MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022110	CCCA	2	8	156423	156430	25 %	0 %	0 %	75 %	532353334
3002	NC_022110	CTT	2	6	156444	156449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353334
3003	NC_022110	ATG	2	6	156480	156485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353334
3004	NC_022110	TAA	2	6	156528	156533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353334
3005	NC_022110	T	7	7	156537	156543	0 %	100 %	0 %	0 %	532353334
3006	NC_022110	AGA	2	6	156593	156598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353334
3007	NC_022110	A	6	6	156629	156634	100 %	0 %	0 %	0 %	532353334
3008	NC_022110	GAA	3	9	156696	156704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353334
3009	NC_022110	GT	3	6	156759	156764	0 %	50 %	50 %	0 %	532353334
3010	NC_022110	AGC	2	6	156770	156775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353334
3011	NC_022110	TCT	2	6	156783	156788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353334
3012	NC_022110	AG	3	6	156798	156803	50 %	0 %	50 %	0 %	532353334
3013	NC_022110	AGG	2	6	156871	156876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353334
3014	NC_022110	AG	3	6	156899	156904	50 %	0 %	50 %	0 %	532353334
3015	NC_022110	AG	3	6	156916	156921	50 %	0 %	50 %	0 %	532353334
3016	NC_022110	AG	3	6	156981	156986	50 %	0 %	50 %	0 %	532353334
3017	NC_022110	ATC	2	6	156992	156997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353334
3018	NC_022110	GGA	2	6	157026	157031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353334
3019	NC_022110	ATA	2	6	157062	157067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353334
3020	NC_022110	A	6	6	157070	157075	100 %	0 %	0 %	0 %	532353334
3021	NC_022110	ACAT	2	8	157086	157093	50 %	25 %	0 %	25 %	532353334
3022	NC_022110	TGTT	2	8	157132	157139	0 %	75 %	25 %	0 %	532353334
3023	NC_022110	TTCTA	2	10	157145	157154	20 %	60 %	0 %	20 %	532353334
3024	NC_022110	CTTG	2	8	157468	157475	0 %	50 %	25 %	25 %	532353335
3025	NC_022110	GA	3	6	157484	157489	50 %	0 %	50 %	0 %	532353335
3026	NC_022110	GCA	2	6	157537	157542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353335
3027	NC_022110	CTTT	2	8	157545	157552	0 %	75 %	0 %	25 %	532353335
3028	NC_022110	CTCCAT	2	12	157569	157580	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532353335
3029	NC_022110	ATT	2	6	157647	157652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353335
3030	NC_022110	GAT	2	6	157673	157678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353335
3031	NC_022110	A	6	6	157716	157721	100 %	0 %	0 %	0 %	532353335
3032	NC_022110	T	6	6	157795	157800	0 %	100 %	0 %	0 %	532353335
3033	NC_022110	ATG	2	6	157845	157850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353335
3034	NC_022110	TG	3	6	157896	157901	0 %	50 %	50 %	0 %	532353335
3035	NC_022110	T	6	6	157915	157920	0 %	100 %	0 %	0 %	532353335
3036	NC_022110	AGA	2	6	157937	157942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353335
3037	NC_022110	AAAG	2	8	157974	157981	75 %	0 %	25 %	0 %	532353335
3038	NC_022110	TTTA	2	8	157983	157990	25 %	75 %	0 %	0 %	532353335
3039	NC_022110	TTA	2	6	158374	158379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353336
3040	NC_022110	CG	3	6	158406	158411	0 %	0 %	50 %	50 %	532353336
3041	NC_022110	AGA	2	6	158432	158437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353336
3042	NC_022110	CAT	2	6	158441	158446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353336
3043	NC_022110	TTC	2	6	158536	158541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353336
3044	NC_022110	AGA	3	9	158546	158554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353336
3045	NC_022110	T	6	6	158605	158610	0 %	100 %	0 %	0 %	532353336
3046	NC_022110	CAT	2	6	159154	159159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353337
3047	NC_022110	TCAA	2	8	159215	159222	50 %	25 %	0 %	25 %	532353337
3048	NC_022110	TGA	2	6	159412	159417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353337
3049	NC_022110	GAA	2	6	159440	159445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353337
3050	NC_022110	TC	3	6	159475	159480	0 %	50 %	0 %	50 %	532353337
3051	NC_022110	GT	3	6	159513	159518	0 %	50 %	50 %	0 %	532353337
3052	NC_022110	AAT	2	6	159557	159562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353337
3053	NC_022110	GGA	2	6	159569	159574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353337
3054	NC_022110	AGGAA	2	10	159598	159607	60 %	0 %	40 %	0 %	532353337
3055	NC_022110	TAG	2	6	159628	159633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353337
3056	NC_022110	AGG	2	6	159634	159639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353337
3057	NC_022110	CTG	2	6	159654	159659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353337
3058	NC_022110	AG	3	6	159685	159690	50 %	0 %	50 %	0 %	532353337
3059	NC_022110	TCT	2	6	159713	159718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353337
