MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 2532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022110	AGTA	2	8	1485	1492	50 %	25 %	25 %	0 %	532353206
2	NC_022110	ATGA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	532353207
3	NC_022110	GATA	2	8	1927	1934	50 %	25 %	25 %	0 %	532353207
4	NC_022110	TTTC	2	8	2223	2230	0 %	75 %	0 %	25 %	532353208
5	NC_022110	CATG	2	8	3104	3111	25 %	25 %	25 %	25 %	532353208
6	NC_022110	TTCC	2	8	3409	3416	0 %	50 %	0 %	50 %	532353208
7	NC_022110	TTTA	2	8	3807	3814	25 %	75 %	0 %	0 %	532353209
8	NC_022110	ATCC	2	8	4107	4114	25 %	25 %	0 %	50 %	532353209
9	NC_022110	GACG	2	8	4854	4861	25 %	0 %	50 %	25 %	532353209
10	NC_022110	TTGG	2	8	4957	4964	0 %	50 %	50 %	0 %	532353209
11	NC_022110	TGGA	2	8	5313	5320	25 %	25 %	50 %	0 %	532353210
12	NC_022110	CTTT	2	8	5690	5697	0 %	75 %	0 %	25 %	532353210
13	NC_022110	GGGA	2	8	6205	6212	25 %	0 %	75 %	0 %	532353210
14	NC_022110	GGTG	2	8	6508	6515	0 %	25 %	75 %	0 %	532353211
15	NC_022110	AAAT	2	8	6574	6581	75 %	25 %	0 %	0 %	532353211
16	NC_022110	ATTT	2	8	7086	7093	25 %	75 %	0 %	0 %	532354030
17	NC_022110	TTTG	2	8	7178	7185	0 %	75 %	25 %	0 %	532354030
18	NC_022110	AAGC	2	8	7812	7819	50 %	0 %	25 %	25 %	532353212
19	NC_022110	ATTG	2	8	8210	8217	25 %	50 %	25 %	0 %	532353213
20	NC_022110	AGCG	2	8	8677	8684	25 %	0 %	50 %	25 %	532353213
21	NC_022110	AAAG	2	8	8698	8705	75 %	0 %	25 %	0 %	532353213
22	NC_022110	CTTT	2	8	9038	9045	0 %	75 %	0 %	25 %	532353213
23	NC_022110	TTCG	2	8	9412	9419	0 %	50 %	25 %	25 %	532353214
24	NC_022110	AATT	2	8	9517	9524	50 %	50 %	0 %	0 %	532353214
25	NC_022110	ATGG	2	8	9576	9583	25 %	25 %	50 %	0 %	532353214
26	NC_022110	CTTT	2	8	10201	10208	0 %	75 %	0 %	25 %	532353215
27	NC_022110	GCAA	2	8	10418	10425	50 %	0 %	25 %	25 %	532353215
28	NC_022110	AGCC	2	8	10648	10655	25 %	0 %	25 %	50 %	532353215
29	NC_022110	GAAA	2	8	10791	10798	75 %	0 %	25 %	0 %	532353215
30	NC_022110	ATTT	2	8	10857	10864	25 %	75 %	0 %	0 %	532353215
31	NC_022110	AATG	2	8	11534	11541	50 %	25 %	25 %	0 %	532353216
32	NC_022110	GTTT	2	8	12566	12573	0 %	75 %	25 %	0 %	532353217
33	NC_022110	ATGC	2	8	12996	13003	25 %	25 %	25 %	25 %	532353217
34	NC_022110	TTGT	2	8	14032	14039	0 %	75 %	25 %	0 %	532353218
35	NC_022110	TTCT	2	8	14203	14210	0 %	75 %	0 %	25 %	532353218
36	NC_022110	ATTT	2	8	14409	14416	25 %	75 %	0 %	0 %	532353218
37	NC_022110	TTTC	2	8	15071	15078	0 %	75 %	0 %	25 %	532353219
38	NC_022110	AAAT	2	8	15553	15560	75 %	25 %	0 %	0 %	532353219
39	NC_022110	GTAA	2	8	16395	16402	50 %	25 %	25 %	0 %	532353220
40	NC_022110	CTAA	2	8	16588	16595	50 %	25 %	0 %	25 %	532353220
41	NC_022110	AGAA	2	8	16851	16858	75 %	0 %	25 %	0 %	532353220
42	NC_022110	ATTT	2	8	16997	17004	25 %	75 %	0 %	0 %	532353220
43	NC_022110	TGCG	2	8	18519	18526	0 %	25 %	50 %	25 %	532353222
44	NC_022110	GAAG	2	8	19503	19510	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
45	NC_022110	TTTG	2	8	19529	19536	0 %	75 %	25 %	0 %	532353222
46	NC_022110	TGTA	2	8	20221	20228	25 %	50 %	25 %	0 %	532353223
47	NC_022110	TGGG	2	8	21639	21646	0 %	25 %	75 %	0 %	532353224
