MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022110	T	7	7	27859	27865	0 %	100 %	0 %	0 %	532353227
502	NC_022110	TAA	2	6	27870	27875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353227
503	NC_022110	TC	3	6	27877	27882	0 %	50 %	0 %	50 %	532353227
504	NC_022110	GAA	2	6	28032	28037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353228
505	NC_022110	ATCCG	2	10	28052	28061	20 %	20 %	20 %	40 %	532353228
506	NC_022110	TTC	2	6	28165	28170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353228
507	NC_022110	TAG	2	6	28213	28218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353228
508	NC_022110	AGA	2	6	28226	28231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353228
509	NC_022110	GAT	3	9	28308	28316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353228
510	NC_022110	GAG	2	6	28351	28356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353228
511	NC_022110	TG	3	6	28383	28388	0 %	50 %	50 %	0 %	532353228
512	NC_022110	GCA	2	6	28407	28412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353228
513	NC_022110	TC	3	6	28436	28441	0 %	50 %	0 %	50 %	532353228
514	NC_022110	AGGGT	2	10	28570	28579	20 %	20 %	60 %	0 %	532353228
515	NC_022110	TTC	2	6	28606	28611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353228
516	NC_022110	CAG	2	6	28618	28623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353228
517	NC_022110	GAA	2	6	28632	28637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353228
518	NC_022110	TGA	2	6	28646	28651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353228
519	NC_022110	TTC	2	6	28679	28684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353228
520	NC_022110	GC	4	8	28850	28857	0 %	0 %	50 %	50 %	532353228
521	NC_022110	AAG	2	6	28858	28863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353228
522	NC_022110	TA	3	6	28972	28977	50 %	50 %	0 %	0 %	532353228
523	NC_022110	GAA	2	6	29061	29066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353228
524	NC_022110	TGT	2	6	29093	29098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353229
525	NC_022110	TCT	2	6	29161	29166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353229
526	NC_022110	ACA	2	6	29389	29394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353229
527	NC_022110	ATG	2	6	29399	29404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353229
528	NC_022110	CTTT	2	8	29541	29548	0 %	75 %	0 %	25 %	532353229
529	NC_022110	TTTG	2	8	29556	29563	0 %	75 %	25 %	0 %	532353229
530	NC_022110	TTGT	2	8	29591	29598	0 %	75 %	25 %	0 %	532353229
531	NC_022110	CCTAT	2	10	29610	29619	20 %	40 %	0 %	40 %	532353229
532	NC_022110	T	6	6	29626	29631	0 %	100 %	0 %	0 %	532353229
533	NC_022110	ATC	2	6	29705	29710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353229
534	NC_022110	TGGC	2	8	29754	29761	0 %	25 %	50 %	25 %	532353229
535	NC_022110	T	8	8	29860	29867	0 %	100 %	0 %	0 %	532353229
536	NC_022110	ATG	2	6	29885	29890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353229
537	NC_022110	GA	3	6	29923	29928	50 %	0 %	50 %	0 %	532353229
538	NC_022110	AG	3	6	30021	30026	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
539	NC_022110	GTT	2	6	30102	30107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353230
540	NC_022110	GAA	2	6	30111	30116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353230
541	NC_022110	TC	3	6	30130	30135	0 %	50 %	0 %	50 %	532353230
542	NC_022110	TCT	2	6	30177	30182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353230
543	NC_022110	ACT	2	6	30267	30272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353230
544	NC_022110	TTC	2	6	30295	30300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353230
545	NC_022110	AAAG	2	8	30314	30321	75 %	0 %	25 %	0 %	532353230
546	NC_022110	CCT	2	6	30331	30336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353230
547	NC_022110	AAAC	2	8	30384	30391	75 %	0 %	0 %	25 %	532353230
548	NC_022110	T	6	6	30401	30406	0 %	100 %	0 %	0 %	532353230
549	NC_022110	GAAGG	2	10	30409	30418	40 %	0 %	60 %	0 %	532353230
550	NC_022110	GGC	2	6	30437	30442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353230
551	NC_022110	GAT	2	6	30516	30521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353230
552	NC_022110	GATG	2	8	30527	30534	25 %	25 %	50 %	0 %	532353230
553	NC_022110	TAG	2	6	30538	30543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353230
554	NC_022110	GTT	2	6	30612	30617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353230
555	NC_022110	TAA	2	6	30722	30727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353230
556	NC_022110	GA	3	6	30751	30756	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