3060	NC_022110	AGG	2	6	159832	159837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353337
3061	NC_022110	GAA	2	6	159845	159850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353337
3062	NC_022110	AGA	2	6	159893	159898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353337
3063	NC_022110	ATAC	2	8	160017	160024	50 %	25 %	0 %	25 %	532353338
3064	NC_022110	AGG	2	6	160043	160048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353338
3065	NC_022110	AGG	2	6	160058	160063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353338
3066	NC_022110	CT	3	6	160156	160161	0 %	50 %	0 %	50 %	532353338
3067	NC_022110	GA	3	6	160166	160171	50 %	0 %	50 %	0 %	532353338
3068	NC_022110	ATT	2	6	160186	160191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353338
3069	NC_022110	ATA	2	6	160282	160287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353338
3070	NC_022110	AC	3	6	160306	160311	50 %	0 %	0 %	50 %	532353338
3071	NC_022110	A	8	8	160351	160358	100 %	0 %	0 %	0 %	532353338
3072	NC_022110	ATG	2	6	160432	160437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353338
3073	NC_022110	TCT	2	6	160447	160452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353338
3074	NC_022110	TTC	2	6	160661	160666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353338
3075	NC_022110	AGG	2	6	160672	160677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353338
3076	NC_022110	ACA	2	6	160688	160693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353338
3077	NC_022110	ATA	3	9	160698	160706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353338
3078	NC_022110	TTTC	2	8	160716	160723	0 %	75 %	0 %	25 %	532353338
3079	NC_022110	AACAGC	2	12	160801	160812	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532353339
3080	NC_022110	AGT	2	6	160844	160849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353339
3081	NC_022110	TGG	2	6	160930	160935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353339
3082	NC_022110	TC	3	6	161257	161262	0 %	50 %	0 %	50 %	532353339
3083	NC_022110	A	6	6	161275	161280	100 %	0 %	0 %	0 %	532353339
3084	NC_022110	CTG	2	6	161343	161348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353339
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3087	NC_022110	GCA	2	6	161429	161434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353339
3088	NC_022110	CTT	2	6	161448	161453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353339
3089	NC_022110	ATTG	2	8	161467	161474	25 %	50 %	25 %	0 %	532353339
3090	NC_022110	TCT	2	6	161498	161503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353339
3091	NC_022110	CT	4	8	161502	161509	0 %	50 %	0 %	50 %	532353339
3092	NC_022110	TGT	2	6	161530	161535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353339
3093	NC_022110	GCTT	2	8	161571	161578	0 %	50 %	25 %	25 %	532353339
3094	NC_022110	CAAAA	2	10	161601	161610	80 %	0 %	0 %	20 %	532353339
3095	NC_022110	TGG	2	6	161945	161950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353340
3096	NC_022110	TGT	2	6	161988	161993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353340
3097	NC_022110	GAA	2	6	161998	162003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353340
3098	NC_022110	GGAA	2	8	162040	162047	50 %	0 %	50 %	0 %	532353340
3099	NC_022110	GAA	3	9	162055	162063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353340
3100	NC_022110	TTTC	2	8	162158	162165	0 %	75 %	0 %	25 %	532353340
3101	NC_022110	ATCT	2	8	162184	162191	25 %	50 %	0 %	25 %	532353340
3102	NC_022110	CTT	2	6	162209	162214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353340
3103	NC_022110	GA	3	6	162263	162268	50 %	0 %	50 %	0 %	532353340
3104	NC_022110	TTG	2	6	162289	162294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353340
3105	NC_022110	GAA	2	6	162310	162315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353340
3106	NC_022110	TTA	2	6	162366	162371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353340
3107	NC_022110	TAG	2	6	162377	162382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353340
3108	NC_022110	GTT	2	6	162464	162469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353340
3109	NC_022110	ACA	3	9	162471	162479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353340
3110	NC_022110	AGA	2	6	162591	162596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353340
3111	NC_022110	TG	3	6	162650	162655	0 %	50 %	50 %	0 %	532353340
3112	NC_022110	AGC	2	6	162668	162673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353340
3113	NC_022110	TAG	2	6	162686	162691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353340
3114	NC_022110	TCGA	2	8	162700	162707	25 %	25 %	25 %	25 %	532353340
3115	NC_022110	AGAGA	2	10	162829	162838	60 %	0 %	40 %	0 %	532353340
3116	NC_022110	ATT	2	6	162852	162857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353340
3117	NC_022110	GAGG	2	8	162877	162884	25 %	0 %	75 %	0 %	532353340