48	NC_022110	CATT	2	8	22696	22703	25 %	50 %	0 %	25 %	532353224
49	NC_022110	GCTT	2	8	23039	23046	0 %	50 %	25 %	25 %	532353224
50	NC_022110	GGTT	2	8	23087	23094	0 %	50 %	50 %	0 %	532353224
51	NC_022110	TTCT	2	8	23456	23463	0 %	75 %	0 %	25 %	532353224
52	NC_022110	TAAC	2	8	23558	23565	50 %	25 %	0 %	25 %	532353224
53	NC_022110	CATT	2	8	23681	23688	25 %	50 %	0 %	25 %	532353224
54	NC_022110	GGTA	2	8	24051	24058	25 %	25 %	50 %	0 %	532353224
55	NC_022110	TTGA	2	8	25045	25052	25 %	50 %	25 %	0 %	532353225
56	NC_022110	TTCG	2	8	25190	25197	0 %	50 %	25 %	25 %	532353225
57	NC_022110	TAGG	2	8	25269	25276	25 %	25 %	50 %	0 %	532353225
58	NC_022110	TTCC	2	8	25393	25400	0 %	50 %	0 %	50 %	532353225
59	NC_022110	TAGG	2	8	25507	25514	25 %	25 %	50 %	0 %	532353225
60	NC_022110	TTTC	2	8	25942	25949	0 %	75 %	0 %	25 %	532353225
61	NC_022110	GCTT	2	8	26279	26286	0 %	50 %	25 %	25 %	532353225
62	NC_022110	GGAA	2	8	26862	26869	50 %	0 %	50 %	0 %	532353226
63	NC_022110	TTAA	2	8	26935	26942	50 %	50 %	0 %	0 %	532353226
64	NC_022110	AAAG	2	8	26985	26992	75 %	0 %	25 %	0 %	532353226
65	NC_022110	GGGC	2	8	27265	27272	0 %	0 %	75 %	25 %	532353226
66	NC_022110	GTTT	2	8	27548	27555	0 %	75 %	25 %	0 %	532353227
67	NC_022110	CAGA	2	8	27570	27577	50 %	0 %	25 %	25 %	532353227
68	NC_022110	CTTT	2	8	29541	29548	0 %	75 %	0 %	25 %	532353229
69	NC_022110	TTTG	2	8	29556	29563	0 %	75 %	25 %	0 %	532353229
70	NC_022110	TTGT	2	8	29591	29598	0 %	75 %	25 %	0 %	532353229
71	NC_022110	TGGC	2	8	29754	29761	0 %	25 %	50 %	25 %	532353229
72	NC_022110	AAAG	2	8	30314	30321	75 %	0 %	25 %	0 %	532353230
73	NC_022110	AAAC	2	8	30384	30391	75 %	0 %	0 %	25 %	532353230
74	NC_022110	GATG	2	8	30527	30534	25 %	25 %	50 %	0 %	532353230
75	NC_022110	TGAT	2	8	34130	34137	25 %	50 %	25 %	0 %	532353235
76	NC_022110	AAGA	3	12	34258	34269	75 %	0 %	25 %	0 %	532353235
77	NC_022110	AAGC	2	8	34478	34485	50 %	0 %	25 %	25 %	532353236
78	NC_022110	GTTC	2	8	34511	34518	0 %	50 %	25 %	25 %	532353236
79	NC_022110	GGCA	2	8	34890	34897	25 %	0 %	50 %	25 %	532353237
80	NC_022110	TCGA	2	8	35147	35154	25 %	25 %	25 %	25 %	532353237
81	NC_022110	TGCT	2	8	35300	35307	0 %	50 %	25 %	25 %	532353237
82	NC_022110	TTGG	2	8	35532	35539	0 %	50 %	50 %	0 %	532353237
83	NC_022110	AGAT	2	8	36252	36259	50 %	25 %	25 %	0 %	532353237
84	NC_022110	CTTT	2	8	36625	36632	0 %	75 %	0 %	25 %	532353238
85	NC_022110	ATGA	2	8	37115	37122	50 %	25 %	25 %	0 %	532353238
86	NC_022110	TAGG	2	8	37274	37281	25 %	25 %	50 %	0 %	532353238
87	NC_022110	CAAT	2	8	37458	37465	50 %	25 %	0 %	25 %	532353238
88	NC_022110	AATG	2	8	38245	38252	50 %	25 %	25 %	0 %	532353238
89	NC_022110	AGAA	2	8	39082	39089	75 %	0 %	25 %	0 %	532353239
90	NC_022110	AAGA	2	8	39134	39141	75 %	0 %	25 %	0 %	532353239
91	NC_022110	ATCC	2	8	39142	39149	25 %	25 %	0 %	50 %	532353239
92	NC_022110	TAAT	2	8	39353	39360	50 %	50 %	0 %	0 %	532353239
93	NC_022110	GTGC	2	8	41442	41449	0 %	25 %	50 %	25 %	532353241
94	NC_022110	AGAA	2	8	41861	41868	75 %	0 %	25 %	0 %	532353241
95	NC_022110	GGAT	2	8	42013	42020	25 %	25 %	50 %	0 %	532353241
96	NC_022110	CAAT	2	8	43422	43429	50 %	25 %	0 %	25 %	532353243
