MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022110	GGA	2	6	184028	184033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353349
3502	NC_022110	TAG	2	6	184053	184058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353349
3503	NC_022110	AGT	2	6	184183	184188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353349
3504	NC_022110	TCA	2	6	184291	184296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353349
3505	NC_022110	GGA	2	6	184306	184311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353349
3506	NC_022110	AGAGA	2	10	184399	184408	60 %	0 %	40 %	0 %	532353350
3507	NC_022110	GCA	2	6	184495	184500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353350
3508	NC_022110	TTA	2	6	184792	184797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353350
3509	NC_022110	GAA	2	6	184861	184866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353350
3510	NC_022110	ATA	2	6	184921	184926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353350
3511	NC_022110	TCTA	2	8	184962	184969	25 %	50 %	0 %	25 %	532353350
3512	NC_022110	GTT	2	6	185030	185035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353350
3513	NC_022110	AGA	2	6	185299	185304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353351
3514	NC_022110	GTT	4	12	185428	185439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353351
3515	NC_022110	T	6	6	185445	185450	0 %	100 %	0 %	0 %	532353351
3516	NC_022110	T	7	7	185453	185459	0 %	100 %	0 %	0 %	532353351
3517	NC_022110	TG	3	6	185688	185693	0 %	50 %	50 %	0 %	532353352
3518	NC_022110	GTC	2	6	185779	185784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353352
3519	NC_022110	ATT	2	6	185849	185854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353352
3520	NC_022110	TCT	2	6	185868	185873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353352
3521	NC_022110	CTT	2	6	185884	185889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353352
3522	NC_022110	AAGC	2	8	185922	185929	50 %	0 %	25 %	25 %	532353352
3523	NC_022110	GAA	2	6	185952	185957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353352
3524	NC_022110	AAC	2	6	186029	186034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353352
3525	NC_022110	TA	3	6	186106	186111	50 %	50 %	0 %	0 %	532353352
3526	NC_022110	CTT	2	6	186127	186132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353352
3527	NC_022110	TAG	2	6	186133	186138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353352
3528	NC_022110	CAT	2	6	186177	186182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353352
3529	NC_022110	T	6	6	186184	186189	0 %	100 %	0 %	0 %	532353352
3530	NC_022110	GCTT	2	8	186203	186210	0 %	50 %	25 %	25 %	532353352
3531	NC_022110	CAC	2	6	186235	186240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353352
3532	NC_022110	GAA	2	6	186270	186275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353352
3533	NC_022110	AAG	2	6	186376	186381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353352
3534	NC_022110	TGT	2	6	186398	186403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353352
3535	NC_022110	ACGAT	2	10	186470	186479	40 %	20 %	20 %	20 %	532353352
3536	NC_022110	TTTA	2	8	186488	186495	25 %	75 %	0 %	0 %	532353352
3537	NC_022110	AAG	2	6	186499	186504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353352
3538	NC_022110	AGA	2	6	186584	186589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353352
3539	NC_022110	A	6	6	186639	186644	100 %	0 %	0 %	0 %	532353352
3540	NC_022110	AGG	2	6	186667	186672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353352
3541	NC_022110	GCTT	2	8	186695	186702	0 %	50 %	25 %	25 %	532353352
3542	NC_022110	T	7	7	186701	186707	0 %	100 %	0 %	0 %	532353352
3543	NC_022110	A	6	6	186742	186747	100 %	0 %	0 %	0 %	532353352
3544	NC_022110	GCT	2	6	186831	186836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353352
3545	NC_022110	TTC	2	6	187010	187015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353352
3546	NC_022110	GAAA	2	8	187118	187125	75 %	0 %	25 %	0 %	532353352
3547	NC_022110	GCTT	2	8	187136	187143	0 %	50 %	25 %	25 %	532353352
3548	NC_022110	TAG	2	6	187174	187179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353352
3549	NC_022110	GAT	2	6	187212	187217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353352
3550	NC_022110	T	7	7	187217	187223	0 %	100 %	0 %	0 %	532353352
3551	NC_022110	TTA	2	6	187247	187252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353352
3552	NC_022110	ATC	2	6	187254	187259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353352