3118	NC_022110	TC	3	6	162890	162895	0 %	50 %	0 %	50 %	532353340
3119	NC_022110	TGT	2	6	163122	163127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353340
3120	NC_022110	CTT	3	9	163148	163156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353340
3121	NC_022110	TTG	2	6	163161	163166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353340
3122	NC_022110	AGC	2	6	163206	163211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353340
3123	NC_022110	AGG	2	6	163215	163220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353340
3124	NC_022110	GAA	2	6	163249	163254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353340
3125	NC_022110	AGCAA	2	10	163264	163273	60 %	0 %	20 %	20 %	532353340
3126	NC_022110	TAC	2	6	163290	163295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353340
3127	NC_022110	TGGC	2	8	163340	163347	0 %	25 %	50 %	25 %	532353340
3128	NC_022110	CCT	2	6	163429	163434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353340
3129	NC_022110	GT	3	6	163448	163453	0 %	50 %	50 %	0 %	532353340
3130	NC_022110	GAG	2	6	163457	163462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353340
3131	NC_022110	GAT	2	6	163483	163488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353340
3132	NC_022110	AAT	2	6	163513	163518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353340
3133	NC_022110	GAT	2	6	163601	163606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353340
3134	NC_022110	TCAA	2	8	163659	163666	50 %	25 %	0 %	25 %	532353341
3135	NC_022110	CGA	2	6	163668	163673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353341
3136	NC_022110	ATG	2	6	163689	163694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353341
3137	NC_022110	TGT	2	6	163821	163826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353341
3138	NC_022110	T	7	7	163865	163871	0 %	100 %	0 %	0 %	532353341
3139	NC_022110	ATT	2	6	163885	163890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353341
3140	NC_022110	GAG	2	6	164088	164093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353341
3141	NC_022110	TTTC	2	8	164099	164106	0 %	75 %	0 %	25 %	532353341
3142	NC_022110	GGA	2	6	164186	164191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353341
3143	NC_022110	TCT	2	6	164207	164212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353341
3144	NC_022110	GCT	2	6	164219	164224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353341
3145	NC_022110	A	8	8	164268	164275	100 %	0 %	0 %	0 %	532353341
3146	NC_022110	GGT	2	6	164362	164367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353341
3147	NC_022110	GA	3	6	164379	164384	50 %	0 %	50 %	0 %	532353341
3148	NC_022110	GC	3	6	164395	164400	0 %	0 %	50 %	50 %	532353341
3149	NC_022110	GTC	2	6	164426	164431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353341
3150	NC_022110	GGA	2	6	164539	164544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353341
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3152	NC_022110	A	8	8	164661	164668	100 %	0 %	0 %	0 %	532353341
3153	NC_022110	AGG	2	6	164704	164709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353341
3154	NC_022110	TTG	2	6	164727	164732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353341
3155	NC_022110	AG	3	6	164758	164763	50 %	0 %	50 %	0 %	532353341
3156	NC_022110	TGT	2	6	164809	164814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353341
3157	NC_022110	G	6	6	164858	164863	0 %	0 %	100 %	0 %	532353341
3158	NC_022110	GA	3	6	164922	164927	50 %	0 %	50 %	0 %	532353341
3159	NC_022110	ATT	2	6	164941	164946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353341
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3161	NC_022110	AGA	3	9	164992	165000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353341
3162	NC_022110	CTT	2	6	165180	165185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353341
3163	NC_022110	ATCG	2	8	165232	165239	25 %	25 %	25 %	25 %	532353341
3164	NC_022110	TTC	2	6	165245	165250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353341
3165	NC_022110	AG	3	6	165266	165271	50 %	0 %	50 %	0 %	532353341
3166	NC_022110	TCG	2	6	165277	165282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353341
3167	NC_022110	TTCT	2	8	165306	165313	0 %	75 %	0 %	25 %	532353341
3168	NC_022110	G	6	6	165419	165424	0 %	0 %	100 %	0 %	532353341
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3175	NC_022110	AT	3	6	165897	165902	50 %	50 %	0 %	0 %	532353342
3176	NC_022110	ATT	2	6	165927	165932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353342
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3182	NC_022110	ATC	2	6	166222	166227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353342
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3189	NC_022110	AGT	2	6	166572	166577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353342
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3193	NC_022110	CT	3	6	166790	166795	0 %	50 %	0 %	50 %	532353342
