MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022110	GGAAG	2	10	82291	82300	40 %	0 %	60 %	0 %	532353271
1502	NC_022110	ATT	2	6	82310	82315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353271
1503	NC_022110	TTG	2	6	82332	82337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353271
1504	NC_022110	TTC	2	6	82340	82345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353271
1505	NC_022110	T	6	6	82374	82379	0 %	100 %	0 %	0 %	532353271
1506	NC_022110	GAA	2	6	82413	82418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353271
1507	NC_022110	GAA	2	6	82442	82447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353271
1508	NC_022110	GA	3	6	82504	82509	50 %	0 %	50 %	0 %	532353271
1509	NC_022110	GTTC	2	8	82514	82521	0 %	50 %	25 %	25 %	532353271
1510	NC_022110	GCT	2	6	82649	82654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353271
1511	NC_022110	GTGC	2	8	82661	82668	0 %	25 %	50 %	25 %	532353271
1512	NC_022110	TAA	2	6	82711	82716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353271
1513	NC_022110	CAT	2	6	82727	82732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353271
1514	NC_022110	GAA	2	6	82739	82744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353271
1515	NC_022110	GA	3	6	82824	82829	50 %	0 %	50 %	0 %	532353271
1516	NC_022110	TAC	2	6	82875	82880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353271
1517	NC_022110	T	6	6	82899	82904	0 %	100 %	0 %	0 %	532353271
1518	NC_022110	T	7	7	82911	82917	0 %	100 %	0 %	0 %	532353271
1519	NC_022110	T	6	6	82924	82929	0 %	100 %	0 %	0 %	532353272
1520	NC_022110	GTA	2	6	83010	83015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353272
1521	NC_022110	T	6	6	83021	83026	0 %	100 %	0 %	0 %	532353272
1522	NC_022110	TATG	2	8	83045	83052	25 %	50 %	25 %	0 %	532353272
1523	NC_022110	TAT	2	6	83074	83079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353272
1524	NC_022110	GTCTGT	2	12	83088	83099	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532353272
1525	NC_022110	TCA	2	6	83108	83113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353272
1526	NC_022110	TCAT	2	8	83116	83123	25 %	50 %	0 %	25 %	532353272
1527	NC_022110	CAA	2	6	83158	83163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353272
1528	NC_022110	ACTG	2	8	83168	83175	25 %	25 %	25 %	25 %	532353272
1529	NC_022110	AGC	2	6	83177	83182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353272
1530	NC_022110	CATT	2	8	83183	83190	25 %	50 %	0 %	25 %	532353272
1531	NC_022110	AGA	2	6	83216	83221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353272
1532	NC_022110	AGCA	2	8	83222	83229	50 %	0 %	25 %	25 %	532353272
1533	NC_022110	TC	3	6	83244	83249	0 %	50 %	0 %	50 %	532353272
1534	NC_022110	TTA	2	6	83265	83270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353272
1535	NC_022110	ATTA	2	8	83375	83382	50 %	50 %	0 %	0 %	532353272
1536	NC_022110	TTTG	2	8	83415	83422	0 %	75 %	25 %	0 %	532353272
1537	NC_022110	TTG	2	6	83512	83517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353272
1538	NC_022110	GAT	2	6	83609	83614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353272
1539	NC_022110	TCTA	2	8	83699	83706	25 %	50 %	0 %	25 %	532353272
1540	NC_022110	CTA	2	6	83727	83732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353272
1541	NC_022110	TAT	2	6	83780	83785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353272
1542	NC_022110	TAAG	2	8	83804	83811	50 %	25 %	25 %	0 %	532353272
1543	NC_022110	AGT	2	6	83893	83898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353273
1544	NC_022110	TAT	2	6	83920	83925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353273
1545	NC_022110	TGC	2	6	83935	83940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353273
1546	NC_022110	AAG	2	6	83955	83960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353273
1547	NC_022110	TC	3	6	83967	83972	0 %	50 %	0 %	50 %	532353273
1548	NC_022110	AG	3	6	83978	83983	50 %	0 %	50 %	0 %	532353273