3553	NC_022110	GATAT	2	10	187283	187292	40 %	40 %	20 %	0 %	532353352
3554	NC_022110	T	6	6	187295	187300	0 %	100 %	0 %	0 %	532353352
3555	NC_022110	TCC	2	6	187315	187320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353352
3556	NC_022110	ACA	3	9	187321	187329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353352
3557	NC_022110	CTC	2	6	188086	188091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354046
3558	NC_022110	CAC	2	6	188132	188137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354046
3559	NC_022110	TAC	2	6	188213	188218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354046
3560	NC_022110	CAT	2	6	188229	188234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354046
3561	NC_022110	CCT	2	6	188352	188357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354047
3562	NC_022110	CCT	2	6	188442	188447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354047
3563	NC_022110	TTA	2	6	188469	188474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354047
3564	NC_022110	CGTA	2	8	188492	188499	25 %	25 %	25 %	25 %	532354047
3565	NC_022110	G	9	9	188511	188519	0 %	0 %	100 %	0 %	532354047
3566	NC_022110	TCC	2	6	188545	188550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354047
3567	NC_022110	CAG	2	6	188553	188558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354047
3568	NC_022110	A	6	6	188572	188577	100 %	0 %	0 %	0 %	532354047
3569	NC_022110	AGA	2	6	188587	188592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354047
3570	NC_022110	GAA	2	6	188593	188598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354047
3571	NC_022110	GGA	2	6	188599	188604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354047
3572	NC_022110	CTT	2	6	188607	188612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354047
3573	NC_022110	AGA	2	6	188668	188673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354047
3574	NC_022110	TAAA	2	8	188721	188728	75 %	25 %	0 %	0 %	532354047
3575	NC_022110	CAA	2	6	188801	188806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354047
3576	NC_022110	CAA	2	6	190586	190591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354048
3577	NC_022110	ACGAT	2	10	190592	190601	40 %	20 %	20 %	20 %	532354048
3578	NC_022110	ACT	2	6	190742	190747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354048
3579	NC_022110	AAG	2	6	190929	190934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354048
3580	NC_022110	A	6	6	190952	190957	100 %	0 %	0 %	0 %	532354048
3581	NC_022110	TTC	2	6	191000	191005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354048
3582	NC_022110	TGT	2	6	191131	191136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354048
3583	NC_022110	GAA	2	6	191162	191167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354048
3584	NC_022110	TTG	2	6	191186	191191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354048
3585	NC_022110	TGA	2	6	191205	191210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354048
3586	NC_022110	TTA	2	6	191248	191253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354048
3587	NC_022110	TA	3	6	191280	191285	50 %	50 %	0 %	0 %	532354048
3588	NC_022110	TTA	2	6	191327	191332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354048
3589	NC_022110	GTGC	2	8	191390	191397	0 %	25 %	50 %	25 %	532354048
3590	NC_022110	CTT	2	6	191482	191487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354048
3591	NC_022110	AG	4	8	191515	191522	50 %	0 %	50 %	0 %	532354048
3592	NC_022110	TCA	2	6	191525	191530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354048
3593	NC_022110	TTGTA	2	10	191565	191574	20 %	60 %	20 %	0 %	532354048
3594	NC_022110	GAAAT	2	10	191588	191597	60 %	20 %	20 %	0 %	532354048
3595	NC_022110	AG	3	6	191658	191663	50 %	0 %	50 %	0 %	532354048
3596	NC_022110	ATTTGC	2	12	191755	191766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532354048
3597	NC_022110	AAG	2	6	191805	191810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354048
3598	NC_022110	TC	3	6	191815	191820	0 %	50 %	0 %	50 %	532354048
3599	NC_022110	GAG	2	6	191897	191902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354049
3600	NC_022110	TCT	2	6	191912	191917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354049
3601	NC_022110	TATGC	2	10	191970	191979	20 %	40 %	20 %	20 %	532354049
3602	NC_022110	GAA	2	6	192072	192077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354049
3603	NC_022110	AAGAA	2	10	192135	192144	80 %	0 %	20 %	0 %	532354049