97	NC_022110	TGTT	2	8	43802	43809	0 %	75 %	25 %	0 %	532353243
98	NC_022110	AATA	2	8	44041	44048	75 %	25 %	0 %	0 %	532353244
99	NC_022110	ATTT	2	8	44179	44186	25 %	75 %	0 %	0 %	532353245
100	NC_022110	GCTC	2	8	44487	44494	0 %	25 %	25 %	50 %	532353245
101	NC_022110	TTCT	2	8	44629	44636	0 %	75 %	0 %	25 %	532353245
102	NC_022110	TTGA	2	8	45229	45236	25 %	50 %	25 %	0 %	532353246
103	NC_022110	TGTT	2	8	45401	45408	0 %	75 %	25 %	0 %	532353246
104	NC_022110	CTAT	2	8	45431	45438	25 %	50 %	0 %	25 %	532353246
105	NC_022110	TGTT	2	8	45460	45467	0 %	75 %	25 %	0 %	532353246
106	NC_022110	CTAT	2	8	45756	45763	25 %	50 %	0 %	25 %	532353246
107	NC_022110	AAGA	2	8	46252	46259	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
108	NC_022110	AAGA	2	8	46309	46316	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
109	NC_022110	AAAG	2	8	46349	46356	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
110	NC_022110	AAGA	2	8	46464	46471	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
111	NC_022110	ACTT	2	8	46725	46732	25 %	50 %	0 %	25 %	532353247
112	NC_022110	ATGG	2	8	47351	47358	25 %	25 %	50 %	0 %	532353247
113	NC_022110	AGGA	2	8	47382	47389	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
114	NC_022110	GAAC	2	8	47928	47935	50 %	0 %	25 %	25 %	532353247
115	NC_022110	AAGT	2	8	47963	47970	50 %	25 %	25 %	0 %	532353247
116	NC_022110	AACA	2	8	48172	48179	75 %	0 %	0 %	25 %	532353248
117	NC_022110	CTTT	2	8	48368	48375	0 %	75 %	0 %	25 %	532353248
118	NC_022110	CTTT	2	8	49253	49260	0 %	75 %	0 %	25 %	532353249
119	NC_022110	GTAG	2	8	49271	49278	25 %	25 %	50 %	0 %	532353249
120	NC_022110	GAAG	2	8	50699	50706	50 %	0 %	50 %	0 %	532353250
121	NC_022110	TTCA	2	8	51121	51128	25 %	50 %	0 %	25 %	532353250
122	NC_022110	TCTA	2	8	51338	51345	25 %	50 %	0 %	25 %	532353250
123	NC_022110	GGAA	2	8	52394	52401	50 %	0 %	50 %	0 %	532353252
124	NC_022110	TTAA	2	8	53135	53142	50 %	50 %	0 %	0 %	532353252
125	NC_022110	CCTT	2	8	53342	53349	0 %	50 %	0 %	50 %	532353253
126	NC_022110	TTTA	2	8	53509	53516	25 %	75 %	0 %	0 %	532353253
127	NC_022110	AAAG	2	8	53733	53740	75 %	0 %	25 %	0 %	532353253
128	NC_022110	GATT	2	8	53870	53877	25 %	50 %	25 %	0 %	532353253
129	NC_022110	AATC	2	8	53925	53932	50 %	25 %	0 %	25 %	532353253
130	NC_022110	TATT	2	8	53986	53993	25 %	75 %	0 %	0 %	532353253
131	NC_022110	CTGG	3	12	55837	55848	0 %	25 %	50 %	25 %	532354032
132	NC_022110	TTGC	2	8	55974	55981	0 %	50 %	25 %	25 %	532354032
133	NC_022110	CGAG	2	8	56016	56023	25 %	0 %	50 %	25 %	532354032
134	NC_022110	AGCT	2	8	56472	56479	25 %	25 %	25 %	25 %	532354032
135	NC_022110	GGTT	2	8	57175	57182	0 %	50 %	50 %	0 %	532354032
136	NC_022110	CGTT	2	8	59237	59244	0 %	50 %	25 %	25 %	532353254
137	NC_022110	GGAG	2	8	59246	59253	25 %	0 %	75 %	0 %	532353254
138	NC_022110	GTAA	2	8	59298	59305	50 %	25 %	25 %	0 %	532353254
139	NC_022110	ATGG	2	8	59525	59532	25 %	25 %	50 %	0 %	532353254
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141	NC_022110	ATGT	2	8	60121	60128	25 %	50 %	25 %	0 %	532353254
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