MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022110	AATC	2	8	53925	53932	50 %	25 %	0 %	25 %	532353253
1002	NC_022110	A	6	6	53964	53969	100 %	0 %	0 %	0 %	532353253
1003	NC_022110	TATT	2	8	53986	53993	25 %	75 %	0 %	0 %	532353253
1004	NC_022110	CTT	2	6	53995	54000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353253
1005	NC_022110	GTT	2	6	55727	55732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354032
1006	NC_022110	TGT	2	6	55777	55782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354032
1007	NC_022110	CTGG	3	12	55837	55848	0 %	25 %	50 %	25 %	532354032
1008	NC_022110	ATT	2	6	55852	55857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354032
1009	NC_022110	GAT	2	6	55865	55870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354032
1010	NC_022110	TCT	2	6	55883	55888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354032
1011	NC_022110	TCC	2	6	55918	55923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354032
1012	NC_022110	TTA	2	6	55931	55936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354032
1013	NC_022110	TTGC	2	8	55974	55981	0 %	50 %	25 %	25 %	532354032
1014	NC_022110	CGAG	2	8	56016	56023	25 %	0 %	50 %	25 %	532354032
1015	NC_022110	T	6	6	56026	56031	0 %	100 %	0 %	0 %	532354032
1016	NC_022110	GTA	2	6	56057	56062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354032
1017	NC_022110	GTT	2	6	56168	56173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354032
1018	NC_022110	TGG	2	6	56187	56192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354032
1019	NC_022110	GTTGT	2	10	56266	56275	0 %	60 %	40 %	0 %	532354032
1020	NC_022110	T	6	6	56321	56326	0 %	100 %	0 %	0 %	532354032
1021	NC_022110	A	7	7	56363	56369	100 %	0 %	0 %	0 %	532354032
1022	NC_022110	TCC	2	6	56371	56376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354032
1023	NC_022110	AGT	3	9	56460	56468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354032
1024	NC_022110	AGCT	2	8	56472	56479	25 %	25 %	25 %	25 %	532354032
1025	NC_022110	CT	3	6	56478	56483	0 %	50 %	0 %	50 %	532354032
1026	NC_022110	GAG	2	6	56491	56496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354032
1027	NC_022110	TGG	2	6	56514	56519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354032
1028	NC_022110	GT	3	6	56528	56533	0 %	50 %	50 %	0 %	532354032
1029	NC_022110	AGT	2	6	56547	56552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354032
1030	NC_022110	GTT	2	6	56640	56645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354032
1031	NC_022110	T	6	6	56644	56649	0 %	100 %	0 %	0 %	532354032
1032	NC_022110	AGA	2	6	56800	56805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354032
1033	NC_022110	CAG	2	6	56963	56968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354032
1034	NC_022110	TTG	2	6	56985	56990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354032
1035	NC_022110	TGT	2	6	57063	57068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354032
1036	NC_022110	TG	3	6	57166	57171	0 %	50 %	50 %	0 %	532354032
1037	NC_022110	GGTT	2	8	57175	57182	0 %	50 %	50 %	0 %	532354032
1038	NC_022110	TAA	2	6	57231	57236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354032
1039	NC_022110	ACT	2	6	57247	57252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354032
1040	NC_022110	TTA	2	6	57253	57258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354032
1041	NC_022110	GAA	3	9	57271	57279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354032
1042	NC_022110	ATT	2	6	57282	57287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354032
1043	NC_022110	T	6	6	57286	57291	0 %	100 %	0 %	0 %	532354032
1044	NC_022110	ATT	2	6	57301	57306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354032
1045	NC_022110	T	6	6	57310	57315	0 %	100 %	0 %	0 %	532354032
1046	NC_022110	TCT	2	6	59054	59059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353254
1047	NC_022110	T	6	6	59086	59091	0 %	100 %	0 %	0 %	532353254
1048	NC_022110	CGTT	2	8	59237	59244	0 %	50 %	25 %	25 %	532353254
1049	NC_022110	GGAG	2	8	59246	59253	25 %	0 %	75 %	0 %	532353254
1050	NC_022110	GTAA	2	8	59298	59305	50 %	25 %	25 %	0 %	532353254
1051	NC_022110	TCCTAA	2	12	59365	59376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353254
1052	NC_022110	AGT	2	6	59394	59399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353254
1053	NC_022110	T	6	6	59426	59431	0 %	100 %	0 %	0 %	532353254
1054	NC_022110	AGC	2	6	59474	59479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353254
1055	NC_022110	GCT	2	6	59486	59491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353254
1056	NC_022110	GTC	2	6	59512	59517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353254
1057	NC_022110	ATGG	2	8	59525	59532	25 %	25 %	50 %	0 %	532353254
1058	NC_022110	AGG	2	6	59559	59564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353254
1059	NC_022110	GA	3	6	59611	59616	50 %	0 %	50 %	0 %	532353254
1060	NC_022110	CAA	2	6	59634	59639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353254