557	NC_022110	GAA	2	6	30861	30866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353230
558	NC_022110	AGA	2	6	30881	30886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353230
559	NC_022110	TCG	2	6	30944	30949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353230
560	NC_022110	ATG	2	6	30978	30983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353230
561	NC_022110	TGG	2	6	30992	30997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353230
562	NC_022110	GAA	2	6	31023	31028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353230
563	NC_022110	ATT	2	6	31059	31064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353230
564	NC_022110	ATG	2	6	31182	31187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353230
565	NC_022110	AAG	2	6	31194	31199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353230
566	NC_022110	T	6	6	31200	31205	0 %	100 %	0 %	0 %	532353230
567	NC_022110	GA	3	6	31219	31224	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
568	NC_022110	A	7	7	31242	31248	100 %	0 %	0 %	0 %	532353230
569	NC_022110	ACA	2	6	31288	31293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353231
570	NC_022110	TGT	2	6	31309	31314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353231
571	NC_022110	AT	3	6	31360	31365	50 %	50 %	0 %	0 %	532353231
572	NC_022110	T	6	6	31428	31433	0 %	100 %	0 %	0 %	532353231
573	NC_022110	GAGCT	2	10	31449	31458	20 %	20 %	40 %	20 %	532353231
574	NC_022110	A	6	6	31523	31528	100 %	0 %	0 %	0 %	532353231
575	NC_022110	A	6	6	31554	31559	100 %	0 %	0 %	0 %	532353231
576	NC_022110	TGC	2	6	31582	31587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353231
577	NC_022110	AGC	2	6	31600	31605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353231
578	NC_022110	TC	3	6	31645	31650	0 %	50 %	0 %	50 %	532353232
579	NC_022110	AAG	2	6	31849	31854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353232
580	NC_022110	AAG	2	6	31856	31861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353232
581	NC_022110	CTT	2	6	31895	31900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353232
582	NC_022110	CGT	2	6	31926	31931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353232
583	NC_022110	TGA	2	6	31972	31977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353232
584	NC_022110	GAG	2	6	32003	32008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353232
585	NC_022110	GCG	2	6	32045	32050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353232
586	NC_022110	CT	3	6	32125	32130	0 %	50 %	0 %	50 %	532353232
587	NC_022110	AGA	2	6	32223	32228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353232
588	NC_022110	AG	3	6	32257	32262	50 %	0 %	50 %	0 %	532353232
589	NC_022110	AAG	2	6	32411	32416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353232
590	NC_022110	ATT	2	6	32461	32466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353232
591	NC_022110	T	6	6	32566	32571	0 %	100 %	0 %	0 %	532353232
592	NC_022110	GGA	2	6	32591	32596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353232
593	NC_022110	AGG	2	6	32816	32821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353233
594	NC_022110	GGT	2	6	32871	32876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353233
595	NC_022110	GCT	2	6	33033	33038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353233
596	NC_022110	GCT	2	6	33066	33071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353233
597	NC_022110	AAAGA	2	10	33082	33091	80 %	0 %	20 %	0 %	532353233
598	NC_022110	GAA	2	6	33177	33182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353234
599	NC_022110	A	6	6	33181	33186	100 %	0 %	0 %	0 %	532353234
600	NC_022110	TGT	2	6	33272	33277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353234
601	NC_022110	TGA	2	6	33323	33328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353234
602	NC_022110	A	6	6	33333	33338	100 %	0 %	0 %	0 %	532353234
603	NC_022110	GTT	2	6	33411	33416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353234
604	NC_022110	AGG	2	6	33460	33465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353234
605	NC_022110	CTT	2	6	33484	33489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353234
606	NC_022110	T	6	6	33506	33511	0 %	100 %	0 %	0 %	532353234
607	NC_022110	GTT	2	6	33524	33529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353234
608	NC_022110	TGA	2	6	33631	33636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353234
609	NC_022110	CAG	2	6	33694	33699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353234
610	NC_022110	CAT	2	6	33738	33743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353234
611	NC_022110	TC	3	6	33754	33759	0 %	50 %	0 %	50 %	532353234
