MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 20375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022117	GGT	2	6	288034	288039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419265
5502	NC_022117	CTT	2	6	288076	288081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419265
5503	NC_022117	GAA	2	6	288109	288114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419265
5504	NC_022117	ATC	2	6	288179	288184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419265
5505	NC_022117	TAT	2	6	288210	288215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419265
5506	NC_022117	TGA	2	6	288219	288224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419265
5507	NC_022117	TGA	2	6	288279	288284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419265
5508	NC_022117	CTCA	2	8	288320	288327	25 %	25 %	0 %	50 %	532419265
5509	NC_022117	TGT	2	6	288336	288341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419265
5510	NC_022117	TGC	2	6	288345	288350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419265
5511	NC_022117	CTA	2	6	288401	288406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419265
5512	NC_022117	TG	3	6	288526	288531	0 %	50 %	50 %	0 %	532419265
5513	NC_022117	TA	3	6	288541	288546	50 %	50 %	0 %	0 %	532419265
5514	NC_022117	AACT	2	8	288562	288569	50 %	25 %	0 %	25 %	532419265
5515	NC_022117	CCT	2	6	288595	288600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419265
5516	NC_022117	ATG	2	6	288629	288634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419266
5517	NC_022117	A	6	6	288695	288700	100 %	0 %	0 %	0 %	532419266
5518	NC_022117	TTA	2	6	288720	288725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419266
5519	NC_022117	TCA	2	6	288794	288799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419266
5520	NC_022117	ATT	2	6	288854	288859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419266
5521	NC_022117	GTC	2	6	288863	288868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419266
5522	NC_022117	AATT	2	8	288879	288886	50 %	50 %	0 %	0 %	532419266
5523	NC_022117	TC	3	6	288897	288902	0 %	50 %	0 %	50 %	532419266
5524	NC_022117	A	6	6	288915	288920	100 %	0 %	0 %	0 %	532419266
5525	NC_022117	TCA	2	6	289087	289092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419266
5526	NC_022117	TCGT	2	8	289227	289234	0 %	50 %	25 %	25 %	532419266
5527	NC_022117	A	6	6	289303	289308	100 %	0 %	0 %	0 %	532419266
5528	NC_022117	TGT	2	6	289336	289341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419266
5529	NC_022117	TCAT	2	8	289386	289393	25 %	50 %	0 %	25 %	532419266
5530	NC_022117	ATA	2	6	289443	289448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419266
5531	NC_022117	CTT	2	6	289539	289544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419266
5532	NC_022117	GAAC	2	8	289550	289557	50 %	0 %	25 %	25 %	532419266
5533	NC_022117	AC	3	6	289569	289574	50 %	0 %	0 %	50 %	532419266
5534	NC_022117	ATT	2	6	289604	289609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419266
5535	NC_022117	ACA	2	6	289628	289633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419266
5536	NC_022117	CTC	2	6	289665	289670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419266
5537	NC_022117	TGC	2	6	289820	289825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419267
5538	NC_022117	TCT	3	9	289836	289844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419267
5539	NC_022117	AGA	2	6	289940	289945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419267
5540	NC_022117	GCT	2	6	290149	290154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419267
5541	NC_022117	TAA	2	6	290159	290164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419267
5542	NC_022117	CGAA	2	8	290216	290223	50 %	0 %	25 %	25 %	532419267
5543	NC_022117	CCT	2	6	290226	290231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419267
5544	NC_022117	TGT	2	6	290232	290237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419267
5545	NC_022117	CCT	2	6	290238	290243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532419267
5546	NC_022117	ATT	2	6	290250	290255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419267
5547	NC_022117	AAG	2	6	290282	290287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419267
5548	NC_022117	CTT	2	6	290365	290370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419267
5549	NC_022117	AGT	2	6	290403	290408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419267
5550	NC_022117	CTT	2	6	290512	290517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419267
5551	NC_022117	AAC	2	6	290534	290539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419267
5552	NC_022117	AAGT	2	8	290562	290569	50 %	25 %	25 %	0 %	532419267
5553	NC_022117	TGCT	2	8	290582	290589	0 %	50 %	25 %	25 %	532419267
5554	NC_022117	CTG	2	6	290605	290610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419267
5555	NC_022117	TAA	2	6	290629	290634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419267
5556	NC_022117	T	6	6	290762	290767	0 %	100 %	0 %	0 %	532419267
5557	NC_022117	TTTC	2	8	290771	290778	0 %	75 %	0 %	25 %	532419267
5558	NC_022117	TA	3	6	290889	290894	50 %	50 %	0 %	0 %	532419267
5559	NC_022117	CTT	2	6	290985	290990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419268
5560	NC_022117	AGT	2	6	290995	291000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419268
5561	NC_022117	AT	3	6	291012	291017	50 %	50 %	0 %	0 %	532419268
5562	NC_022117	A	6	6	291063	291068	100 %	0 %	0 %	0 %	532419268
5563	NC_022117	TCT	2	6	291077	291082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419268
5564	NC_022117	TC	3	6	291096	291101	0 %	50 %	0 %	50 %	532419268