1061	NC_022110	ATAA	2	8	59671	59678	75 %	25 %	0 %	0 %	532353254
1062	NC_022110	GAGCA	2	10	59711	59720	40 %	0 %	40 %	20 %	532353254
1063	NC_022110	GT	3	6	59749	59754	0 %	50 %	50 %	0 %	532353254
1064	NC_022110	TAG	2	6	59761	59766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353254
1065	NC_022110	AAG	2	6	59946	59951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353254
1066	NC_022110	AAC	2	6	59991	59996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353254
1067	NC_022110	T	7	7	60010	60016	0 %	100 %	0 %	0 %	532353254
1068	NC_022110	CTT	2	6	60060	60065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353254
1069	NC_022110	AAT	2	6	60090	60095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353254
1070	NC_022110	TTC	2	6	60101	60106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353254
1071	NC_022110	ATGT	2	8	60121	60128	25 %	50 %	25 %	0 %	532353254
1072	NC_022110	CATT	2	8	60150	60157	25 %	50 %	0 %	25 %	532353254
1073	NC_022110	ATG	2	6	60171	60176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353254
1074	NC_022110	CCT	2	6	60177	60182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353254
1075	NC_022110	AGT	2	6	60232	60237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353255
1076	NC_022110	TCT	2	6	60255	60260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353255
1077	NC_022110	TCA	2	6	60267	60272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353255
1078	NC_022110	TTC	2	6	60388	60393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353255
1079	NC_022110	CTTT	2	8	60422	60429	0 %	75 %	0 %	25 %	532353255
1080	NC_022110	TTCT	2	8	60445	60452	0 %	75 %	0 %	25 %	532353255
1081	NC_022110	TTC	2	6	60483	60488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353255
1082	NC_022110	TC	3	6	60495	60500	0 %	50 %	0 %	50 %	532353255
1083	NC_022110	T	6	6	60507	60512	0 %	100 %	0 %	0 %	532353255
1084	NC_022110	T	7	7	60567	60573	0 %	100 %	0 %	0 %	532353255
1085	NC_022110	CAGA	2	8	60681	60688	50 %	0 %	25 %	25 %	532354033
1086	NC_022110	GA	3	6	60723	60728	50 %	0 %	50 %	0 %	532354033
1087	NC_022110	TAA	2	6	60736	60741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354033
1088	NC_022110	TCA	2	6	60952	60957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353256
1089	NC_022110	TTC	2	6	61014	61019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353256
1090	NC_022110	TCT	2	6	61078	61083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353256
1091	NC_022110	A	6	6	61114	61119	100 %	0 %	0 %	0 %	532353256
1092	NC_022110	CA	3	6	61121	61126	50 %	0 %	0 %	50 %	532353256
1093	NC_022110	TGA	2	6	61133	61138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353256
1094	NC_022110	TTA	2	6	61146	61151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353256
1095	NC_022110	TCA	2	6	61186	61191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353256
1096	NC_022110	GAA	2	6	61192	61197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353256
1097	NC_022110	TCT	2	6	61198	61203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353256
1098	NC_022110	AAG	2	6	61238	61243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353256
1099	NC_022110	CTT	2	6	61250	61255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353256
1100	NC_022110	ATT	2	6	61260	61265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353256
1101	NC_022110	AT	3	6	61371	61376	50 %	50 %	0 %	0 %	532353256
1102	NC_022110	GA	3	6	61394	61399	50 %	0 %	50 %	0 %	532353256
1103	NC_022110	TTC	2	6	61421	61426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353256
1104	NC_022110	GAA	2	6	61465	61470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353256
1105	NC_022110	GA	3	6	61520	61525	50 %	0 %	50 %	0 %	532353256
1106	NC_022110	ATG	2	6	61762	61767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353256
1107	NC_022110	TGT	2	6	61809	61814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353256
1108	NC_022110	AGC	2	6	61827	61832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353256
1109	NC_022110	AAT	2	6	61989	61994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353256
1110	NC_022110	ATG	2	6	62060	62065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353256
1111	NC_022110	TGTGA	2	10	62155	62164	20 %	40 %	40 %	0 %	532353256
1112	NC_022110	TGT	2	6	62176	62181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353256
1113	NC_022110	A	6	6	62257	62262	100 %	0 %	0 %	0 %	532353256
1114	NC_022110	ATT	2	6	62274	62279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353256
1115	NC_022110	CGA	2	6	62322	62327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353256
1116	NC_022110	GA	3	6	62332	62337	50 %	0 %	50 %	0 %	532353256
1117	NC_022110	CTT	2	6	62453	62458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353256
1118	NC_022110	AAG	2	6	62487	62492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353256
1119	NC_022110	TTA	2	6	62564	62569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353256