3194	NC_022110	GCT	2	6	166860	166865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353342
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3200	NC_022110	AG	3	6	167063	167068	50 %	0 %	50 %	0 %	532353342
3201	NC_022110	ACT	2	6	167088	167093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353342
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3203	NC_022110	CTG	2	6	167239	167244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353342
3204	NC_022110	CTG	2	6	167305	167310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353342
3205	NC_022110	GTTT	2	8	167336	167343	0 %	75 %	25 %	0 %	532353342
3206	NC_022110	GA	3	6	167381	167386	50 %	0 %	50 %	0 %	532353342
3207	NC_022110	CT	3	6	167495	167500	0 %	50 %	0 %	50 %	532353342
3208	NC_022110	A	6	6	167569	167574	100 %	0 %	0 %	0 %	532353342
3209	NC_022110	AAGAG	2	10	167600	167609	60 %	0 %	40 %	0 %	532353342
3210	NC_022110	AGCT	2	8	167629	167636	25 %	25 %	25 %	25 %	532353342
3211	NC_022110	AGC	2	6	167647	167652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353342
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3213	NC_022110	TCT	2	6	167702	167707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353342
3214	NC_022110	TC	3	6	167722	167727	0 %	50 %	0 %	50 %	532353342
3215	NC_022110	AAG	2	6	167761	167766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353342
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3218	NC_022110	GATTG	2	10	167945	167954	20 %	40 %	40 %	0 %	532353342
3219	NC_022110	TGA	2	6	167957	167962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353342
3220	NC_022110	AG	3	6	168002	168007	50 %	0 %	50 %	0 %	532353342
3221	NC_022110	GCT	2	6	168042	168047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353342
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3224	NC_022110	GGT	2	6	168098	168103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353342
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3229	NC_022110	TC	3	6	168242	168247	0 %	50 %	0 %	50 %	532353342
3230	NC_022110	TCT	2	6	168277	168282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353342
3231	NC_022110	TAT	2	6	168305	168310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353342
3232	NC_022110	AGTT	2	8	168412	168419	25 %	50 %	25 %	0 %	532353342
3233	NC_022110	GAA	2	6	168427	168432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353342
3234	NC_022110	AGA	2	6	168478	168483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353342
3235	NC_022110	AGC	2	6	168533	168538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353342
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3237	NC_022110	GCGG	2	8	168608	168615	0 %	0 %	75 %	25 %	532353342
3238	NC_022110	TAA	2	6	168629	168634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353342
3239	NC_022110	AAG	2	6	168642	168647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353342
3240	NC_022110	AGA	2	6	168755	168760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353342
3241	NC_022110	GCTT	2	8	168783	168790	0 %	50 %	25 %	25 %	532353342
3242	NC_022110	TCA	2	6	168893	168898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353342
3243	NC_022110	AGT	2	6	168917	168922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353342
3244	NC_022110	AGA	2	6	168983	168988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353342
3245	NC_022110	GA	3	6	169004	169009	50 %	0 %	50 %	0 %	532353342
3246	NC_022110	TGT	2	6	169012	169017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353342
3247	NC_022110	GAT	2	6	169023	169028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353342
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3422	NC_022110	CT	3	6	178424	178429	0 %	50 %	0 %	50 %	532354043
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3480	NC_022110	GA	3	6	183071	183076	50 %	0 %	50 %	0 %	532354045
3481	NC_022110	GTT	2	6	183082	183087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354045
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3491	NC_022110	GGA	3	9	183462	183470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354045
3492	NC_022110	TC	3	6	183478	183483	0 %	50 %	0 %	50 %	532354045
3493	NC_022110	ATT	2	6	183497	183502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354045
3494	NC_022110	A	7	7	183527	183533	100 %	0 %	0 %	0 %	532354045
3495	NC_022110	T	8	8	183539	183546	0 %	100 %	0 %	0 %	532354045
3496	NC_022110	ATA	2	6	183589	183594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354045
3497	NC_022110	A	6	6	183594	183599	100 %	0 %	0 %	0 %	532354045
3498	NC_022110	TCT	3	9	183880	183888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353349
3499	NC_022110	TTTC	2	8	183953	183960	0 %	75 %	0 %	25 %	532353349
3500	NC_022110	CTG	2	6	184001	184006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353349

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