612	NC_022110	AG	3	6	33767	33772	50 %	0 %	50 %	0 %	532353234
613	NC_022110	CTG	2	6	33864	33869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353235
614	NC_022110	ACA	2	6	33881	33886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353235
615	NC_022110	AG	3	6	33905	33910	50 %	0 %	50 %	0 %	532353235
616	NC_022110	GTC	2	6	33937	33942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353235
617	NC_022110	ATT	2	6	33984	33989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353235
618	NC_022110	T	6	6	34036	34041	0 %	100 %	0 %	0 %	532353235
619	NC_022110	TTA	2	6	34066	34071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353235
620	NC_022110	TGAT	2	8	34130	34137	25 %	50 %	25 %	0 %	532353235
621	NC_022110	GAA	2	6	34158	34163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353235
622	NC_022110	AAG	2	6	34205	34210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353235
623	NC_022110	AGA	2	6	34256	34261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353235
624	NC_022110	AAGA	3	12	34258	34269	75 %	0 %	25 %	0 %	532353235
625	NC_022110	TGC	2	6	34293	34298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353235
626	NC_022110	TGT	2	6	34317	34322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353235
627	NC_022110	ATG	2	6	34328	34333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353235
628	NC_022110	AAG	2	6	34359	34364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353235
629	NC_022110	GAA	2	6	34378	34383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353235
630	NC_022110	AAGC	2	8	34478	34485	50 %	0 %	25 %	25 %	532353236
631	NC_022110	GTTC	2	8	34511	34518	0 %	50 %	25 %	25 %	532353236
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634	NC_022110	GA	4	8	34620	34627	50 %	0 %	50 %	0 %	532353236
635	NC_022110	AGA	2	6	34655	34660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353236
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643	NC_022110	TCGA	2	8	35147	35154	25 %	25 %	25 %	25 %	532353237
644	NC_022110	GAG	2	6	35159	35164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353237
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651	NC_022110	TTGG	2	8	35532	35539	0 %	50 %	50 %	0 %	532353237
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660	NC_022110	TCCTA	2	10	36169	36178	20 %	40 %	0 %	40 %	532353237
661	NC_022110	AGAT	2	8	36252	36259	50 %	25 %	25 %	0 %	532353237
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663	NC_022110	ATT	2	6	36327	36332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353237
664	NC_022110	GA	3	6	36523	36528	50 %	0 %	50 %	0 %	532353238
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673	NC_022110	TTA	2	6	36915	36920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353238
674	NC_022110	TTA	2	6	36981	36986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353238
675	NC_022110	TGC	2	6	36995	37000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353238
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759	NC_022110	GAA	2	6	41594	41599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353241
760	NC_022110	TGT	3	9	41622	41630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353241
761	NC_022110	CTT	2	6	41638	41643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353241
762	NC_022110	TGA	2	6	41719	41724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353241
763	NC_022110	GAT	2	6	41828	41833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353241
764	NC_022110	AGAA	2	8	41861	41868	75 %	0 %	25 %	0 %	532353241
765	NC_022110	GA	3	6	41993	41998	50 %	0 %	50 %	0 %	532353241
766	NC_022110	GA	4	8	42003	42010	50 %	0 %	50 %	0 %	532353241
767	NC_022110	GGAT	2	8	42013	42020	25 %	25 %	50 %	0 %	532353241
768	NC_022110	A	7	7	42074	42080	100 %	0 %	0 %	0 %	532353241
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772	NC_022110	A	6	6	42196	42201	100 %	0 %	0 %	0 %	532353241
773	NC_022110	GTT	2	6	42216	42221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353241
774	NC_022110	AG	3	6	42239	42244	50 %	0 %	50 %	0 %	532353241
775	NC_022110	AAG	2	6	42256	42261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353241
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781	NC_022110	T	6	6	42897	42902	0 %	100 %	0 %	0 %	532353242
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787	NC_022110	ACC	2	6	43102	43107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353242
788	NC_022110	AAG	2	6	43111	43116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353242
789	NC_022110	CCA	2	6	43129	43134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353242
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