3604	NC_022110	AAT	2	6	192145	192150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354049
3605	NC_022110	AT	3	6	192156	192161	50 %	50 %	0 %	0 %	532354049
3606	NC_022110	TGT	2	6	192170	192175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354049
3607	NC_022110	CTGG	2	8	192223	192230	0 %	25 %	50 %	25 %	532354049
3608	NC_022110	TATCA	2	10	192336	192345	40 %	40 %	0 %	20 %	532353353
3609	NC_022110	AG	3	6	192378	192383	50 %	0 %	50 %	0 %	532353353
3610	NC_022110	GATCT	2	10	192482	192491	20 %	40 %	20 %	20 %	532353353
3611	NC_022110	ATGC	2	8	192529	192536	25 %	25 %	25 %	25 %	532353353
3612	NC_022110	GTT	2	6	192537	192542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353353
3613	NC_022110	CTTT	2	8	192670	192677	0 %	75 %	0 %	25 %	532354050
3614	NC_022110	AAG	2	6	192717	192722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354050
3615	NC_022110	T	6	6	192767	192772	0 %	100 %	0 %	0 %	532354050
3616	NC_022110	ATT	2	6	192780	192785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354050
3617	NC_022110	T	6	6	192796	192801	0 %	100 %	0 %	0 %	532354050
3618	NC_022110	T	6	6	192944	192949	0 %	100 %	0 %	0 %	532353354
3619	NC_022110	CTC	2	6	192994	192999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353354
3620	NC_022110	AAT	2	6	193092	193097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353354
3621	NC_022110	TGCT	2	8	193114	193121	0 %	50 %	25 %	25 %	532353354
3622	NC_022110	ACA	2	6	193166	193171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353354
3623	NC_022110	AGCAAC	2	12	193178	193189	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532353354
3624	NC_022110	GTA	2	6	193218	193223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353354
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3626	NC_022110	CAA	2	6	193360	193365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353354
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3628	NC_022110	CAT	2	6	193551	193556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353354
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3635	NC_022110	GATTA	2	10	193735	193744	40 %	40 %	20 %	0 %	532353354
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3748	NC_022110	AGC	2	6	200341	200346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353359
3749	NC_022110	GT	4	8	200385	200392	0 %	50 %	50 %	0 %	532353359
3750	NC_022110	T	7	7	200423	200429	0 %	100 %	0 %	0 %	532353359
3751	NC_022110	ATG	2	6	200430	200435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353359
3752	NC_022110	T	7	7	200640	200646	0 %	100 %	0 %	0 %	532353359
3753	NC_022110	CTT	2	6	200688	200693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353359
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3756	NC_022110	GTTG	2	8	200765	200772	0 %	50 %	50 %	0 %	532353359
3757	NC_022110	TGC	2	6	200784	200789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353359
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3768	NC_022110	GAAA	2	8	201336	201343	75 %	0 %	25 %	0 %	532353360
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3776	NC_022110	TGC	2	6	201581	201586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353360
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3778	NC_022110	CAT	2	6	201687	201692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353361
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3855	NC_022110	TTTG	2	8	206692	206699	0 %	75 %	25 %	0 %	532353366
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3864	NC_022110	ATC	2	6	206965	206970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353366
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3869	NC_022110	TTC	2	6	207280	207285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353366
3870	NC_022110	GCT	2	6	207333	207338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353366
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3995	NC_022110	TTC	2	6	213268	213273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353371
3996	NC_022110	TA	3	6	213288	213293	50 %	50 %	0 %	0 %	532353371
3997	NC_022110	TTC	2	6	213316	213321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353371
3998	NC_022110	GCA	2	6	213326	213331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353371
3999	NC_022110	GCT	2	6	213335	213340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353371
4000	NC_022110	GGA	2	6	213392	213397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353371

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