1120	NC_022110	GA	3	6	62595	62600	50 %	0 %	50 %	0 %	532353256
1121	NC_022110	TTA	2	6	62645	62650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353256
1122	NC_022110	AAG	2	6	62652	62657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353256
1123	NC_022110	TC	3	6	62751	62756	0 %	50 %	0 %	50 %	532353256
1124	NC_022110	CAA	2	6	62852	62857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353256
1125	NC_022110	AT	3	6	62932	62937	50 %	50 %	0 %	0 %	532353256
1126	NC_022110	TTC	2	6	62938	62943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353256
1127	NC_022110	GTT	2	6	63077	63082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353256
1128	NC_022110	CTTC	2	8	63083	63090	0 %	50 %	0 %	50 %	532353256
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1252	NC_022110	GCA	2	6	69935	69940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353262
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1255	NC_022110	CTT	2	6	70081	70086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353262
1256	NC_022110	GA	3	6	70090	70095	50 %	0 %	50 %	0 %	532353262
1257	NC_022110	CTCTT	2	10	70096	70105	0 %	60 %	0 %	40 %	532353262
1258	NC_022110	AGAA	2	8	70108	70115	75 %	0 %	25 %	0 %	532353262
1259	NC_022110	TGA	2	6	70136	70141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353262
1260	NC_022110	TTG	2	6	70225	70230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353262
1261	NC_022110	TCT	2	6	70248	70253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353262
1262	NC_022110	GA	3	6	70289	70294	50 %	0 %	50 %	0 %	532353262
1263	NC_022110	AGCT	2	8	70330	70337	25 %	25 %	25 %	25 %	532353262
1264	NC_022110	TGA	2	6	70376	70381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353262
1265	NC_022110	GCAT	2	8	70391	70398	25 %	25 %	25 %	25 %	532353262
1266	NC_022110	AGA	2	6	70409	70414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353262
1267	NC_022110	TCAA	2	8	70535	70542	50 %	25 %	0 %	25 %	532353262
1268	NC_022110	GT	3	6	70565	70570	0 %	50 %	50 %	0 %	532353262
1269	NC_022110	CT	3	6	70646	70651	0 %	50 %	0 %	50 %	532353262
1270	NC_022110	GA	3	6	70667	70672	50 %	0 %	50 %	0 %	532353262
1271	NC_022110	AGT	2	6	70709	70714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353262
1272	NC_022110	AGGGG	2	10	70742	70751	20 %	0 %	80 %	0 %	532353262
1273	NC_022110	AAGAA	2	10	70784	70793	80 %	0 %	20 %	0 %	532353262
1274	NC_022110	AGA	2	6	70856	70861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353262
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1276	NC_022110	TAT	2	6	70903	70908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353262
1277	NC_022110	CAT	2	6	71078	71083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353263
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1279	NC_022110	GCTT	2	8	71137	71144	0 %	50 %	25 %	25 %	532353263
1280	NC_022110	A	6	6	71232	71237	100 %	0 %	0 %	0 %	532353263
1281	NC_022110	ATT	2	6	71282	71287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353263
1282	NC_022110	CAA	2	6	71429	71434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353263
1283	NC_022110	TCC	2	6	71453	71458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353263
1284	NC_022110	TTCT	2	8	71475	71482	0 %	75 %	0 %	25 %	532353263
1285	NC_022110	ATG	2	6	71487	71492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353263
1286	NC_022110	GCTT	2	8	71521	71528	0 %	50 %	25 %	25 %	532353263
1287	NC_022110	AGA	2	6	71530	71535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353263
1288	NC_022110	GAGC	2	8	71549	71556	25 %	0 %	50 %	25 %	532353263
1289	NC_022110	TCA	2	6	71574	71579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353263
1290	NC_022110	A	7	7	71581	71587	100 %	0 %	0 %	0 %	532353263
1291	NC_022110	CTATTT	2	12	71592	71603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532353263
1292	NC_022110	TGA	2	6	71626	71631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353263
1293	NC_022110	ATG	2	6	71664	71669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353263
1294	NC_022110	AGA	2	6	71794	71799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353263
1295	NC_022110	CT	3	6	71802	71807	0 %	50 %	0 %	50 %	532353263
1296	NC_022110	TTC	2	6	71987	71992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353264
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1298	NC_022110	ATTGG	2	10	72073	72082	20 %	40 %	40 %	0 %	532353264
1299	NC_022110	T	6	6	72089	72094	0 %	100 %	0 %	0 %	532353264
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1314	NC_022110	GAA	2	6	72599	72604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353264
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1376	NC_022110	CT	3	6	75493	75498	0 %	50 %	0 %	50 %	532353266
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1378	NC_022110	GATA	2	8	75581	75588	50 %	25 %	25 %	0 %	532353266
1379	NC_022110	TAG	2	6	75638	75643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353266
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