5565	NC_022117	GAC	2	6	291123	291128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419268
5566	NC_022117	TTCC	2	8	291152	291159	0 %	50 %	0 %	50 %	532419268
5567	NC_022117	AGT	2	6	291331	291336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419268
5568	NC_022117	TAA	2	6	291382	291387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419268
5569	NC_022117	AAG	2	6	291501	291506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419268
5570	NC_022117	GCAATG	2	12	291542	291553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532419268
5571	NC_022117	GTT	2	6	291589	291594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419268
5572	NC_022117	CTAA	2	8	291599	291606	50 %	25 %	0 %	25 %	532419268
5573	NC_022117	CAA	2	6	291642	291647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419268
5574	NC_022117	TCA	2	6	291648	291653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419268
5575	NC_022117	GAA	3	9	291835	291843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419896
5576	NC_022117	C	11	11	291855	291865	0 %	0 %	0 %	100 %	532419896
5577	NC_022117	A	6	6	291893	291898	100 %	0 %	0 %	0 %	532419896
5578	NC_022117	CTT	2	6	292034	292039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419269
5579	NC_022117	CT	3	6	292097	292102	0 %	50 %	0 %	50 %	532419269
5580	NC_022117	CAG	2	6	292165	292170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419269
5581	NC_022117	CGACAT	2	12	292215	292226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532419269
5582	NC_022117	ATT	2	6	292258	292263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419269
5583	NC_022117	TAC	2	6	292313	292318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419269
5584	NC_022117	CTT	2	6	292356	292361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419269
5585	NC_022117	AGCA	2	8	292415	292422	50 %	0 %	25 %	25 %	532419269
5586	NC_022117	T	6	6	292483	292488	0 %	100 %	0 %	0 %	532419269
5587	NC_022117	AGAT	2	8	292513	292520	50 %	25 %	25 %	0 %	532419270
5588	NC_022117	AGCT	2	8	292537	292544	25 %	25 %	25 %	25 %	532419270
5589	NC_022117	CGAG	2	8	292561	292568	25 %	0 %	50 %	25 %	532419270
5590	NC_022117	CTG	2	6	292606	292611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419270
5591	NC_022117	ATA	2	6	292708	292713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419270
5592	NC_022117	A	7	7	292826	292832	100 %	0 %	0 %	0 %	532419270
5593	NC_022117	GAA	2	6	292890	292895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419270
5594	NC_022117	CTA	2	6	292989	292994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419270
5595	NC_022117	AGC	2	6	293135	293140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419270
5596	NC_022117	CAG	2	6	293175	293180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419270
5597	NC_022117	TCTT	2	8	293205	293212	0 %	75 %	0 %	25 %	532419270
5598	NC_022117	TCTT	2	8	293219	293226	0 %	75 %	0 %	25 %	532419271
5599	NC_022117	TCT	2	6	293279	293284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532419271
5600	NC_022117	ATT	2	6	293289	293294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419271
5601	NC_022117	ATG	2	6	293364	293369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419271
5602	NC_022117	ACT	2	6	293384	293389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532419271
5603	NC_022117	AAC	2	6	293424	293429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419271
5604	NC_022117	ACA	2	6	293471	293476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532419271
5605	NC_022117	TGC	2	6	293489	293494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532419271
5606	NC_022117	TTCT	2	8	293553	293560	0 %	75 %	0 %	25 %	532419271
5607	NC_022117	TGG	2	6	293572	293577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532419271
5608	NC_022117	GAA	2	6	293591	293596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419271
5609	NC_022117	TAG	2	6	293625	293630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419271
5610	NC_022117	A	6	6	293652	293657	100 %	0 %	0 %	0 %	532419271
5611	NC_022117	CCCTTA	2	12	293669	293680	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532419271
5612	NC_022117	TGA	2	6	293710	293715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532419271
5613	NC_022117	A	7	7	293755	293761	100 %	0 %	0 %	0 %	532419271
5614	NC_022117	GAA	2	6	293861	293866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532419271
5615	NC_022117	CT	3	6	293876	293881	0 %	50 %	0 %	50 %	532419271
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5618	NC_022117	CT	4	8	293979	293986	0 %	50 %	0 %	50 %	532419272
5619	NC_022117	TAA	2	6	294002	294007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532419272
5620	NC_022117	TACC	2	8	294020	294027	25 %	25 %	0 %	50 %	532419272
5621	NC_022117	GAG	2	6	294079	294084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532419272
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5994	NC_022117	CAAAGA	2	12	312189	312200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532419289
5995	NC_022117	TTA	2	6	312232	312237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419289
5996	NC_022117	TGGT	2	8	312400	312407	0 %	50 %	50 %	0 %	532419290
5997	NC_022117	ATT	2	6	312410	312415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532419290
5998	NC_022117	CTTGG	2	10	312435	312444	0 %	40 %	40 %	20 %	532419290
5999	NC_022117	TTG	2	6	312500	312505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532419290
6000	NC_022117	GCA	2	6	312511	312516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532419290

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