MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_022110	AG	3	6	131307	131312	50 %	0 %	50 %	0 %	532353310
2503	NC_022110	TGTA	2	8	131330	131337	25 %	50 %	25 %	0 %	532353310
2504	NC_022110	GAG	2	6	131375	131380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353310
2505	NC_022110	TGA	2	6	131451	131456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2506	NC_022110	TAG	2	6	131468	131473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2507	NC_022110	TGAA	2	8	131567	131574	50 %	25 %	25 %	0 %	532353310
2508	NC_022110	AT	3	6	131583	131588	50 %	50 %	0 %	0 %	532353310
2509	NC_022110	CTT	2	6	131642	131647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353310
2510	NC_022110	ATTC	2	8	131661	131668	25 %	50 %	0 %	25 %	532353310
2511	NC_022110	TTCT	2	8	131744	131751	0 %	75 %	0 %	25 %	532353310
2512	NC_022110	TTC	2	6	131774	131779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353310
2513	NC_022110	TGA	2	6	131802	131807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2514	NC_022110	TGA	2	6	131856	131861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2515	NC_022110	AAG	2	6	131897	131902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353310
2516	NC_022110	AGCA	2	8	131915	131922	50 %	0 %	25 %	25 %	532353310
2517	NC_022110	GAA	2	6	132010	132015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353310
2518	NC_022110	AAAAG	2	10	132036	132045	80 %	0 %	20 %	0 %	532353310
2519	NC_022110	CTT	2	6	132140	132145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353310
2520	NC_022110	GGA	2	6	132147	132152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353310
2521	NC_022110	TGA	2	6	132216	132221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2522	NC_022110	GTT	2	6	132238	132243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353310
2523	NC_022110	A	6	6	132269	132274	100 %	0 %	0 %	0 %	532353310
2524	NC_022110	GGAG	2	8	132279	132286	25 %	0 %	75 %	0 %	532353310
2525	NC_022110	GGA	2	6	132309	132314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353310
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2527	NC_022110	CAGT	2	8	132359	132366	25 %	25 %	25 %	25 %	532353310
2528	NC_022110	GATTC	2	10	132367	132376	20 %	40 %	20 %	20 %	532353310
2529	NC_022110	GCT	2	6	132379	132384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353310
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2531	NC_022110	GAA	2	6	132499	132504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353310
2532	NC_022110	GAT	2	6	132507	132512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2533	NC_022110	AT	3	6	132531	132536	50 %	50 %	0 %	0 %	532353310
2534	NC_022110	TCC	2	6	132570	132575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353310
2535	NC_022110	GAA	2	6	132592	132597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353310
2536	NC_022110	GGAG	2	8	132598	132605	25 %	0 %	75 %	0 %	532353310
2537	NC_022110	TC	3	6	132606	132611	0 %	50 %	0 %	50 %	532353310
2538	NC_022110	AAG	2	6	132621	132626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353310
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2540	NC_022110	TGA	2	6	132651	132656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2541	NC_022110	AAG	2	6	132674	132679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353310
2542	NC_022110	TGA	2	6	132705	132710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2543	NC_022110	AAG	2	6	132730	132735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353310
2544	NC_022110	ATT	2	6	132803	132808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353310
2545	NC_022110	AAG	2	6	132836	132841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353310
2546	NC_022110	TGT	2	6	132852	132857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353310
2547	NC_022110	ATT	2	6	132875	132880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353310
2548	NC_022110	GAAA	2	8	132997	133004	75 %	0 %	25 %	0 %	532353310
2549	NC_022110	GAT	2	6	133021	133026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2550	NC_022110	AGT	2	6	133107	133112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353310
2551	NC_022110	TGT	2	6	133118	133123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353310
2552	NC_022110	TTAAAA	2	12	133199	133210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353310
2553	NC_022110	TG	3	6	133234	133239	0 %	50 %	50 %	0 %	532353310
2554	NC_022110	TCT	2	6	133276	133281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353310
2555	NC_022110	ACCG	2	8	133285	133292	25 %	0 %	25 %	50 %	532353310
2556	NC_022110	GCGA	2	8	133297	133304	25 %	0 %	50 %	25 %	532353310
2557	NC_022110	CAA	2	6	133346	133351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353311
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2560	NC_022110	GAT	2	6	133595	133600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353311
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2562	NC_022110	TGC	2	6	133720	133725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353311
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2569	NC_022110	TTC	2	6	134139	134144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353311
2570	NC_022110	GGC	2	6	134239	134244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353311
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2572	NC_022110	AT	3	6	134317	134322	50 %	50 %	0 %	0 %	532353311
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2583	NC_022110	CT	3	6	134664	134669	0 %	50 %	0 %	50 %	532353311
2584	NC_022110	TTG	2	6	134697	134702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353311
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2593	NC_022110	GGA	2	6	135204	135209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353312
2594	NC_022110	AG	3	6	135234	135239	50 %	0 %	50 %	0 %	532353312
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2598	NC_022110	AAC	2	6	135534	135539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353313
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2602	NC_022110	TAT	2	6	135689	135694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353313
2603	NC_022110	TGG	2	6	135734	135739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353313
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2607	NC_022110	CGC	2	6	135982	135987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353314
2608	NC_022110	TG	3	6	136008	136013	0 %	50 %	50 %	0 %	532353314
2609	NC_022110	TG	3	6	136034	136039	0 %	50 %	50 %	0 %	532353314
2610	NC_022110	TAG	2	6	136071	136076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353314
2611	NC_022110	ACA	2	6	136079	136084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353314
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2613	NC_022110	TGTTT	2	10	136111	136120	0 %	80 %	20 %	0 %	532353314
2614	NC_022110	GCT	2	6	136124	136129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353314
2615	NC_022110	GGAT	2	8	136139	136146	25 %	25 %	50 %	0 %	532353314
2616	NC_022110	AAGC	2	8	136342	136349	50 %	0 %	25 %	25 %	532353315
2617	NC_022110	TTTG	2	8	136368	136375	0 %	75 %	25 %	0 %	532353315
2618	NC_022110	GCG	2	6	136411	136416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353315
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2621	NC_022110	CTG	2	6	136453	136458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353315
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2623	NC_022110	TTTG	2	8	136483	136490	0 %	75 %	25 %	0 %	532353315
2624	NC_022110	CAG	2	6	136520	136525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353315
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2748	NC_022110	GAAA	2	8	143817	143824	75 %	0 %	25 %	0 %	532353323
2749	NC_022110	GTC	2	6	143825	143830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353323
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2994	NC_022110	AT	3	6	156137	156142	50 %	50 %	0 %	0 %	532353334
2995	NC_022110	CTT	2	6	156175	156180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353334
2996	NC_022110	TGGAGA	2	12	156200	156211	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532353334
2997	NC_022110	GCTT	2	8	156243	156250	0 %	50 %	25 %	25 %	532353334
2998	NC_022110	GCA	2	6	156273	156278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353334
2999	NC_022110	TAGA	2	8	156295	156302	50 %	25 %	25 %	0 %	532353334
3000	NC_022110	AG	3	6	156370	156375	50 %	0 %	50 %	0 %	532353334

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