294
6116	NC_022117	TTC	2	6	317726	317731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419294
6117	NC_022117	ATT	2	6	317758	317763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419294
6118	NC_022117	AATA	2	8	317765	317772	75 %	25 %	0 %	0 %	532419294
6119	NC_022117	TAAA	2	8	317786	317793	75 %	25 %	0 %	0 %	532419294
6120	NC_022117	CAGA	2	8	317794	317801	50 %	0 %	25 %	25 %	532419294
6121	NC_022117	A	6	6	318072	318077	100 %	0 %	0 %	0 %	532419295
6122	NC_022117	GAA	2	6	318278	318283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419295
6123	NC_022117	GAA	2	6	318303	318308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419295
6124	NC_022117	GCT	2	6	318309	318314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419295
6125	NC_022117	TCAA	2	8	318364	318371	50 %	25 %	0 %	25 %	532419295
6126	NC_022117	ATTTA	2	10	318458	318467	40 %	60 %	0 %	0 %	532419295
6127	NC_022117	C	7	7	318473	318479	0 %	0 %	0 %	100 %	532419295
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6130	NC_022117	TCT	3	9	318528	318536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419295
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6133	NC_022117	GTC	2	6	318691	318696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419295
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6137	NC_022117	GAA	2	6	318873	318878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419295
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6145	NC_022117	GTT	2	6	319113	319118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419295
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6153	NC_022117	A	6	6	319363	319368	100 %	0 %	0 %	0 %	532419295
6154	NC_022117	GCT	2	6	319416	319421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419295
6155	NC_022117	TGA	2	6	319430	319435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419295
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6230	NC_022117	A	6	6	322804	322809	100 %	0 %	0 %	0 %	532419297
6231	NC_022117	GAGC	2	8	322910	322917	25 %	0 %	50 %	25 %	532419297
6232	NC_022117	CTT	2	6	322919	322924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419297
6233	NC_022117	AT	3	6	322978	322983	50 %	50 %	0 %	0 %	532419297
6234	NC_022117	TAA	2	6	322997	323002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419297
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6236	NC_022117	CTTA	2	8	323050	323057	25 %	50 %	0 %	25 %	532419297
6237	NC_022117	TAA	2	6	323069	323074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419297
6238	NC_022117	CGA	2	6	323075	323080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419297
6239	NC_022117	TAAA	2	8	323152	323159	75 %	25 %	0 %	0 %	532419297
6240	NC_022117	ACG	2	6	323180	323185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419297
6241	NC_022117	AGA	2	6	323273	323278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419297
6242	NC_022117	CAA	2	6	323313	323318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419297
6243	NC_022117	CTC	2	6	323322	323327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419297
6244	NC_022117	AGA	2	6	323330	323335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419297
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6246	NC_022117	ATG	2	6	323469	323474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419297
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