1549	NC_022110	GAA	2	6	84011	84016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353273
1550	NC_022110	CAG	2	6	84150	84155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353273
1551	NC_022110	TAA	2	6	84196	84201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353273
1552	NC_022110	AG	3	6	84245	84250	50 %	0 %	50 %	0 %	532353273
1553	NC_022110	TTC	2	6	84264	84269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353273
1554	NC_022110	GAAG	2	8	84308	84315	50 %	0 %	50 %	0 %	532353273
1555	NC_022110	A	6	6	84332	84337	100 %	0 %	0 %	0 %	532353273
1556	NC_022110	AGA	2	6	84382	84387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353273
1557	NC_022110	TTC	2	6	84460	84465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353273
1558	NC_022110	TAAA	2	8	84474	84481	75 %	25 %	0 %	0 %	532353273
1559	NC_022110	ATCC	2	8	84545	84552	25 %	25 %	0 %	50 %	532353273
1560	NC_022110	TGG	2	6	84573	84578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353273
1561	NC_022110	TGA	2	6	84606	84611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353273
1562	NC_022110	TCC	2	6	84613	84618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353273
1563	NC_022110	ACA	2	6	84637	84642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353273
1564	NC_022110	TTTC	2	8	84692	84699	0 %	75 %	0 %	25 %	532353273
1565	NC_022110	AGAT	2	8	84733	84740	50 %	25 %	25 %	0 %	532353273
1566	NC_022110	AGCGA	2	10	84757	84766	40 %	0 %	40 %	20 %	532353273
1567	NC_022110	CTT	2	6	84770	84775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353273
1568	NC_022110	T	6	6	84796	84801	0 %	100 %	0 %	0 %	532353273
1569	NC_022110	GAA	2	6	84923	84928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353273
1570	NC_022110	T	6	6	85003	85008	0 %	100 %	0 %	0 %	532353273
1571	NC_022110	GTG	2	6	85014	85019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353273
1572	NC_022110	A	7	7	85023	85029	100 %	0 %	0 %	0 %	532353273
1573	NC_022110	AGC	2	6	85249	85254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353274
1574	NC_022110	AG	3	6	85276	85281	50 %	0 %	50 %	0 %	532353274
1575	NC_022110	GAAA	2	8	85314	85321	75 %	0 %	25 %	0 %	532353274
1576	NC_022110	T	6	6	85451	85456	0 %	100 %	0 %	0 %	532353274
1577	NC_022110	TGG	2	6	85552	85557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353274
1578	NC_022110	AC	3	6	85579	85584	50 %	0 %	0 %	50 %	532353274
1579	NC_022110	CTT	2	6	85608	85613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353274
1580	NC_022110	CAA	2	6	85619	85624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353274
1581	NC_022110	TCT	2	6	85697	85702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353274
1582	NC_022110	CTT	2	6	85703	85708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353274
1583	NC_022110	GAAA	2	8	85709	85716	75 %	0 %	25 %	0 %	532353274
1584	NC_022110	GCA	2	6	85732	85737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353274
1585	NC_022110	CTG	2	6	85829	85834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353274
1586	NC_022110	GATCC	2	10	85842	85851	20 %	20 %	20 %	40 %	532353274
1587	NC_022110	TAG	2	6	85872	85877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353274
1588	NC_022110	ATGG	3	12	85909	85920	25 %	25 %	50 %	0 %	532353274
1589	NC_022110	GTT	2	6	85921	85926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353274
1590	NC_022110	GGT	2	6	86002	86007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353274
1591	NC_022110	AT	3	6	86134	86139	50 %	50 %	0 %	0 %	532353274
1592	NC_022110	TTG	2	6	86157	86162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353274
1593	NC_022110	AGC	2	6	86331	86336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353274
1594	NC_022110	TTA	2	6	86373	86378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353274
1595	NC_022110	TCT	2	6	86398	86403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353274
1596	NC_022110	TATT	2	8	86497	86504	25 %	75 %	0 %	0 %	532353274
1597	NC_022110	AG	3	6	86560	86565	50 %	0 %	50 %	0 %	532353274
1598	NC_022110	TTA	2	6	86569	86574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353274
1599	NC_022110	GGA	2	6	86671	86676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353274
1600	NC_022110	TA	3	6	86882	86887	50 %	50 %	0 %	0 %	532353274
1601	NC_022110	T	6	6	86981	86986	0 %	100 %	0 %	0 %	532353274
1602	NC_022110	TTG	2	6	87137	87142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354034
1603	NC_022110	TCT	2	6	87159	87164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354034
1604	NC_022110	AGAGC	2	10	87177	87186	40 %	0 %	40 %	20 %	532354034
1605	NC_022110	ATG	2	6	87243	87248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354034
1606	NC_022110	TG	3	6	87251	87256	0 %	50 %	50 %	0 %	532354034
1607	NC_022110	ATG	2	6	87267	87272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354034
1608	NC_022110	CAT	2	6	87322	87327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354034
1609	NC_022110	TCT	3	9	87330	87338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354034
1610	NC_022110	ACTT	2	8	87355	87362	25 %	50 %	0 %	25 %	532354034
1611	NC_022110	AGA	2	6	87395	87400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354034
1612	NC_022110	AAG	2	6	87443	87448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354034
1613	NC_022110	AGG	2	6	87530	87535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354034
1614	NC_022110	T	6	6	87557	87562	0 %	100 %	0 %	0 %	532354034
1615	NC_022110	CTT	2	6	87565	87570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354034
1616	NC_022110	CTC	2	6	87610	87615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354034
1617	NC_022110	CAT	2	6	87745	87750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354034
1618	NC_022110	ACA	2	6	87822	87827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354034
1619	NC_022110	TTC	2	6	87836	87841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354034
1620	NC_022110	TAA	2	6	87920	87925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354034
1621	NC_022110	TAA	2	6	87938	87943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354034
1622	NC_022110	A	6	6	87942	87947	100 %	0 %	0 %	0 %	532354034
1623	NC_022110	TTC	2	6	87948	87953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354034
1624	NC_022110	ATT	2	6	87974	87979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354034
1625	NC_022110	GTTT	2	8	87988	87995	0 %	75 %	25 %	0 %	532354034
1626	NC_022110	TGT	2	6	88173	88178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353275
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1628	NC_022110	GGAT	2	8	88303	88310	25 %	25 %	50 %	0 %	532353275
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1973	NC_022110	ATCA	2	8	104940	104947	50 %	25 %	0 %	25 %	532353290
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1984	NC_022110	CCA	2	6	105323	105328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353290
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1989	NC_022110	TA	3	6	105997	106002	50 %	50 %	0 %	0 %	532353291
1990	NC_022110	AGG	2	6	106034	106039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353291
1991	NC_022110	T	6	6	106074	106079	0 %	100 %	0 %	0 %	532353291
1992	NC_022110	AGC	2	6	106100	106105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353291
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1994	NC_022110	CAA	2	6	106253	106258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353291
1995	NC_022110	AG	3	6	106290	106295	50 %	0 %	50 %	0 %	532353291
1996	NC_022110	TCAGAA	2	12	106300	106311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532353291
1997	NC_022110	T	6	6	106320	106325	0 %	100 %	0 %	0 %	532353291
1998	NC_022110	ATA	2	6	106328	106333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353291
1999	NC_022110	A	6	6	106409	106414	100 %	0 %	0 %	0 %	532353291
2000	NC_022110	T	6	6	106497	106502	0 %	100 %	0 %	0 %	532353291

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